Protein–RNA interactions for Protein: Q9NZN3

EHD3, EH domain-containing protein 3, humanhuman

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Length 535 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EHD3Q9NZN3 AC009336.1-201ENST00000608941 1553 ntBASIC16.47■□□□□ 0.23
EHD3Q9NZN3 RTEL1-TNFRSF6B-202ENST00000482936 4931 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
EHD3Q9NZN3 NFATC4-222ENST00000555590 2830 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
EHD3Q9NZN3 WWTR1-201ENST00000360632 2103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
EHD3Q9NZN3 PARP9-204ENST00000471785 3040 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.23
EHD3Q9NZN3 DCST1-202ENST00000368419 2207 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
EHD3Q9NZN3 ZGLP1-202ENST00000403903 2303 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
EHD3Q9NZN3 TBL3-205ENST00000568546 6803 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
EHD3Q9NZN3 KLC1-207ENST00000445352 2416 ntTSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
EHD3Q9NZN3 SLC9A6-203ENST00000370701 4755 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
EHD3Q9NZN3 ATP6V0E2-202ENST00000425642 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
EHD3Q9NZN3 TMEFF2-201ENST00000272771 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
EHD3Q9NZN3 CENPX-201ENST00000306704 751 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
EHD3Q9NZN3 ITM2C-204ENST00000409704 1106 ntTSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
EHD3Q9NZN3 CYHR1-203ENST00000424149 1162 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
EHD3Q9NZN3 B4GALT1-AS1-202ENST00000442432 843 ntTSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.23
EHD3Q9NZN3 AC092338.2-202ENST00000567158 611 ntTSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
EHD3Q9NZN3 LINC00910-203ENST00000587874 544 ntTSL 4 BASIC16.46■□□□□ 0.23
EHD3Q9NZN3 CYP1B1-AS1-214ENST00000620177 554 ntTSL 4 BASIC16.46■□□□□ 0.23
EHD3Q9NZN3 YTHDF3-212ENST00000621413 2370 ntTSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
EHD3Q9NZN3 IRF5-210ENST00000477535 1374 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
EHD3Q9NZN3 NEIL2-203ENST00000436750 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
EHD3Q9NZN3 GNAI2-204ENST00000440628 1663 ntTSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
EHD3Q9NZN3 GXYLT2-201ENST00000389617 3260 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.22
EHD3Q9NZN3 MOB3A-201ENST00000357066 3391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.22
EHD3Q9NZN3 WBP2-204ENST00000585462 1895 ntTSL 3 BASIC16.46■□□□□ 0.22
EHD3Q9NZN3 SCNN1D-206ENST00000400928 2731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.22
EHD3Q9NZN3 TBXAS1-210ENST00000458722 2057 ntTSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.22
EHD3Q9NZN3 ADORA1-204ENST00000367236 3407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
EHD3Q9NZN3 DOCK7-203ENST00000404627 2678 ntTSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
EHD3Q9NZN3 TAF3-201ENST00000344293 4872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
EHD3Q9NZN3 WTAP-205ENST00000614346 1623 ntTSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
EHD3Q9NZN3 TSC2-207ENST00000439673 5287 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
EHD3Q9NZN3 RDH12-201ENST00000267502 1833 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
EHD3Q9NZN3 AC132938.5-201ENST00000624980 1813 ntBASIC16.45■□□□□ 0.22
EHD3Q9NZN3 TSPAN7-202ENST00000378482 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
EHD3Q9NZN3 FENDRR-206ENST00000599749 2843 ntTSL 3 BASIC16.45■□□□□ 0.22
EHD3Q9NZN3 NEURL2-201ENST00000372518 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
EHD3Q9NZN3 RCN1P2-201ENST00000398357 915 ntBASIC16.45■□□□□ 0.22
EHD3Q9NZN3 TP53TG1-202ENST00000416560 710 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
EHD3Q9NZN3 AL096828.1-201ENST00000423020 542 ntTSL 4 BASIC16.45■□□□□ 0.22
EHD3Q9NZN3 AC068134.1-202ENST00000439072 356 ntTSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
EHD3Q9NZN3 SRP19-202ENST00000445150 833 ntTSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
EHD3Q9NZN3 AP000344.1-201ENST00000454268 641 ntTSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
EHD3Q9NZN3 AP000344.1-202ENST00000457193 586 ntTSL 4 BASIC16.45■□□□□ 0.22
EHD3Q9NZN3 STK19B-204ENST00000512515 211 ntBASIC16.45■□□□□ 0.22
EHD3Q9NZN3 COX5A-202ENST00000562233 441 ntTSL 3 BASIC16.45■□□□□ 0.22
EHD3Q9NZN3 COX5A-204ENST00000567270 579 ntTSL 3 BASIC16.45■□□□□ 0.22
EHD3Q9NZN3 SCAMP4-213ENST00000621748 1172 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
EHD3Q9NZN3 SETD3-209ENST00000630307 1281 ntTSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
EHD3Q9NZN3 WDR90-202ENST00000315764 1454 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
EHD3Q9NZN3 DDHD2-201ENST00000397166 4921 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
EHD3Q9NZN3 TTC29-201ENST00000325106 1785 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
EHD3Q9NZN3 TTC29-205ENST00000504425 1777 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
EHD3Q9NZN3 EPHX2-204ENST00000518379 1959 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
EHD3Q9NZN3 USP27X-AS1-201ENST00000437322 2175 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
EHD3Q9NZN3 MAN2A2-216ENST00000559717 6704 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
EHD3Q9NZN3 MANSC1-202ENST00000535902 5831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
EHD3Q9NZN3 NTRK1-202ENST00000368196 2701 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
EHD3Q9NZN3 RAD1-202ENST00000341754 2341 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
EHD3Q9NZN3 CLDN15-202ENST00000401528 2131 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
EHD3Q9NZN3 DAGLB-202ENST00000425398 2044 ntTSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
EHD3Q9NZN3 GOLGA7-202ENST00000405786 1903 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
EHD3Q9NZN3 ASB10-202ENST00000377867 1738 ntTSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
EHD3Q9NZN3 ALKBH5-203ENST00000541285 1605 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
EHD3Q9NZN3 AL121761.2-201ENST00000598007 1648 ntBASIC16.45■□□□□ 0.22
EHD3Q9NZN3 ANKRD17-201ENST00000330838 7734 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
EHD3Q9NZN3 RPAIN-203ENST00000381209 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
EHD3Q9NZN3 GJA8-201ENST00000369235 1302 ntAPPRIS P1 BASIC16.45■□□□□ 0.22
EHD3Q9NZN3 C8orf46-215ENST00000522977 1347 ntTSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
EHD3Q9NZN3 SLC19A2-202ENST00000367804 2976 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
EHD3Q9NZN3 VPS37C-201ENST00000301765 2865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
EHD3Q9NZN3 DNM2-201ENST00000355667 3541 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
EHD3Q9NZN3 SLC25A23-202ENST00000301454 3425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
EHD3Q9NZN3 CHRNA7-207ENST00000635884 1975 ntTSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
EHD3Q9NZN3 MAP4K3-201ENST00000263881 4362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
EHD3Q9NZN3 ST3GAL6-214ENST00000483910 1886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
EHD3Q9NZN3 ZNF618-203ENST00000374126 3018 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
EHD3Q9NZN3 ST8SIA4-202ENST00000451528 1794 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
EHD3Q9NZN3 CRTC3-202ENST00000420329 5209 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
EHD3Q9NZN3 VPS13B-201ENST00000355155 2822 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
EHD3Q9NZN3 MTG1-201ENST00000317502 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
EHD3Q9NZN3 CHGA-202ENST00000334654 1474 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
EHD3Q9NZN3 NDRG4-202ENST00000356752 1375 ntTSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
EHD3Q9NZN3 FAM237A-203ENST00000543490 1376 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
EHD3Q9NZN3 SLC47A1-209ENST00000575023 2224 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
EHD3Q9NZN3 KLF4P1-201ENST00000412782 1185 ntBASIC16.44■□□□□ 0.22
EHD3Q9NZN3 LINC02237-202ENST00000521904 477 ntTSL 3 BASIC16.44■□□□□ 0.22
EHD3Q9NZN3 SELENOH-204ENST00000534355 818 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
EHD3Q9NZN3 PNN-202ENST00000553331 656 ntTSL 3 BASIC16.44■□□□□ 0.22
EHD3Q9NZN3 FUT6-212ENST00000592563 1095 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
EHD3Q9NZN3 CCNC-219ENST00000627680 896 ntTSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
EHD3Q9NZN3 GDF6-201ENST00000287020 3701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
EHD3Q9NZN3 CDS1-201ENST00000295887 4461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
EHD3Q9NZN3 SEMA3B-204ENST00000433753 2755 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
EHD3Q9NZN3 RHBDF1P1-201ENST00000427504 1941 ntBASIC16.44■□□□□ 0.22
EHD3Q9NZN3 RAN-212ENST00000543796 2661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
EHD3Q9NZN3 GFOD1-203ENST00000379287 8751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
EHD3Q9NZN3 AC093525.9-201ENST00000624961 1746 ntBASIC16.44■□□□□ 0.22
EHD3Q9NZN3 PAPD5-203ENST00000561678 2916 ntTSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
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