Protein–RNA interactions for Protein: Q9UBF2

COPG2, Coatomer subunit gamma-2, humanhuman

Predictions only

Length 871 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
COPG2Q9UBF2 PGRMC2-207ENST00000520121 3785 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
COPG2Q9UBF2 CES3-203ENST00000543856 3178 ntTSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
COPG2Q9UBF2 TSC2-201ENST00000219476 6156 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
COPG2Q9UBF2 MTCL1-205ENST00000517570 6009 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
COPG2Q9UBF2 NDRG4-202ENST00000356752 1375 ntTSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
COPG2Q9UBF2 AC092171.3-201ENST00000610122 2651 ntBASIC17.14■□□□□ 0.34
COPG2Q9UBF2 CNTNAP3-201ENST00000297668 5064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.34
COPG2Q9UBF2 MAGI3-201ENST00000307546 6430 ntTSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
COPG2Q9UBF2 PCIF1-201ENST00000372409 2747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
COPG2Q9UBF2 ALDH3B1-208ENST00000617288 2078 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
COPG2Q9UBF2 AL021453.1-201ENST00000333487 2989 ntTSL 2 BASIC17.14■□□□□ 0.33
COPG2Q9UBF2 PHF1-202ENST00000374516 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
COPG2Q9UBF2 PALM-201ENST00000264560 2755 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC17.14■□□□□ 0.33
COPG2Q9UBF2 ZNF514-202ENST00000411425 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
COPG2Q9UBF2 SEMA5B-202ENST00000357599 4792 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
COPG2Q9UBF2 SPATA18-202ENST00000419395 2816 ntTSL 2 BASIC17.14■□□□□ 0.33
COPG2Q9UBF2 OTUD5-204ENST00000428668 1493 ntTSL 2 BASIC17.14■□□□□ 0.33
COPG2Q9UBF2 MED17-201ENST00000251871 5142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
COPG2Q9UBF2 HECTD2-204ENST00000446394 4939 ntTSL 2 BASIC17.14■□□□□ 0.33
COPG2Q9UBF2 ANGPTL4-202ENST00000393962 1705 ntTSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
COPG2Q9UBF2 TMTC2-201ENST00000321196 5681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
COPG2Q9UBF2 PXMP4-201ENST00000217398 979 ntTSL 2 BASIC17.14■□□□□ 0.33
COPG2Q9UBF2 TCEAL3-201ENST00000243286 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
COPG2Q9UBF2 NUDT6-201ENST00000304430 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
COPG2Q9UBF2 AURKAIP1-202ENST00000338338 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
COPG2Q9UBF2 TBC1D7-202ENST00000356436 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
COPG2Q9UBF2 NMRK1-202ENST00000376808 1121 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
COPG2Q9UBF2 TBC1D7-204ENST00000379300 1276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
COPG2Q9UBF2 FXN-203ENST00000396366 922 ntTSL 2 BASIC17.14■□□□□ 0.33
COPG2Q9UBF2 RNF216P1-205ENST00000406089 807 ntTSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
COPG2Q9UBF2 MOBP-204ENST00000420739 940 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
COPG2Q9UBF2 DMKN-215ENST00000451297 1111 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
COPG2Q9UBF2 GUSBP12-201ENST00000513727 720 ntBASIC17.14■□□□□ 0.33
COPG2Q9UBF2 COX6C-204ENST00000520271 571 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.14■□□□□ 0.33
COPG2Q9UBF2 AC109462.3-201ENST00000573934 613 ntBASIC17.14■□□□□ 0.33
COPG2Q9UBF2 CCDC106-206ENST00000591241 1153 ntTSL 3 BASIC17.14■□□□□ 0.33
COPG2Q9UBF2 KCNE1B-204ENST00000623803 811 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
COPG2Q9UBF2 LINC01714-202ENST00000635451 896 ntTSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
COPG2Q9UBF2 AL365255.1-201ENST00000637702 847 ntTSL 2 BASIC17.14■□□□□ 0.33
COPG2Q9UBF2 LFNG-207ENST00000614382 1969 ntTSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
COPG2Q9UBF2 ST8SIA4-202ENST00000451528 1794 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
COPG2Q9UBF2 OTUB1-202ENST00000422031 2297 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
COPG2Q9UBF2 RFXANK-205ENST00000456252 1325 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
COPG2Q9UBF2 PIAS3-201ENST00000369298 2761 ntTSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
COPG2Q9UBF2 HAUS8-201ENST00000253669 1568 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
COPG2Q9UBF2 NPC1L1-203ENST00000423141 2554 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
COPG2Q9UBF2 SLC35F3-202ENST00000366618 2891 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.14■□□□□ 0.33
COPG2Q9UBF2 TTC8-216ENST00000614125 2377 ntTSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
COPG2Q9UBF2 WTAP-205ENST00000614346 1623 ntTSL 2 BASIC17.14■□□□□ 0.33
COPG2Q9UBF2 TCF3-212ENST00000588136 2658 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.14■□□□□ 0.33
COPG2Q9UBF2 NIPA2-201ENST00000337451 3233 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
COPG2Q9UBF2 FAM214B-206ENST00000603301 3256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
COPG2Q9UBF2 FAM153A-203ENST00000440605 1966 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
COPG2Q9UBF2 POLD4-205ENST00000529704 1486 ntTSL 2 BASIC17.13■□□□□ 0.33
COPG2Q9UBF2 HEYL-201ENST00000372852 3661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
COPG2Q9UBF2 MARCH1-203ENST00000503008 5877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
COPG2Q9UBF2 KCTD20-202ENST00000373731 5619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
COPG2Q9UBF2 SMO-201ENST00000249373 3738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
COPG2Q9UBF2 CHGA-201ENST00000216492 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
COPG2Q9UBF2 RRBP1-208ENST00000470422 2070 ntTSL 2 BASIC17.13■□□□□ 0.33
COPG2Q9UBF2 TMTC4-203ENST00000376234 3483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
COPG2Q9UBF2 KIF16B-203ENST00000408042 4640 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
COPG2Q9UBF2 SULT2B1-201ENST00000201586 1295 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
COPG2Q9UBF2 INPP5F-203ENST00000369081 874 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
COPG2Q9UBF2 SZT2-202ENST00000372450 1191 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
COPG2Q9UBF2 ISG15-201ENST00000379389 711 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
COPG2Q9UBF2 LINC01770-202ENST00000430109 510 ntTSL 3 BASIC17.13■□□□□ 0.33
COPG2Q9UBF2 BOC-211ENST00000484034 1286 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
COPG2Q9UBF2 AC010463.1-201ENST00000596542 1207 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.13■□□□□ 0.33
COPG2Q9UBF2 WT1-209ENST00000530998 2421 ntTSL 2 BASIC17.13■□□□□ 0.33
COPG2Q9UBF2 COQ8A-202ENST00000366778 2743 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
COPG2Q9UBF2 KPNA2-202ENST00000537025 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
COPG2Q9UBF2 SYBU-230ENST00000532779 2765 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.13■□□□□ 0.33
COPG2Q9UBF2 AC091980.2-201ENST00000619056 2775 ntAPPRIS P1 BASIC17.13■□□□□ 0.33
COPG2Q9UBF2 AKIRIN1-201ENST00000372984 1330 ntTSL 2 BASIC17.13■□□□□ 0.33
COPG2Q9UBF2 CCDC74A-206ENST00000467992 1347 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
COPG2Q9UBF2 C2orf27B-201ENST00000623129 1325 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
COPG2Q9UBF2 DPEP1-203ENST00000421184 1647 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
COPG2Q9UBF2 OR6D1P-203ENST00000641209 4860 ntBASIC17.13■□□□□ 0.33
COPG2Q9UBF2 FAM234A-202ENST00000301679 1936 ntTSL 2 BASIC17.13■□□□□ 0.33
COPG2Q9UBF2 KLHDC3-202ENST00000326974 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
COPG2Q9UBF2 TMEM198B-203ENST00000482378 2230 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
COPG2Q9UBF2 CHST10-201ENST00000264249 2842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
COPG2Q9UBF2 PACS1-201ENST00000320580 4392 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
COPG2Q9UBF2 RNF19A-201ENST00000341084 4285 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
COPG2Q9UBF2 MIB2-217ENST00000504599 3311 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.13■□□□□ 0.33
COPG2Q9UBF2 GAS7-213ENST00000580865 2417 ntTSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
COPG2Q9UBF2 SLC39A8-201ENST00000356736 3144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
COPG2Q9UBF2 PICALM-219ENST00000532317 3474 ntTSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
COPG2Q9UBF2 FAM86DP-207ENST00000497543 2152 ntTSL 2 BASIC17.12■□□□□ 0.33
COPG2Q9UBF2 ARHGAP44-202ENST00000340825 4211 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
COPG2Q9UBF2 ARHGAP44-203ENST00000379672 4228 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
COPG2Q9UBF2 ADARB1-204ENST00000389863 3563 ntTSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
COPG2Q9UBF2 GTPBP3-201ENST00000324894 2579 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
COPG2Q9UBF2 MAP3K20-203ENST00000409176 2572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
COPG2Q9UBF2 TMED3-203ENST00000536821 2265 ntTSL 2 BASIC17.12■□□□□ 0.33
COPG2Q9UBF2 AIFM3-201ENST00000399163 2309 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
COPG2Q9UBF2 MRPL4-203ENST00000393733 1620 ntTSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
COPG2Q9UBF2 TMEM88-201ENST00000301599 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
COPG2Q9UBF2 ISCU-201ENST00000311893 994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 48.8 ms