Protein–RNA interactions for Protein: P13765

HLA-DOB, HLA class II histocompatibility antigen, DO beta chain, humanhuman

Predictions only

Length 273 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HLA-DOBP13765 MTHFD1L-211ENST00000611279 3475 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
HLA-DOBP13765 XXYLT1-205ENST00000437101 2149 ntTSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
HLA-DOBP13765 CDKN1A-204ENST00000448526 2104 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.4■□□□□ 0.06
HLA-DOBP13765 AC016757.1-205ENST00000470346 1888 ntTSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
HLA-DOBP13765 RNF217-211ENST00000560949 5145 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
HLA-DOBP13765 AL121761.2-201ENST00000598007 1648 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
HLA-DOBP13765 HRASLS5-206ENST00000540857 3032 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
HLA-DOBP13765 SQOR-208ENST00000568606 1792 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
HLA-DOBP13765 EWSR1-206ENST00000397938 2654 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
HLA-DOBP13765 RSPH14-201ENST00000216036 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
HLA-DOBP13765 MCL1-201ENST00000307940 1110 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
HLA-DOBP13765 TOR3A-201ENST00000352445 1182 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
HLA-DOBP13765 PRSS38-201ENST00000366757 1267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
HLA-DOBP13765 C6orf48-203ENST00000375638 847 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
HLA-DOBP13765 C6orf48-207ENST00000375642 962 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
HLA-DOBP13765 CMTM2-202ENST00000379486 904 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
HLA-DOBP13765 AC078883.2-201ENST00000441212 558 ntTSL 3 BASIC15.4■□□□□ 0.06
HLA-DOBP13765 TM4SF19-TCTEX1D2-201ENST00000442633 964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
HLA-DOBP13765 S100A2-206ENST00000497140 697 ntTSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
HLA-DOBP13765 TMEM218-203ENST00000526175 972 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.4■□□□□ 0.06
HLA-DOBP13765 PLPP5-214ENST00000531823 875 ntTSL 3 BASIC15.4■□□□□ 0.06
HLA-DOBP13765 MTUS2-205ENST00000542829 1165 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
HLA-DOBP13765 PSME1-205ENST00000559123 1033 ntTSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
HLA-DOBP13765 MRPL21-208ENST00000567045 932 ntTSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
HLA-DOBP13765 TRAF7-205ENST00000567653 666 ntTSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
HLA-DOBP13765 FGF11-204ENST00000575235 928 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
HLA-DOBP13765 LINC01956-202ENST00000584273 612 ntTSL 3 BASIC15.4■□□□□ 0.06
HLA-DOBP13765 SYNGR2-202ENST00000585591 949 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
HLA-DOBP13765 AC008608.2-201ENST00000606089 416 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
HLA-DOBP13765 IFNL4P1-201ENST00000607083 540 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
HLA-DOBP13765 NOL12-207ENST00000611699 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
HLA-DOBP13765 AL355877.3-201ENST00000622820 899 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
HLA-DOBP13765 NPAS4-204ENST00000639555 878 ntTSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
HLA-DOBP13765 AL356309.3-201ENST00000624132 1934 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
HLA-DOBP13765 TEF-201ENST00000266304 4394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
HLA-DOBP13765 CCDC154-202ENST00000409671 2561 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
HLA-DOBP13765 CBSL-202ENST00000617706 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
HLA-DOBP13765 AC068888.1-203ENST00000546566 1650 ntTSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
HLA-DOBP13765 JMY-201ENST00000396137 9042 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
HLA-DOBP13765 NFATC2-206ENST00000609943 5690 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
HLA-DOBP13765 CD72-211ENST00000612238 1424 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
HLA-DOBP13765 LINC01569-202ENST00000573042 2093 ntTSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
HLA-DOBP13765 C4orf50-202ENST00000531445 6860 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
HLA-DOBP13765 CSNK1D-204ENST00000398519 1580 ntTSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
HLA-DOBP13765 SLC18B1-201ENST00000275227 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
HLA-DOBP13765 CACNA1A-238ENST00000637276 7135 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
HLA-DOBP13765 EIF4A1-203ENST00000577269 1319 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
HLA-DOBP13765 XKR7-201ENST00000562532 7844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
HLA-DOBP13765 AD000671.3-202ENST00000591091 1712 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
HLA-DOBP13765 AL357673.1-201ENST00000637610 2542 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
HLA-DOBP13765 LDLRAP1-201ENST00000374338 2940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
HLA-DOBP13765 L2HGDH-202ENST00000267436 6414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
HLA-DOBP13765 ADCYAP1R1-203ENST00000409363 1889 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
HLA-DOBP13765 CFL1-203ENST00000525451 1878 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
HLA-DOBP13765 SLC39A7-202ENST00000374677 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
HLA-DOBP13765 ARFRP1-212ENST00000618838 1623 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
HLA-DOBP13765 TADA1-201ENST00000367874 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
HLA-DOBP13765 SH3BP4-202ENST00000392011 5194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
HLA-DOBP13765 HPN-202ENST00000392226 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
HLA-DOBP13765 OVOL1-203ENST00000532448 1774 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
HLA-DOBP13765 CAMK2D-201ENST00000296402 5820 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
HLA-DOBP13765 TSC2-222ENST00000568454 5434 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
HLA-DOBP13765 CMTM1-204ENST00000336328 606 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
HLA-DOBP13765 IPPK-202ENST00000375522 882 ntTSL 3 BASIC15.39■□□□□ 0.05
HLA-DOBP13765 GOSR2-202ENST00000393456 788 ntTSL 3 BASIC15.39■□□□□ 0.05
HLA-DOBP13765 HDAC11-202ENST00000402259 1000 ntTSL 3 BASIC15.39■□□□□ 0.05
HLA-DOBP13765 AL022314.1-201ENST00000414203 464 ntTSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
HLA-DOBP13765 LINC00982-205ENST00000420957 435 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
HLA-DOBP13765 ACTG1P4-201ENST00000425123 1122 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
HLA-DOBP13765 EEF1E1-202ENST00000429723 562 ntTSL 3 BASIC15.39■□□□□ 0.05
HLA-DOBP13765 FGFR3P6-201ENST00000457012 610 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
HLA-DOBP13765 AC034243.1-201ENST00000520838 587 ntTSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
HLA-DOBP13765 KLK12-203ENST00000525263 1077 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
HLA-DOBP13765 AF238378.1-201ENST00000526806 358 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
HLA-DOBP13765 CMTM1-213ENST00000529506 581 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
HLA-DOBP13765 GPHA2-202ENST00000532246 466 ntTSL 3 BASIC15.39■□□□□ 0.05
HLA-DOBP13765 SART3-203ENST00000546611 1184 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
HLA-DOBP13765 AC092725.1-201ENST00000565783 499 ntTSL 4 BASIC15.39■□□□□ 0.05
HLA-DOBP13765 AC022150.1-201ENST00000599222 640 ntTSL 3 BASIC15.39■□□□□ 0.05
HLA-DOBP13765 AL590235.2-202ENST00000602543 594 ntTSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
HLA-DOBP13765 AC064862.7-201ENST00000604520 867 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
HLA-DOBP13765 SMN2-213ENST00000614240 804 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
HLA-DOBP13765 SUZ12-204ENST00000580398 3977 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
HLA-DOBP13765 STX3-203ENST00000529177 1571 ntTSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
HLA-DOBP13765 ADAMTSL5-201ENST00000330475 2857 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
HLA-DOBP13765 HIST1H2BN-204ENST00000612898 1723 ntAPPRIS P1 BASIC15.39■□□□□ 0.05
HLA-DOBP13765 LYPLAL1-202ENST00000366928 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
HLA-DOBP13765 DYDC2-202ENST00000372197 2022 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
HLA-DOBP13765 CEP120-201ENST00000306467 4900 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
HLA-DOBP13765 AC011473.4-202ENST00000250366 1602 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
HLA-DOBP13765 ZNF773-201ENST00000282292 2206 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
HLA-DOBP13765 CCZ1-207ENST00000628813 2218 ntTSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
HLA-DOBP13765 PDPK2P-201ENST00000382326 2387 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
HLA-DOBP13765 MGAT2-201ENST00000305386 2687 ntAPPRIS P1 BASIC15.39■□□□□ 0.05
HLA-DOBP13765 FER1L4-210ENST00000615531 5998 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
HLA-DOBP13765 TPBG-203ENST00000543496 2881 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
HLA-DOBP13765 CRELD1-201ENST00000326434 1994 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
HLA-DOBP13765 FTCDNL1-204ENST00000622774 1997 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
HLA-DOBP13765 GNAI2-204ENST00000440628 1663 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
HLA-DOBP13765 PAN3-AS1-201ENST00000563843 1351 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30.3 ms