Protein–RNA interactions for Protein: O14727

APAF1, Apoptotic protease-activating factor 1, humanhuman

Predictions only

Length 1,248 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
APAF1O14727 AC098831.1-202ENST00000438821 336 ntBASIC22.56■■□□□ 1.2
APAF1O14727 C9orf147-204ENST00000463223 863 ntTSL 3 BASIC22.56■■□□□ 1.2
APAF1O14727 PENK-208ENST00000523051 772 ntTSL 5 BASIC22.56■■□□□ 1.2
APAF1O14727 SPCS2-207ENST00000530257 612 ntTSL 3 BASIC22.56■■□□□ 1.2
APAF1O14727 MRFAP1-205ENST00000617365 2112 ntTSL 5 BASIC22.56■■□□□ 1.2
APAF1O14727 ADORA1-209ENST00000640524 653 ntTSL 5 BASIC22.56■■□□□ 1.2
APAF1O14727 BCAM-206ENST00000589651 2686 ntTSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
APAF1O14727 MYO15B-232ENST00000610510 9195 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.56■■□□□ 1.2
APAF1O14727 AC068944.1-201ENST00000514855 1604 ntTSL 2 BASIC22.56■■□□□ 1.2
APAF1O14727 AD000864.1-201ENST00000624076 2295 ntBASIC22.56■■□□□ 1.2
APAF1O14727 MCUR1-201ENST00000379170 5471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
APAF1O14727 SLC35G1-202ENST00000427197 2402 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
APAF1O14727 FIP1L1-207ENST00000507922 1335 ntTSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
APAF1O14727 CDH24-204ENST00000487137 3438 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.56■■□□□ 1.2
APAF1O14727 AC020916.1-201ENST00000587762 1774 ntBASIC22.55■■□□□ 1.2
APAF1O14727 PBX2-201ENST00000375050 3205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
APAF1O14727 EIF4H-201ENST00000265753 2679 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC22.55■■□□□ 1.2
APAF1O14727 SMG5-201ENST00000361813 4559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
APAF1O14727 RGS19-202ENST00000395042 1593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
APAF1O14727 CALD1-204ENST00000417172 1915 ntTSL 5 BASIC22.55■■□□□ 1.2
APAF1O14727 ZRSR2-201ENST00000307771 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
APAF1O14727 AC083864.1-201ENST00000381493 1497 ntTSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
APAF1O14727 CHTOP-201ENST00000368686 2250 ntTSL 2 BASIC22.55■■□□□ 1.2
APAF1O14727 GPR137-212ENST00000539851 1843 ntTSL 2 BASIC22.55■■□□□ 1.2
APAF1O14727 FOSB-209ENST00000590335 2170 ntTSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
APAF1O14727 TMEM177-201ENST00000272521 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
APAF1O14727 SLC38A6-202ENST00000354886 1730 ntTSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
APAF1O14727 LINC00887-203ENST00000429578 1717 ntTSL 2 BASIC22.55■■□□□ 1.2
APAF1O14727 DAPK2-202ENST00000457488 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
APAF1O14727 AC079776.4-201ENST00000511039 504 ntBASIC22.55■■□□□ 1.2
APAF1O14727 IGHV3-22-201ENST00000520721 359 ntBASIC22.55■■□□□ 1.2
APAF1O14727 CHMP1A-208ENST00000550102 803 ntTSL 5 BASIC22.55■■□□□ 1.2
APAF1O14727 HIST1H2AK-201ENST00000618958 393 ntAPPRIS P1 BASIC22.55■■□□□ 1.2
APAF1O14727 RNF187-201ENST00000305943 3017 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
APAF1O14727 SERPINH1-201ENST00000358171 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
APAF1O14727 AC105020.1-201ENST00000435356 2205 ntBASIC22.55■■□□□ 1.2
APAF1O14727 NFE2-202ENST00000435572 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
APAF1O14727 SLC27A2-201ENST00000267842 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
APAF1O14727 KCTD2-201ENST00000322444 3635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
APAF1O14727 TBC1D1-203ENST00000402522 1567 ntTSL 2 BASIC22.55■■□□□ 1.2
APAF1O14727 SWAP70-202ENST00000447399 3538 ntTSL 2 BASIC22.54■■□□□ 1.2
APAF1O14727 ANKRD9-201ENST00000286918 6727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
APAF1O14727 REEP4-202ENST00000334530 1476 ntTSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
APAF1O14727 AES-201ENST00000221561 1884 ntTSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
APAF1O14727 IFNGR1-201ENST00000367739 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
APAF1O14727 SFTPB-202ENST00000409383 1867 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
APAF1O14727 ZBTB11-202ENST00000461821 2115 ntTSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
APAF1O14727 CADM3-201ENST00000368124 2546 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
APAF1O14727 USB1-201ENST00000219281 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
APAF1O14727 PAX4-202ENST00000341640 2010 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
APAF1O14727 PIH1D1-201ENST00000262265 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
APAF1O14727 EXOSC3-202ENST00000396521 768 ntTSL 2 BASIC22.54■■□□□ 1.2
APAF1O14727 IGHV3-65-201ENST00000523210 341 ntBASIC22.54■■□□□ 1.2
APAF1O14727 FIBP-212ENST00000533045 1173 ntTSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
APAF1O14727 AC008667.4-201ENST00000607370 168 ntBASIC22.54■■□□□ 1.2
APAF1O14727 ZEB1-AS1-209ENST00000607455 559 ntTSL 4 BASIC22.54■■□□□ 1.2
APAF1O14727 MIR1199-201ENST00000621445 119 ntBASIC22.54■■□□□ 1.2
APAF1O14727 SLC26A1-205ENST00000622731 1057 ntTSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
APAF1O14727 LINC01666-201ENST00000623794 845 ntTSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
APAF1O14727 FBXO33-201ENST00000298097 3853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
APAF1O14727 SNTG2-202ENST00000407292 1436 ntTSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
APAF1O14727 EPB41L3-204ENST00000540638 3370 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
APAF1O14727 SGK3-206ENST00000520976 2483 ntTSL 2 BASIC22.54■■□□□ 1.2
APAF1O14727 TLE3-214ENST00000558939 6004 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
APAF1O14727 FAM66C-209ENST00000544214 2623 ntTSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
APAF1O14727 L1CAM-205ENST00000370060 5113 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
APAF1O14727 TSHZ3-201ENST00000240587 5176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
APAF1O14727 HOXC6-201ENST00000243108 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
APAF1O14727 AC106886.4-201ENST00000623557 2502 ntBASIC22.54■■□□□ 1.2
APAF1O14727 RABL6-203ENST00000371663 3078 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
APAF1O14727 CDKN1B-201ENST00000228872 2657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
APAF1O14727 UQCC3-202ENST00000531323 2288 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.54■■□□□ 1.2
APAF1O14727 PSMC5-202ENST00000375812 1494 ntTSL 2 BASIC22.54■■□□□ 1.2
APAF1O14727 GPR135-201ENST00000395116 4578 ntAPPRIS P1 BASIC22.53■■□□□ 1.2
APAF1O14727 ZNF385A-203ENST00000394313 2430 ntTSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
APAF1O14727 EIF3J-201ENST00000261868 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
APAF1O14727 FCHO1-201ENST00000252771 3118 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.53■■□□□ 1.2
APAF1O14727 ASPH-211ENST00000518068 2744 ntTSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
APAF1O14727 CTD-3080P12.3-203ENST00000514376 1757 ntTSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
APAF1O14727 FAM109A-204ENST00000548163 2317 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.53■■□□□ 1.2
APAF1O14727 DKFZP434K028-202ENST00000536405 2466 ntTSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
APAF1O14727 SHOX-204ENST00000554971 1902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
APAF1O14727 NRG1-216ENST00000523079 2359 ntTSL 2 BASIC22.53■■□□□ 1.2
APAF1O14727 AC132872.2-201ENST00000581303 2368 ntTSL 5 BASIC22.53■■□□□ 1.2
APAF1O14727 EZR-202ENST00000367075 3096 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
APAF1O14727 RTCA-203ENST00000370128 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
APAF1O14727 AL355987.4-201ENST00000415992 4244 ntTSL 2 BASIC22.53■■□□□ 1.2
APAF1O14727 SLC25A6P2-201ENST00000497974 877 ntBASIC22.53■■□□□ 1.2
APAF1O14727 ORAOV1-210ENST00000539414 817 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.53■■□□□ 1.2
APAF1O14727 CIPC-205ENST00000555437 566 ntTSL 3 BASIC22.53■■□□□ 1.2
APAF1O14727 RIN3-211ENST00000557762 517 ntTSL 3 BASIC22.53■■□□□ 1.2
APAF1O14727 AL096870.2-201ENST00000565988 2108 ntTSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
APAF1O14727 SEPHS2-201ENST00000478753 2551 ntAPPRIS P1 BASIC22.53■■□□□ 1.2
APAF1O14727 CFC1-202ENST00000615342 1554 ntTSL 5 BASIC22.53■■□□□ 1.2
APAF1O14727 CFC1B-202ENST00000619050 1554 ntTSL 5 BASIC22.53■■□□□ 1.2
APAF1O14727 DYDC2-202ENST00000372197 2022 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
APAF1O14727 MREG-205ENST00000620139 2618 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.53■■□□□ 1.2
APAF1O14727 RXRB-201ENST00000374680 2908 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
APAF1O14727 SYVN1-203ENST00000377190 3052 ntTSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
APAF1O14727 PCDHB17P-201ENST00000539533 2393 ntBASIC22.53■■□□□ 1.2
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24.4 ms