Protein–RNA interactions for Protein: Q9UHC1

MLH3, DNA mismatch repair protein Mlh3, humanhuman

Predictions only

Length 1,453 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MLH3Q9UHC1 PSRC1-201ENST00000369903 1710 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC25.1■■□□□ 1.61
MLH3Q9UHC1 SEMA7A-203ENST00000543145 2304 ntTSL 2 BASIC25.1■■□□□ 1.61
MLH3Q9UHC1 ACTA1-201ENST00000366683 1122 ntTSL 5 BASIC25.09■■□□□ 1.61
MLH3Q9UHC1 AL133456.1-201ENST00000415655 577 ntTSL 4 BASIC25.09■■□□□ 1.61
MLH3Q9UHC1 CDK2AP2P3-201ENST00000422476 372 ntBASIC25.09■■□□□ 1.61
MLH3Q9UHC1 CC2D2B-203ENST00000423344 1241 ntTSL 2 BASIC25.09■■□□□ 1.61
MLH3Q9UHC1 STARD13-205ENST00000439831 945 ntTSL 2 BASIC25.09■■□□□ 1.61
MLH3Q9UHC1 AL606760.2-202ENST00000452466 524 ntTSL 5 BASIC25.09■■□□□ 1.61
MLH3Q9UHC1 CALML4-206ENST00000467889 987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
MLH3Q9UHC1 NEIL2-207ENST00000528323 998 ntTSL 2 BASIC25.09■■□□□ 1.61
MLH3Q9UHC1 CLNS1A-210ENST00000528364 953 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.09■■□□□ 1.61
MLH3Q9UHC1 AC026803.2-201ENST00000599784 819 ntTSL 3 BASIC25.09■■□□□ 1.61
MLH3Q9UHC1 RN7SL828P-201ENST00000607615 303 ntBASIC25.09■■□□□ 1.61
MLH3Q9UHC1 AC119396.1-201ENST00000576789 1558 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.09■■□□□ 1.61
MLH3Q9UHC1 EWSR1-208ENST00000414183 2189 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC25.09■■□□□ 1.61
MLH3Q9UHC1 DCLK2-207ENST00000635524 2153 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.09■■□□□ 1.61
MLH3Q9UHC1 HNF1B-201ENST00000613727 1546 ntTSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
MLH3Q9UHC1 HS6ST2-203ENST00000406696 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
MLH3Q9UHC1 CRLF3-201ENST00000324238 2957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
MLH3Q9UHC1 EDC3-202ENST00000426797 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
MLH3Q9UHC1 FCGRT-201ENST00000221466 1798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
MLH3Q9UHC1 ZFP1-209ENST00000570010 1457 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.09■■□□□ 1.61
MLH3Q9UHC1 TMEM64-203ENST00000458549 4997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
MLH3Q9UHC1 SLC39A7-201ENST00000374675 2153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
MLH3Q9UHC1 ARHGEF4-202ENST00000355771 1872 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
MLH3Q9UHC1 TOM1-201ENST00000382034 1300 ntTSL 5 BASIC25.09■■□□□ 1.61
MLH3Q9UHC1 PGM1-205ENST00000540265 2345 ntTSL 2 BASIC25.09■■□□□ 1.61
MLH3Q9UHC1 FOXR1-201ENST00000317011 1159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
MLH3Q9UHC1 PPP1R27-201ENST00000330261 782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
MLH3Q9UHC1 ING1-204ENST00000375775 1074 ntTSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
MLH3Q9UHC1 CIB3-202ENST00000379859 467 ntTSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
MLH3Q9UHC1 ZSCAN2-213ENST00000541040 965 ntTSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
MLH3Q9UHC1 DRAM1-202ENST00000544152 1048 ntTSL 2 BASIC25.09■■□□□ 1.61
MLH3Q9UHC1 YEATS4-202ENST00000548020 1100 ntTSL 2 BASIC25.09■■□□□ 1.61
MLH3Q9UHC1 AC132938.2-201ENST00000579188 680 ntBASIC25.09■■□□□ 1.61
MLH3Q9UHC1 DM1-AS-201ENST00000586251 483 ntTSL 2 BASIC25.09■■□□□ 1.61
MLH3Q9UHC1 AC006116.8-201ENST00000587004 987 ntTSL 2 BASIC25.09■■□□□ 1.61
MLH3Q9UHC1 ALKBH7-203ENST00000599849 556 ntTSL 3 BASIC25.09■■□□□ 1.61
MLH3Q9UHC1 LAMTOR5-208ENST00000614544 846 ntTSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
MLH3Q9UHC1 AL591163.1-201ENST00000641757 987 ntBASIC25.09■■□□□ 1.61
MLH3Q9UHC1 NFYC-210ENST00000425457 1536 ntTSL 2 BASIC25.08■■□□□ 1.61
MLH3Q9UHC1 GCSH-208ENST00000639169 2537 ntTSL 2 BASIC25.08■■□□□ 1.61
MLH3Q9UHC1 CYP2D6-204ENST00000389970 1714 ntTSL 5 BASIC25.08■■□□□ 1.61
MLH3Q9UHC1 CLDN14-204ENST00000399137 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
MLH3Q9UHC1 KREMEN1-203ENST00000407188 1422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
MLH3Q9UHC1 PDLIM3-201ENST00000284767 2589 ntTSL 5 BASIC25.08■■□□□ 1.61
MLH3Q9UHC1 SP9-201ENST00000394967 2554 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.08■■□□□ 1.61
MLH3Q9UHC1 AC005865.2-201ENST00000505276 2303 ntTSL 2 BASIC25.08■■□□□ 1.61
MLH3Q9UHC1 LYPLAL1-201ENST00000366927 1819 ntTSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
MLH3Q9UHC1 AL138781.2-201ENST00000617896 1843 ntBASIC25.08■■□□□ 1.61
MLH3Q9UHC1 SSB-202ENST00000409333 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
MLH3Q9UHC1 BANP-202ENST00000355022 2164 ntTSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
MLH3Q9UHC1 ANXA6-201ENST00000354546 2593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.6
MLH3Q9UHC1 PAGE5-201ENST00000289619 741 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.6
MLH3Q9UHC1 AQP7-204ENST00000379506 1062 ntTSL 2 BASIC25.08■■□□□ 1.6
MLH3Q9UHC1 IFITM3-201ENST00000399808 808 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.6
MLH3Q9UHC1 TMEM247-204ENST00000434431 680 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.08■■□□□ 1.6
MLH3Q9UHC1 DRAP1-208ENST00000532933 751 ntTSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.6
MLH3Q9UHC1 AC008969.1-205ENST00000553254 876 ntTSL 2 BASIC25.08■■□□□ 1.6
MLH3Q9UHC1 GNG2-209ENST00000555472 908 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.08■■□□□ 1.6
MLH3Q9UHC1 MIR6805-201ENST00000615055 62 ntBASIC25.08■■□□□ 1.6
MLH3Q9UHC1 AFF2-204ENST00000370458 1488 ntTSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.6
MLH3Q9UHC1 CCNA1-203ENST00000625767 1699 ntTSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.6
MLH3Q9UHC1 NOX4-201ENST00000263317 2388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
MLH3Q9UHC1 SEMA6C-209ENST00000613223 1950 ntTSL 5 BASIC25.07■■□□□ 1.6
MLH3Q9UHC1 NHLH2-201ENST00000320238 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
MLH3Q9UHC1 B4GALNT2-201ENST00000300404 1906 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
MLH3Q9UHC1 BCL2L11-201ENST00000308659 1522 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.07■■□□□ 1.6
MLH3Q9UHC1 NPNT-203ENST00000427316 2481 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.07■■□□□ 1.6
MLH3Q9UHC1 MAPT-215ENST00000574436 1326 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.07■■□□□ 1.6
MLH3Q9UHC1 COPS7A-204ENST00000534947 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
MLH3Q9UHC1 GBGT1-201ENST00000372036 871 ntTSL 3 BASIC25.07■■□□□ 1.6
MLH3Q9UHC1 CTRC-202ENST00000375949 898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
MLH3Q9UHC1 MRPS6-201ENST00000399312 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
MLH3Q9UHC1 RASL12-203ENST00000434605 982 ntTSL 2 BASIC25.07■■□□□ 1.6
MLH3Q9UHC1 HAUS2-211ENST00000639412 375 ntTSL 2 BASIC25.07■■□□□ 1.6
MLH3Q9UHC1 ODC1-201ENST00000234111 2653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
MLH3Q9UHC1 LINC00963-208ENST00000454968 1403 ntTSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
MLH3Q9UHC1 HLA-B-249ENST00000412585 1547 ntAPPRIS P1 BASIC25.06■■□□□ 1.6
MLH3Q9UHC1 ZNF789-201ENST00000331410 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
MLH3Q9UHC1 ZNF346-208ENST00000511834 2306 ntTSL 5 BASIC25.06■■□□□ 1.6
MLH3Q9UHC1 TCTN1-225ENST00000551590 2309 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
MLH3Q9UHC1 CEP78-202ENST00000376597 2618 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
MLH3Q9UHC1 CLDN14-201ENST00000342108 1453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
MLH3Q9UHC1 TSPAN7-202ENST00000378482 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
MLH3Q9UHC1 NDUFA2-201ENST00000252102 804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
MLH3Q9UHC1 LCN15-201ENST00000316144 762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
MLH3Q9UHC1 CLCN6-207ENST00000376497 814 ntTSL 3 BASIC25.06■■□□□ 1.6
MLH3Q9UHC1 ZFAND2B-203ENST00000409206 1159 ntTSL 2 BASIC25.06■■□□□ 1.6
MLH3Q9UHC1 ZFAND2B-212ENST00000444522 1199 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.06■■□□□ 1.6
MLH3Q9UHC1 AC135586.1-201ENST00000539323 574 ntBASIC25.06■■□□□ 1.6
MLH3Q9UHC1 AL589739.1-201ENST00000607720 493 ntBASIC25.06■■□□□ 1.6
MLH3Q9UHC1 E4F1-204ENST00000564139 2493 ntTSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
MLH3Q9UHC1 CLPB-212ENST00000543042 2133 ntTSL 2 BASIC25.06■■□□□ 1.6
MLH3Q9UHC1 FXYD6-204ENST00000526014 2171 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
MLH3Q9UHC1 GCGR-202ENST00000570996 1872 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.05■■□□□ 1.6
MLH3Q9UHC1 CCDC90B-202ENST00000455220 1550 ntTSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
MLH3Q9UHC1 KRT8P49-201ENST00000604166 1432 ntBASIC25.05■■□□□ 1.6
MLH3Q9UHC1 H2BFWT-201ENST00000217926 894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
MLH3Q9UHC1 PSMB9-207ENST00000374859 782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31 ms