Protein–RNA interactions for Protein: O00716

E2F3, Transcription factor E2F3, humanhuman

Predictions only

Length 465 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
E2F3O00716 POM121L3P-201ENST00000419331 1163 ntBASIC16.76■□□□□ 0.27
E2F3O00716 NTMT1-205ENST00000459968 1123 ntTSL 2 BASIC16.76■□□□□ 0.27
E2F3O00716 SLC2A1-204ENST00000460369 541 ntTSL 2 BASIC16.76■□□□□ 0.27
E2F3O00716 EIF5A2-203ENST00000474096 570 ntTSL 4 BASIC16.76■□□□□ 0.27
E2F3O00716 NTMT1-207ENST00000482347 1072 ntTSL 2 BASIC16.76■□□□□ 0.27
E2F3O00716 AC104819.1-201ENST00000504587 486 ntBASIC16.76■□□□□ 0.27
E2F3O00716 TMEM33-208ENST00000513702 1092 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
E2F3O00716 ERCC5-207ENST00000535557 1125 ntTSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
E2F3O00716 TUBA1A-203ENST00000546918 984 ntTSL 3 BASIC16.76■□□□□ 0.27
E2F3O00716 TMEM220-AS1-202ENST00000580899 561 ntTSL 4 BASIC16.76■□□□□ 0.27
E2F3O00716 AC008105.3-202ENST00000585471 1077 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
E2F3O00716 IZUMO4-213ENST00000620263 947 ntTSL 3 BASIC16.76■□□□□ 0.27
E2F3O00716 CEP76-202ENST00000423709 2197 ntTSL 2 BASIC16.76■□□□□ 0.27
E2F3O00716 TBPL1-208ENST00000613034 1625 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.76■□□□□ 0.27
E2F3O00716 GUCY1A2-202ENST00000347596 2532 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
E2F3O00716 FGFR1-206ENST00000397091 5702 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
E2F3O00716 CABP4-202ENST00000438189 1426 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
E2F3O00716 ARHGEF25-208ENST00000616622 2103 ntTSL 2 BASIC16.76■□□□□ 0.27
E2F3O00716 SLC8B1-210ENST00000550047 2493 ntTSL 2 BASIC16.76■□□□□ 0.27
E2F3O00716 PNO1-201ENST00000263657 2286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
E2F3O00716 ZNF512B-201ENST00000369888 5919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
E2F3O00716 TACC3-201ENST00000313288 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
E2F3O00716 TBXAS1-206ENST00000425687 2080 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
E2F3O00716 GTPBP8-203ENST00000383678 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
E2F3O00716 LINC02381-201ENST00000508564 1369 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
E2F3O00716 MGAT1-203ENST00000393340 3077 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.76■□□□□ 0.27
E2F3O00716 POC1A-201ENST00000296484 1898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
E2F3O00716 WDR6-202ENST00000415265 1883 ntTSL 2 BASIC16.76■□□□□ 0.27
E2F3O00716 AC016757.1-205ENST00000470346 1888 ntTSL 2 BASIC16.76■□□□□ 0.27
E2F3O00716 AL109955.1-201ENST00000417346 1540 ntTSL 2 BASIC16.75■□□□□ 0.27
E2F3O00716 KCNA7-201ENST00000221444 4372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
E2F3O00716 PTPN18-201ENST00000175756 3669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
E2F3O00716 MYB-205ENST00000367814 3302 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
E2F3O00716 TRIM7-204ENST00000393319 2320 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
E2F3O00716 GPR137-212ENST00000539851 1843 ntTSL 2 BASIC16.75■□□□□ 0.27
E2F3O00716 PRMT1-202ENST00000454376 1327 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
E2F3O00716 LRRC58-201ENST00000295628 7903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
E2F3O00716 CTNNAL1-201ENST00000325551 2490 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
E2F3O00716 ACSM2B-211ENST00000567001 1988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
E2F3O00716 GPR89P-201ENST00000407924 1495 ntBASIC16.75■□□□□ 0.27
E2F3O00716 ZFYVE28-208ENST00000511071 3273 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
E2F3O00716 UBE3A-201ENST00000232165 5051 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
E2F3O00716 ALDH1A3-201ENST00000329841 3924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
E2F3O00716 GJA3-201ENST00000241125 5211 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.75■□□□□ 0.27
E2F3O00716 SLC5A2-201ENST00000330498 2271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
E2F3O00716 CDK4-201ENST00000257904 2076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
E2F3O00716 KRT84-201ENST00000257951 2092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
E2F3O00716 TMEM42-201ENST00000302392 1026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
E2F3O00716 ART5-201ENST00000359918 1241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
E2F3O00716 FUOM-202ENST00000368551 628 ntTSL 3 BASIC16.75■□□□□ 0.27
E2F3O00716 MRPL43-208ENST00000370242 884 ntTSL 2 BASIC16.75■□□□□ 0.27
E2F3O00716 PSMA7-201ENST00000370858 925 ntTSL 2 BASIC16.75■□□□□ 0.27
E2F3O00716 HLA-DMA-201ENST00000374843 1123 ntAPPRIS P1 BASIC16.75■□□□□ 0.27
E2F3O00716 CYCS-202ENST00000409409 974 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.75■□□□□ 0.27
E2F3O00716 AL645941.2-201ENST00000429234 612 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.75■□□□□ 0.27
E2F3O00716 CALM1-205ENST00000553542 877 ntTSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
E2F3O00716 RPL19-204ENST00000579260 1051 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.75■□□□□ 0.27
E2F3O00716 LINC01711-201ENST00000598340 967 ntBASIC16.75■□□□□ 0.27
E2F3O00716 AC138894.3-201ENST00000603787 634 ntBASIC16.75■□□□□ 0.27
E2F3O00716 AC005632.4-201ENST00000613759 431 ntTSL 3 BASIC16.75■□□□□ 0.27
E2F3O00716 DNAJB2-201ENST00000336576 3176 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
E2F3O00716 KCNJ8-201ENST00000240662 2389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
E2F3O00716 POLR3E-202ENST00000359210 2469 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
E2F3O00716 USP2-202ENST00000455332 2903 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
E2F3O00716 FAM237A-203ENST00000543490 1376 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
E2F3O00716 TSR2-201ENST00000375151 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
E2F3O00716 DBNL-213ENST00000452943 1513 ntTSL 2 BASIC16.75■□□□□ 0.27
E2F3O00716 SSR4-201ENST00000320857 1671 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.75■□□□□ 0.27
E2F3O00716 CYP2D6-203ENST00000360608 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
E2F3O00716 CHEK1-202ENST00000427383 1670 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
E2F3O00716 AC011270.2-201ENST00000624293 2550 ntBASIC16.75■□□□□ 0.27
E2F3O00716 SRRM2-201ENST00000301740 9353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
E2F3O00716 DRC3-201ENST00000313838 2064 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
E2F3O00716 GBGT1-204ENST00000372043 1935 ntTSL 2 BASIC16.74■□□□□ 0.27
E2F3O00716 ADGRG3-202ENST00000450388 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.74■□□□□ 0.27
E2F3O00716 MED25-202ENST00000538643 1623 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
E2F3O00716 TACC1-202ENST00000317827 7802 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
E2F3O00716 DNAJC28-203ENST00000402202 1480 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
E2F3O00716 CNTNAP3-204ENST00000377656 4986 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
E2F3O00716 PJA1-201ENST00000361478 2755 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
E2F3O00716 ZNF232-201ENST00000250076 2179 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
E2F3O00716 NBL1-210ENST00000615215 2160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
E2F3O00716 WBP2-219ENST00000626827 1867 ntTSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
E2F3O00716 EXD3-201ENST00000340951 2872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
E2F3O00716 BRPF1-203ENST00000424362 4712 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
E2F3O00716 EGR3-204ENST00000522910 1553 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.74■□□□□ 0.27
E2F3O00716 RUNX1-207ENST00000437180 5967 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
E2F3O00716 MTA2-204ENST00000527204 2265 ntTSL 2 BASIC16.74■□□□□ 0.27
E2F3O00716 ATP5J-201ENST00000284971 614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
E2F3O00716 MAL-203ENST00000353004 873 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
E2F3O00716 CD1E-203ENST00000368156 861 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
E2F3O00716 SPDYE21P-201ENST00000413323 827 ntBASIC16.74■□□□□ 0.27
E2F3O00716 ICAM2-203ENST00000449662 1221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
E2F3O00716 COX18-204ENST00000507544 1086 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
E2F3O00716 EFCAB11-211ENST00000556609 568 ntTSL 3 BASIC16.74■□□□□ 0.27
E2F3O00716 AC006538.3-201ENST00000612495 578 ntBASIC16.74■□□□□ 0.27
E2F3O00716 ADAMTS7-201ENST00000388820 5490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
E2F3O00716 STAT5A-207ENST00000546010 3086 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
E2F3O00716 CELF6-204ENST00000543764 1676 ntTSL 2 BASIC16.74■□□□□ 0.27
E2F3O00716 MAP3K6-202ENST00000374040 4309 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 38.6 ms