Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y3B3

TMED7, Transmembrane emp24 domain-containing protein 7, humanhuman

Predictions only

Length 224 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TMED7Q9Y3B3 CACNG5-202ENST00000533854 1311 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
TMED7Q9Y3B3 ZSCAN18-201ENST00000240727 2779 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
TMED7Q9Y3B3 EML2-203ENST00000536630 2791 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
TMED7Q9Y3B3 ZBTB45-201ENST00000354590 2352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
TMED7Q9Y3B3 SLC25A46-201ENST00000355943 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
TMED7Q9Y3B3 SMARCC2-202ENST00000347471 3839 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
TMED7Q9Y3B3 PML-206ENST00000395135 2199 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
TMED7Q9Y3B3 RHOF-201ENST00000267205 3009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
TMED7Q9Y3B3 CSNK1D-204ENST00000398519 1580 ntTSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
TMED7Q9Y3B3 OGFR-201ENST00000290291 2410 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
TMED7Q9Y3B3 GXYLT2-201ENST00000389617 3260 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
TMED7Q9Y3B3 GTPBP8-203ENST00000383678 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
TMED7Q9Y3B3 AP1S2-201ENST00000329235 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
TMED7Q9Y3B3 WNK1-206ENST00000535572 9886 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
TMED7Q9Y3B3 KMT5C-212ENST00000630497 2037 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
TMED7Q9Y3B3 ELOVL7-205ENST00000508821 3994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
TMED7Q9Y3B3 GLRB-201ENST00000264428 3126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
TMED7Q9Y3B3 CADM3-201ENST00000368124 2546 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
TMED7Q9Y3B3 CDC25A-202ENST00000351231 3663 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
TMED7Q9Y3B3 UGP2-202ENST00000394417 2136 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
TMED7Q9Y3B3 LRRTM1-202ENST00000409148 2126 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC15.61■□□□□ 0.09
TMED7Q9Y3B3 SELENBP1-204ENST00000426705 1928 ntTSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
TMED7Q9Y3B3 PHYH-202ENST00000396913 1732 ntTSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
TMED7Q9Y3B3 GALNT9-201ENST00000328957 2410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
TMED7Q9Y3B3 MIR202HG-201ENST00000300167 384 ntTSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
TMED7Q9Y3B3 ZNF7-201ENST00000325217 592 ntTSL 4 BASIC15.61■□□□□ 0.09
TMED7Q9Y3B3 UXT-202ENST00000335890 701 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
TMED7Q9Y3B3 CD1E-203ENST00000368156 861 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
TMED7Q9Y3B3 KCNAB2-205ENST00000378092 1202 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
TMED7Q9Y3B3 DMKN-206ENST00000418261 1257 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
TMED7Q9Y3B3 DUSP5P1-201ENST00000441325 1139 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
TMED7Q9Y3B3 SCARNA2-201ENST00000458748 420 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
TMED7Q9Y3B3 UNC93B7-201ENST00000509439 705 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
TMED7Q9Y3B3 AF238378.1-201ENST00000526806 358 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
TMED7Q9Y3B3 SART3-203ENST00000546611 1184 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
TMED7Q9Y3B3 IRF8-202ENST00000562492 946 ntTSL 3 BASIC15.61■□□□□ 0.09
TMED7Q9Y3B3 SAXO2-206ENST00000566205 340 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
TMED7Q9Y3B3 MCRIP1-211ENST00000576679 751 ntTSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
TMED7Q9Y3B3 PLAUR-214ENST00000601723 1205 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
TMED7Q9Y3B3 EWSR1-206ENST00000397938 2654 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
TMED7Q9Y3B3 YY1-201ENST00000262238 6697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
TMED7Q9Y3B3 CDK11B-207ENST00000626918 2457 ntTSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
TMED7Q9Y3B3 AC060834.1-201ENST00000443027 2032 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
TMED7Q9Y3B3 ORAOV1-206ENST00000536870 2274 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
TMED7Q9Y3B3 SPECC1-203ENST00000395525 2536 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
TMED7Q9Y3B3 EIF4A1-203ENST00000577269 1319 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
TMED7Q9Y3B3 ABHD3-209ENST00000580981 1836 ntTSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
TMED7Q9Y3B3 ILVBL-209ENST00000534378 2067 ntTSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
TMED7Q9Y3B3 ZGLP1-202ENST00000403903 2303 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
TMED7Q9Y3B3 ZNF500-201ENST00000219478 5880 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
TMED7Q9Y3B3 AMFR-201ENST00000290649 3600 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
TMED7Q9Y3B3 LGI4-202ENST00000392225 2891 ntTSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
TMED7Q9Y3B3 TNFRSF14-AS1-205ENST00000449660 1629 ntTSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
TMED7Q9Y3B3 ZADH2-201ENST00000322342 7732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
TMED7Q9Y3B3 TJP1-212ENST00000614355 6977 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
TMED7Q9Y3B3 NLRP6-203ENST00000534750 2936 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
TMED7Q9Y3B3 LHX3-203ENST00000619587 2698 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
TMED7Q9Y3B3 ZFP3-201ENST00000318833 5206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
TMED7Q9Y3B3 AC092053.1-201ENST00000605787 1936 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
TMED7Q9Y3B3 LTBR-207ENST00000539925 1665 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
TMED7Q9Y3B3 AZIN2-203ENST00000373441 1443 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
TMED7Q9Y3B3 DFFA-201ENST00000377036 1403 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
TMED7Q9Y3B3 ARL13B-203ENST00000394222 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
TMED7Q9Y3B3 C10orf111-201ENST00000624760 1714 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
TMED7Q9Y3B3 TRAF2-201ENST00000247668 2264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
TMED7Q9Y3B3 CACNA1A-253ENST00000637927 6847 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
TMED7Q9Y3B3 GPR89P-201ENST00000407924 1495 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
TMED7Q9Y3B3 KSR1-201ENST00000268763 2806 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
TMED7Q9Y3B3 ITSN2-201ENST00000355123 6300 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
TMED7Q9Y3B3 DPEP3-201ENST00000268793 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
TMED7Q9Y3B3 ZFP64-205ENST00000371518 1841 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
TMED7Q9Y3B3 WRAP53-203ENST00000431639 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
TMED7Q9Y3B3 SPRED2-206ENST00000443619 1800 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
TMED7Q9Y3B3 WRAP53-204ENST00000457584 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
TMED7Q9Y3B3 GTDC1-219ENST00000542155 2677 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
TMED7Q9Y3B3 DNM2-201ENST00000355667 3541 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
TMED7Q9Y3B3 PTPMT1-201ENST00000326656 928 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
TMED7Q9Y3B3 ZNF81-201ENST00000334937 610 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
TMED7Q9Y3B3 COLEC11-202ENST00000349077 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
TMED7Q9Y3B3 HLA-DMA-201ENST00000374843 1123 ntAPPRIS P1 BASIC15.6■□□□□ 0.09
TMED7Q9Y3B3 UPK3A-202ENST00000396082 627 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
TMED7Q9Y3B3 ESR1-204ENST00000406599 1251 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
TMED7Q9Y3B3 ELOB-202ENST00000409477 997 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
TMED7Q9Y3B3 AL645941.2-201ENST00000429234 612 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
TMED7Q9Y3B3 AC016999.1-201ENST00000447880 452 ntTSL 3 BASIC15.6■□□□□ 0.09
TMED7Q9Y3B3 RAB42-202ENST00000465518 857 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
TMED7Q9Y3B3 AC106791.1-202ENST00000508281 1148 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
TMED7Q9Y3B3 AC034243.1-201ENST00000520838 587 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
TMED7Q9Y3B3 MTUS2-205ENST00000542829 1165 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
TMED7Q9Y3B3 BLOC1S6-202ENST00000562384 494 ntTSL 4 BASIC15.6■□□□□ 0.09
TMED7Q9Y3B3 TMEM220-203ENST00000578345 559 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
TMED7Q9Y3B3 FAM220A-205ENST00000578372 207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
TMED7Q9Y3B3 AC064862.7-201ENST00000604520 867 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
TMED7Q9Y3B3 DAPK1-202ENST00000408954 5892 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
TMED7Q9Y3B3 SCNN1D-206ENST00000400928 2731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
TMED7Q9Y3B3 NAT9-201ENST00000357814 1875 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
TMED7Q9Y3B3 SUZ12-201ENST00000322652 4491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
TMED7Q9Y3B3 LRRC56-201ENST00000270115 2769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
TMED7Q9Y3B3 AL121761.2-201ENST00000598007 1648 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
TMED7Q9Y3B3 ZSCAN25-201ENST00000262941 1652 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.4 ms