Protein–RNA interactions for Protein: Q9UJT2

TSKS, Testis-specific serine kinase substrate, humanhuman

Predictions only

Length 592 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TSKSQ9UJT2 HNRNPUL1-203ENST00000378215 2864 ntTSL 2 BASIC20.11■□□□□ 0.81
TSKSQ9UJT2 AC132938.6-201ENST00000623828 1655 ntBASIC20.11■□□□□ 0.81
TSKSQ9UJT2 TMEM52-201ENST00000310991 929 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
TSKSQ9UJT2 RHOC-206ENST00000369637 888 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.11■□□□□ 0.81
TSKSQ9UJT2 GPR162-202ENST00000382315 1150 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
TSKSQ9UJT2 MIR1909-201ENST00000411312 80 ntBASIC20.11■□□□□ 0.81
TSKSQ9UJT2 LINC00473-201ENST00000444465 798 ntTSL 3 BASIC20.11■□□□□ 0.81
TSKSQ9UJT2 TMEM205-202ENST00000447337 916 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.11■□□□□ 0.81
TSKSQ9UJT2 AL627443.1-201ENST00000456477 1035 ntTSL 3 BASIC20.11■□□□□ 0.81
TSKSQ9UJT2 AC069120.2-201ENST00000524091 540 ntBASIC20.11■□□□□ 0.81
TSKSQ9UJT2 FAM212B-207ENST00000534365 1217 ntTSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
TSKSQ9UJT2 AC026150.2-201ENST00000564693 1156 ntBASIC20.11■□□□□ 0.81
TSKSQ9UJT2 ALDH3B1-203ENST00000612297 1231 ntTSL 3 BASIC20.11■□□□□ 0.81
TSKSQ9UJT2 TMEM178A-206ENST00000618232 1286 ntTSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
TSKSQ9UJT2 PDE9A-209ENST00000398227 1606 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
TSKSQ9UJT2 NR2C1-219ENST00000622476 1561 ntTSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
TSKSQ9UJT2 CHST11-201ENST00000303694 5709 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
TSKSQ9UJT2 PDE4A-202ENST00000344979 2579 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
TSKSQ9UJT2 STK25-203ENST00000403346 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
TSKSQ9UJT2 ZGPAT-202ENST00000355969 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
TSKSQ9UJT2 RNH1-204ENST00000397614 1864 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
TSKSQ9UJT2 FUT8-AS1-201ENST00000621019 1521 ntBASIC20.11■□□□□ 0.81
TSKSQ9UJT2 LUC7L-221ENST00000629543 1520 ntTSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
TSKSQ9UJT2 DACH1-202ENST00000613252 5233 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
TSKSQ9UJT2 NOV-201ENST00000259526 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
TSKSQ9UJT2 LYPLA2-205ENST00000374514 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
TSKSQ9UJT2 TBXAS1-206ENST00000425687 2080 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
TSKSQ9UJT2 PRDM14-201ENST00000276594 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
TSKSQ9UJT2 COL18A1-204ENST00000400337 5436 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
TSKSQ9UJT2 VGLL4-211ENST00000430365 1377 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.1■□□□□ 0.81
TSKSQ9UJT2 ANXA3-201ENST00000264908 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
TSKSQ9UJT2 AC068880.1-201ENST00000507289 2297 ntBASIC20.1■□□□□ 0.81
TSKSQ9UJT2 TNPO2-201ENST00000356861 4962 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
TSKSQ9UJT2 IL17RC-215ENST00000455057 2244 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
TSKSQ9UJT2 AL079301.1-201ENST00000424580 1633 ntTSL 2 BASIC20.1■□□□□ 0.81
TSKSQ9UJT2 ZNF74-203ENST00000403682 2789 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
TSKSQ9UJT2 CBS-203ENST00000398158 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
TSKSQ9UJT2 CBSL-206ENST00000624406 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
TSKSQ9UJT2 AL499627.1-201ENST00000569373 2188 ntBASIC20.1■□□□□ 0.81
TSKSQ9UJT2 ATP5J-205ENST00000400094 589 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.1■□□□□ 0.81
TSKSQ9UJT2 AC020915.1-202ENST00000427361 922 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.1■□□□□ 0.81
TSKSQ9UJT2 AC092580.3-201ENST00000430932 139 ntBASIC20.1■□□□□ 0.81
TSKSQ9UJT2 LINC01503-203ENST00000436710 901 ntTSL 3 BASIC20.1■□□□□ 0.81
TSKSQ9UJT2 FAM185BP-201ENST00000443595 716 ntBASIC20.1■□□□□ 0.81
TSKSQ9UJT2 PPP6R2P1-201ENST00000450880 1275 ntBASIC20.1■□□□□ 0.81
TSKSQ9UJT2 LINC01184-209ENST00000514573 609 ntTSL 3 BASIC20.1■□□□□ 0.81
TSKSQ9UJT2 FAM86C2P-203ENST00000528684 1004 ntBASIC20.1■□□□□ 0.81
TSKSQ9UJT2 GALNT9-208ENST00000541995 1001 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
TSKSQ9UJT2 AC090607.3-202ENST00000558971 383 ntTSL 3 BASIC20.1■□□□□ 0.81
TSKSQ9UJT2 TUBB4A-209ENST00000598006 565 ntTSL 2 BASIC20.1■□□□□ 0.81
TSKSQ9UJT2 IFI27-210ENST00000616764 716 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20.1■□□□□ 0.81
TSKSQ9UJT2 IFI27-213ENST00000620066 719 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
TSKSQ9UJT2 NMRK1-203ENST00000376811 2050 ntTSL 2 BASIC20.1■□□□□ 0.81
TSKSQ9UJT2 ADRA1A-201ENST00000276393 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
TSKSQ9UJT2 PLEKHB1-203ENST00000398492 2275 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
TSKSQ9UJT2 SIGIRR-203ENST00000431843 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
TSKSQ9UJT2 PLK3-201ENST00000372201 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
TSKSQ9UJT2 NOS1AP-206ENST00000530878 2894 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
TSKSQ9UJT2 TBPL1-208ENST00000613034 1625 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.09■□□□□ 0.81
TSKSQ9UJT2 SAMD11-212ENST00000617307 2314 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
TSKSQ9UJT2 TDP2-202ENST00000378198 2071 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
TSKSQ9UJT2 ITGA6-201ENST00000264107 5618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
TSKSQ9UJT2 AC020916.1-201ENST00000587762 1774 ntBASIC20.09■□□□□ 0.81
TSKSQ9UJT2 NDUFV1-216ENST00000529927 1503 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
TSKSQ9UJT2 AL139398.1-201ENST00000638795 1529 ntTSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
TSKSQ9UJT2 SYTL1-208ENST00000543823 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
TSKSQ9UJT2 C6orf52-202ENST00000379586 430 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.09■□□□□ 0.81
TSKSQ9UJT2 AC004890.2-204ENST00000481968 304 ntBASIC20.09■□□□□ 0.81
TSKSQ9UJT2 LINC00596-201ENST00000559615 937 ntTSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
TSKSQ9UJT2 MRPS23-202ENST00000578444 580 ntTSL 2 BASIC20.09■□□□□ 0.81
TSKSQ9UJT2 AC027575.2-201ENST00000585258 1295 ntTSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
TSKSQ9UJT2 AC017083.2-201ENST00000608069 979 ntBASIC20.09■□□□□ 0.81
TSKSQ9UJT2 ACTL9-202ENST00000612068 1252 ntBASIC20.09■□□□□ 0.81
TSKSQ9UJT2 MAGIX-204ENST00000614074 778 ntTSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
TSKSQ9UJT2 KLF6-204ENST00000469435 2169 ntTSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
TSKSQ9UJT2 LAT-202ENST00000360872 1459 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.09■□□□□ 0.81
TSKSQ9UJT2 EGFL6-201ENST00000361306 2398 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
TSKSQ9UJT2 EGFL6-202ENST00000380602 2385 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
TSKSQ9UJT2 FAM213B-205ENST00000444521 2827 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.09■□□□□ 0.81
TSKSQ9UJT2 CSK-201ENST00000220003 2767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
TSKSQ9UJT2 PP7080-201ENST00000342584 1876 ntTSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
TSKSQ9UJT2 NGLY1-207ENST00000428257 2534 ntTSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
TSKSQ9UJT2 HOXA9-201ENST00000343483 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
TSKSQ9UJT2 ATP2A2-201ENST00000308664 4453 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
TSKSQ9UJT2 PNPO-201ENST00000225573 2256 ntTSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
TSKSQ9UJT2 NR4A2-204ENST00000409572 2878 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
TSKSQ9UJT2 RNF183-203ENST00000441031 1366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
TSKSQ9UJT2 ADAM33-203ENST00000379861 3674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
TSKSQ9UJT2 BCS1L-202ENST00000392109 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
TSKSQ9UJT2 BCS1L-204ENST00000392111 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
TSKSQ9UJT2 PCSK5-202ENST00000376767 2845 ntTSL 2 BASIC20.08■□□□□ 0.81
TSKSQ9UJT2 IGSF9B-206ENST00000533871 5050 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.81
TSKSQ9UJT2 KRT6A-201ENST00000330722 2310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
TSKSQ9UJT2 GCH1-207ENST00000622544 2923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
TSKSQ9UJT2 COL16A1-203ENST00000373672 5736 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.81
TSKSQ9UJT2 HNRNPM-201ENST00000325495 2494 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
TSKSQ9UJT2 CEACAM21-203ENST00000407170 1691 ntTSL 2 BASIC20.08■□□□□ 0.81
TSKSQ9UJT2 ZCCHC17-205ENST00000615916 1652 ntTSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
TSKSQ9UJT2 SRP19-201ENST00000282999 937 ntTSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
TSKSQ9UJT2 BLZF1-202ENST00000367807 1295 ntTSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31.1 ms