Protein–RNA interactions for Protein: O15061

SYNM, Synemin, humanhuman

Predictions only

Length 1,565 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SYNMO15061 ALDH3A1-206ENST00000457500 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
SYNMO15061 KRT6A-201ENST00000330722 2310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
SYNMO15061 KIF1BP-204ENST00000626493 2337 ntTSL 5 BASIC24.44■■□□□ 1.5
SYNMO15061 NPR3-204ENST00000434067 2715 ntTSL 5 BASIC24.44■■□□□ 1.5
SYNMO15061 CERS5-203ENST00000422340 2855 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.44■■□□□ 1.5
SYNMO15061 CDIP1-207ENST00000564828 1636 ntTSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
SYNMO15061 TOP3BP1-201ENST00000420768 1380 ntBASIC24.43■■□□□ 1.5
SYNMO15061 LGMN-201ENST00000334869 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
SYNMO15061 ENTPD6-209ENST00000433259 2654 ntTSL 5 BASIC24.43■■□□□ 1.5
SYNMO15061 AC091729.2-201ENST00000415656 302 ntTSL 3 BASIC24.43■■□□□ 1.5
SYNMO15061 SPTLC1P1-201ENST00000447199 261 ntBASIC24.43■■□□□ 1.5
SYNMO15061 CCDC25-209ENST00000522915 785 ntTSL 3 BASIC24.43■■□□□ 1.5
SYNMO15061 AC105233.2-201ENST00000523697 349 ntBASIC24.43■■□□□ 1.5
SYNMO15061 AF228730.5-201ENST00000530288 346 ntBASIC24.43■■□□□ 1.5
SYNMO15061 EMC4-203ENST00000557879 1009 ntTSL 3 BASIC24.43■■□□□ 1.5
SYNMO15061 AC073389.1-201ENST00000595595 795 ntBASIC24.43■■□□□ 1.5
SYNMO15061 AL132655.2-201ENST00000596276 594 ntBASIC24.43■■□□□ 1.5
SYNMO15061 ADGRA2-202ENST00000412232 5651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
SYNMO15061 PSRC1-201ENST00000369903 1710 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.43■■□□□ 1.5
SYNMO15061 ADRA1A-205ENST00000380582 2089 ntTSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
SYNMO15061 EIF2B5-201ENST00000273783 2655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
SYNMO15061 UBE2I-203ENST00000397514 2976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
SYNMO15061 SDHA-213ENST00000510361 2148 ntTSL 2 BASIC24.43■■□□□ 1.5
SYNMO15061 TRPM2-208ENST00000621064 1669 ntTSL 5 BASIC24.43■■□□□ 1.5
SYNMO15061 AL355312.1-201ENST00000407115 2176 ntBASIC24.43■■□□□ 1.5
SYNMO15061 SLC44A3-207ENST00000529450 2045 ntTSL 2 BASIC24.42■■□□□ 1.5
SYNMO15061 KCNJ5-201ENST00000338350 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
SYNMO15061 ANKS3-201ENST00000304283 2662 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.42■■□□□ 1.5
SYNMO15061 FKBP10-201ENST00000321562 2662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
SYNMO15061 OTOL1-201ENST00000327928 1434 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.42■■□□□ 1.5
SYNMO15061 C12orf10-201ENST00000267103 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
SYNMO15061 TOMM5-201ENST00000321301 751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
SYNMO15061 PIN1P1-201ENST00000412108 996 ntBASIC24.42■■□□□ 1.5
SYNMO15061 AP001471.1-201ENST00000454245 672 ntTSL 3 BASIC24.42■■□□□ 1.5
SYNMO15061 LINC02437-201ENST00000505053 911 ntTSL 3 BASIC24.42■■□□□ 1.5
SYNMO15061 FAM212B-207ENST00000534365 1217 ntTSL 5 BASIC24.42■■□□□ 1.5
SYNMO15061 RARRES2P9-201ENST00000565168 469 ntBASIC24.42■■□□□ 1.5
SYNMO15061 AC004790.1-201ENST00000612686 536 ntBASIC24.42■■□□□ 1.5
SYNMO15061 FAM92A-219ENST00000620645 1014 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.42■■□□□ 1.5
SYNMO15061 GTPBP3-222ENST00000600625 2493 ntTSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
SYNMO15061 GRAP2-202ENST00000407075 1304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
SYNMO15061 CHRM2-201ENST00000320658 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
SYNMO15061 LLGL2-203ENST00000392550 3509 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
SYNMO15061 FAM91A1-207ENST00000521166 2706 ntTSL 2 BASIC24.42■■□□□ 1.5
SYNMO15061 TSPAN7-202ENST00000378482 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
SYNMO15061 NME9-203ENST00000383180 2133 ntTSL 2 BASIC24.42■■□□□ 1.5
SYNMO15061 IFT20-203ENST00000395418 825 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
SYNMO15061 WNT7B-203ENST00000410058 714 ntTSL 3 BASIC24.42■■□□□ 1.5
SYNMO15061 SNHG11-207ENST00000434729 1058 ntTSL 4 BASIC24.42■■□□□ 1.5
SYNMO15061 KRT17P7-201ENST00000451704 1104 ntBASIC24.42■■□□□ 1.5
SYNMO15061 PSMB5-204ENST00000460922 729 ntTSL 2 BASIC24.42■■□□□ 1.5
SYNMO15061 IFT20-216ENST00000588477 774 ntTSL 5 BASIC24.42■■□□□ 1.5
SYNMO15061 EED-202ENST00000327320 2033 ntTSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
SYNMO15061 ORMDL1-203ENST00000392350 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
SYNMO15061 LUC7L2-210ENST00000619796 2783 ntTSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
SYNMO15061 DEF8-225ENST00000569453 1852 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC24.41■■□□□ 1.5
SYNMO15061 SDHA-204ENST00000504309 2067 ntTSL 5 BASIC24.41■■□□□ 1.5
SYNMO15061 AC008764.6-201ENST00000595909 2069 ntBASIC24.41■■□□□ 1.5
SYNMO15061 CDIPT-209ENST00000569956 1532 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.41■■□□□ 1.5
SYNMO15061 GAL3ST1-201ENST00000338911 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
SYNMO15061 SSB-202ENST00000409333 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
SYNMO15061 MXRA8-202ENST00000342753 2231 ntTSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
SYNMO15061 SEPT8-205ENST00000378701 1817 ntTSL 2 BASIC24.41■■□□□ 1.5
SYNMO15061 CDV3-201ENST00000264993 3307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
SYNMO15061 PDLIM1-201ENST00000329399 1452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
SYNMO15061 ANKRD2-203ENST00000370655 1451 ntTSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
SYNMO15061 AC007216.4-201ENST00000574364 562 ntTSL 4 BASIC24.41■■□□□ 1.5
SYNMO15061 ACY1-212ENST00000635797 1294 ntTSL 5 BASIC24.41■■□□□ 1.5
SYNMO15061 EGFL6-202ENST00000380602 2385 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
SYNMO15061 TULP2-201ENST00000221399 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
SYNMO15061 TMEM155-202ENST00000394394 1753 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC24.41■■□□□ 1.5
SYNMO15061 MARVELD3-204ENST00000565261 1351 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
SYNMO15061 AC068944.1-201ENST00000514855 1604 ntTSL 2 BASIC24.4■■□□□ 1.5
SYNMO15061 IRF5-215ENST00000619830 1652 ntTSL 2 BASIC24.4■■□□□ 1.5
SYNMO15061 POLR3D-201ENST00000306433 1931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
SYNMO15061 AC131009.4-201ENST00000624048 1740 ntBASIC24.4■■□□□ 1.5
SYNMO15061 RPS5-202ENST00000596046 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
SYNMO15061 FKBP2-201ENST00000309366 657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
SYNMO15061 FCRLB-204ENST00000367946 1152 ntTSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
SYNMO15061 C9orf24-204ENST00000379127 596 ntTSL 3 BASIC24.4■■□□□ 1.5
SYNMO15061 SLC25A6P5-201ENST00000435663 894 ntBASIC24.4■■□□□ 1.5
SYNMO15061 TMEM33-208ENST00000513702 1092 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.4■■□□□ 1.5
SYNMO15061 LINC00824-206ENST00000523173 920 ntTSL 2 BASIC24.4■■□□□ 1.5
SYNMO15061 AL844908.2-201ENST00000609461 460 ntBASIC24.4■■□□□ 1.5
SYNMO15061 WT1-AS_2.1-201ENST00000613208 137 ntBASIC24.4■■□□□ 1.5
SYNMO15061 RGS3-206ENST00000374136 2092 ntTSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
SYNMO15061 MIB2-231ENST00000518681 3116 ntTSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
SYNMO15061 UCKL1-202ENST00000358711 1845 ntTSL 2 BASIC24.4■■□□□ 1.5
SYNMO15061 LYPLAL1-201ENST00000366927 1819 ntTSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
SYNMO15061 AC073957.2-201ENST00000549241 1562 ntTSL 4 BASIC24.4■■□□□ 1.5
SYNMO15061 SLC44A3-201ENST00000271227 2388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
SYNMO15061 CHRFAM7A-202ENST00000397827 2794 ntTSL 5 BASIC24.4■■□□□ 1.5
SYNMO15061 AC133963.1-201ENST00000504166 1679 ntBASIC24.4■■□□□ 1.5
SYNMO15061 HCK-210ENST00000629881 1969 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.4■■□□□ 1.5
SYNMO15061 BORCS6-201ENST00000389017 2575 ntAPPRIS P1 BASIC24.39■■□□□ 1.5
SYNMO15061 PHYH-202ENST00000396913 1732 ntTSL 5 BASIC24.39■■□□□ 1.5
SYNMO15061 KLK3-201ENST00000326003 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
SYNMO15061 LRRD1-201ENST00000343318 2073 ntTSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
SYNMO15061 KRT86-202ENST00000423955 2217 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.39■■□□□ 1.5
SYNMO15061 ASB12-201ENST00000362002 1289 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.39■■□□□ 1.5
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 51.9 ms