Protein–RNA interactions for Protein: Q99567

NUP88, Nuclear pore complex protein Nup88, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 741 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NUP88Q99567 CDC42EP4-206ENST00000581014 737 ntTSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
NUP88Q99567 CYB561-216ENST00000582297 897 ntTSL 3 BASIC20.11■□□□□ 0.81
NUP88Q99567 PCDHA8-202ENST00000531613 5260 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
NUP88Q99567 SLC27A5-207ENST00000601355 1987 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.11■□□□□ 0.81
NUP88Q99567 SLC7A9-202ENST00000587772 1568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
NUP88Q99567 OSBPL9-222ENST00000531828 2210 ntTSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
NUP88Q99567 GATA2-202ENST00000430265 2525 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
NUP88Q99567 BIN1-208ENST00000376113 1832 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
NUP88Q99567 ERMARD-210ENST00000588451 2146 ntTSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
NUP88Q99567 CAPN15-201ENST00000219611 4744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
NUP88Q99567 RANBP3-220ENST00000591092 1783 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
NUP88Q99567 MYBPH-202ENST00000621380 1772 ntTSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
NUP88Q99567 KDM1A-201ENST00000356634 3033 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
NUP88Q99567 RBM14-202ENST00000393979 1426 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
NUP88Q99567 ZNF274-202ENST00000345813 2678 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
NUP88Q99567 PSRC1-201ENST00000369903 1710 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
NUP88Q99567 NUDT19-201ENST00000397061 2967 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.1■□□□□ 0.81
NUP88Q99567 RBBP7-203ENST00000380087 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
NUP88Q99567 LSP1-201ENST00000311604 1699 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
NUP88Q99567 DENND6B-201ENST00000413817 4939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
NUP88Q99567 CGB7-202ENST00000596965 1949 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.1■□□□□ 0.81
NUP88Q99567 CACNA2D2-201ENST00000266039 5476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
NUP88Q99567 JMJD6-205ENST00000585429 1330 ntTSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
NUP88Q99567 CCDC137-201ENST00000329214 2468 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
NUP88Q99567 LYSMD4-203ENST00000378904 2122 ntBASIC20.1■□□□□ 0.81
NUP88Q99567 AC131097.3-202ENST00000439270 331 ntTSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
NUP88Q99567 DNAJB3-201ENST00000446806 729 ntBASIC20.1■□□□□ 0.81
NUP88Q99567 MOK-203ENST00000517966 1230 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
NUP88Q99567 COX5A-206ENST00000568783 571 ntTSL 3 BASIC20.1■□□□□ 0.81
NUP88Q99567 MIR3687-2-201ENST00000577708 61 ntBASIC20.1■□□□□ 0.81
NUP88Q99567 MIR3687-1-201ENST00000614492 61 ntBASIC20.1■□□□□ 0.81
NUP88Q99567 AC010654.1-201ENST00000615722 808 ntBASIC20.1■□□□□ 0.81
NUP88Q99567 LINC01451-201ENST00000623792 534 ntBASIC20.1■□□□□ 0.81
NUP88Q99567 AC010507.1-201ENST00000633895 436 ntBASIC20.1■□□□□ 0.81
NUP88Q99567 LRRD1-201ENST00000343318 2073 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
NUP88Q99567 STAMBPL1-203ENST00000371926 2532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
NUP88Q99567 AHRR-209ENST00000512529 1912 ntTSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
NUP88Q99567 ITGA8-201ENST00000378076 6755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
NUP88Q99567 SCNN1D-201ENST00000325425 2679 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
NUP88Q99567 PHF12-205ENST00000577226 7679 ntTSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
NUP88Q99567 ISG20-201ENST00000306072 1856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
NUP88Q99567 RGN-202ENST00000352078 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
NUP88Q99567 RNH1-204ENST00000397614 1864 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
NUP88Q99567 SUSD4-208ENST00000494793 1833 ntTSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
NUP88Q99567 PRAMEF20-201ENST00000316412 1597 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
NUP88Q99567 SGSM2-202ENST00000426855 4734 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
NUP88Q99567 GOLGA2P7-201ENST00000316967 2525 ntTSL 2 BASIC20.09■□□□□ 0.81
NUP88Q99567 HMGXB3-206ENST00000613459 5567 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
NUP88Q99567 HPCAL1-206ENST00000613496 1547 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.09■□□□□ 0.81
NUP88Q99567 IFFO1-201ENST00000336604 2686 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
NUP88Q99567 FGFBP2-201ENST00000259989 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
NUP88Q99567 RPS17-201ENST00000330244 592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
NUP88Q99567 ATP5G3-202ENST00000392541 842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
NUP88Q99567 CHMP3-203ENST00000409225 1099 ntTSL 2 BASIC20.09■□□□□ 0.81
NUP88Q99567 LINC01972-201ENST00000422271 553 ntTSL 3 BASIC20.09■□□□□ 0.81
NUP88Q99567 ALG1L5P-201ENST00000482043 771 ntBASIC20.09■□□□□ 0.81
NUP88Q99567 DDIT4-AS1-201ENST00000491934 847 ntTSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
NUP88Q99567 FAM172A-207ENST00000509739 1031 ntTSL 2 BASIC20.09■□□□□ 0.81
NUP88Q99567 AL137786.1-202ENST00000555496 789 ntTSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
NUP88Q99567 AC126696.3-201ENST00000563993 575 ntTSL 4 BASIC20.09■□□□□ 0.81
NUP88Q99567 GIPC1-213ENST00000591349 1068 ntTSL 2 BASIC20.09■□□□□ 0.81
NUP88Q99567 TUBB4A-209ENST00000598006 565 ntTSL 2 BASIC20.09■□□□□ 0.81
NUP88Q99567 TMEM178A-206ENST00000618232 1286 ntTSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
NUP88Q99567 DAPK2-202ENST00000457488 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
NUP88Q99567 LMNA-208ENST00000448611 1943 ntTSL 2 BASIC20.09■□□□□ 0.81
NUP88Q99567 ARHGEF19-201ENST00000270747 3029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
NUP88Q99567 PRKRIP1-208ENST00000496391 3430 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.09■□□□□ 0.81
NUP88Q99567 C16orf59-204ENST00000563531 1864 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
NUP88Q99567 PTPRU-202ENST00000373779 5579 ntTSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
NUP88Q99567 KRT79-201ENST00000330553 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
NUP88Q99567 WHAMMP3-203ENST00000621139 4494 ntTSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
NUP88Q99567 C14orf180-202ENST00000410013 2009 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
NUP88Q99567 CTSB-204ENST00000453527 2011 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.09■□□□□ 0.81
NUP88Q99567 ALDH2-202ENST00000416293 1572 ntTSL 2 BASIC20.08■□□□□ 0.81
NUP88Q99567 FOXP1-210ENST00000484350 1996 ntTSL 2 BASIC20.08■□□□□ 0.81
NUP88Q99567 FAM135A-209ENST00000505769 4806 ntTSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.81
NUP88Q99567 AP5B1-201ENST00000532090 4811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
NUP88Q99567 PGRMC2-208ENST00000613358 3783 ntTSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
NUP88Q99567 MAGI3-201ENST00000307546 6430 ntTSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.81
NUP88Q99567 CLN6-202ENST00000538696 1343 ntTSL 2 BASIC20.08■□□□□ 0.81
NUP88Q99567 TXNL4A-201ENST00000269601 3504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
NUP88Q99567 TNNT1-201ENST00000291901 967 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
NUP88Q99567 MOB1B-202ENST00000396051 1107 ntTSL 2 BASIC20.08■□□□□ 0.81
NUP88Q99567 MRPS12-203ENST00000407800 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
NUP88Q99567 HNRNPA1P28-201ENST00000424481 961 ntBASIC20.08■□□□□ 0.81
NUP88Q99567 PIGBOS1-201ENST00000436697 866 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20.08■□□□□ 0.81
NUP88Q99567 FTCD-AS1-201ENST00000446649 500 ntTSL 2 BASIC20.08■□□□□ 0.81
NUP88Q99567 CPSF1-207ENST00000531727 704 ntTSL 3 BASIC20.08■□□□□ 0.81
NUP88Q99567 ELOF1-204ENST00000587806 1172 ntTSL 2 BASIC20.08■□□□□ 0.81
NUP88Q99567 LINC00623-201ENST00000613486 486 ntTSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.81
NUP88Q99567 AC134684.3-201ENST00000641758 218 ntBASIC20.08■□□□□ 0.81
NUP88Q99567 DFNA5-203ENST00000409970 2005 ntTSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.8
NUP88Q99567 SIGIRR-201ENST00000332725 1639 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.08■□□□□ 0.8
NUP88Q99567 CPEB2-AS1-201ENST00000500394 1630 ntTSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
NUP88Q99567 STX2-201ENST00000261653 3331 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
NUP88Q99567 ALAS2-203ENST00000396198 1936 ntTSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.8
NUP88Q99567 MPP2-206ENST00000518766 1896 ntTSL 2 BASIC20.07■□□□□ 0.8
NUP88Q99567 CROCC2-201ENST00000443866 5382 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.07■□□□□ 0.8
NUP88Q99567 ARHGAP4-204ENST00000393721 2721 ntTSL 5 BASIC20.07■□□□□ 0.8
NUP88Q99567 GNE-204ENST00000539208 2190 ntTSL 2 BASIC20.07■□□□□ 0.8
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 67.4 ms