Protein–RNA interactions for Protein: Q99795

GPA33, Cell surface A33 antigen, humanhuman

Predictions only

Length 319 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GPA33Q99795 CHAT-205ENST00000395562 2528 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
GPA33Q99795 VSTM2A-204ENST00000407838 3112 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.62■□□□□ 0.09
GPA33Q99795 SEPT6-209ENST00000489216 1617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
GPA33Q99795 AGK-211ENST00000629555 2765 ntTSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
GPA33Q99795 TPM1-205ENST00000357980 1800 ntTSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
GPA33Q99795 PIGT-221ENST00000638594 1835 ntTSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
GPA33Q99795 PDCD2-208ENST00000541970 3378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
GPA33Q99795 ACSF3-204ENST00000406948 2247 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
GPA33Q99795 SCP2-204ENST00000407246 2239 ntTSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
GPA33Q99795 AL391005.1-201ENST00000623953 2435 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
GPA33Q99795 ADCY8-201ENST00000286355 5938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
GPA33Q99795 PIGP-207ENST00000464265 3437 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
GPA33Q99795 TK2-207ENST00000544898 3441 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
GPA33Q99795 GBA2-203ENST00000378103 3611 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
GPA33Q99795 SNRPA1-201ENST00000254193 1055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
GPA33Q99795 DNAJC4-201ENST00000321460 1015 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
GPA33Q99795 AURKAIP1-202ENST00000338338 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
GPA33Q99795 RALGDS-205ENST00000393160 3801 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
GPA33Q99795 TMEM33-208ENST00000513702 1092 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
GPA33Q99795 RNASEH2C-202ENST00000527610 835 ntTSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
GPA33Q99795 AC009061.1-201ENST00000567261 475 ntTSL 3 BASIC15.62■□□□□ 0.09
GPA33Q99795 AC004771.4-201ENST00000576752 474 ntTSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
GPA33Q99795 EEF2KMT-206ENST00000587133 873 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.62■□□□□ 0.09
GPA33Q99795 AC011467.2-201ENST00000598425 242 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
GPA33Q99795 MED25-212ENST00000618715 1467 ntTSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
GPA33Q99795 PLCH2-203ENST00000378486 4837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
GPA33Q99795 PLCH2-204ENST00000419816 4837 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
GPA33Q99795 AP5B1-201ENST00000532090 4811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
GPA33Q99795 SGCE-206ENST00000445866 1666 ntTSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
GPA33Q99795 DIMT1-201ENST00000199320 2859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
GPA33Q99795 AC104809.1-201ENST00000425110 2345 ntTSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
GPA33Q99795 CCT6P1-202ENST00000442266 1317 ntTSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
GPA33Q99795 MMAB-204ENST00000537236 1342 ntTSL 3 BASIC15.62■□□□□ 0.09
GPA33Q99795 ABHD15-201ENST00000307201 3592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
GPA33Q99795 SNRK-204ENST00000454177 2961 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
GPA33Q99795 DENR-201ENST00000280557 2769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
GPA33Q99795 PLK2-215ENST00000617412 2792 ntTSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
GPA33Q99795 TMC3-AS1-203ENST00000559781 2195 ntTSL 3 BASIC15.62■□□□□ 0.09
GPA33Q99795 RDH13-202ENST00000396247 1987 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
GPA33Q99795 TMEM145-201ENST00000301204 1768 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
GPA33Q99795 HES1-201ENST00000232424 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
GPA33Q99795 SORCS3-202ENST00000369701 5757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
GPA33Q99795 CSK-210ENST00000567571 2443 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
GPA33Q99795 GLYCTK-201ENST00000305690 1371 ntTSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
GPA33Q99795 THAP3-201ENST00000054650 1366 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
GPA33Q99795 BCAR1-206ENST00000535626 2894 ntTSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
GPA33Q99795 ARHGEF28-203ENST00000426542 6118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
GPA33Q99795 SEPT8-204ENST00000378699 2289 ntTSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
GPA33Q99795 SRSF12-201ENST00000452027 3599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
GPA33Q99795 PRICKLE4-204ENST00000458694 1646 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
GPA33Q99795 PELI3-209ENST00000618547 2508 ntTSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
GPA33Q99795 VSX2-201ENST00000261980 2995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
GPA33Q99795 HLA-A-202ENST00000376806 1854 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
GPA33Q99795 LSP1-217ENST00000612798 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
GPA33Q99795 CELF6-204ENST00000543764 1676 ntTSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
GPA33Q99795 RMND5B-201ENST00000313386 1929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
GPA33Q99795 TBP-202ENST00000392092 1903 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
GPA33Q99795 RPS12-201ENST00000230050 631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
GPA33Q99795 BCL2L10-201ENST00000260442 1249 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
GPA33Q99795 S100A3-201ENST00000368712 579 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.61■□□□□ 0.09
GPA33Q99795 DDRGK1-202ENST00000380201 1128 ntTSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
GPA33Q99795 GGT1-207ENST00000404532 853 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
GPA33Q99795 AC246785.2-201ENST00000432512 513 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
GPA33Q99795 PCAT7-201ENST00000452148 1164 ntTSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
GPA33Q99795 MOK-234ENST00000524370 1165 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
GPA33Q99795 AP002807.1-202ENST00000526897 791 ntTSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
GPA33Q99795 AC009533.2-201ENST00000543664 586 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
GPA33Q99795 TSFM-208ENST00000543727 651 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
GPA33Q99795 ANAPC11-217ENST00000579978 575 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
GPA33Q99795 AC010422.3-201ENST00000597692 838 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
GPA33Q99795 Metazoa_SRP.104-201ENST00000622099 280 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
GPA33Q99795 AC110813.1-201ENST00000507934 2209 ntTSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
GPA33Q99795 MYOG-201ENST00000241651 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
GPA33Q99795 P2RY6-204ENST00000393592 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
GPA33Q99795 HAPLN3-204ENST00000562889 1547 ntTSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
GPA33Q99795 MAP2K7-202ENST00000397981 3430 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
GPA33Q99795 NFE2-202ENST00000435572 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
GPA33Q99795 STK25-201ENST00000316586 4619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
GPA33Q99795 F3-201ENST00000334047 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
GPA33Q99795 TSPAN32-201ENST00000182290 1318 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
GPA33Q99795 TSPAN32-217ENST00000612299 1301 ntTSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
GPA33Q99795 PLCG1-202ENST00000373271 7395 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
GPA33Q99795 PLEKHG4-205ENST00000450733 4480 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
GPA33Q99795 DOLK-201ENST00000372586 2090 ntAPPRIS P1 BASIC15.61■□□□□ 0.09
GPA33Q99795 UIMC1-201ENST00000377227 2570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
GPA33Q99795 MICALL2-201ENST00000297508 3121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
GPA33Q99795 CPXM1-201ENST00000380605 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
GPA33Q99795 FGFBP1-201ENST00000382333 1359 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.61■□□□□ 0.09
GPA33Q99795 STEAP3-204ENST00000409811 2103 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
GPA33Q99795 USP7-201ENST00000344836 5412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
GPA33Q99795 TLE2-202ENST00000426948 2406 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
GPA33Q99795 CALD1-204ENST00000417172 1915 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
GPA33Q99795 WASF1-207ENST00000392589 3220 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
GPA33Q99795 PDK1-203ENST00000410055 2990 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
GPA33Q99795 KRT23-201ENST00000209718 1987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
GPA33Q99795 SRRM2-201ENST00000301740 9353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
GPA33Q99795 EXTL3-201ENST00000220562 6483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
GPA33Q99795 STIM2-203ENST00000467011 3925 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
GPA33Q99795 ELN-221ENST00000445912 2583 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
GPA33Q99795 EDN3-205ENST00000395654 2318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 34.2 ms