Protein–RNA interactions for Protein: Q9UJ98

STAG3, Cohesin subunit SA-3, humanhuman

Predictions only

Length 1,225 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
STAG3Q9UJ98 PIANP-201ENST00000320591 2323 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
STAG3Q9UJ98 UMOD-205ENST00000570689 2315 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.49■■□□□ 1.51
STAG3Q9UJ98 N4BP3-201ENST00000274605 6080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
STAG3Q9UJ98 TRAF3-203ENST00000392745 2459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
STAG3Q9UJ98 RASGRP1-201ENST00000310803 5023 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
STAG3Q9UJ98 RASGRP1-204ENST00000539159 5021 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.49■■□□□ 1.51
STAG3Q9UJ98 ERCC1-201ENST00000013807 1278 ntTSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
STAG3Q9UJ98 PENK-201ENST00000314922 1199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
STAG3Q9UJ98 TCEAL3-203ENST00000372628 1221 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.49■■□□□ 1.51
STAG3Q9UJ98 ADM2-201ENST00000395737 535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
STAG3Q9UJ98 RAB17-204ENST00000409822 1077 ntTSL 5 BASIC24.49■■□□□ 1.51
STAG3Q9UJ98 SS18L2-202ENST00000447630 1047 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.49■■□□□ 1.51
STAG3Q9UJ98 CPLX2-206ENST00000512824 518 ntTSL 4 BASIC24.49■■□□□ 1.51
STAG3Q9UJ98 AC027369.6-201ENST00000525520 931 ntBASIC24.49■■□□□ 1.51
STAG3Q9UJ98 TMEM120B-206ENST00000540377 962 ntTSL 3 BASIC24.49■■□□□ 1.51
STAG3Q9UJ98 AC013565.3-202ENST00000570120 460 ntTSL 2 BASIC24.49■■□□□ 1.51
STAG3Q9UJ98 AC009118.2-201ENST00000613275 655 ntBASIC24.49■■□□□ 1.51
STAG3Q9UJ98 GATA5-201ENST00000252997 2595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
STAG3Q9UJ98 TPD52-209ENST00000518937 2856 ntTSL 2 BASIC24.49■■□□□ 1.51
STAG3Q9UJ98 WDR4-201ENST00000330317 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
STAG3Q9UJ98 TLE3-214ENST00000558939 6004 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
STAG3Q9UJ98 FAM60A-203ENST00000454658 1555 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.49■■□□□ 1.51
STAG3Q9UJ98 REEP1-208ENST00000538924 1702 ntTSL 5 BASIC24.49■■□□□ 1.51
STAG3Q9UJ98 EGFL7-203ENST00000371699 2125 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.49■■□□□ 1.51
STAG3Q9UJ98 MAFF-207ENST00000538999 2365 ntTSL 2 BASIC24.49■■□□□ 1.51
STAG3Q9UJ98 DAG1-222ENST00000545947 5829 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.48■■□□□ 1.51
STAG3Q9UJ98 HBEGF-201ENST00000230990 2386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
STAG3Q9UJ98 RNF139-201ENST00000303545 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
STAG3Q9UJ98 P2RY2-201ENST00000311131 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
STAG3Q9UJ98 C11orf88-201ENST00000332814 795 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC24.48■■□□□ 1.51
STAG3Q9UJ98 KCNQ2-205ENST00000360480 2775 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.48■■□□□ 1.51
STAG3Q9UJ98 SMOC1-201ENST00000361956 2040 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
STAG3Q9UJ98 NDUFB8-202ENST00000370320 684 ntTSL 3 BASIC24.48■■□□□ 1.51
STAG3Q9UJ98 TMEM143-202ENST00000377431 1960 ntTSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
STAG3Q9UJ98 CRIP1-203ENST00000409393 677 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.48■■□□□ 1.51
STAG3Q9UJ98 LINC00475-203ENST00000417983 703 ntTSL 2 BASIC24.48■■□□□ 1.51
STAG3Q9UJ98 NEIL2-203ENST00000436750 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
STAG3Q9UJ98 FYCO1-203ENST00000438446 1072 ntTSL 5 BASIC24.48■■□□□ 1.51
STAG3Q9UJ98 FAM153A-203ENST00000440605 1966 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
STAG3Q9UJ98 EEF1D-205ENST00000442189 2207 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
STAG3Q9UJ98 PLCH2-205ENST00000449969 5450 ntTSL 5 BASIC24.48■■□□□ 1.51
STAG3Q9UJ98 AL627443.1-201ENST00000456477 1035 ntTSL 3 BASIC24.48■■□□□ 1.51
STAG3Q9UJ98 GNG4-205ENST00000484517 684 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.48■■□□□ 1.51
STAG3Q9UJ98 SLC25A30-AS1-201ENST00000506633 701 ntTSL 3 BASIC24.48■■□□□ 1.51
STAG3Q9UJ98 AGGF1-204ENST00000506806 1142 ntTSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
STAG3Q9UJ98 LACTB2-203ENST00000522447 1034 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.48■■□□□ 1.51
STAG3Q9UJ98 TOMM5-205ENST00000544379 635 ntTSL 2 BASIC24.48■■□□□ 1.51
STAG3Q9UJ98 SPATA8-AS1-201ENST00000558722 465 ntTSL 3 BASIC24.48■■□□□ 1.51
STAG3Q9UJ98 RBM15B-201ENST00000563281 6641 ntAPPRIS P1 BASIC24.48■■□□□ 1.51
STAG3Q9UJ98 AL596325.1-201ENST00000563991 1082 ntBASIC24.48■■□□□ 1.51
STAG3Q9UJ98 COQ9-214ENST00000567933 882 ntTSL 3 BASIC24.48■■□□□ 1.51
STAG3Q9UJ98 AL353732.1-201ENST00000569618 1459 ntBASIC24.48■■□□□ 1.51
STAG3Q9UJ98 LINC01451-201ENST00000623792 534 ntBASIC24.48■■□□□ 1.51
STAG3Q9UJ98 COBLL1-201ENST00000342193 4898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
STAG3Q9UJ98 PTPN21-208ENST00000556564 6166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
STAG3Q9UJ98 SPART-209ENST00000494062 3018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
STAG3Q9UJ98 TUBA4A-202ENST00000392088 2499 ntTSL 2 BASIC24.47■■□□□ 1.51
STAG3Q9UJ98 PTH2R-204ENST00000617735 2472 ntTSL 2 BASIC24.47■■□□□ 1.51
STAG3Q9UJ98 TBC1D19-201ENST00000264866 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
STAG3Q9UJ98 ZSWIM4-201ENST00000254323 4339 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.47■■□□□ 1.51
STAG3Q9UJ98 PLA2G4C-222ENST00000599921 1984 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
STAG3Q9UJ98 PODNL1-201ENST00000254320 1859 ntTSL 2 BASIC24.47■■□□□ 1.51
STAG3Q9UJ98 BIN1-208ENST00000376113 1832 ntTSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
STAG3Q9UJ98 SPAST-203ENST00000615843 5212 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
STAG3Q9UJ98 COTL1-203ENST00000564057 1677 ntTSL 5 BASIC24.47■■□□□ 1.51
STAG3Q9UJ98 MSL1-202ENST00000398532 4707 ntTSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
STAG3Q9UJ98 TSPAN4-205ENST00000397406 1426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
STAG3Q9UJ98 SYCE1-202ENST00000343131 1113 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
STAG3Q9UJ98 CYSRT1-201ENST00000409414 1297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
STAG3Q9UJ98 NME2P1-201ENST00000426182 414 ntBASIC24.47■■□□□ 1.51
STAG3Q9UJ98 TTC28-AS1-213ENST00000434221 972 ntTSL 3 BASIC24.47■■□□□ 1.51
STAG3Q9UJ98 RN7SL692P-201ENST00000464677 288 ntBASIC24.47■■□□□ 1.51
STAG3Q9UJ98 SMCO4-204ENST00000527149 472 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.47■■□□□ 1.51
STAG3Q9UJ98 SPDYE22P-201ENST00000582158 798 ntBASIC24.47■■□□□ 1.51
STAG3Q9UJ98 ELOF1-205ENST00000589171 743 ntTSL 3 BASIC24.47■■□□□ 1.51
STAG3Q9UJ98 AL359881.2-201ENST00000602973 570 ntBASIC24.47■■□□□ 1.51
STAG3Q9UJ98 EIF5-201ENST00000216554 5945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
STAG3Q9UJ98 ENTPD2-202ENST00000355097 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
STAG3Q9UJ98 IL1R1-205ENST00000410023 5143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
STAG3Q9UJ98 CHST11-201ENST00000303694 5709 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
STAG3Q9UJ98 SPSB1-201ENST00000328089 3120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
STAG3Q9UJ98 ZNF133-210ENST00000535822 2341 ntTSL 3 BASIC24.46■■□□□ 1.51
STAG3Q9UJ98 TPT1-AS1-215ENST00000522673 1519 ntTSL 5 BASIC24.46■■□□□ 1.51
STAG3Q9UJ98 FAM174A-201ENST00000312637 1356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
STAG3Q9UJ98 PLA2G2F-201ENST00000375102 2723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
STAG3Q9UJ98 SYNGR1-205ENST00000406293 564 ntTSL 2 BASIC24.46■■□□□ 1.51
STAG3Q9UJ98 MRPS18AP1-201ENST00000414458 589 ntBASIC24.46■■□□□ 1.51
STAG3Q9UJ98 AC092691.1-201ENST00000484092 554 ntTSL 4 BASIC24.46■■□□□ 1.51
STAG3Q9UJ98 AP002748.3-201ENST00000527092 828 ntTSL 3 BASIC24.46■■□□□ 1.51
STAG3Q9UJ98 TUBB3-203ENST00000553967 736 ntTSL 2 BASIC24.46■■□□□ 1.51
STAG3Q9UJ98 AC004233.3-201ENST00000607794 1269 ntBASIC24.46■■□□□ 1.51
STAG3Q9UJ98 AC073592.8-201ENST00000624126 511 ntBASIC24.46■■□□□ 1.51
STAG3Q9UJ98 TBXAS1-202ENST00000411653 1792 ntTSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
STAG3Q9UJ98 CLN8-211ENST00000636934 1790 ntTSL 5 BASIC24.46■■□□□ 1.51
STAG3Q9UJ98 APCDD1-201ENST00000355285 3809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
STAG3Q9UJ98 IQCE-210ENST00000438376 2170 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.46■■□□□ 1.51
STAG3Q9UJ98 ATP6AP2-224ENST00000637327 1929 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.45■■□□□ 1.51
STAG3Q9UJ98 AP000974.1-201ENST00000623909 2387 ntBASIC24.45■■□□□ 1.51
STAG3Q9UJ98 ADGRA3-202ENST00000334304 4566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
STAG3Q9UJ98 NT5C3A-204ENST00000405342 1759 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25 ms