Protein–RNA interactions for Protein: O15084

ANKRD28, Serine/threonine-protein phosphatase 6 regulatory ankyrin repeat subunit A, humanhuman

Predictions only

Length 1,053 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ANKRD28O15084 C18orf32-201ENST00000318240 1128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
ANKRD28O15084 UBL5-201ENST00000358666 513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
ANKRD28O15084 AL391650.1-205ENST00000433939 579 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.36■□□□□ 0.21
ANKRD28O15084 PDZD7-203ENST00000470414 1057 ntTSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
ANKRD28O15084 LY6E-209ENST00000521003 740 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
ANKRD28O15084 C1QTNF8-202ENST00000621771 897 ntTSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
ANKRD28O15084 AL121956.5-201ENST00000625261 221 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
ANKRD28O15084 RMND5B-201ENST00000313386 1929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
ANKRD28O15084 BRIX1-201ENST00000336767 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
ANKRD28O15084 LINC00029-201ENST00000370341 1631 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
ANKRD28O15084 AC005332.1-201ENST00000577698 1310 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
ANKRD28O15084 ZNF703-201ENST00000331569 3349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
ANKRD28O15084 LSP1-202ENST00000381775 2016 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
ANKRD28O15084 AC026691.1-201ENST00000602502 2017 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
ANKRD28O15084 MADCAM1-204ENST00000587541 1723 ntTSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
ANKRD28O15084 FAM208A-209ENST00000493960 5600 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
ANKRD28O15084 CHST10-201ENST00000264249 2842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
ANKRD28O15084 TBX4-201ENST00000240335 2470 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
ANKRD28O15084 WIZ-201ENST00000263381 5695 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
ANKRD28O15084 CABP4-202ENST00000438189 1426 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
ANKRD28O15084 XRCC3-209ENST00000554913 2539 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
ANKRD28O15084 C16orf89-203ENST00000474471 1829 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
ANKRD28O15084 LSP1-217ENST00000612798 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
ANKRD28O15084 NRG1-216ENST00000523079 2359 ntTSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
ANKRD28O15084 NEURL1B-201ENST00000369800 6424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
ANKRD28O15084 NIPA2-201ENST00000337451 3233 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
ANKRD28O15084 GGT5-203ENST00000398292 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
ANKRD28O15084 ZNF281-201ENST00000294740 4891 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
ANKRD28O15084 AC148477.5-201ENST00000625164 1645 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
ANKRD28O15084 GLOD4-203ENST00000536578 2497 ntTSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
ANKRD28O15084 NAP1L4-222ENST00000620138 2479 ntTSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
ANKRD28O15084 STXBP1-216ENST00000636962 2918 ntTSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
ANKRD28O15084 PGLS-201ENST00000252603 1028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
ANKRD28O15084 BEX4-201ENST00000372691 1066 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
ANKRD28O15084 STEAP3-204ENST00000409811 2103 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
ANKRD28O15084 NKTR-203ENST00000442970 646 ntTSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
ANKRD28O15084 NUS1P1-201ENST00000446295 882 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
ANKRD28O15084 CDV3-207ENST00000508481 661 ntTSL 3 BASIC16.35■□□□□ 0.21
ANKRD28O15084 AC015712.1-203ENST00000559331 593 ntTSL 3 BASIC16.35■□□□□ 0.21
ANKRD28O15084 AC106782.2-201ENST00000563252 992 ntTSL 3 BASIC16.35■□□□□ 0.21
ANKRD28O15084 FUT6-212ENST00000592563 1095 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
ANKRD28O15084 AL121672.3-201ENST00000608644 468 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
ANKRD28O15084 PCDHGA12-202ENST00000613314 2634 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
ANKRD28O15084 FGFR2-215ENST00000457416 3061 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
ANKRD28O15084 ULBP2-201ENST00000367351 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
ANKRD28O15084 CLDN14-203ENST00000399136 1330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
ANKRD28O15084 ACSF3-204ENST00000406948 2247 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
ANKRD28O15084 AC110813.1-201ENST00000507934 2209 ntTSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
ANKRD28O15084 AC233702.3-201ENST00000578656 1387 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
ANKRD28O15084 PMS1-213ENST00000441310 3225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
ANKRD28O15084 MOV10L1-203ENST00000395852 1422 ntTSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
ANKRD28O15084 FGD5-201ENST00000285046 5720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
ANKRD28O15084 C2orf81-206ENST00000640868 2407 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
ANKRD28O15084 SENP5-201ENST00000323460 6308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
ANKRD28O15084 CXXC1-201ENST00000285106 2936 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
ANKRD28O15084 FOXO3-202ENST00000406360 7341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
ANKRD28O15084 LTF-203ENST00000426532 2494 ntTSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
ANKRD28O15084 ZBTB47-202ENST00000505904 2456 ntTSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
ANKRD28O15084 C11orf68-203ENST00000530188 1528 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
ANKRD28O15084 TMUB2-213ENST00000589856 1505 ntTSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
ANKRD28O15084 VSTM2A-204ENST00000407838 3112 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.34■□□□□ 0.21
ANKRD28O15084 RGS19-202ENST00000395042 1593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
ANKRD28O15084 DLG4-201ENST00000302955 3184 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
ANKRD28O15084 CD276-213ENST00000561213 2690 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
ANKRD28O15084 CDKN1A-201ENST00000244741 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
ANKRD28O15084 SLC25A45-201ENST00000294187 2196 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
ANKRD28O15084 PLK2-215ENST00000617412 2792 ntTSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
ANKRD28O15084 BMPER-201ENST00000297161 5031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
ANKRD28O15084 OTUB1-202ENST00000422031 2297 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
ANKRD28O15084 PCDHGA11-202ENST00000518882 2263 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
ANKRD28O15084 MUTYH-201ENST00000354383 1744 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
ANKRD28O15084 CBWD5-204ENST00000377392 2863 ntTSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
ANKRD28O15084 FBXO21-201ENST00000330622 2906 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
ANKRD28O15084 SRRM2-201ENST00000301740 9353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
ANKRD28O15084 CORO6-202ENST00000388767 2397 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
ANKRD28O15084 WDR20-211ENST00000556807 2382 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
ANKRD28O15084 LINC01502-201ENST00000445997 2471 ntTSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
ANKRD28O15084 ASH1L-207ENST00000548830 1862 ntTSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
ANKRD28O15084 CCDC107-201ENST00000327351 804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
ANKRD28O15084 PPIH-202ENST00000372549 327 ntTSL 3 BASIC16.34■□□□□ 0.21
ANKRD28O15084 ING5-202ENST00000406941 946 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
ANKRD28O15084 PLPP5-202ENST00000422581 853 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
ANKRD28O15084 BX276092.5-203ENST00000456199 560 ntBASIC16.34■□□□□ 0.21
ANKRD28O15084 VENTXP7-201ENST00000475503 772 ntBASIC16.34■□□□□ 0.21
ANKRD28O15084 NAPSB-203ENST00000531692 561 ntTSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
ANKRD28O15084 AC139749.1-201ENST00000534584 1094 ntTSL 3 BASIC16.34■□□□□ 0.21
ANKRD28O15084 AC010632.1-201ENST00000590376 572 ntTSL 4 BASIC16.34■□□□□ 0.21
ANKRD28O15084 IGFLR1-209ENST00000592537 1195 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
ANKRD28O15084 BNIP3P18-201ENST00000593976 575 ntBASIC16.34■□□□□ 0.21
ANKRD28O15084 TBC1D9B-220ENST00000630103 303 ntTSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
ANKRD28O15084 LENG8-202ENST00000376514 5146 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
ANKRD28O15084 CALD1-204ENST00000417172 1915 ntTSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
ANKRD28O15084 KANK1-204ENST00000382293 5249 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
ANKRD28O15084 AKIRIN1-201ENST00000372984 1330 ntTSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
ANKRD28O15084 ZC3H12A-201ENST00000373087 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
ANKRD28O15084 CTNNB1-210ENST00000453024 2841 ntTSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
ANKRD28O15084 CFC1B-203ENST00000620207 1444 ntTSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
ANKRD28O15084 CFC1-203ENST00000621673 1444 ntTSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
ANKRD28O15084 VPS37C-201ENST00000301765 2865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
ANKRD28O15084 CCDC188-201ENST00000439765 1475 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 45.3 ms