Protein–RNA interactions for Protein: Q9H347

UBQLN3, Ubiquilin-3, humanhuman

Predictions only

Length 655 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
UBQLN3Q9H347 NRXN1-209ENST00000405581 5078 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
UBQLN3Q9H347 RSRC1-211ENST00000480820 1410 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
UBQLN3Q9H347 CFL1-203ENST00000525451 1878 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
UBQLN3Q9H347 CCDC184-201ENST00000316554 2343 ntAPPRIS P1 BASIC15.95■□□□□ 0.14
UBQLN3Q9H347 PRDM5-203ENST00000428209 2338 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
UBQLN3Q9H347 ITGB7-202ENST00000422257 2791 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
UBQLN3Q9H347 ROBO3-221ENST00000543966 1520 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
UBQLN3Q9H347 EPHX2-204ENST00000518379 1959 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
UBQLN3Q9H347 MIB2-232ENST00000520777 3321 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
UBQLN3Q9H347 LGMN-201ENST00000334869 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
UBQLN3Q9H347 PITHD1-201ENST00000246151 1603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
UBQLN3Q9H347 SLC12A2-208ENST00000628403 3617 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
UBQLN3Q9H347 TBL2-201ENST00000305632 3161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
UBQLN3Q9H347 Metazoa_SRP.28-201ENST00000366402 260 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
UBQLN3Q9H347 SERF1B-202ENST00000380751 703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
UBQLN3Q9H347 AL031284.1-201ENST00000419297 478 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
UBQLN3Q9H347 AC005104.2-201ENST00000427818 678 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
UBQLN3Q9H347 MPIG6B-210ENST00000480039 790 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
UBQLN3Q9H347 CNOT8-225ENST00000524105 904 ntTSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
UBQLN3Q9H347 NCAM1-AS1-202ENST00000533638 618 ntTSL 4 BASIC15.95■□□□□ 0.14
UBQLN3Q9H347 ARAP1-AS1-201ENST00000542022 388 ntTSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
UBQLN3Q9H347 AL162171.1-201ENST00000556328 718 ntTSL 3 BASIC15.95■□□□□ 0.14
UBQLN3Q9H347 AP001005.1-201ENST00000571755 1248 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
UBQLN3Q9H347 AC025062.2-201ENST00000605477 670 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
UBQLN3Q9H347 SCUBE2-202ENST00000450649 2912 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
UBQLN3Q9H347 PPP3CA-203ENST00000394854 4685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
UBQLN3Q9H347 ARFRP1-213ENST00000619493 2456 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.95■□□□□ 0.14
UBQLN3Q9H347 CDK11B-208ENST00000629289 2490 ntTSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
UBQLN3Q9H347 CDK11B-209ENST00000629312 2496 ntTSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
UBQLN3Q9H347 FAM208A-209ENST00000493960 5600 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
UBQLN3Q9H347 MBD4-202ENST00000393278 1684 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
UBQLN3Q9H347 DPP9-AS1-201ENST00000381796 3071 ntTSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
UBQLN3Q9H347 ST6GALNAC6-202ENST00000373141 2424 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
UBQLN3Q9H347 SYBU-224ENST00000529690 1983 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
UBQLN3Q9H347 SLC52A1-201ENST00000254853 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
UBQLN3Q9H347 SRRM2-201ENST00000301740 9353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
UBQLN3Q9H347 SYVN1-203ENST00000377190 3052 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
UBQLN3Q9H347 DDHD1-201ENST00000323669 5503 ntTSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
UBQLN3Q9H347 RUNX1-203ENST00000358356 2720 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
UBQLN3Q9H347 PITPNA-202ENST00000539476 3612 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
UBQLN3Q9H347 LGALS1-201ENST00000215909 560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
UBQLN3Q9H347 GHSR-201ENST00000241256 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
UBQLN3Q9H347 MRPS18A-201ENST00000372116 785 ntTSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
UBQLN3Q9H347 POMC-203ENST00000395826 959 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
UBQLN3Q9H347 DMKN-206ENST00000418261 1257 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
UBQLN3Q9H347 HNRNPDP1-201ENST00000439535 754 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
UBQLN3Q9H347 PRYP5-201ENST00000451909 266 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
UBQLN3Q9H347 AC002558.1-201ENST00000488906 803 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
UBQLN3Q9H347 CDK2AP1-207ENST00000618072 1144 ntTSL 3 BASIC15.94■□□□□ 0.14
UBQLN3Q9H347 IL18BP-214ENST00000620017 1566 ntTSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
UBQLN3Q9H347 LGALS12-201ENST00000255684 1667 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
UBQLN3Q9H347 GAREM2-202ENST00000407684 5138 ntTSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
UBQLN3Q9H347 C14orf93-204ENST00000397377 1776 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
UBQLN3Q9H347 NUP62-211ENST00000597029 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
UBQLN3Q9H347 DNAJA3-202ENST00000355296 2591 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
UBQLN3Q9H347 FAM174B-201ENST00000327355 2792 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
UBQLN3Q9H347 TMEM189-UBE2V1-201ENST00000341698 2757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
UBQLN3Q9H347 ADAMTSL5-201ENST00000330475 2857 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
UBQLN3Q9H347 RECK-201ENST00000377966 4888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
UBQLN3Q9H347 PTP4A1-201ENST00000370651 5088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
UBQLN3Q9H347 ASPM-201ENST00000294732 6132 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
UBQLN3Q9H347 ARL6IP6-201ENST00000326446 2805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
UBQLN3Q9H347 PACS2-205ENST00000547217 2809 ntTSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
UBQLN3Q9H347 CLDN15-208ENST00000611078 1509 ntTSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
UBQLN3Q9H347 FUT8-AS1-201ENST00000621019 1521 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
UBQLN3Q9H347 CRTC3-208ENST00000560098 1421 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
UBQLN3Q9H347 LZTS3-203ENST00000360342 4055 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
UBQLN3Q9H347 MAFB-201ENST00000373313 3393 ntAPPRIS P1 BASIC15.93■□□□□ 0.14
UBQLN3Q9H347 EXD3-201ENST00000340951 2872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
UBQLN3Q9H347 SLC27A2-201ENST00000267842 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
UBQLN3Q9H347 SLX1A-SULT1A3-202ENST00000565342 2195 ntTSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
UBQLN3Q9H347 KRT79-201ENST00000330553 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
UBQLN3Q9H347 OSBP2-211ENST00000446658 2836 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
UBQLN3Q9H347 SWSAP1-201ENST00000312423 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
UBQLN3Q9H347 DAPK1-207ENST00000469640 5899 ntTSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
UBQLN3Q9H347 ABCB8-211ENST00000477092 1596 ntTSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
UBQLN3Q9H347 CHGA-202ENST00000334654 1474 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
UBQLN3Q9H347 RIC8B-203ENST00000392839 2440 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
UBQLN3Q9H347 MRTO4-201ENST00000330263 2315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
UBQLN3Q9H347 FAM109A-204ENST00000548163 2317 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
UBQLN3Q9H347 ELN-207ENST00000380562 2240 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
UBQLN3Q9H347 ART5-201ENST00000359918 1241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
UBQLN3Q9H347 PSMA7-201ENST00000370858 925 ntTSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
UBQLN3Q9H347 DRAP1-202ENST00000376991 819 ntTSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
UBQLN3Q9H347 SMIM11A-202ENST00000399295 1074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
UBQLN3Q9H347 RPL13P5-203ENST00000421824 845 ntTSL 3 BASIC15.93■□□□□ 0.14
UBQLN3Q9H347 AL391650.1-205ENST00000433939 579 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.93■□□□□ 0.14
UBQLN3Q9H347 ORAOV1-210ENST00000539414 817 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
UBQLN3Q9H347 ZBP1-208ENST00000541799 1041 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
UBQLN3Q9H347 ADAM10-217ENST00000561288 583 ntTSL 3 BASIC15.93■□□□□ 0.14
UBQLN3Q9H347 AC109462.3-201ENST00000573934 613 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
UBQLN3Q9H347 PNMT-203ENST00000581428 677 ntTSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
UBQLN3Q9H347 SMIM11B-207ENST00000624758 1074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
UBQLN3Q9H347 FAM215A-202ENST00000632077 792 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
UBQLN3Q9H347 SCP2-202ENST00000371513 2003 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
UBQLN3Q9H347 DAGLB-202ENST00000425398 2044 ntTSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
UBQLN3Q9H347 SLC12A9-202ENST00000415287 1912 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
UBQLN3Q9H347 RPS6KA3-201ENST00000379565 7918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
UBQLN3Q9H347 ARFIP2-203ENST00000423813 1430 ntTSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
UBQLN3Q9H347 PSMD12-202ENST00000357146 2437 ntTSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27.3 ms