Protein–RNA interactions for Protein: P14653

HOXB1, Homeobox protein Hox-B1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 301 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HOXB1P14653 HIST2H4B-201ENST00000579512 1132 ntAPPRIS P1 BASIC15.36■□□□□ 0.05
HOXB1P14653 AC008105.3-202ENST00000585471 1077 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
HOXB1P14653 IRF5-214ENST00000613821 595 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
HOXB1P14653 Metazoa_SRP.91-201ENST00000622745 281 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
HOXB1P14653 MAP2K3-215ENST00000627447 351 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
HOXB1P14653 ANKMY2-206ENST00000628652 1270 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
HOXB1P14653 CCNA2-201ENST00000274026 2797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
HOXB1P14653 ZNF131-206ENST00000505606 3209 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
HOXB1P14653 CYP2D6-204ENST00000389970 1714 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
HOXB1P14653 PRPF19-201ENST00000227524 2157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
HOXB1P14653 HGFAC-201ENST00000382774 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
HOXB1P14653 TAL1-201ENST00000294339 5001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
HOXB1P14653 DENND2A-201ENST00000275884 3735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
HOXB1P14653 SETD3-201ENST00000329331 1330 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
HOXB1P14653 POMT1-208ENST00000423007 3320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
HOXB1P14653 CSAD-209ENST00000453446 1774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
HOXB1P14653 C7orf31-201ENST00000283905 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
HOXB1P14653 IFFO1-202ENST00000356896 2680 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
HOXB1P14653 ZNF397-204ENST00000585800 2046 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
HOXB1P14653 IL18BP-214ENST00000620017 1566 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
HOXB1P14653 HMGXB3-201ENST00000502717 4974 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
HOXB1P14653 MLLT1-201ENST00000252674 4507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
HOXB1P14653 ST6GALNAC6-201ENST00000291839 2280 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
HOXB1P14653 PAN3-AS1-201ENST00000563843 1351 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
HOXB1P14653 SYNM-204ENST00000594047 6407 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
HOXB1P14653 SSC5D-202ENST00000587166 3017 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
HOXB1P14653 AC016757.1-205ENST00000470346 1888 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
HOXB1P14653 MSLNL-201ENST00000442466 2109 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
HOXB1P14653 TMEM106C-203ENST00000449758 1414 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
HOXB1P14653 SIGLEC16-201ENST00000599858 1437 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
HOXB1P14653 SOCS2-AS1-202ENST00000500986 1655 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
HOXB1P14653 ACTB-201ENST00000331789 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
HOXB1P14653 AHRR-209ENST00000512529 1912 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
HOXB1P14653 FOSB-209ENST00000590335 2170 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
HOXB1P14653 DAG1-222ENST00000545947 5829 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
HOXB1P14653 HNF1B-207ENST00000621123 1971 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
HOXB1P14653 TCEA1-201ENST00000396401 2718 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
HOXB1P14653 ACHE-202ENST00000302913 2956 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
HOXB1P14653 CARNS1-202ENST00000445895 3971 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
HOXB1P14653 TRAF3IP1-202ENST00000391993 4003 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
HOXB1P14653 TSR2-201ENST00000375151 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
HOXB1P14653 NANS-201ENST00000210444 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
HOXB1P14653 MRPL34-201ENST00000252602 968 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
HOXB1P14653 ZNHIT1-201ENST00000305105 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
HOXB1P14653 AC083799.1-201ENST00000366451 910 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
HOXB1P14653 GNMT-201ENST00000372808 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
HOXB1P14653 KCNAB2-205ENST00000378092 1202 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
HOXB1P14653 AL591212.1-201ENST00000433646 615 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
HOXB1P14653 TSTD3-201ENST00000452647 962 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
HOXB1P14653 AL133343.2-201ENST00000457213 370 ntTSL 3 BASIC15.35■□□□□ 0.05
HOXB1P14653 ACP6-203ENST00000487562 1258 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
HOXB1P14653 MCCC2-205ENST00000509358 1214 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
HOXB1P14653 TMEM41B-203ENST00000527813 803 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
HOXB1P14653 AP000721.2-201ENST00000537170 650 ntTSL 4 BASIC15.35■□□□□ 0.05
HOXB1P14653 REXO2-206ENST00000539275 710 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
HOXB1P14653 MRPL21-208ENST00000567045 932 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
HOXB1P14653 STK25P1-201ENST00000585406 838 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
HOXB1P14653 MTDHP3-201ENST00000594186 672 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
HOXB1P14653 AC097376.1-201ENST00000602907 997 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
HOXB1P14653 AL121912.1-201ENST00000603683 238 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
HOXB1P14653 AC064862.7-201ENST00000604520 867 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
HOXB1P14653 AC008608.2-201ENST00000606089 416 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
HOXB1P14653 C8orf59-207ENST00000611854 563 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
HOXB1P14653 STATH-208ENST00000615994 598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
HOXB1P14653 AL139288.1-201ENST00000623748 933 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
HOXB1P14653 AC073592.4-201ENST00000623827 446 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
HOXB1P14653 AC073592.5-201ENST00000624854 528 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
HOXB1P14653 NRXN1-234ENST00000630656 837 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
HOXB1P14653 SCYL1-203ENST00000420247 2583 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
HOXB1P14653 AL118508.1-201ENST00000613502 2345 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
HOXB1P14653 ETFBKMT-202ENST00000395763 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
HOXB1P14653 PDCD2-208ENST00000541970 3378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
HOXB1P14653 VASH1-201ENST00000167106 5728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
HOXB1P14653 ENC1-201ENST00000302351 5520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
HOXB1P14653 CHD1L-203ENST00000369259 2358 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
HOXB1P14653 BBC3-201ENST00000300880 1347 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
HOXB1P14653 RBPMS-204ENST00000397323 2941 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
HOXB1P14653 ISG20-201ENST00000306072 1856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
HOXB1P14653 NAT9-201ENST00000357814 1875 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
HOXB1P14653 MPP2-206ENST00000518766 1896 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
HOXB1P14653 CCR7-203ENST00000579344 1874 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
HOXB1P14653 MIPEP-201ENST00000382172 2400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
HOXB1P14653 PTGES2-201ENST00000277462 1614 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
HOXB1P14653 P2RX5-209ENST00000552276 1642 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
HOXB1P14653 APLP2-210ENST00000528499 2530 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
HOXB1P14653 MOV10L1-203ENST00000395852 1422 ntTSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
HOXB1P14653 KRT8P10-201ENST00000450021 1447 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
HOXB1P14653 ILF3-203ENST00000449870 6119 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
HOXB1P14653 WSCD1-209ENST00000574232 2129 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
HOXB1P14653 TMUB2-213ENST00000589856 1505 ntTSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
HOXB1P14653 AMIGO2-202ENST00000429635 3058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
HOXB1P14653 ALPPL2-201ENST00000295453 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
HOXB1P14653 LINC00271-201ENST00000421378 1580 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
HOXB1P14653 HR-202ENST00000381418 6336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
HOXB1P14653 AKR1C7P-201ENST00000305623 895 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
HOXB1P14653 TYMS-202ENST00000323250 693 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
HOXB1P14653 PSMA7-201ENST00000370858 925 ntTSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
HOXB1P14653 AL020989.1-201ENST00000422979 469 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
HOXB1P14653 AL596442.1-201ENST00000429305 429 ntTSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
HOXB1P14653 NKTR-203ENST00000442970 646 ntTSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30.4 ms