Protein–RNA interactions for Protein: A6NKF2

ARID3C, AT-rich interactive domain-containing protein 3C, humanhuman

Predictions only

Length 412 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ARID3CA6NKF2 USE1-201ENST00000263897 843 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
ARID3CA6NKF2 SLC2A8-201ENST00000373352 914 ntTSL 2 BASIC26.56■■□□□ 1.84
ARID3CA6NKF2 TSSK5P-201ENST00000423978 907 ntBASIC26.56■■□□□ 1.84
ARID3CA6NKF2 SNX21-206ENST00000462307 1043 ntTSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
ARID3CA6NKF2 AC027369.6-201ENST00000525520 931 ntBASIC26.56■■□□□ 1.84
ARID3CA6NKF2 AC109635.5-201ENST00000533593 962 ntBASIC26.56■■□□□ 1.84
ARID3CA6NKF2 SPDYE22P-201ENST00000582158 798 ntBASIC26.56■■□□□ 1.84
ARID3CA6NKF2 SHTN1-203ENST00000392901 2190 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.56■■□□□ 1.84
ARID3CA6NKF2 DCST1-204ENST00000423025 2199 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.56■■□□□ 1.84
ARID3CA6NKF2 LYPLAL1-201ENST00000366927 1819 ntTSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
ARID3CA6NKF2 SPRED2-206ENST00000443619 1800 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.55■■□□□ 1.84
ARID3CA6NKF2 MAT2A-202ENST00000409017 1927 ntTSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
ARID3CA6NKF2 UMOD-201ENST00000302509 2477 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC26.55■■□□□ 1.84
ARID3CA6NKF2 TPM2-201ENST00000329305 1018 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC26.55■■□□□ 1.84
ARID3CA6NKF2 ALKBH6-202ENST00000378875 973 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
ARID3CA6NKF2 AL391335.1-201ENST00000504583 535 ntTSL 4 BASIC26.55■■□□□ 1.84
ARID3CA6NKF2 SPDYE12P-201ENST00000618416 771 ntBASIC26.55■■□□□ 1.84
ARID3CA6NKF2 AC008267.7-201ENST00000624570 1194 ntBASIC26.55■■□□□ 1.84
ARID3CA6NKF2 PPT2-247ENST00000375143 1754 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.55■■□□□ 1.84
ARID3CA6NKF2 HARS-204ENST00000438307 1789 ntTSL 2 BASIC26.55■■□□□ 1.84
ARID3CA6NKF2 BIN1-208ENST00000376113 1832 ntTSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
ARID3CA6NKF2 FAM174A-201ENST00000312637 1356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
ARID3CA6NKF2 MAPRE3-201ENST00000233121 1892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
ARID3CA6NKF2 KRT81-201ENST00000327741 1929 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
ARID3CA6NKF2 PRRT2-205ENST00000567659 1470 ntTSL 2 BASIC26.55■■□□□ 1.84
ARID3CA6NKF2 CD72-204ENST00000396757 2035 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC26.55■■□□□ 1.84
ARID3CA6NKF2 AC053503.2-201ENST00000420563 1598 ntTSL 2 BASIC26.54■■□□□ 1.84
ARID3CA6NKF2 LINC00029-201ENST00000370341 1631 ntTSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
ARID3CA6NKF2 CACNA1I-204ENST00000407673 5952 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
ARID3CA6NKF2 KRT6C-201ENST00000252250 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
ARID3CA6NKF2 KRT6B-201ENST00000252252 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
ARID3CA6NKF2 MYEOV-201ENST00000308946 2287 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
ARID3CA6NKF2 PSRC1-204ENST00000369909 1742 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
ARID3CA6NKF2 GTF3C5-202ENST00000372097 2406 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
ARID3CA6NKF2 CLDN4-201ENST00000340958 1831 ntAPPRIS P1 BASIC26.54■■□□□ 1.84
ARID3CA6NKF2 PRDX5-202ENST00000347941 463 ntTSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
ARID3CA6NKF2 WFDC3-204ENST00000372632 704 ntTSL 3 BASIC26.54■■□□□ 1.84
ARID3CA6NKF2 AMACR-202ENST00000382068 862 ntTSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
ARID3CA6NKF2 RNU1-129P-201ENST00000384064 167 ntBASIC26.54■■□□□ 1.84
ARID3CA6NKF2 SYNGR1-205ENST00000406293 564 ntTSL 2 BASIC26.54■■□□□ 1.84
ARID3CA6NKF2 SS18L2-202ENST00000447630 1047 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.54■■□□□ 1.84
ARID3CA6NKF2 AC114956.2-201ENST00000512498 572 ntTSL 4 BASIC26.54■■□□□ 1.84
ARID3CA6NKF2 GSTO1-207ENST00000539281 1052 ntTSL 5 BASIC26.54■■□□□ 1.84
ARID3CA6NKF2 TUBB3-203ENST00000553967 736 ntTSL 2 BASIC26.54■■□□□ 1.84
ARID3CA6NKF2 GCHFR-204ENST00000559445 626 ntTSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
ARID3CA6NKF2 U1.21-201ENST00000580816 167 ntBASIC26.54■■□□□ 1.84
ARID3CA6NKF2 AL031055.1-201ENST00000606362 631 ntBASIC26.54■■□□□ 1.84
ARID3CA6NKF2 ARHGAP4-204ENST00000393721 2721 ntTSL 5 BASIC26.54■■□□□ 1.84
ARID3CA6NKF2 AC118553.2-202ENST00000638792 2729 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.54■■□□□ 1.84
ARID3CA6NKF2 RBM17-201ENST00000379888 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
ARID3CA6NKF2 AC107464.1-203ENST00000468356 2120 ntTSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
ARID3CA6NKF2 COLEC12-201ENST00000400256 5742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
ARID3CA6NKF2 SLC25A35-205ENST00000580340 1541 ntTSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
ARID3CA6NKF2 CDK13-207ENST00000613626 3099 ntTSL 5 BASIC26.54■■□□□ 1.84
ARID3CA6NKF2 NOX4-201ENST00000263317 2388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
ARID3CA6NKF2 MMD2-202ENST00000404774 2415 ntTSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
ARID3CA6NKF2 ARFRP1-212ENST00000618838 1623 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.54■■□□□ 1.84
ARID3CA6NKF2 IL17RC-201ENST00000295981 2621 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC26.53■■□□□ 1.84
ARID3CA6NKF2 PMAIP1-202ENST00000316660 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
ARID3CA6NKF2 DPF1-203ENST00000414789 1960 ntTSL 2 BASIC26.53■■□□□ 1.84
ARID3CA6NKF2 BIRC8-201ENST00000426466 2026 ntAPPRIS P1 BASIC26.53■■□□□ 1.84
ARID3CA6NKF2 CBS-203ENST00000398158 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
ARID3CA6NKF2 CBSL-206ENST00000624406 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
ARID3CA6NKF2 MIR346-201ENST00000362234 95 ntBASIC26.53■■□□□ 1.84
ARID3CA6NKF2 TEX30-202ENST00000376021 1038 ntTSL 2 BASIC26.53■■□□□ 1.84
ARID3CA6NKF2 PGF-202ENST00000405431 666 ntTSL 5 BASIC26.53■■□□□ 1.84
ARID3CA6NKF2 COX5BP8-201ENST00000416911 349 ntBASIC26.53■■□□□ 1.84
ARID3CA6NKF2 NME2P1-201ENST00000426182 414 ntBASIC26.53■■□□□ 1.84
ARID3CA6NKF2 DICER1-AS1-202ENST00000439819 810 ntTSL 3 BASIC26.53■■□□□ 1.84
ARID3CA6NKF2 AC022201.2-201ENST00000445084 287 ntTSL 5 BASIC26.53■■□□□ 1.84
ARID3CA6NKF2 LINC01160-202ENST00000450155 894 ntTSL 3 BASIC26.53■■□□□ 1.84
ARID3CA6NKF2 RBAKDN-201ENST00000498308 514 ntTSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
ARID3CA6NKF2 AL139349.1-201ENST00000530479 577 ntTSL 4 BASIC26.53■■□□□ 1.84
ARID3CA6NKF2 AC005544.2-201ENST00000579138 229 ntTSL 5 BASIC26.53■■□□□ 1.84
ARID3CA6NKF2 AL590560.3-201ENST00000623350 461 ntBASIC26.53■■□□□ 1.84
ARID3CA6NKF2 OPN5-206ENST00000638973 1090 ntTSL 5 BASIC26.53■■□□□ 1.84
ARID3CA6NKF2 BORCS6-201ENST00000389017 2575 ntAPPRIS P1 BASIC26.53■■□□□ 1.84
ARID3CA6NKF2 CERS5-203ENST00000422340 2855 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.53■■□□□ 1.84
ARID3CA6NKF2 NRG2-202ENST00000289422 2923 ntTSL 5 BASIC26.53■■□□□ 1.84
ARID3CA6NKF2 ADAP2-201ENST00000330889 2934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
ARID3CA6NKF2 TPT1-AS1-215ENST00000522673 1519 ntTSL 5 BASIC26.53■■□□□ 1.84
ARID3CA6NKF2 WTAP-205ENST00000614346 1623 ntTSL 2 BASIC26.53■■□□□ 1.84
ARID3CA6NKF2 MAP3K13-212ENST00000448876 1681 ntTSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
ARID3CA6NKF2 AC105202.1-204ENST00000502167 1781 ntTSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
ARID3CA6NKF2 LGMN-201ENST00000334869 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
ARID3CA6NKF2 YTHDF3-214ENST00000621890 2296 ntTSL 5 BASIC26.53■■□□□ 1.84
ARID3CA6NKF2 HBEGF-201ENST00000230990 2386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
ARID3CA6NKF2 FN1-208ENST00000426059 2388 ntTSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
ARID3CA6NKF2 T-201ENST00000296946 2436 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.53■■□□□ 1.84
ARID3CA6NKF2 ZNF274-203ENST00000424679 2539 ntTSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
ARID3CA6NKF2 TSLP-203ENST00000420978 2621 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.52■■□□□ 1.84
ARID3CA6NKF2 BLOC1S3-201ENST00000433642 2601 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.52■■□□□ 1.84
ARID3CA6NKF2 ASB13-201ENST00000357700 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.52■■□□□ 1.84
ARID3CA6NKF2 ISLR2-210ENST00000565540 2780 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC26.52■■□□□ 1.84
ARID3CA6NKF2 CHD1L-204ENST00000431239 2907 ntTSL 5 BASIC26.52■■□□□ 1.84
ARID3CA6NKF2 CADPS2-202ENST00000334010 6045 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.52■■□□□ 1.84
ARID3CA6NKF2 TBC1D9-201ENST00000442267 5306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.52■■□□□ 1.84
ARID3CA6NKF2 LIM2-201ENST00000221973 983 ntTSL 1 (best) BASIC26.52■■□□□ 1.84
ARID3CA6NKF2 LSM12-201ENST00000293406 2308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.52■■□□□ 1.84
ARID3CA6NKF2 MBD4-202ENST00000393278 1684 ntTSL 1 (best) BASIC26.52■■□□□ 1.84
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 39.5 ms