Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y6C7

LINC00312, Putative uncharacterized protein encoded by LINC00312, humanhuman

Predictions only

Length 94 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LINC00312Q9Y6C7 MCCC1-201ENST00000265594 2545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.18□□□□□ -0.14
LINC00312Q9Y6C7 PBK-201ENST00000301905 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.18□□□□□ -0.14
LINC00312Q9Y6C7 AC099684.1-202ENST00000425277 1747 ntTSL 1 (best) BASIC14.18□□□□□ -0.14
LINC00312Q9Y6C7 PDCL3-201ENST00000264254 1337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.18□□□□□ -0.14
LINC00312Q9Y6C7 SDR39U1-206ENST00000553930 1325 ntTSL 5 BASIC14.18□□□□□ -0.14
LINC00312Q9Y6C7 ZNF74-202ENST00000400451 3159 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.18□□□□□ -0.14
LINC00312Q9Y6C7 SMARCA4-215ENST00000590574 5282 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.18□□□□□ -0.14
LINC00312Q9Y6C7 TRH-202ENST00000507066 1580 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.18□□□□□ -0.14
LINC00312Q9Y6C7 SYNE3-202ENST00000553340 2615 ntTSL 1 (best) BASIC14.18□□□□□ -0.14
LINC00312Q9Y6C7 SBF2-AS1-201ENST00000498905 2709 ntTSL 5 BASIC14.18□□□□□ -0.14
LINC00312Q9Y6C7 CLDN11-201ENST00000064724 2169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.18□□□□□ -0.14
LINC00312Q9Y6C7 STX2-201ENST00000261653 3331 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.18□□□□□ -0.14
LINC00312Q9Y6C7 DNAH14-205ENST00000366850 1103 ntTSL 5 BASIC14.18□□□□□ -0.14
LINC00312Q9Y6C7 SDR39U1-201ENST00000399395 1233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.18□□□□□ -0.14
LINC00312Q9Y6C7 AC134772.1-202ENST00000435578 549 ntTSL 4 BASIC14.18□□□□□ -0.14
LINC00312Q9Y6C7 MAGI2-AS3-208ENST00000446159 670 ntTSL 3 BASIC14.18□□□□□ -0.14
LINC00312Q9Y6C7 AF186996.4-201ENST00000467186 377 ntBASIC14.18□□□□□ -0.14
LINC00312Q9Y6C7 ARTN-206ENST00000472435 402 ntTSL 3 BASIC14.18□□□□□ -0.14
LINC00312Q9Y6C7 MPIG6B-210ENST00000480039 790 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.18□□□□□ -0.14
LINC00312Q9Y6C7 TXNRD2-212ENST00000485358 850 ntTSL 2 BASIC14.18□□□□□ -0.14
LINC00312Q9Y6C7 LMX1B-203ENST00000526117 1195 ntTSL 1 (best) BASIC14.18□□□□□ -0.14
LINC00312Q9Y6C7 SMIM20-205ENST00000614775 1190 ntTSL 5 BASIC14.18□□□□□ -0.14
LINC00312Q9Y6C7 AC004706.3-202ENST00000621574 984 ntBASIC14.18□□□□□ -0.14
LINC00312Q9Y6C7 CDIPT-209ENST00000569956 1532 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.18□□□□□ -0.14
LINC00312Q9Y6C7 HPN-202ENST00000392226 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.18□□□□□ -0.14
LINC00312Q9Y6C7 GFAP-203ENST00000435360 1779 ntTSL 2 BASIC14.18□□□□□ -0.14
LINC00312Q9Y6C7 OVOL1-203ENST00000532448 1774 ntTSL 1 (best) BASIC14.18□□□□□ -0.14
LINC00312Q9Y6C7 KMT5C-212ENST00000630497 2037 ntTSL 1 (best) BASIC14.18□□□□□ -0.14
LINC00312Q9Y6C7 PFN2-201ENST00000239940 2261 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.18□□□□□ -0.14
LINC00312Q9Y6C7 MIB2-201ENST00000355826 3290 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.18□□□□□ -0.14
LINC00312Q9Y6C7 ADGRG2-209ENST00000379876 4779 ntTSL 1 (best) BASIC14.18□□□□□ -0.14
LINC00312Q9Y6C7 NAT9-201ENST00000357814 1875 ntTSL 1 (best) BASIC14.18□□□□□ -0.14
LINC00312Q9Y6C7 RAPGEFL1-212ENST00000620260 3855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.18□□□□□ -0.14
LINC00312Q9Y6C7 HDAC10-222ENST00000626012 2607 ntTSL 5 BASIC14.18□□□□□ -0.14
LINC00312Q9Y6C7 OR2C3-203ENST00000617752 2481 ntAPPRIS P1 BASIC14.18□□□□□ -0.14
LINC00312Q9Y6C7 AFMID-201ENST00000327898 1700 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.18□□□□□ -0.14
LINC00312Q9Y6C7 AD000671.3-202ENST00000591091 1712 ntTSL 1 (best) BASIC14.18□□□□□ -0.14
LINC00312Q9Y6C7 HIST1H2BN-204ENST00000612898 1723 ntAPPRIS P1 BASIC14.18□□□□□ -0.14
LINC00312Q9Y6C7 STX3-203ENST00000529177 1571 ntTSL 2 BASIC14.17□□□□□ -0.14
LINC00312Q9Y6C7 ZNF668-201ENST00000300849 2762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.17□□□□□ -0.14
LINC00312Q9Y6C7 AL590787.1-201ENST00000568856 1315 ntBASIC14.17□□□□□ -0.14
LINC00312Q9Y6C7 ZSCAN25-201ENST00000262941 1652 ntTSL 1 (best) BASIC14.17□□□□□ -0.14
LINC00312Q9Y6C7 AC068888.1-203ENST00000546566 1650 ntTSL 2 BASIC14.17□□□□□ -0.14
LINC00312Q9Y6C7 LUC7L2-202ENST00000354926 2645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.17□□□□□ -0.14
LINC00312Q9Y6C7 DPEP3-201ENST00000268793 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.17□□□□□ -0.14
LINC00312Q9Y6C7 ZFP3-201ENST00000318833 5206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.17□□□□□ -0.14
LINC00312Q9Y6C7 SEPHS1-202ENST00000378614 2387 ntTSL 1 (best) BASIC14.17□□□□□ -0.14
LINC00312Q9Y6C7 COL9A1-201ENST00000320755 3059 ntTSL 1 (best) BASIC14.17□□□□□ -0.14
LINC00312Q9Y6C7 AC106820.2-201ENST00000563775 3264 ntBASIC14.17□□□□□ -0.14
LINC00312Q9Y6C7 AC011473.4-202ENST00000250366 1602 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC14.17□□□□□ -0.14
LINC00312Q9Y6C7 DPEP1-203ENST00000421184 1647 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.17□□□□□ -0.14
LINC00312Q9Y6C7 GYG2P1-204ENST00000382966 639 ntTSL 3 BASIC14.17□□□□□ -0.14
LINC00312Q9Y6C7 NFKBIB-202ENST00000392079 991 ntTSL 5 BASIC14.17□□□□□ -0.14
LINC00312Q9Y6C7 FAM197Y8-203ENST00000450145 560 ntBASIC14.17□□□□□ -0.14
LINC00312Q9Y6C7 ACP6-203ENST00000487562 1258 ntTSL 5 BASIC14.17□□□□□ -0.14
LINC00312Q9Y6C7 GOLGA7-203ENST00000518270 808 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.17□□□□□ -0.14
LINC00312Q9Y6C7 OR7E14P-202ENST00000530490 1290 ntBASIC14.17□□□□□ -0.14
LINC00312Q9Y6C7 ANKRD34C-AS1-203ENST00000559225 528 ntTSL 4 BASIC14.17□□□□□ -0.14
LINC00312Q9Y6C7 TUBB4A-209ENST00000598006 565 ntTSL 2 BASIC14.17□□□□□ -0.14
LINC00312Q9Y6C7 EVI5L-202ENST00000538904 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.17□□□□□ -0.14
LINC00312Q9Y6C7 IL4I1-204ENST00000595948 2407 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.17□□□□□ -0.14
LINC00312Q9Y6C7 FBXO7-201ENST00000266087 2195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.17□□□□□ -0.14
LINC00312Q9Y6C7 SQSTM1-202ENST00000389805 2986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.17□□□□□ -0.14
LINC00312Q9Y6C7 PLEKHG6-203ENST00000396988 2963 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.17□□□□□ -0.14
LINC00312Q9Y6C7 SEPT2-245ENST00000616972 3446 ntTSL 2 BASIC14.17□□□□□ -0.14
LINC00312Q9Y6C7 FGFR4-203ENST00000393648 2733 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.17□□□□□ -0.14
LINC00312Q9Y6C7 AL590627.1-201ENST00000626603 1910 ntTSL 2 BASIC14.17□□□□□ -0.14
LINC00312Q9Y6C7 TMEM50B-210ENST00000542230 2375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.17□□□□□ -0.14
LINC00312Q9Y6C7 PFKL-201ENST00000349048 2912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.17□□□□□ -0.14
LINC00312Q9Y6C7 C6orf47-202ENST00000375911 2475 ntAPPRIS P1 BASIC14.17□□□□□ -0.14
LINC00312Q9Y6C7 ZBTB7C-221ENST00000590800 4947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.17□□□□□ -0.14
LINC00312Q9Y6C7 UGP2-202ENST00000394417 2136 ntTSL 1 (best) BASIC14.17□□□□□ -0.14
LINC00312Q9Y6C7 SMCHD1-201ENST00000320876 8821 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.17□□□□□ -0.14
LINC00312Q9Y6C7 CHEK1-202ENST00000427383 1670 ntTSL 1 (best) BASIC14.17□□□□□ -0.14
LINC00312Q9Y6C7 EMILIN3-201ENST00000332312 3796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.17□□□□□ -0.14
LINC00312Q9Y6C7 EHD2-202ENST00000538399 1766 ntTSL 2 BASIC14.17□□□□□ -0.14
LINC00312Q9Y6C7 SCNN1A-205ENST00000396966 2336 ntTSL 3 BASIC14.16□□□□□ -0.14
LINC00312Q9Y6C7 AGXT-201ENST00000307503 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.16□□□□□ -0.14
LINC00312Q9Y6C7 CDK19-202ENST00000368911 6246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.16□□□□□ -0.14
LINC00312Q9Y6C7 FRMD8P1-201ENST00000440433 1524 ntBASIC14.16□□□□□ -0.14
LINC00312Q9Y6C7 ZSCAN10-202ENST00000538082 2350 ntTSL 4 BASIC14.16□□□□□ -0.14
LINC00312Q9Y6C7 ISPD-201ENST00000399310 1709 ntTSL 1 (best) BASIC14.16□□□□□ -0.14
LINC00312Q9Y6C7 FOXO3-202ENST00000406360 7341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.16□□□□□ -0.14
LINC00312Q9Y6C7 SH2D3C-213ENST00000629203 2478 ntTSL 2 BASIC14.16□□□□□ -0.14
LINC00312Q9Y6C7 BATF2-202ENST00000435842 1949 ntTSL 1 (best) BASIC14.16□□□□□ -0.14
LINC00312Q9Y6C7 RPS2P28-201ENST00000314255 741 ntBASIC14.16□□□□□ -0.14
LINC00312Q9Y6C7 MAL-203ENST00000353004 873 ntTSL 1 (best) BASIC14.16□□□□□ -0.14
LINC00312Q9Y6C7 PDLIM4-202ENST00000379018 1006 ntTSL 1 (best) BASIC14.16□□□□□ -0.14
LINC00312Q9Y6C7 POMC-203ENST00000395826 959 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.16□□□□□ -0.14
LINC00312Q9Y6C7 KRT18P67-201ENST00000432816 1264 ntBASIC14.16□□□□□ -0.14
LINC00312Q9Y6C7 STK32A-AS1-201ENST00000504297 863 ntTSL 3 BASIC14.16□□□□□ -0.14
LINC00312Q9Y6C7 RNPS1P1-201ENST00000507437 918 ntBASIC14.16□□□□□ -0.14
LINC00312Q9Y6C7 RNPS1-222ENST00000567147 830 ntTSL 3 BASIC14.16□□□□□ -0.14
LINC00312Q9Y6C7 AC068594.1-202ENST00000581657 749 ntTSL 3 BASIC14.16□□□□□ -0.14
LINC00312Q9Y6C7 SMIM22-210ENST00000615471 928 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC14.16□□□□□ -0.14
LINC00312Q9Y6C7 TP73-AS1-207ENST00000624167 988 ntBASIC14.16□□□□□ -0.14
LINC00312Q9Y6C7 VPS51-217ENST00000639871 243 ntTSL 5 BASIC14.16□□□□□ -0.14
LINC00312Q9Y6C7 ZNF773-201ENST00000282292 2206 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.16□□□□□ -0.14
LINC00312Q9Y6C7 ALDH16A1-201ENST00000293350 3153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.16□□□□□ -0.14
LINC00312Q9Y6C7 QSOX1-201ENST00000367600 2519 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.16□□□□□ -0.14
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31 ms