Protein–RNA interactions for Protein: Q9C009

FOXQ1, Forkhead box protein Q1, humanhuman

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Length 403 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FOXQ1Q9C009 HNRNPA3P1-201ENST00000401429 1139 ntBASIC17.16■□□□□ 0.34
FOXQ1Q9C009 AC068898.1-201ENST00000440750 335 ntTSL 3 BASIC17.16■□□□□ 0.34
FOXQ1Q9C009 SPTLC1P1-201ENST00000447199 261 ntBASIC17.16■□□□□ 0.34
FOXQ1Q9C009 HNRNPA3P5-201ENST00000455201 833 ntBASIC17.16■□□□□ 0.34
FOXQ1Q9C009 AL359815.1-201ENST00000457706 821 ntTSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
FOXQ1Q9C009 FKBP11-208ENST00000550765 1030 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
FOXQ1Q9C009 FIGNL2-201ENST00000564840 4693 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
FOXQ1Q9C009 AC004233.1-201ENST00000570515 608 ntTSL 4 BASIC17.16■□□□□ 0.34
FOXQ1Q9C009 ANAPC11-213ENST00000577747 672 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
FOXQ1Q9C009 TNNT1-211ENST00000588426 683 ntTSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
FOXQ1Q9C009 AL031055.1-201ENST00000606362 631 ntBASIC17.16■□□□□ 0.34
FOXQ1Q9C009 AC254562.3-201ENST00000626627 631 ntTSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
FOXQ1Q9C009 MYO19-225ENST00000621344 1640 ntTSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
FOXQ1Q9C009 PTPA-204ENST00000355007 2515 ntTSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
FOXQ1Q9C009 GCSH-208ENST00000639169 2537 ntTSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
FOXQ1Q9C009 KANSL1-202ENST00000432791 5343 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
FOXQ1Q9C009 CARD10-202ENST00000403299 4113 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
FOXQ1Q9C009 RAB5C-201ENST00000346213 1671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
FOXQ1Q9C009 JMJD6-205ENST00000585429 1330 ntTSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
FOXQ1Q9C009 NEIL2-203ENST00000436750 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
FOXQ1Q9C009 MSI2-203ENST00000416426 1714 ntTSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
FOXQ1Q9C009 TBC1D19-201ENST00000264866 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
FOXQ1Q9C009 HERPUD2-201ENST00000311350 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
FOXQ1Q9C009 ECEL1-201ENST00000304546 2865 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
FOXQ1Q9C009 MYBPH-202ENST00000621380 1772 ntTSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
FOXQ1Q9C009 REPS1-203ENST00000409812 2511 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
FOXQ1Q9C009 PPP1R7-201ENST00000234038 2386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
FOXQ1Q9C009 OTOL1-201ENST00000327928 1434 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
FOXQ1Q9C009 PRKAR1B-204ENST00000406797 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
FOXQ1Q9C009 SCLT1-205ENST00000503401 1604 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.15■□□□□ 0.34
FOXQ1Q9C009 FIBP-201ENST00000338369 1261 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
FOXQ1Q9C009 MRPL9-202ENST00000368830 1296 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
FOXQ1Q9C009 MORN4-202ENST00000370635 419 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
FOXQ1Q9C009 TEX30-202ENST00000376021 1038 ntTSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
FOXQ1Q9C009 KRTAP6-3-201ENST00000391624 636 ntAPPRIS P1 BASIC17.15■□□□□ 0.34
FOXQ1Q9C009 HFE-208ENST00000397022 1280 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
FOXQ1Q9C009 TMEM91-205ENST00000436170 864 ntTSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
FOXQ1Q9C009 U91328.1-201ENST00000437528 223 ntBASIC17.15■□□□□ 0.34
FOXQ1Q9C009 AL359764.1-201ENST00000444330 504 ntTSL 3 BASIC17.15■□□□□ 0.34
FOXQ1Q9C009 LINC00473-201ENST00000444465 798 ntTSL 3 BASIC17.15■□□□□ 0.34
FOXQ1Q9C009 COMT-209ENST00000449653 1035 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
FOXQ1Q9C009 AL606760.1-201ENST00000458151 1181 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
FOXQ1Q9C009 AC022494.1-201ENST00000466044 728 ntBASIC17.15■□□□□ 0.34
FOXQ1Q9C009 RAB7A-204ENST00000483906 533 ntTSL 3 BASIC17.15■□□□□ 0.34
FOXQ1Q9C009 HFE-214ENST00000488199 781 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
FOXQ1Q9C009 AC138466.1-201ENST00000535242 391 ntTSL 3 BASIC17.15■□□□□ 0.34
FOXQ1Q9C009 AL138918.1-201ENST00000568306 659 ntBASIC17.15■□□□□ 0.34
FOXQ1Q9C009 AC026471.2-201ENST00000569782 655 ntTSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
FOXQ1Q9C009 TPGS2-215ENST00000590842 1239 ntTSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
FOXQ1Q9C009 FAM131A-203ENST00000383847 1483 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
FOXQ1Q9C009 AC016027.1-202ENST00000607927 1699 ntBASIC17.15■□□□□ 0.34
FOXQ1Q9C009 RUSC2-202ENST00000455600 5636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
FOXQ1Q9C009 FGFR3-202ENST00000340107 4293 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
FOXQ1Q9C009 METRN-204ENST00000568223 3325 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
FOXQ1Q9C009 ZDHHC2-201ENST00000262096 6377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
FOXQ1Q9C009 TRIM17-204ENST00000366698 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
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FOXQ1Q9C009 SCAI-202ENST00000373549 1968 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
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FOXQ1Q9C009 SLC6A7-203ENST00000524041 2431 ntTSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
FOXQ1Q9C009 ZSWIM5-201ENST00000359600 5819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
FOXQ1Q9C009 ARF1-214ENST00000541182 2006 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.14■□□□□ 0.34
FOXQ1Q9C009 SUSD4-208ENST00000494793 1833 ntTSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.34
FOXQ1Q9C009 CHRAC1-201ENST00000220913 2488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.34
FOXQ1Q9C009 CYP4F2-201ENST00000011989 2067 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
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FOXQ1Q9C009 BID-205ENST00000399774 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
FOXQ1Q9C009 ACP2-206ENST00000529444 1719 ntTSL 2 BASIC17.14■□□□□ 0.33
FOXQ1Q9C009 GPR148-201ENST00000309926 1267 ntAPPRIS P1 BASIC17.14■□□□□ 0.33
FOXQ1Q9C009 RNU1-129P-201ENST00000384064 167 ntBASIC17.14■□□□□ 0.33
FOXQ1Q9C009 ITPR1-AS1-201ENST00000412804 858 ntTSL 2 BASIC17.14■□□□□ 0.33
FOXQ1Q9C009 PTPA-213ENST00000419582 952 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
FOXQ1Q9C009 AC106872.10-201ENST00000503778 747 ntTSL 3 BASIC17.14■□□□□ 0.33
FOXQ1Q9C009 AC008378.1-201ENST00000521251 496 ntTSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
FOXQ1Q9C009 AC084125.2-203ENST00000532766 821 ntTSL 3 BASIC17.14■□□□□ 0.33
FOXQ1Q9C009 NR2C2AP-204ENST00000538165 891 ntTSL 2 BASIC17.14■□□□□ 0.33
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FOXQ1Q9C009 ACAP1-208ENST00000574499 412 ntTSL 2 BASIC17.14■□□□□ 0.33
FOXQ1Q9C009 MRPS23-202ENST00000578444 580 ntTSL 2 BASIC17.14■□□□□ 0.33
FOXQ1Q9C009 U1.21-201ENST00000580816 167 ntBASIC17.14■□□□□ 0.33
FOXQ1Q9C009 AC003101.2-201ENST00000612557 442 ntBASIC17.14■□□□□ 0.33
FOXQ1Q9C009 AL138828.2-201ENST00000615812 383 ntBASIC17.14■□□□□ 0.33
FOXQ1Q9C009 FNBP1-201ENST00000355681 1977 ntTSL 2 BASIC17.14■□□□□ 0.33
FOXQ1Q9C009 FAM153A-203ENST00000440605 1966 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
FOXQ1Q9C009 CDH22-201ENST00000372262 3661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
FOXQ1Q9C009 TRAM1L1-201ENST00000310754 2023 ntAPPRIS P1 BASIC17.14■□□□□ 0.33
FOXQ1Q9C009 PLEKHB2-204ENST00000409158 2277 ntTSL 2 BASIC17.14■□□□□ 0.33
FOXQ1Q9C009 SARDH-202ENST00000371867 1326 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
FOXQ1Q9C009 CLN8-205ENST00000520991 1305 ntTSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
FOXQ1Q9C009 AC053503.2-201ENST00000420563 1598 ntTSL 2 BASIC17.14■□□□□ 0.33
FOXQ1Q9C009 KRT79-201ENST00000330553 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
FOXQ1Q9C009 ZNF133-210ENST00000535822 2341 ntTSL 3 BASIC17.14■□□□□ 0.33
FOXQ1Q9C009 HBEGF-201ENST00000230990 2386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
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