Protein–RNA interactions for Protein: P14867

GABRA1, Gamma-aminobutyric acid receptor subunit alpha-1, humanhuman

Predictions only

Length 456 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GABRA1P14867 RABL6-203ENST00000371663 3078 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
GABRA1P14867 CHRNA5-201ENST00000299565 3623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
GABRA1P14867 EGR3-204ENST00000522910 1553 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.65■□□□□ 0.1
GABRA1P14867 WDR13-201ENST00000218056 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
GABRA1P14867 CXXC1-202ENST00000412036 2280 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
GABRA1P14867 TMPRSS2-206ENST00000458356 1701 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.65■□□□□ 0.1
GABRA1P14867 H2AFV-201ENST00000222690 3804 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.65■□□□□ 0.1
GABRA1P14867 PSMD4-201ENST00000368881 1333 ntTSL 5 BASIC15.65■□□□□ 0.1
GABRA1P14867 HSP90B1-210ENST00000614327 1338 ntTSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
GABRA1P14867 NTRK1-202ENST00000368196 2701 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
GABRA1P14867 PPM1H-201ENST00000228705 6353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
GABRA1P14867 C6orf106-202ENST00000374023 4418 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
GABRA1P14867 AL118508.1-201ENST00000613502 2345 ntBASIC15.65■□□□□ 0.1
GABRA1P14867 AL023806.1-201ENST00000603994 1649 ntBASIC15.65■□□□□ 0.1
GABRA1P14867 DCAF8-218ENST00000610139 1607 ntTSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
GABRA1P14867 RASA4-202ENST00000449970 2787 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.64■□□□□ 0.09
GABRA1P14867 SYNGAP1-202ENST00000418600 5828 ntTSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
GABRA1P14867 CYP2W1-202ENST00000340150 2361 ntTSL 2 BASIC15.64■□□□□ 0.09
GABRA1P14867 GID4-202ENST00000376345 1391 ntTSL 3 BASIC15.64■□□□□ 0.09
GABRA1P14867 CEACAM21-203ENST00000407170 1691 ntTSL 2 BASIC15.64■□□□□ 0.09
GABRA1P14867 AC009949.1-201ENST00000623048 1830 ntBASIC15.64■□□□□ 0.09
GABRA1P14867 F11R-202ENST00000368026 4835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
GABRA1P14867 TRA2B-202ENST00000342294 288 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
GABRA1P14867 TOR3A-201ENST00000352445 1182 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
GABRA1P14867 CRCP-205ENST00000431089 942 ntTSL 2 BASIC15.64■□□□□ 0.09
GABRA1P14867 AL121672.1-201ENST00000439423 1181 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
GABRA1P14867 AC009947.1-201ENST00000444350 727 ntBASIC15.64■□□□□ 0.09
GABRA1P14867 AL157871.1-202ENST00000556458 478 ntTSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
GABRA1P14867 ZPBP2-204ENST00000584588 1277 ntTSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
GABRA1P14867 STK25P1-201ENST00000585406 838 ntBASIC15.64■□□□□ 0.09
GABRA1P14867 CYGB-205ENST00000590175 830 ntTSL 3 BASIC15.64■□□□□ 0.09
GABRA1P14867 MCF2L-208ENST00000397030 6580 ntTSL 2 BASIC15.64■□□□□ 0.09
GABRA1P14867 NRSN2-202ENST00000382291 2088 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.64■□□□□ 0.09
GABRA1P14867 ACTB-201ENST00000331789 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
GABRA1P14867 CXorf67-201ENST00000342995 1929 ntAPPRIS P1 BASIC15.64■□□□□ 0.09
GABRA1P14867 TOM1L2-203ENST00000395739 1766 ntTSL 2 BASIC15.64■□□□□ 0.09
GABRA1P14867 P2RX5-209ENST00000552276 1642 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
GABRA1P14867 CHGA-202ENST00000334654 1474 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
GABRA1P14867 FAM120AOS-201ENST00000375412 2771 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
GABRA1P14867 KCNK3-201ENST00000302909 6162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
GABRA1P14867 GJA3-201ENST00000241125 5211 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.63■□□□□ 0.09
GABRA1P14867 GINS4-206ENST00000520710 2022 ntTSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
GABRA1P14867 GGA1-203ENST00000343632 3159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
GABRA1P14867 HEBP2-204ENST00000607197 10014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
GABRA1P14867 TSKS-201ENST00000246801 1883 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
GABRA1P14867 UBL3-201ENST00000380680 4384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
GABRA1P14867 ZMYND11-214ENST00000509513 2065 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
GABRA1P14867 NKILA-202ENST00000614771 2598 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
GABRA1P14867 ACBD3-201ENST00000366812 3573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
GABRA1P14867 HIBCH-201ENST00000359678 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
GABRA1P14867 WDR13-202ENST00000376729 5469 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
GABRA1P14867 WIPI2-201ENST00000288828 4476 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
GABRA1P14867 TCP11L2-203ENST00000547153 1788 ntTSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
GABRA1P14867 TSTD1-203ENST00000368024 457 ntTSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
GABRA1P14867 TRIM36-203ENST00000379618 693 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
GABRA1P14867 MOB1B-202ENST00000396051 1107 ntTSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
GABRA1P14867 C6orf226-201ENST00000408925 552 ntAPPRIS P1 BASIC15.63■□□□□ 0.09
GABRA1P14867 IMP4-203ENST00000409935 958 ntTSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
GABRA1P14867 MOGAT1-201ENST00000446656 1048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
GABRA1P14867 DNAJB3-201ENST00000446806 729 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
GABRA1P14867 AL365226.1-201ENST00000448363 349 ntTSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
GABRA1P14867 AC108751.1-201ENST00000490852 363 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
GABRA1P14867 CDKN2A-209ENST00000498628 926 ntTSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
GABRA1P14867 AC034243.1-201ENST00000520838 587 ntTSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
GABRA1P14867 AP005019.1-201ENST00000545254 664 ntTSL 3 BASIC15.63■□□□□ 0.09
GABRA1P14867 HAGH-208ENST00000566709 1291 ntTSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
GABRA1P14867 TCAP-202ENST00000578283 583 ntTSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
GABRA1P14867 ACYP2-209ENST00000607452 831 ntTSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
GABRA1P14867 NFIB-212ENST00000622520 1274 ntTSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
GABRA1P14867 SLC8B1-210ENST00000550047 2493 ntTSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
GABRA1P14867 SLBP-202ENST00000429429 1623 ntTSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
GABRA1P14867 TOM1L1-221ENST00000575882 2507 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
GABRA1P14867 TEX261-201ENST00000272438 3441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
GABRA1P14867 AC055811.2-201ENST00000427497 1693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
GABRA1P14867 ATP10A-201ENST00000356865 6680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
GABRA1P14867 PCGF6-202ENST00000369847 2230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
GABRA1P14867 MFSD11-207ENST00000586622 2952 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
GABRA1P14867 ETFBKMT-202ENST00000395763 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
GABRA1P14867 DTX3-204ENST00000548804 2067 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
GABRA1P14867 SEMA3C-201ENST00000265361 5174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
GABRA1P14867 WDR45-206ENST00000376368 1381 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
GABRA1P14867 AP000347.2-202ENST00000421064 3041 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
GABRA1P14867 FZR1-203ENST00000441788 5212 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
GABRA1P14867 LCA10-201ENST00000618311 1392 ntTSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
GABRA1P14867 CELF3-201ENST00000290583 3246 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
GABRA1P14867 CFLAR-208ENST00000423241 2128 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
GABRA1P14867 IFT74-203ENST00000433700 2119 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
GABRA1P14867 TAF15-211ENST00000604841 2140 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
GABRA1P14867 BANP-227ENST00000626016 2144 ntTSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
GABRA1P14867 CNGA3-205ENST00000436404 2504 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
GABRA1P14867 ELF2-204ENST00000394235 4012 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
GABRA1P14867 AKIRIN1-202ENST00000432648 2741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
GABRA1P14867 LRRFIP2-209ENST00000440230 1989 ntTSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
GABRA1P14867 AC100803.2-201ENST00000562459 1963 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
GABRA1P14867 INPP5J-202ENST00000400294 2393 ntTSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
GABRA1P14867 SMOC1-201ENST00000361956 2040 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
GABRA1P14867 ZSCAN10-207ENST00000575108 2247 ntTSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
GABRA1P14867 KLC1-207ENST00000445352 2416 ntTSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
GABRA1P14867 C12orf56-207ENST00000543942 3242 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
GABRA1P14867 CST3-201ENST00000376925 873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 34.5 ms