Protein–RNA interactions for Protein: A5PKW4

PSD, PH and SEC7 domain-containing protein 1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 1,024 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PSDA5PKW4 LAMP1-201ENST00000332556 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
PSDA5PKW4 RIMBP3C-202ENST00000433039 5784 ntAPPRIS P2 BASIC21.72■■□□□ 1.07
PSDA5PKW4 WASH6P-202ENST00000359512 1437 ntBASIC21.72■■□□□ 1.07
PSDA5PKW4 PRRT2-219ENST00000637565 1733 ntTSL 5 BASIC21.72■■□□□ 1.07
PSDA5PKW4 RSAD1-201ENST00000258955 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
PSDA5PKW4 KCNK6-201ENST00000263372 5722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
PSDA5PKW4 TMEM129-202ENST00000382936 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
PSDA5PKW4 SKP2-201ENST00000274254 1537 ntTSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
PSDA5PKW4 TMEM106C-202ENST00000429772 1515 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.72■■□□□ 1.07
PSDA5PKW4 LTV1-201ENST00000367576 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
PSDA5PKW4 CIDEA-201ENST00000320477 828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
PSDA5PKW4 HDAC8-203ENST00000373559 632 ntTSL 2 BASIC21.72■■□□□ 1.07
PSDA5PKW4 HDAC8-208ENST00000373583 434 ntTSL 5 BASIC21.72■■□□□ 1.07
PSDA5PKW4 MMP17-203ENST00000535004 719 ntTSL 3 BASIC21.72■■□□□ 1.07
PSDA5PKW4 AC087645.2-201ENST00000586321 799 ntTSL 3 BASIC21.72■■□□□ 1.07
PSDA5PKW4 TEX28P1-201ENST00000613479 1221 ntBASIC21.72■■□□□ 1.07
PSDA5PKW4 TEX28P2-201ENST00000617764 1221 ntBASIC21.72■■□□□ 1.07
PSDA5PKW4 RAB34-223ENST00000636154 730 ntTSL 2 BASIC21.72■■□□□ 1.07
PSDA5PKW4 ABCC6-209ENST00000640696 1893 ntTSL 5 BASIC21.72■■□□□ 1.07
PSDA5PKW4 MSLN-202ENST00000545450 2162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
PSDA5PKW4 MKRN3-203ENST00000568252 1312 ntTSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
PSDA5PKW4 RAD51C-215ENST00000583539 1319 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.72■■□□□ 1.07
PSDA5PKW4 OGG1-203ENST00000302036 2220 ntTSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
PSDA5PKW4 GSEC-201ENST00000626810 2289 ntTSL 2 BASIC21.72■■□□□ 1.07
PSDA5PKW4 GLS-201ENST00000320717 4834 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
PSDA5PKW4 CCDC94-201ENST00000262962 1434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
PSDA5PKW4 MTERF2-202ENST00000392830 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
PSDA5PKW4 ALOX15B-205ENST00000573359 1809 ntTSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
PSDA5PKW4 RNF114-201ENST00000244061 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
PSDA5PKW4 NPM2-203ENST00000397940 1874 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.71■■□□□ 1.07
PSDA5PKW4 CD177-203ENST00000618265 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
PSDA5PKW4 CNIH3-201ENST00000272133 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
PSDA5PKW4 SPNS1-204ENST00000352260 1948 ntTSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
PSDA5PKW4 GRB10-205ENST00000401949 2627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
PSDA5PKW4 GMCL1P1-201ENST00000463439 1581 ntBASIC21.71■■□□□ 1.07
PSDA5PKW4 AC027097.1-202ENST00000592201 1954 ntTSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
PSDA5PKW4 ZNF296-202ENST00000622376 1631 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
PSDA5PKW4 AL096814.1-202ENST00000372963 647 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC21.71■■□□□ 1.07
PSDA5PKW4 TEX30-202ENST00000376021 1038 ntTSL 2 BASIC21.71■■□□□ 1.07
PSDA5PKW4 OSM-203ENST00000403463 464 ntTSL 3 BASIC21.71■■□□□ 1.07
PSDA5PKW4 AC017116.1-201ENST00000445938 708 ntTSL 3 BASIC21.71■■□□□ 1.07
PSDA5PKW4 RAB7A-204ENST00000483906 533 ntTSL 3 BASIC21.71■■□□□ 1.07
PSDA5PKW4 AC012322.1-201ENST00000561657 861 ntTSL 3 BASIC21.71■■□□□ 1.07
PSDA5PKW4 AC007967.4-201ENST00000614700 386 ntBASIC21.71■■□□□ 1.07
PSDA5PKW4 SNX1-214ENST00000625244 324 ntTSL 5 BASIC21.71■■□□□ 1.07
PSDA5PKW4 SHISA7-201ENST00000376325 6033 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.71■■□□□ 1.07
PSDA5PKW4 ORMDL1-203ENST00000392350 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
PSDA5PKW4 CASKIN1-201ENST00000343516 5759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
PSDA5PKW4 PCCA-201ENST00000376279 2418 ntTSL 2 BASIC21.71■■□□□ 1.07
PSDA5PKW4 CLDN4-201ENST00000340958 1831 ntAPPRIS P1 BASIC21.71■■□□□ 1.07
PSDA5PKW4 FAM72C-202ENST00000584486 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
PSDA5PKW4 DNAAF4-202ENST00000348518 1897 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.71■■□□□ 1.07
PSDA5PKW4 AC105411.1-202ENST00000565050 1476 ntTSL 5 BASIC21.71■■□□□ 1.07
PSDA5PKW4 AGPAT5-201ENST00000285518 3685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.07
PSDA5PKW4 SLC12A4-202ENST00000422611 4670 ntTSL 2 BASIC21.7■■□□□ 1.06
PSDA5PKW4 AC069544.2-201ENST00000640019 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
PSDA5PKW4 CORO1A-216ENST00000570045 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
PSDA5PKW4 CCKBR-203ENST00000525462 2138 ntTSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
PSDA5PKW4 AC008687.8-201ENST00000599795 1748 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.7■■□□□ 1.06
PSDA5PKW4 ADGRD2-201ENST00000334810 3244 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.7■■□□□ 1.06
PSDA5PKW4 FAM214B-203ENST00000378561 5771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
PSDA5PKW4 TNNI1-203ENST00000367312 1100 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.7■■□□□ 1.06
PSDA5PKW4 TCEAL3-203ENST00000372628 1221 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.7■■□□□ 1.06
PSDA5PKW4 CCL25-203ENST00000390669 924 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
PSDA5PKW4 SETD4-205ENST00000399208 1165 ntTSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
PSDA5PKW4 ZNF527-203ENST00000483919 1142 ntTSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
PSDA5PKW4 NKX3-1-202ENST00000523261 713 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
PSDA5PKW4 DUSP6-204ENST00000547291 1074 ntTSL 2 BASIC21.7■■□□□ 1.06
PSDA5PKW4 FOS-206ENST00000555347 1280 ntTSL 2 BASIC21.7■■□□□ 1.06
PSDA5PKW4 AC007333.1-201ENST00000568286 630 ntTSL 3 BASIC21.7■■□□□ 1.06
PSDA5PKW4 TECR-207ENST00000596073 1170 ntTSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
PSDA5PKW4 TECR-220ENST00000600083 1204 ntTSL 2 BASIC21.7■■□□□ 1.06
PSDA5PKW4 WNT11-204ENST00000621122 789 ntTSL 5 BASIC21.7■■□□□ 1.06
PSDA5PKW4 FKBPL-201ENST00000375156 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
PSDA5PKW4 ADAMTS19-205ENST00000638972 5089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
PSDA5PKW4 UMOD-201ENST00000302509 2477 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.7■■□□□ 1.06
PSDA5PKW4 KLK15-201ENST00000326856 1389 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.7■■□□□ 1.06
PSDA5PKW4 NDN-201ENST00000331837 1931 ntAPPRIS P1 BASIC21.7■■□□□ 1.06
PSDA5PKW4 ADAM15-207ENST00000368413 1901 ntTSL 5 BASIC21.7■■□□□ 1.06
PSDA5PKW4 KMT5B-201ENST00000304363 5837 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.7■■□□□ 1.06
PSDA5PKW4 HEPN1-201ENST00000408930 1434 ntAPPRIS P1 BASIC21.7■■□□□ 1.06
PSDA5PKW4 RNF167-214ENST00000576229 1436 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.7■■□□□ 1.06
PSDA5PKW4 NUDT10-202ENST00000376006 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
PSDA5PKW4 CGRRF1-201ENST00000216420 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
PSDA5PKW4 PDHX-203ENST00000448838 2653 ntTSL 5 BASIC21.7■■□□□ 1.06
PSDA5PKW4 C15orf56-202ENST00000623360 2129 ntTSL 2 BASIC21.7■■□□□ 1.06
PSDA5PKW4 HCCS-201ENST00000321143 2277 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.69■■□□□ 1.06
PSDA5PKW4 POLR1D-207ENST00000621089 1606 ntTSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
PSDA5PKW4 LIMS2-204ENST00000409286 1678 ntTSL 2 BASIC21.69■■□□□ 1.06
PSDA5PKW4 MEN1-209ENST00000394376 3034 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.69■■□□□ 1.06
PSDA5PKW4 AC020922.1-201ENST00000591954 3058 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.69■■□□□ 1.06
PSDA5PKW4 HTR1A-201ENST00000323865 1778 ntAPPRIS P1 BASIC21.69■■□□□ 1.06
PSDA5PKW4 MATN4-205ENST00000537548 1991 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.69■■□□□ 1.06
PSDA5PKW4 LZTS3-201ENST00000329152 5257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
PSDA5PKW4 BOLA3-201ENST00000295326 444 ntTSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
PSDA5PKW4 BANF1-201ENST00000312175 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
PSDA5PKW4 PITX2-203ENST00000355080 2100 ntTSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
PSDA5PKW4 EIF1AX-201ENST00000379593 765 ntTSL 3 BASIC21.69■■□□□ 1.06
PSDA5PKW4 AC105940.2-201ENST00000421055 380 ntTSL 3 BASIC21.69■■□□□ 1.06
PSDA5PKW4 AC087294.1-202ENST00000439136 487 ntTSL 3 BASIC21.69■■□□□ 1.06
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.8 ms