Protein–RNA interactions for Protein: Q9BT67

NDFIP1, NEDD4 family-interacting protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 221 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NDFIP1Q9BT67 CD151-213ENST00000528011 1369 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.21□□□□□ -0.29
NDFIP1Q9BT67 HMBS-221ENST00000544387 1351 ntTSL 2 BASIC13.21□□□□□ -0.29
NDFIP1Q9BT67 SMARCC2-202ENST00000347471 3839 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
NDFIP1Q9BT67 RPL3L-201ENST00000268661 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
NDFIP1Q9BT67 AL079301.1-201ENST00000424580 1633 ntTSL 2 BASIC13.21□□□□□ -0.29
NDFIP1Q9BT67 CASKIN2-205ENST00000581870 1612 ntTSL 2 BASIC13.21□□□□□ -0.29
NDFIP1Q9BT67 ACAN-202ENST00000439576 8840 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.21□□□□□ -0.29
NDFIP1Q9BT67 WDR33-201ENST00000322313 9471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
NDFIP1Q9BT67 ABHD3-209ENST00000580981 1836 ntTSL 5 BASIC13.21□□□□□ -0.29
NDFIP1Q9BT67 JMJD4-206ENST00000615711 2591 ntTSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
NDFIP1Q9BT67 MGRN1-202ENST00000399577 6425 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
NDFIP1Q9BT67 MIOS-202ENST00000405785 3095 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.21□□□□□ -0.29
NDFIP1Q9BT67 BAALC-201ENST00000297574 801 ntTSL 3 BASIC13.21□□□□□ -0.29
NDFIP1Q9BT67 C6orf132-202ENST00000356542 894 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.21□□□□□ -0.29
NDFIP1Q9BT67 AC115618.1-201ENST00000376775 549 ntTSL 3 BASIC13.21□□□□□ -0.29
NDFIP1Q9BT67 TSPY8-202ENST00000383000 1125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
NDFIP1Q9BT67 TSPY8-203ENST00000383005 435 ntTSL 5 BASIC13.21□□□□□ -0.29
NDFIP1Q9BT67 GOSR2-202ENST00000393456 788 ntTSL 3 BASIC13.21□□□□□ -0.29
NDFIP1Q9BT67 ZNF534-203ENST00000432303 956 ntTSL 2 BASIC13.21□□□□□ -0.29
NDFIP1Q9BT67 FAHD2CP-202ENST00000443258 893 ntTSL 3 BASIC13.21□□□□□ -0.29
NDFIP1Q9BT67 KCNIP3-205ENST00000468529 985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
NDFIP1Q9BT67 PAIP2-208ENST00000511706 468 ntTSL 5 BASIC13.21□□□□□ -0.29
NDFIP1Q9BT67 LINGO1-AS2-201ENST00000557799 663 ntTSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
NDFIP1Q9BT67 TMEM249-203ENST00000565365 975 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC13.21□□□□□ -0.29
NDFIP1Q9BT67 AC034238.1-212ENST00000596137 723 ntTSL 5 BASIC13.21□□□□□ -0.29
NDFIP1Q9BT67 RPARP-AS1-206ENST00000596366 631 ntTSL 3 BASIC13.21□□□□□ -0.29
NDFIP1Q9BT67 ZNF534-205ENST00000617900 1085 ntTSL 2 BASIC13.21□□□□□ -0.29
NDFIP1Q9BT67 STK32C-204ENST00000368622 2010 ntTSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
NDFIP1Q9BT67 GCK-209ENST00000616242 2260 ntTSL 5 BASIC13.21□□□□□ -0.29
NDFIP1Q9BT67 ARL10-201ENST00000310389 10845 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.21□□□□□ -0.29
NDFIP1Q9BT67 P2RY1-201ENST00000305097 6747 ntAPPRIS P1 BASIC13.21□□□□□ -0.29
NDFIP1Q9BT67 AC068418.2-201ENST00000577309 3703 ntBASIC13.21□□□□□ -0.29
NDFIP1Q9BT67 AQP1-204ENST00000441328 2487 ntTSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
NDFIP1Q9BT67 GGN-201ENST00000334928 2239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
NDFIP1Q9BT67 FRMD6-AS1-201ENST00000617151 2229 ntBASIC13.21□□□□□ -0.29
NDFIP1Q9BT67 DUOXA1-201ENST00000267803 1996 ntTSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
NDFIP1Q9BT67 AC103702.1-201ENST00000548801 2630 ntBASIC13.21□□□□□ -0.3
NDFIP1Q9BT67 TBC1D24-205ENST00000567020 6673 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.3
NDFIP1Q9BT67 GSTZ1-204ENST00000393734 1424 ntTSL 5 BASIC13.21□□□□□ -0.3
NDFIP1Q9BT67 CYMP-AS1-201ENST00000457402 2351 ntTSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.3
NDFIP1Q9BT67 LINC01311-201ENST00000565162 1445 ntBASIC13.21□□□□□ -0.3
NDFIP1Q9BT67 AC074117.1-201ENST00000447070 3060 ntTSL 2 BASIC13.21□□□□□ -0.3
NDFIP1Q9BT67 LYSMD4-203ENST00000378904 2122 ntBASIC13.21□□□□□ -0.3
NDFIP1Q9BT67 STXBP2-202ENST00000414284 1859 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.3
NDFIP1Q9BT67 PEX6-202ENST00000304611 3478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.3
NDFIP1Q9BT67 XRCC3-209ENST00000554913 2539 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.2□□□□□ -0.3
NDFIP1Q9BT67 KRT8P47-201ENST00000604727 1398 ntBASIC13.2□□□□□ -0.3
NDFIP1Q9BT67 ABHD14B-203ENST00000395008 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
NDFIP1Q9BT67 SLC39A13-202ENST00000362021 2296 ntTSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
NDFIP1Q9BT67 CCDC88A-201ENST00000263630 9667 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
NDFIP1Q9BT67 FAM157B-201ENST00000446912 1795 ntTSL 2 BASIC13.2□□□□□ -0.3
NDFIP1Q9BT67 POC1A-203ENST00000474012 1760 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.2□□□□□ -0.3
NDFIP1Q9BT67 PTCHD3-202ENST00000622555 1720 ntTSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
NDFIP1Q9BT67 METTL21C-201ENST00000267273 1088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
NDFIP1Q9BT67 PRORSD1P-201ENST00000295112 541 ntBASIC13.2□□□□□ -0.3
NDFIP1Q9BT67 CXCL3-201ENST00000296026 1075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
NDFIP1Q9BT67 MYLK2-202ENST00000375994 2956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
NDFIP1Q9BT67 UQCRQ-201ENST00000378665 586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
NDFIP1Q9BT67 TMEM88B-201ENST00000378821 492 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.2□□□□□ -0.3
NDFIP1Q9BT67 UHRF2-202ENST00000381373 802 ntTSL 3 BASIC13.2□□□□□ -0.3
NDFIP1Q9BT67 SERTAD4-AS1-201ENST00000437764 726 ntTSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
NDFIP1Q9BT67 GCSHP5-201ENST00000443090 522 ntBASIC13.2□□□□□ -0.3
NDFIP1Q9BT67 AL162457.2-201ENST00000447909 937 ntTSL 3 BASIC13.2□□□□□ -0.3
NDFIP1Q9BT67 AC004080.6-201ENST00000467897 919 ntTSL 5 BASIC13.2□□□□□ -0.3
NDFIP1Q9BT67 CCNJL-205ENST00000519673 940 ntTSL 2 BASIC13.2□□□□□ -0.3
NDFIP1Q9BT67 CDC42EP2-202ENST00000533419 1279 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.2□□□□□ -0.3
NDFIP1Q9BT67 VASH1-204ENST00000554743 1096 ntTSL 3 BASIC13.2□□□□□ -0.3
NDFIP1Q9BT67 PRORSD1P-203ENST00000579162 626 ntTSL 5 BASIC13.2□□□□□ -0.3
NDFIP1Q9BT67 Z94160.2-201ENST00000609322 910 ntTSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
NDFIP1Q9BT67 OBP2B-205ENST00000618116 961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
NDFIP1Q9BT67 AL157888.1-201ENST00000631930 593 ntBASIC13.2□□□□□ -0.3
NDFIP1Q9BT67 GLDC-219ENST00000640208 420 ntTSL 2 BASIC13.2□□□□□ -0.3
NDFIP1Q9BT67 HNF1A-215ENST00000615446 2344 ntTSL 5 BASIC13.2□□□□□ -0.3
NDFIP1Q9BT67 PCDHGC3-205ENST00000617641 2346 ntTSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
NDFIP1Q9BT67 CD151-203ENST00000397421 1486 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
NDFIP1Q9BT67 NDUFA10-214ENST00000620965 1489 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.2□□□□□ -0.3
NDFIP1Q9BT67 CRTC3-201ENST00000268184 2537 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
NDFIP1Q9BT67 KRT28-201ENST00000306658 1685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
NDFIP1Q9BT67 ACBD6-201ENST00000367595 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
NDFIP1Q9BT67 NDUFS2-202ENST00000392179 2064 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
NDFIP1Q9BT67 PRKAR2B-201ENST00000265717 3745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
NDFIP1Q9BT67 CD72-211ENST00000612238 1424 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.2□□□□□ -0.3
NDFIP1Q9BT67 FAM8A1-201ENST00000259963 4677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
NDFIP1Q9BT67 KIF25-203ENST00000443060 1613 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.2□□□□□ -0.3
NDFIP1Q9BT67 AC026691.1-201ENST00000602502 2017 ntBASIC13.2□□□□□ -0.3
NDFIP1Q9BT67 ACSF3-204ENST00000406948 2247 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.2□□□□□ -0.3
NDFIP1Q9BT67 NUDT16P1-202ENST00000499077 2208 ntTSL 2 BASIC13.2□□□□□ -0.3
NDFIP1Q9BT67 ZSCAN2-214ENST00000546148 2242 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC13.2□□□□□ -0.3
NDFIP1Q9BT67 FAM222B-211ENST00000582266 2613 ntTSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
NDFIP1Q9BT67 ADD1-201ENST00000264758 4045 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.2□□□□□ -0.3
NDFIP1Q9BT67 TNS2-201ENST00000314250 5010 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
NDFIP1Q9BT67 ZNF514-202ENST00000411425 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
NDFIP1Q9BT67 METTL21A-208ENST00000448007 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
NDFIP1Q9BT67 ARHGAP8-202ENST00000356099 1584 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
NDFIP1Q9BT67 WIPI1-202ENST00000546360 1575 ntTSL 2 BASIC13.2□□□□□ -0.3
NDFIP1Q9BT67 DDX42-208ENST00000578681 4337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
NDFIP1Q9BT67 TRPC4AP-202ENST00000451813 3138 ntTSL 2 BASIC13.19□□□□□ -0.3
NDFIP1Q9BT67 PRKY-203ENST00000528056 7218 ntTSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
NDFIP1Q9BT67 NR4A1-204ENST00000394825 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
NDFIP1Q9BT67 C11orf49-204ENST00000395460 1916 ntTSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 36.1 ms