Protein–RNA interactions for Protein: P05000

IFNW1, Interferon omega-1, humanhuman

Predictions only

Length 195 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
IFNW1P05000 HMGXB3-202ENST00000503427 5275 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
IFNW1P05000 PELP1-208ENST00000572293 5272 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
IFNW1P05000 PRMT1-202ENST00000454376 1327 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
IFNW1P05000 BEND4-203ENST00000611697 1348 ntTSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
IFNW1P05000 PIR-202ENST00000380421 1539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
IFNW1P05000 FUT8-AS1-201ENST00000621019 1521 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
IFNW1P05000 DNAJA3-201ENST00000262375 2763 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
IFNW1P05000 CA7-202ENST00000394069 1713 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
IFNW1P05000 TXNDC11-202ENST00000356957 3178 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
IFNW1P05000 ACE-204ENST00000428043 5120 ntTSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
IFNW1P05000 LRRC14-205ENST00000529022 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
IFNW1P05000 LIMS2-208ENST00000410011 2335 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
IFNW1P05000 CHKA-201ENST00000265689 2530 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
IFNW1P05000 SLC29A2-202ENST00000357440 2514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
IFNW1P05000 STUM-201ENST00000366788 7705 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
IFNW1P05000 FBXL16-202ENST00000397621 3547 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
IFNW1P05000 IGLL1-201ENST00000249053 716 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
IFNW1P05000 GLRX2-201ENST00000367439 701 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
IFNW1P05000 MRPL23-201ENST00000381514 919 ntTSL 3 BASIC15.94■□□□□ 0.14
IFNW1P05000 AL645929.1-201ENST00000420084 975 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
IFNW1P05000 SPDYE13P-201ENST00000445314 798 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
IFNW1P05000 MOGAT1-201ENST00000446656 1048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
IFNW1P05000 RN7SL606P-201ENST00000472779 293 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
IFNW1P05000 AL353801.3-201ENST00000609898 542 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
IFNW1P05000 AC006011.2-201ENST00000621313 1158 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
IFNW1P05000 AC073912.3-201ENST00000624414 853 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
IFNW1P05000 ADD1-201ENST00000264758 4045 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
IFNW1P05000 HOXA10-202ENST00000396344 1570 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
IFNW1P05000 AL135999.2-201ENST00000622438 1686 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
IFNW1P05000 MLLT10-203ENST00000377072 5126 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
IFNW1P05000 RANBP3-220ENST00000591092 1783 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
IFNW1P05000 NUP50-202ENST00000396096 1895 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
IFNW1P05000 FOXP1-210ENST00000484350 1996 ntTSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
IFNW1P05000 OTUB1-202ENST00000422031 2297 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
IFNW1P05000 CACNA1G-202ENST00000354983 8138 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
IFNW1P05000 EPHA8-201ENST00000166244 4943 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
IFNW1P05000 SEMA4B-202ENST00000411539 3807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
IFNW1P05000 TLE2-201ENST00000262953 2705 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
IFNW1P05000 WT1-209ENST00000530998 2421 ntTSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
IFNW1P05000 ZNF397-204ENST00000585800 2046 ntTSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
IFNW1P05000 KLHDC3-202ENST00000326974 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
IFNW1P05000 HOXC5-201ENST00000312492 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
IFNW1P05000 AL021453.1-201ENST00000333487 2989 ntTSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
IFNW1P05000 AC091980.2-201ENST00000619056 2775 ntAPPRIS P1 BASIC15.93■□□□□ 0.14
IFNW1P05000 AC092171.3-201ENST00000610122 2651 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
IFNW1P05000 DNAAF1-201ENST00000378553 2379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
IFNW1P05000 GIGYF1-201ENST00000275732 6530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
IFNW1P05000 CFAP100-201ENST00000352312 2086 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
IFNW1P05000 RRBP1-208ENST00000470422 2070 ntTSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
IFNW1P05000 RAPGEFL1-209ENST00000544503 2079 ntTSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
IFNW1P05000 USP3-AS1-201ENST00000558831 1784 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
IFNW1P05000 MRPS5-201ENST00000272418 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
IFNW1P05000 RIMS1-210ENST00000491071 5047 ntTSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
IFNW1P05000 NRXN1-204ENST00000401669 5870 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
IFNW1P05000 PRAMEF20-201ENST00000316412 1597 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
IFNW1P05000 PPP1R26-205ENST00000605286 4744 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.93■□□□□ 0.14
IFNW1P05000 AC009336.1-201ENST00000608941 1553 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
IFNW1P05000 ADRA1A-204ENST00000380573 2548 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
IFNW1P05000 GPR89P-201ENST00000407924 1495 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
IFNW1P05000 AL353593.2-201ENST00000602529 1483 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
IFNW1P05000 KIAA1217-206ENST00000376462 6123 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
IFNW1P05000 METTL5-201ENST00000260953 1010 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
IFNW1P05000 PLCB1-204ENST00000404098 1260 ntTSL 3 BASIC15.93■□□□□ 0.14
IFNW1P05000 ELF3-AS1-202ENST00000419190 788 ntTSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
IFNW1P05000 CAMTA1-IT1-201ENST00000427317 365 ntTSL 3 BASIC15.93■□□□□ 0.14
IFNW1P05000 TSPY22P-201ENST00000427496 604 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
IFNW1P05000 BPHL-208ENST00000434640 1186 ntTSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
IFNW1P05000 AP001059.1-201ENST00000442785 523 ntTSL 3 BASIC15.93■□□□□ 0.14
IFNW1P05000 MHENCR-202ENST00000449500 801 ntTSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
IFNW1P05000 RPL29-204ENST00000479017 670 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.93■□□□□ 0.14
IFNW1P05000 PACRGL-218ENST00000507634 1142 ntTSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
IFNW1P05000 STK19B-204ENST00000512515 211 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
IFNW1P05000 TMEM33-208ENST00000513702 1092 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
IFNW1P05000 AL157871.1-202ENST00000556458 478 ntTSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
IFNW1P05000 AC090970.2-201ENST00000561318 865 ntTSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
IFNW1P05000 ATP6V0C-202ENST00000564973 1081 ntTSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
IFNW1P05000 AC011840.4-201ENST00000578471 627 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
IFNW1P05000 LINC00092-202ENST00000580908 580 ntTSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
IFNW1P05000 AC090616.6-201ENST00000582640 721 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
IFNW1P05000 AC083849.1-201ENST00000615227 514 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
IFNW1P05000 HDAC5-201ENST00000225983 5326 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
IFNW1P05000 PCDH8P1-201ENST00000428983 2773 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
IFNW1P05000 ZNF644-201ENST00000337393 5763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
IFNW1P05000 NIPA2-201ENST00000337451 3233 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
IFNW1P05000 KIF5C-201ENST00000435030 6931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
IFNW1P05000 SLC39A13-202ENST00000362021 2296 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
IFNW1P05000 SENP1-204ENST00000549518 2260 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
IFNW1P05000 ZNF296-202ENST00000622376 1631 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
IFNW1P05000 MFSD11-202ENST00000355954 2832 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
IFNW1P05000 AC079328.2-201ENST00000561241 3354 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
IFNW1P05000 PYCR2-208ENST00000612039 1549 ntTSL 3 BASIC15.93■□□□□ 0.14
IFNW1P05000 PYCR2-209ENST00000612651 1538 ntTSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
IFNW1P05000 AGTPBP1-201ENST00000337006 4473 ntTSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
IFNW1P05000 FAM214B-206ENST00000603301 3256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
IFNW1P05000 HAGH-202ENST00000397356 2984 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
IFNW1P05000 POC1A-201ENST00000296484 1898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
IFNW1P05000 NTMT1-203ENST00000372483 1315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
IFNW1P05000 CCDC74A-206ENST00000467992 1347 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
IFNW1P05000 CHAD-203ENST00000508540 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
IFNW1P05000 ETV4-205ENST00000545954 1775 ntTSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.3 ms