Protein–RNA interactions for Protein: Q9HCS2

CYP4F12, Cytochrome P450 4F12, humanhuman

Predictions only

Length 524 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CYP4F12Q9HCS2 MATN3-201ENST00000407540 2524 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
CYP4F12Q9HCS2 C16orf70-208ENST00000569600 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
CYP4F12Q9HCS2 MFSD2A-201ENST00000372809 2173 ntTSL 2 BASIC17.4■□□□□ 0.38
CYP4F12Q9HCS2 TBX6-203ENST00000553607 2162 ntTSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
CYP4F12Q9HCS2 CLDN11-201ENST00000064724 2169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
CYP4F12Q9HCS2 AL138752.2-201ENST00000540557 2591 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.4■□□□□ 0.38
CYP4F12Q9HCS2 ARL4C-202ENST00000390645 4013 ntAPPRIS P1 BASIC17.4■□□□□ 0.38
CYP4F12Q9HCS2 SLCO5A1-206ENST00000530307 2630 ntTSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
CYP4F12Q9HCS2 CCZ1-207ENST00000628813 2218 ntTSL 2 BASIC17.4■□□□□ 0.38
CYP4F12Q9HCS2 CDK11B-207ENST00000626918 2457 ntTSL 5 BASIC17.4■□□□□ 0.38
CYP4F12Q9HCS2 CDK11B-208ENST00000629289 2490 ntTSL 5 BASIC17.4■□□□□ 0.38
CYP4F12Q9HCS2 CDK11B-209ENST00000629312 2496 ntTSL 5 BASIC17.4■□□□□ 0.38
CYP4F12Q9HCS2 ELOA3-201ENST00000330682 1877 ntAPPRIS P1 BASIC17.4■□□□□ 0.38
CYP4F12Q9HCS2 ZBTB5-201ENST00000307750 4627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
CYP4F12Q9HCS2 FCER2-202ENST00000360067 1482 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.4■□□□□ 0.38
CYP4F12Q9HCS2 SNX14-210ENST00000505648 3193 ntTSL 2 BASIC17.4■□□□□ 0.38
CYP4F12Q9HCS2 KRTAP1-1-201ENST00000306271 903 ntAPPRIS P1 BASIC17.4■□□□□ 0.38
CYP4F12Q9HCS2 TSPY2-201ENST00000320701 1161 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
CYP4F12Q9HCS2 CELA2A-201ENST00000359621 919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
CYP4F12Q9HCS2 TLE1-202ENST00000376484 666 ntTSL 3 BASIC17.4■□□□□ 0.38
CYP4F12Q9HCS2 COLEC11-207ENST00000404205 1062 ntTSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
CYP4F12Q9HCS2 DMKN-206ENST00000418261 1257 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
CYP4F12Q9HCS2 TSPY2-203ENST00000429039 779 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.4■□□□□ 0.38
CYP4F12Q9HCS2 HNRNPDP1-201ENST00000439535 754 ntBASIC17.4■□□□□ 0.38
CYP4F12Q9HCS2 NDUFB2-209ENST00000472695 503 ntTSL 5 BASIC17.4■□□□□ 0.38
CYP4F12Q9HCS2 AC008105.3-202ENST00000585471 1077 ntTSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
CYP4F12Q9HCS2 AC008878.2-201ENST00000601870 942 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC17.4■□□□□ 0.38
CYP4F12Q9HCS2 LINC01197-204ENST00000611265 956 ntTSL 5 BASIC17.4■□□□□ 0.38
CYP4F12Q9HCS2 AL139288.1-201ENST00000623748 933 ntBASIC17.4■□□□□ 0.38
CYP4F12Q9HCS2 AC064853.6-201ENST00000642029 303 ntAPPRIS P1 BASIC17.4■□□□□ 0.38
CYP4F12Q9HCS2 CBWD1-202ENST00000356521 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
CYP4F12Q9HCS2 TMEM59L-205ENST00000600490 1717 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.4■□□□□ 0.38
CYP4F12Q9HCS2 CHTOP-203ENST00000368690 2165 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
CYP4F12Q9HCS2 FOSB-209ENST00000590335 2170 ntTSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
CYP4F12Q9HCS2 PGRMC1-202ENST00000535419 1762 ntTSL 2 BASIC17.4■□□□□ 0.38
CYP4F12Q9HCS2 NAGPA-201ENST00000312251 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
CYP4F12Q9HCS2 ZBTB7C-221ENST00000590800 4947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
CYP4F12Q9HCS2 CPT2-210ENST00000637252 2739 ntTSL 5 BASIC17.4■□□□□ 0.38
CYP4F12Q9HCS2 TTLL10-202ENST00000379289 2259 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.4■□□□□ 0.38
CYP4F12Q9HCS2 EIF3L-202ENST00000406934 2282 ntTSL 2 BASIC17.4■□□□□ 0.38
CYP4F12Q9HCS2 SYT15-201ENST00000374321 1369 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC17.4■□□□□ 0.38
CYP4F12Q9HCS2 C4orf50-202ENST00000531445 6860 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC17.4■□□□□ 0.38
CYP4F12Q9HCS2 TOM1L1-221ENST00000575882 2507 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
CYP4F12Q9HCS2 DPF2-205ENST00000528416 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
CYP4F12Q9HCS2 SNX16-201ENST00000345957 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.38
CYP4F12Q9HCS2 RSRC1-211ENST00000480820 1410 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.39■□□□□ 0.38
CYP4F12Q9HCS2 CLEC10A-204ENST00000571664 1442 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.38
CYP4F12Q9HCS2 MIOX-202ENST00000395732 1658 ntTSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
CYP4F12Q9HCS2 ERO1A-201ENST00000395686 5285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
CYP4F12Q9HCS2 LYRM9-203ENST00000460380 2196 ntTSL 2 BASIC17.39■□□□□ 0.37
CYP4F12Q9HCS2 IFNL4-204ENST00000634967 1493 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
CYP4F12Q9HCS2 NSUN5P2-205ENST00000602348 1776 ntTSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
CYP4F12Q9HCS2 NANS-201ENST00000210444 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
CYP4F12Q9HCS2 RALGDS-205ENST00000393160 3801 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
CYP4F12Q9HCS2 POMC-203ENST00000395826 959 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.39■□□□□ 0.37
CYP4F12Q9HCS2 ODF3B-202ENST00000401779 869 ntTSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
CYP4F12Q9HCS2 ODF3B-203ENST00000403326 643 ntTSL 3 BASIC17.39■□□□□ 0.37
CYP4F12Q9HCS2 ODF3B-205ENST00000428989 762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
CYP4F12Q9HCS2 KLK12-203ENST00000525263 1077 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
CYP4F12Q9HCS2 C12orf76-202ENST00000546627 461 ntTSL 4 BASIC17.39■□□□□ 0.37
CYP4F12Q9HCS2 YPEL3-209ENST00000566595 796 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.39■□□□□ 0.37
CYP4F12Q9HCS2 AL049840.3-201ENST00000602669 611 ntBASIC17.39■□□□□ 0.37
CYP4F12Q9HCS2 GPX4-212ENST00000616066 924 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.39■□□□□ 0.37
CYP4F12Q9HCS2 BX640515.1-201ENST00000617215 977 ntBASIC17.39■□□□□ 0.37
CYP4F12Q9HCS2 LRRC23-215ENST00000622489 1061 ntTSL 5 BASIC17.39■□□□□ 0.37
CYP4F12Q9HCS2 AD001527.2-201ENST00000622994 785 ntBASIC17.39■□□□□ 0.37
CYP4F12Q9HCS2 NAA50-201ENST00000240922 6135 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
CYP4F12Q9HCS2 PMPCAP1-201ENST00000508114 1576 ntBASIC17.39■□□□□ 0.37
CYP4F12Q9HCS2 CASZ1-202ENST00000377022 7936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
CYP4F12Q9HCS2 AC011676.5-201ENST00000624864 2660 ntBASIC17.39■□□□□ 0.37
CYP4F12Q9HCS2 CD24-201ENST00000606017 2180 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
CYP4F12Q9HCS2 AKIRIN1-202ENST00000432648 2741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
CYP4F12Q9HCS2 KDM5C-204ENST00000375401 6031 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
CYP4F12Q9HCS2 TGDS-201ENST00000261296 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
CYP4F12Q9HCS2 ITGB7-202ENST00000422257 2791 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.39■□□□□ 0.37
CYP4F12Q9HCS2 COBL-201ENST00000265136 5291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
CYP4F12Q9HCS2 MOV10L1-203ENST00000395852 1422 ntTSL 2 BASIC17.38■□□□□ 0.37
CYP4F12Q9HCS2 RPL13P5-202ENST00000412023 1438 ntTSL 2 BASIC17.38■□□□□ 0.37
CYP4F12Q9HCS2 NKILA-202ENST00000614771 2598 ntBASIC17.38■□□□□ 0.37
CYP4F12Q9HCS2 AC003002.1-202ENST00000596755 1743 ntAPPRIS P1 BASIC17.38■□□□□ 0.37
CYP4F12Q9HCS2 PFKFB3-215ENST00000536985 2094 ntTSL 2 BASIC17.38■□□□□ 0.37
CYP4F12Q9HCS2 VAC14-201ENST00000261776 3099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
CYP4F12Q9HCS2 SSBP3-203ENST00000371319 1578 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.38■□□□□ 0.37
CYP4F12Q9HCS2 RPS12-201ENST00000230050 631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
CYP4F12Q9HCS2 TFF3-201ENST00000291525 407 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
CYP4F12Q9HCS2 RPS2P28-201ENST00000314255 741 ntBASIC17.38■□□□□ 0.37
CYP4F12Q9HCS2 RPS2P1-201ENST00000434010 821 ntBASIC17.38■□□□□ 0.37
CYP4F12Q9HCS2 NKTR-203ENST00000442970 646 ntTSL 2 BASIC17.38■□□□□ 0.37
CYP4F12Q9HCS2 RAB42-202ENST00000465518 857 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.38■□□□□ 0.37
CYP4F12Q9HCS2 BLOC1S6-214ENST00000567461 1052 ntTSL 2 BASIC17.38■□□□□ 0.37
CYP4F12Q9HCS2 TMED1-207ENST00000591695 809 ntTSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
CYP4F12Q9HCS2 FUT6-212ENST00000592563 1095 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
CYP4F12Q9HCS2 ANO2-212ENST00000612575 1087 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
CYP4F12Q9HCS2 FAM215A-202ENST00000632077 792 ntBASIC17.38■□□□□ 0.37
CYP4F12Q9HCS2 TMEM130-202ENST00000345589 2261 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
CYP4F12Q9HCS2 RGL3-202ENST00000393423 2278 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
CYP4F12Q9HCS2 PHKA1-205ENST00000541944 5944 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
CYP4F12Q9HCS2 RHBDF1-201ENST00000262316 2992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
CYP4F12Q9HCS2 PROK1-201ENST00000271331 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
CYP4F12Q9HCS2 IL9RP2-201ENST00000423948 1312 ntBASIC17.38■□□□□ 0.37
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 42.8 ms