Protein–RNA interactions for Protein: A7E2U8

C4orf47, UPF0602 protein C4orf47, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
C4orf47A7E2U8 HLA-F-218ENST00000376861 1544 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.74■□□□□ 0.27
C4orf47A7E2U8 AL139398.1-201ENST00000638795 1529 ntTSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
C4orf47A7E2U8 FAM174A-201ENST00000312637 1356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
C4orf47A7E2U8 SKOR1-204ENST00000554240 3597 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
C4orf47A7E2U8 RSPO4-201ENST00000217260 2707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
C4orf47A7E2U8 IQSEC1-201ENST00000273221 5279 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
C4orf47A7E2U8 RAI2-203ENST00000415486 2037 ntTSL 2 BASIC16.74■□□□□ 0.27
C4orf47A7E2U8 VIM-201ENST00000224237 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
C4orf47A7E2U8 TSKS-201ENST00000246801 1883 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
C4orf47A7E2U8 LMTK2-201ENST00000297293 8946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
C4orf47A7E2U8 PANX1-202ENST00000436171 2750 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
C4orf47A7E2U8 LHX8-201ENST00000294638 2373 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
C4orf47A7E2U8 EGFL6-202ENST00000380602 2385 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
C4orf47A7E2U8 MYC-207ENST00000621592 2366 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
C4orf47A7E2U8 TMEM216-203ENST00000515837 1958 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.73■□□□□ 0.27
C4orf47A7E2U8 SDK1-202ENST00000404826 10397 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
C4orf47A7E2U8 STK25-203ENST00000403346 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
C4orf47A7E2U8 PRSS12-201ENST00000296498 4809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
C4orf47A7E2U8 AC142086.1-202ENST00000398669 1839 ntTSL 2 BASIC16.73■□□□□ 0.27
C4orf47A7E2U8 ZMYND11-214ENST00000509513 2065 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
C4orf47A7E2U8 PRR15-201ENST00000319694 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
C4orf47A7E2U8 MZF1-206ENST00000599369 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
C4orf47A7E2U8 PNKD-201ENST00000248451 758 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
C4orf47A7E2U8 MRNIP-201ENST00000292586 1238 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
C4orf47A7E2U8 AC124057.1-201ENST00000433035 404 ntTSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
C4orf47A7E2U8 AC099669.1-201ENST00000457331 456 ntTSL 3 BASIC16.73■□□□□ 0.27
C4orf47A7E2U8 SLC25A30-AS1-201ENST00000506633 701 ntTSL 3 BASIC16.73■□□□□ 0.27
C4orf47A7E2U8 AL132711.1-201ENST00000557546 722 ntTSL 3 BASIC16.73■□□□□ 0.27
C4orf47A7E2U8 CD7-202ENST00000578509 925 ntTSL 3 BASIC16.73■□□□□ 0.27
C4orf47A7E2U8 FOSB-211ENST00000592436 1057 ntTSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
C4orf47A7E2U8 AC092070.4-201ENST00000599803 507 ntTSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
C4orf47A7E2U8 UBE2E3-205ENST00000602475 602 ntTSL 3 BASIC16.73■□□□□ 0.27
C4orf47A7E2U8 GTF2IRD2-205ENST00000614386 578 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
C4orf47A7E2U8 CCDC189-204ENST00000541260 1531 ntTSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
C4orf47A7E2U8 RABEPK-206ENST00000628863 1537 ntTSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
C4orf47A7E2U8 WDR59-202ENST00000536050 1752 ntTSL 2 BASIC16.73■□□□□ 0.27
C4orf47A7E2U8 DDX42-202ENST00000389924 3939 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
C4orf47A7E2U8 DNAJA3-203ENST00000431375 2294 ntTSL 2 BASIC16.73■□□□□ 0.27
C4orf47A7E2U8 KRT16P6-201ENST00000417510 1873 ntTSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
C4orf47A7E2U8 RNF183-203ENST00000441031 1366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
C4orf47A7E2U8 BANP-223ENST00000538234 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
C4orf47A7E2U8 HPS3-202ENST00000460120 2745 ntTSL 2 BASIC16.73■□□□□ 0.27
C4orf47A7E2U8 SEPT8-208ENST00000378721 1723 ntTSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
C4orf47A7E2U8 GNAZ-203ENST00000615612 3333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
C4orf47A7E2U8 ZNF205-206ENST00000620094 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
C4orf47A7E2U8 SEPT8-201ENST00000296873 4394 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
C4orf47A7E2U8 NRG2-205ENST00000361474 3020 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
C4orf47A7E2U8 PAQR4-202ENST00000318782 2793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
C4orf47A7E2U8 DTX2-211ENST00000446600 2281 ntTSL 2 BASIC16.72■□□□□ 0.27
C4orf47A7E2U8 AC099508.1-201ENST00000499110 1666 ntTSL 4 BASIC16.72■□□□□ 0.27
C4orf47A7E2U8 FAM49B-214ENST00000519540 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
C4orf47A7E2U8 HARS-203ENST00000431330 1774 ntTSL 2 BASIC16.72■□□□□ 0.27
C4orf47A7E2U8 SREK1-216ENST00000612404 2128 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
C4orf47A7E2U8 RILPL2-201ENST00000280571 6141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
C4orf47A7E2U8 MFSD2B-202ENST00000406420 1528 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
C4orf47A7E2U8 WDR45-234ENST00000634838 1545 ntTSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
C4orf47A7E2U8 CHTF8-203ENST00000448552 2903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
C4orf47A7E2U8 SLC39A3-202ENST00000455372 2940 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
C4orf47A7E2U8 DAG1-219ENST00000538711 5582 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
C4orf47A7E2U8 GMNN-201ENST00000230056 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
C4orf47A7E2U8 SLC2A8-201ENST00000373352 914 ntTSL 2 BASIC16.72■□□□□ 0.27
C4orf47A7E2U8 TNNT3-204ENST00000381558 1258 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
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C4orf47A7E2U8 AC087163.2-201ENST00000457299 853 ntBASIC16.72■□□□□ 0.27
C4orf47A7E2U8 RN7SL692P-201ENST00000464677 288 ntBASIC16.72■□□□□ 0.27
C4orf47A7E2U8 FAM177A1-207ENST00000554052 540 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.72■□□□□ 0.27
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C4orf47A7E2U8 DBN1-201ENST00000292385 3072 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
C4orf47A7E2U8 RPRD1A-209ENST00000590898 1945 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
C4orf47A7E2U8 THNSL2-203ENST00000377254 1560 ntTSL 2 BASIC16.72■□□□□ 0.27
C4orf47A7E2U8 BIRC8-201ENST00000426466 2026 ntAPPRIS P1 BASIC16.72■□□□□ 0.27
C4orf47A7E2U8 PRELID3A-209ENST00000592149 2001 ntTSL 2 BASIC16.72■□□□□ 0.27
C4orf47A7E2U8 APBB1-215ENST00000608394 2128 ntTSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
C4orf47A7E2U8 APBB1-222ENST00000610474 2147 ntTSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
C4orf47A7E2U8 HYAL3-207ENST00000621157 1696 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
C4orf47A7E2U8 HTR1A-201ENST00000323865 1778 ntAPPRIS P1 BASIC16.72■□□□□ 0.27
C4orf47A7E2U8 EMC8-201ENST00000253457 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
C4orf47A7E2U8 SKP2-201ENST00000274254 1537 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
C4orf47A7E2U8 RGN-202ENST00000352078 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
C4orf47A7E2U8 AC026471.1-201ENST00000564629 3026 ntBASIC16.71■□□□□ 0.27
C4orf47A7E2U8 AMIGO1-202ENST00000369864 5088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
C4orf47A7E2U8 NPRL2-201ENST00000232501 1700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
C4orf47A7E2U8 NUDT9-201ENST00000302174 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
C4orf47A7E2U8 ANKRD10-201ENST00000267339 2495 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.27
C4orf47A7E2U8 TRIM41-202ENST00000351937 2696 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
C4orf47A7E2U8 ADAM15-207ENST00000368413 1901 ntTSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
C4orf47A7E2U8 DACH1-202ENST00000613252 5233 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
C4orf47A7E2U8 NOS1AP-206ENST00000530878 2894 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
C4orf47A7E2U8 VCX2-201ENST00000317103 815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
C4orf47A7E2U8 FNDC11-202ENST00000370098 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
C4orf47A7E2U8 ADIRF-201ENST00000372013 917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
C4orf47A7E2U8 ABHD11-203ENST00000395147 812 ntTSL 3 BASIC16.71■□□□□ 0.27
C4orf47A7E2U8 ZC3H12D-202ENST00000409948 753 ntTSL 3 BASIC16.71■□□□□ 0.27
C4orf47A7E2U8 AC082651.1-201ENST00000478468 832 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
C4orf47A7E2U8 OTUB2-202ENST00000553723 708 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
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