Protein–RNA interactions for Protein: P02649

APOE, Apolipoprotein E, humanhuman

Predictions only

Length 317 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
APOEP02649 PIP5K1C-205ENST00000589578 2933 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
APOEP02649 MFSD11-219ENST00000593181 1922 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
APOEP02649 HTR1A-201ENST00000323865 1778 ntAPPRIS P1 BASIC18.02■□□□□ 0.47
APOEP02649 MAP3K6-202ENST00000374040 4309 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
APOEP02649 HLA-A-201ENST00000376802 1334 ntBASIC18.01■□□□□ 0.47
APOEP02649 NUDT9-201ENST00000302174 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
APOEP02649 DHCR7-201ENST00000355527 2666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
APOEP02649 TNIP1-208ENST00000520931 2680 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
APOEP02649 PARVG-205ENST00000422871 3462 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
APOEP02649 HPGD-213ENST00000541923 2920 ntTSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
APOEP02649 C16orf89-202ENST00000472572 1444 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
APOEP02649 DTX2-206ENST00000430490 2623 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
APOEP02649 TFF3-201ENST00000291525 407 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
APOEP02649 HINT1-201ENST00000304043 1081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
APOEP02649 TBC1D7-202ENST00000356436 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
APOEP02649 INIP-202ENST00000374236 874 ntTSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
APOEP02649 TBC1D7-204ENST00000379300 1276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
APOEP02649 CCDC74A-202ENST00000409856 1298 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
APOEP02649 NDUFB2-209ENST00000472695 503 ntTSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
APOEP02649 AP000688.1-201ENST00000535199 1221 ntTSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
APOEP02649 AK2-210ENST00000548033 936 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
APOEP02649 ADAM10-217ENST00000561288 583 ntTSL 3 BASIC18.01■□□□□ 0.47
APOEP02649 AL022328.2-201ENST00000608016 640 ntTSL 3 BASIC18.01■□□□□ 0.47
APOEP02649 CDK2AP1-207ENST00000618072 1144 ntTSL 3 BASIC18.01■□□□□ 0.47
APOEP02649 AC008735.5-201ENST00000623544 497 ntBASIC18.01■□□□□ 0.47
APOEP02649 LIN28B-AS1-205ENST00000637414 879 ntTSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
APOEP02649 AL135999.2-201ENST00000622438 1686 ntBASIC18.01■□□□□ 0.47
APOEP02649 SLC22A18AS-203ENST00000625099 1659 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
APOEP02649 TBXAS1-210ENST00000458722 2057 ntTSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
APOEP02649 ABHD14B-206ENST00000483233 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
APOEP02649 IL12RB2-202ENST00000371000 2454 ntTSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
APOEP02649 OPN5-204ENST00000489301 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
APOEP02649 DPF3-204ENST00000546183 1514 ntTSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
APOEP02649 MIF4GD-204ENST00000577542 1531 ntTSL 3 BASIC18.01■□□□□ 0.47
APOEP02649 CHTOP-203ENST00000368690 2165 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
APOEP02649 LTBP4-205ENST00000396819 4764 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
APOEP02649 PITHD1-201ENST00000246151 1603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
APOEP02649 GHRHR-205ENST00000409904 1613 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
APOEP02649 AD000864.1-201ENST00000624076 2295 ntBASIC18.01■□□□□ 0.47
APOEP02649 MED17-201ENST00000251871 5142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
APOEP02649 CCDC112-205ENST00000506442 2145 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
APOEP02649 ZRSR2-201ENST00000307771 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
APOEP02649 BTG3-202ENST00000348354 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
APOEP02649 SETD3-202ENST00000331768 2878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
APOEP02649 TRIM17-204ENST00000366698 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
APOEP02649 MOB3A-201ENST00000357066 3391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
APOEP02649 AP3D1-201ENST00000345016 4870 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
APOEP02649 YIPF2-204ENST00000586748 1550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
APOEP02649 ACTN4-201ENST00000252699 4963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
APOEP02649 RTKN2-203ENST00000395260 2076 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
APOEP02649 KCMF1-201ENST00000409785 7568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
APOEP02649 TMEM37-201ENST00000306406 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
APOEP02649 CRTC3-208ENST00000560098 1421 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
APOEP02649 CD24-204ENST00000619133 2513 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
APOEP02649 EN2-201ENST00000297375 3395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
APOEP02649 PELI2-201ENST00000267460 5909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
APOEP02649 NR2F1-201ENST00000327111 3732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
APOEP02649 PIR-202ENST00000380421 1539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
APOEP02649 DNM1-202ENST00000372923 3244 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
APOEP02649 AC134772.1-202ENST00000435578 549 ntTSL 4 BASIC18■□□□□ 0.47
APOEP02649 IDH3B-206ENST00000474315 1279 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
APOEP02649 AC067930.3-201ENST00000524808 701 ntTSL 3 BASIC18■□□□□ 0.47
APOEP02649 EEF1D-238ENST00000531621 840 ntTSL 3 BASIC18■□□□□ 0.47
APOEP02649 BLOC1S6-202ENST00000562384 494 ntTSL 4 BASIC18■□□□□ 0.47
APOEP02649 AL590235.2-202ENST00000602543 594 ntTSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
APOEP02649 GPX4-212ENST00000616066 924 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
APOEP02649 OSBP2-202ENST00000401475 2468 ntTSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
APOEP02649 BUB3-201ENST00000368858 1361 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
APOEP02649 GGT5-201ENST00000263112 2334 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
APOEP02649 TTC8-202ENST00000345383 2329 ntTSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
APOEP02649 AP003071.5-201ENST00000641568 2695 ntAPPRIS P1 BASIC18■□□□□ 0.47
APOEP02649 RAB33B-201ENST00000305626 4562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
APOEP02649 DIP2A-204ENST00000457905 3044 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
APOEP02649 NKX2-2-201ENST00000377142 2092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
APOEP02649 LAMC1-201ENST00000258341 7889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
APOEP02649 KDM6A-211ENST00000536777 5633 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
APOEP02649 SEMA3B-204ENST00000433753 2755 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
APOEP02649 HOXA2-201ENST00000222718 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
APOEP02649 SUSD4-208ENST00000494793 1833 ntTSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
APOEP02649 LMNA-205ENST00000368299 2253 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
APOEP02649 BRPF1-201ENST00000383829 4736 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
APOEP02649 ATXN7-210ENST00000487717 3683 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
APOEP02649 ARHGAP4-204ENST00000393721 2721 ntTSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
APOEP02649 OR6D1P-203ENST00000641209 4860 ntBASIC17.99■□□□□ 0.47
APOEP02649 IGSF8-201ENST00000314485 2343 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
APOEP02649 PTP4A3-201ENST00000329397 2785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
APOEP02649 HNRNPLL-202ENST00000358367 2779 ntTSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
APOEP02649 BCL2L11-201ENST00000308659 1522 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
APOEP02649 KCNJ2-AS1-201ENST00000590966 2442 ntBASIC17.99■□□□□ 0.47
APOEP02649 COL8A2-202ENST00000397799 4670 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
APOEP02649 SLC2A6-202ENST00000371899 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
APOEP02649 AC022211.2-201ENST00000585075 2527 ntBASIC17.99■□□□□ 0.47
APOEP02649 AC125494.1-203ENST00000396799 1622 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
APOEP02649 CNTNAP3-201ENST00000297668 5064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
APOEP02649 NPRL2-201ENST00000232501 1700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
APOEP02649 SERF1B-202ENST00000380751 703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
APOEP02649 ACTG1P4-201ENST00000425123 1122 ntBASIC17.99■□□□□ 0.47
APOEP02649 TCTN1-208ENST00000471804 718 ntTSL 3 BASIC17.99■□□□□ 0.47
APOEP02649 H2AFJ-203ENST00000544848 644 ntAPPRIS P1 BASIC17.99■□□□□ 0.47
APOEP02649 AHSA1-208ENST00000555517 832 ntTSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24.4 ms