Protein–RNA interactions for Protein: P04180

LCAT, Phosphatidylcholine-sterol acyltransferase, humanhuman

Predictions only

Length 440 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LCATP04180 WDFY4-202ENST00000360890 2193 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
LCATP04180 KCNV2-201ENST00000382082 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
LCATP04180 TMEM198B-203ENST00000482378 2230 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
LCATP04180 MEI1-215ENST00000540833 2326 ntTSL 5 BASIC15.05■□□□□ 0
LCATP04180 ASXL1-210ENST00000613218 7038 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ 0
LCATP04180 RIC8B-203ENST00000392839 2440 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
LCATP04180 AC022211.2-201ENST00000585075 2527 ntBASIC15.05■□□□□ 0
LCATP04180 LUC7L2-202ENST00000354926 2645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
LCATP04180 PCDHGC5-202ENST00000610789 2763 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.05■□□□□ 0
LCATP04180 SLC22A3-201ENST00000275300 3348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
LCATP04180 CACNG7-201ENST00000222212 1016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
LCATP04180 PSMA7-201ENST00000370858 925 ntTSL 2 BASIC15.05■□□□□ -0
LCATP04180 PSMA7-203ENST00000370873 996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
LCATP04180 FOSL1P1-201ENST00000511041 816 ntBASIC15.05■□□□□ -0
LCATP04180 FAM53C-211ENST00000513056 923 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
LCATP04180 CTDNEP1-207ENST00000572043 857 ntTSL 3 BASIC15.05■□□□□ -0
LCATP04180 AL162497.1-201ENST00000615635 518 ntTSL 4 BASIC15.05■□□□□ -0
LCATP04180 ARHGAP8-201ENST00000336963 1487 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
LCATP04180 PEX13-204ENST00000444100 1533 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
LCATP04180 ETV7-207ENST00000620358 1599 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
LCATP04180 LINC02012-201ENST00000608206 1725 ntBASIC15.05■□□□□ -0
LCATP04180 RANBP3-220ENST00000591092 1783 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
LCATP04180 PTPRS-205ENST00000588012 5993 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
LCATP04180 SLC44A3-207ENST00000529450 2045 ntTSL 2 BASIC15.05■□□□□ -0
LCATP04180 CCDC112-205ENST00000506442 2145 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.05■□□□□ -0
LCATP04180 PML-206ENST00000395135 2199 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
LCATP04180 TMEM50B-210ENST00000542230 2375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
LCATP04180 CSTB-204ENST00000640406 2354 ntTSL 2 BASIC15.05■□□□□ -0
LCATP04180 NFATC4-215ENST00000554661 2631 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
LCATP04180 RNF187-201ENST00000305943 3017 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
LCATP04180 TBC1D9B-202ENST00000356834 5173 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
LCATP04180 COG5-203ENST00000393603 5418 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
LCATP04180 GFOD1-203ENST00000379287 8751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
LCATP04180 H2AFV-201ENST00000222690 3804 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
LCATP04180 RABL6-203ENST00000371663 3078 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
LCATP04180 C5orf30-201ENST00000319933 3049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
LCATP04180 PAPD5-203ENST00000561678 2916 ntTSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
LCATP04180 VASN-201ENST00000304735 2806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
LCATP04180 AC011270.2-201ENST00000624293 2550 ntBASIC15.04■□□□□ -0
LCATP04180 FLJ16779-201ENST00000612722 7638 ntBASIC15.04■□□□□ -0
LCATP04180 ICA1-201ENST00000265577 2309 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
LCATP04180 RCAN3-202ENST00000374395 6802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
LCATP04180 FOSB-209ENST00000590335 2170 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
LCATP04180 CFAP100-201ENST00000352312 2086 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
LCATP04180 F12-201ENST00000253496 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
LCATP04180 PPARD-202ENST00000337400 2041 ntTSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
LCATP04180 BATF2-202ENST00000435842 1949 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
LCATP04180 SPDEF-201ENST00000374037 1895 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
LCATP04180 PTHLH-205ENST00000535992 1891 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
LCATP04180 NFATC4-203ENST00000422617 5491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
LCATP04180 CELF6-204ENST00000543764 1676 ntTSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
LCATP04180 WTAP-205ENST00000614346 1623 ntTSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
LCATP04180 CHAC1-204ENST00000617768 1560 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
LCATP04180 OTUD5-204ENST00000428668 1493 ntTSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
LCATP04180 KCNMA1-251ENST00000639090 4319 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
LCATP04180 SOD2-201ENST00000337404 991 ntTSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
LCATP04180 EDN3-203ENST00000371025 1153 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
LCATP04180 RASGRP2-208ENST00000394428 444 ntTSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
LCATP04180 NAT6-202ENST00000417393 1163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
LCATP04180 AL020989.1-201ENST00000422979 469 ntBASIC15.04■□□□□ -0
LCATP04180 ABCD1P5-201ENST00000445663 754 ntBASIC15.04■□□□□ -0
LCATP04180 SIGLEC30P-201ENST00000455569 941 ntBASIC15.04■□□□□ -0
LCATP04180 ST20-202ENST00000485386 529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
LCATP04180 ZFPM1-205ENST00000569086 563 ntTSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
LCATP04180 AC008105.3-202ENST00000585471 1077 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
LCATP04180 GPX4-210ENST00000611653 793 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
LCATP04180 AL732314.6-201ENST00000627721 484 ntTSL 4 BASIC15.04■□□□□ -0
LCATP04180 PPP1R16B-201ENST00000299824 6251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
LCATP04180 RASA4-202ENST00000449970 2787 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
LCATP04180 OR2C3-203ENST00000617752 2481 ntAPPRIS P1 BASIC15.04■□□□□ -0
LCATP04180 MXD4-201ENST00000337190 4056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
LCATP04180 ORAOV1-206ENST00000536870 2274 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
LCATP04180 HMGXB3-202ENST00000503427 5275 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
LCATP04180 PBK-201ENST00000301905 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
LCATP04180 LRRTM1-202ENST00000409148 2126 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC15.04■□□□□ -0
LCATP04180 UBR3-201ENST00000272793 8005 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
LCATP04180 TMEM145-201ENST00000301204 1768 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
LCATP04180 SELENBP1-201ENST00000368868 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
LCATP04180 NUDT9-201ENST00000302174 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
LCATP04180 SETD3-202ENST00000331768 2878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
LCATP04180 ARL6IP6-201ENST00000326446 2805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
LCATP04180 SWSAP1-201ENST00000312423 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
LCATP04180 MRPS30-202ENST00000507110 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
LCATP04180 AL121761.2-201ENST00000598007 1648 ntBASIC15.03■□□□□ -0
LCATP04180 SERPINB6-207ENST00000612421 1570 ntTSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
LCATP04180 PIR-202ENST00000380421 1539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
LCATP04180 P2RY6-204ENST00000393592 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
LCATP04180 B4GALT4-216ENST00000483209 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
LCATP04180 C3orf58-201ENST00000315691 4346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
LCATP04180 KXD1-201ENST00000222307 1426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
LCATP04180 IQSEC3-203ENST00000538872 7094 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
LCATP04180 NEK3-206ENST00000611833 2345 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
LCATP04180 NDRG4-202ENST00000356752 1375 ntTSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
LCATP04180 THAP3-201ENST00000054650 1366 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
LCATP04180 PFN2-201ENST00000239940 2261 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
LCATP04180 MITF-204ENST00000352241 4814 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
LCATP04180 MOB3B-201ENST00000262244 6454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
LCATP04180 RHBDF1-201ENST00000262316 2992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
LCATP04180 PSCA-201ENST00000301258 1020 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
LCATP04180 ID2-202ENST00000331129 623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 37.9 ms