Protein–RNA interactions for Protein: Q9P275

USP36, Ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 36, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 1,121 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
USP36Q9P275 AC015911.4-201ENST00000588022 1070 ntBASIC17.05■□□□□ 0.32
USP36Q9P275 PGPEP1-209ENST00000604499 769 ntTSL 5 BASIC17.05■□□□□ 0.32
USP36Q9P275 SPDYE10P-202ENST00000612005 668 ntBASIC17.05■□□□□ 0.32
USP36Q9P275 SPDYE8P-202ENST00000612377 668 ntBASIC17.05■□□□□ 0.32
USP36Q9P275 FNBP1-202ENST00000420781 5410 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
USP36Q9P275 ULK3-220ENST00000569437 2611 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
USP36Q9P275 KCTD20-210ENST00000536244 5345 ntTSL 2 BASIC17.05■□□□□ 0.32
USP36Q9P275 PRR36-202ENST00000618550 4456 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.05■□□□□ 0.32
USP36Q9P275 PRRT2-205ENST00000567659 1470 ntTSL 2 BASIC17.05■□□□□ 0.32
USP36Q9P275 CCKBR-203ENST00000525462 2138 ntTSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
USP36Q9P275 ERMARD-210ENST00000588451 2146 ntTSL 5 BASIC17.05■□□□□ 0.32
USP36Q9P275 VPS37B-201ENST00000267202 3028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
USP36Q9P275 FBXL15-201ENST00000224862 2362 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
USP36Q9P275 GPR135-201ENST00000395116 4578 ntAPPRIS P1 BASIC17.04■□□□□ 0.32
USP36Q9P275 LINC00887-203ENST00000429578 1717 ntTSL 2 BASIC17.04■□□□□ 0.32
USP36Q9P275 SYBU-224ENST00000529690 1983 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.04■□□□□ 0.32
USP36Q9P275 KRT86-202ENST00000423955 2217 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.04■□□□□ 0.32
USP36Q9P275 COBLL1-201ENST00000342193 4898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
USP36Q9P275 SLC35F5-201ENST00000245680 4412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
USP36Q9P275 MMD2-202ENST00000404774 2415 ntTSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
USP36Q9P275 CRYBA2-201ENST00000295728 893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
USP36Q9P275 YIF1B-201ENST00000329420 964 ntTSL 3 BASIC17.04■□□□□ 0.32
USP36Q9P275 WNT8B-201ENST00000343737 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
USP36Q9P275 NKAIN2-201ENST00000368416 1106 ntTSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
USP36Q9P275 LINC00404-201ENST00000418660 428 ntTSL 2 BASIC17.04■□□□□ 0.32
USP36Q9P275 SLC25A6P5-201ENST00000435663 894 ntBASIC17.04■□□□□ 0.32
USP36Q9P275 AL391845.1-202ENST00000449154 437 ntTSL 3 BASIC17.04■□□□□ 0.32
USP36Q9P275 RN7SL589P-201ENST00000481268 310 ntBASIC17.04■□□□□ 0.32
USP36Q9P275 AHSA1-202ENST00000535854 1173 ntTSL 2 BASIC17.04■□□□□ 0.32
USP36Q9P275 WDR25-203ENST00000542471 1214 ntTSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
USP36Q9P275 PML-221ENST00000569965 2148 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
USP36Q9P275 AC005412.3-201ENST00000580309 715 ntBASIC17.04■□□□□ 0.32
USP36Q9P275 AC005330.1-201ENST00000590086 1238 ntTSL 5 BASIC17.04■□□□□ 0.32
USP36Q9P275 MTX1-207ENST00000609421 1085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
USP36Q9P275 RSRP1-201ENST00000243189 1502 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
USP36Q9P275 SOST-201ENST00000301691 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
USP36Q9P275 HPSE-207ENST00000513463 1458 ntTSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
USP36Q9P275 IL15-201ENST00000296545 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
USP36Q9P275 SOCS2-AS1-202ENST00000500986 1655 ntTSL 2 BASIC17.04■□□□□ 0.32
USP36Q9P275 TNPO2-201ENST00000356861 4962 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
USP36Q9P275 GADD45B-201ENST00000215631 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
USP36Q9P275 FANCA-203ENST00000389302 1641 ntTSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
USP36Q9P275 ZNF517-201ENST00000359971 2335 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC17.03■□□□□ 0.32
USP36Q9P275 LRPPRC-203ENST00000409946 1848 ntTSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
USP36Q9P275 ZNF385B-204ENST00000410066 3288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
USP36Q9P275 FIGNL2-201ENST00000564840 4693 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.03■□□□□ 0.32
USP36Q9P275 GINM1-201ENST00000367419 2024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
USP36Q9P275 CLEC10A-201ENST00000254868 1797 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
USP36Q9P275 COQ6-220ENST00000629426 1538 ntTSL 5 BASIC17.03■□□□□ 0.32
USP36Q9P275 TCTN1-229ENST00000614115 1965 ntTSL 5 BASIC17.03■□□□□ 0.32
USP36Q9P275 RBX1-201ENST00000216225 1188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
USP36Q9P275 RESP18-201ENST00000333527 795 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
USP36Q9P275 UGGT2-202ENST00000376714 1233 ntTSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
USP36Q9P275 BCRP1-201ENST00000444246 691 ntBASIC17.03■□□□□ 0.32
USP36Q9P275 LINC01143-201ENST00000449073 625 ntTSL 2 BASIC17.03■□□□□ 0.32
USP36Q9P275 REEP2-206ENST00000506158 1021 ntTSL 2 BASIC17.03■□□□□ 0.32
USP36Q9P275 SERF1A-207ENST00000512649 846 ntTSL 2 BASIC17.03■□□□□ 0.32
USP36Q9P275 BATF2-204ENST00000527716 1230 ntTSL 2 BASIC17.03■□□□□ 0.32
USP36Q9P275 JPH4-203ENST00000544177 1124 ntTSL 2 BASIC17.03■□□□□ 0.32
USP36Q9P275 FAM177A1-207ENST00000554052 540 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.03■□□□□ 0.32
USP36Q9P275 AC090515.4-201ENST00000558042 450 ntTSL 3 BASIC17.03■□□□□ 0.32
USP36Q9P275 AL138781.1-202ENST00000563018 775 ntTSL 3 BASIC17.03■□□□□ 0.32
USP36Q9P275 AL096865.1-201ENST00000606796 927 ntBASIC17.03■□□□□ 0.32
USP36Q9P275 GRIFIN-202ENST00000614228 461 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.03■□□□□ 0.32
USP36Q9P275 UGGT2-212ENST00000621375 1004 ntTSL 5 BASIC17.03■□□□□ 0.32
USP36Q9P275 UGGT2-213ENST00000638479 1010 ntTSL 5 BASIC17.03■□□□□ 0.32
USP36Q9P275 MECP2-205ENST00000453960 1729 ntTSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
USP36Q9P275 MAN2A1-201ENST00000261483 4667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
USP36Q9P275 POLR3D-201ENST00000306433 1931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
USP36Q9P275 DCAF4-201ENST00000353777 1940 ntTSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
USP36Q9P275 CDK13-201ENST00000181839 7298 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
USP36Q9P275 RPAP3-203ENST00000432584 2133 ntTSL 2 BASIC17.03■□□□□ 0.32
USP36Q9P275 RNF157-201ENST00000269391 4955 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
USP36Q9P275 SYTL3-201ENST00000297239 2292 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
USP36Q9P275 AR-209ENST00000613054 3532 ntTSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
USP36Q9P275 UBN1-201ENST00000262376 6252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
USP36Q9P275 CLASRP-201ENST00000221455 2234 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
USP36Q9P275 MAP4K1-203ENST00000586296 1363 ntTSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.32
USP36Q9P275 SCARF1-202ENST00000348987 2619 ntTSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
USP36Q9P275 CTSB-202ENST00000353047 3875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
USP36Q9P275 MTERF2-201ENST00000240050 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
USP36Q9P275 MAPT-209ENST00000446361 5345 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
USP36Q9P275 KANK3-201ENST00000330915 2787 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
USP36Q9P275 AKAP8P1-201ENST00000434743 1349 ntBASIC17.02■□□□□ 0.32
USP36Q9P275 PJA1-202ENST00000374571 2672 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
USP36Q9P275 ECE1-203ENST00000374893 2484 ntTSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
USP36Q9P275 CBS-203ENST00000398158 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
USP36Q9P275 CBSL-206ENST00000624406 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
USP36Q9P275 ENOSF1-202ENST00000340116 1658 ntTSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.32
USP36Q9P275 CENPM-201ENST00000215980 966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
USP36Q9P275 CLIC1-208ENST00000375784 1254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
USP36Q9P275 HMGA1P7-201ENST00000406908 502 ntBASIC17.02■□□□□ 0.32
USP36Q9P275 TFAMP1-201ENST00000412727 736 ntBASIC17.02■□□□□ 0.32
USP36Q9P275 WDR53-203ENST00000429115 683 ntTSL 2 BASIC17.02■□□□□ 0.32
USP36Q9P275 ITGA9-AS1-209ENST00000450990 562 ntTSL 4 BASIC17.02■□□□□ 0.32
USP36Q9P275 LAMTOR4-206ENST00000473459 720 ntTSL 2 BASIC17.02■□□□□ 0.32
USP36Q9P275 SLBP-205ENST00000488267 987 ntTSL 2 BASIC17.02■□□□□ 0.32
USP36Q9P275 AC079140.1-201ENST00000508039 487 ntBASIC17.02■□□□□ 0.32
USP36Q9P275 AC087276.3-201ENST00000526220 787 ntTSL 3 BASIC17.02■□□□□ 0.32
USP36Q9P275 LINC01481-203ENST00000549651 883 ntTSL 2 BASIC17.02■□□□□ 0.32
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 38.8 ms