Protein–RNA interactions for Protein: Q99523

SORT1, Sortilin, humanhuman

Predictions only

Length 831 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SORT1Q99523 ADCYAP1-202ENST00000450565 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
SORT1Q99523 AC136604.3-201ENST00000508188 429 ntTSL 3 BASIC16.76■□□□□ 0.27
SORT1Q99523 STK19B-204ENST00000512515 211 ntBASIC16.76■□□□□ 0.27
SORT1Q99523 AC009185.1-201ENST00000517634 911 ntTSL 3 BASIC16.76■□□□□ 0.27
SORT1Q99523 RDH5-202ENST00000547072 1054 ntTSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
SORT1Q99523 LCK-201ENST00000333070 2166 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
SORT1Q99523 PI16-201ENST00000373674 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
SORT1Q99523 ALDH5A1-202ENST00000357578 5248 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
SORT1Q99523 TAP2-202ENST00000374899 2497 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
SORT1Q99523 CYP11A1-201ENST00000268053 1934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
SORT1Q99523 ZDHHC13-201ENST00000399351 2283 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
SORT1Q99523 SLC12A9-202ENST00000415287 1912 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
SORT1Q99523 ALDH3A2-225ENST00000630662 1558 ntTSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
SORT1Q99523 NPRL2-201ENST00000232501 1700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
SORT1Q99523 IRF5-210ENST00000477535 1374 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
SORT1Q99523 FTSJ1-202ENST00000348411 1892 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
SORT1Q99523 SEPT11-209ENST00000510515 1886 ntTSL 2 BASIC16.76■□□□□ 0.27
SORT1Q99523 LSP1-217ENST00000612798 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.76■□□□□ 0.27
SORT1Q99523 ZNF84-208ENST00000539354 3237 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
SORT1Q99523 ZNF213-206ENST00000574902 3208 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
SORT1Q99523 CCDC155-201ENST00000447857 2378 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
SORT1Q99523 NEUROD1-201ENST00000295108 2852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
SORT1Q99523 DLC1-203ENST00000358919 4392 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
SORT1Q99523 ZFAND5-204ENST00000376960 2686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
SORT1Q99523 AC132938.5-201ENST00000624980 1813 ntBASIC16.75■□□□□ 0.27
SORT1Q99523 TBX18-202ENST00000369663 6245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
SORT1Q99523 APOLD1-202ENST00000356591 4646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
SORT1Q99523 AC113347.1-201ENST00000413321 391 ntBASIC16.75■□□□□ 0.27
SORT1Q99523 CAVIN3-203ENST00000530979 957 ntTSL 2 BASIC16.75■□□□□ 0.27
SORT1Q99523 DUX4L17-201ENST00000557360 1267 ntBASIC16.75■□□□□ 0.27
SORT1Q99523 ELAC2-212ENST00000578071 579 ntTSL 4 BASIC16.75■□□□□ 0.27
SORT1Q99523 APOPT1-201ENST00000409074 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
SORT1Q99523 AL139300.1-201ENST00000472726 2505 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.75■□□□□ 0.27
SORT1Q99523 HS2ST1-202ENST00000370551 1585 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
SORT1Q99523 PYCR1-201ENST00000329875 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
SORT1Q99523 CTSB-201ENST00000345125 2028 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
SORT1Q99523 TSHZ1-204ENST00000580243 3582 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.75■□□□□ 0.27
SORT1Q99523 ZBTB4-202ENST00000380599 5866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
SORT1Q99523 INTS11-247ENST00000540437 2629 ntTSL 2 BASIC16.75■□□□□ 0.27
SORT1Q99523 JADE3-204ENST00000614628 4934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
SORT1Q99523 AC011840.1-202ENST00000436477 1351 ntTSL 2 BASIC16.75■□□□□ 0.27
SORT1Q99523 CTSD-213ENST00000637915 1982 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
SORT1Q99523 CSAD-208ENST00000444623 2122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
SORT1Q99523 GCK-202ENST00000345378 2421 ntTSL 2 BASIC16.75■□□□□ 0.27
SORT1Q99523 MAPK7-201ENST00000299612 2715 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
SORT1Q99523 CLU-215ENST00000523500 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
SORT1Q99523 NUDT16P1-202ENST00000499077 2208 ntTSL 2 BASIC16.74■□□□□ 0.27
SORT1Q99523 IL12RB1-201ENST00000322153 1902 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
SORT1Q99523 SHMT2-232ENST00000557487 1918 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
SORT1Q99523 CKMT2-202ENST00000424301 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
SORT1Q99523 KAZN-203ENST00000376030 6030 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
SORT1Q99523 AMMECR1-201ENST00000262844 5504 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
SORT1Q99523 AC027796.3-201ENST00000572919 4753 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
SORT1Q99523 NR2C1-201ENST00000330677 2014 ntTSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
SORT1Q99523 RPL8-202ENST00000394920 965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
SORT1Q99523 SCO2-202ENST00000395693 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
SORT1Q99523 TSPY5P-201ENST00000426936 936 ntBASIC16.74■□□□□ 0.27
SORT1Q99523 MEG3-211ENST00000452514 461 ntTSL 3 BASIC16.74■□□□□ 0.27
SORT1Q99523 HOMER2P1-201ENST00000455653 964 ntBASIC16.74■□□□□ 0.27
SORT1Q99523 CDKN2AIPNL-202ENST00000458198 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
SORT1Q99523 GUSBP12-201ENST00000513727 720 ntBASIC16.74■□□□□ 0.27
SORT1Q99523 AP002490.2-201ENST00000524791 560 ntBASIC16.74■□□□□ 0.27
SORT1Q99523 AL592071.1-201ENST00000611956 408 ntBASIC16.74■□□□□ 0.27
SORT1Q99523 RAB34-226ENST00000636772 1180 ntTSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
SORT1Q99523 LZTS3-202ENST00000337576 4238 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
SORT1Q99523 WDR88-202ENST00000361680 1835 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
SORT1Q99523 CD1E-213ENST00000444681 1820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
SORT1Q99523 AKT1-214ENST00000555528 3066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
SORT1Q99523 WDR90-209ENST00000547944 1672 ntTSL 2 BASIC16.74■□□□□ 0.27
SORT1Q99523 SPIN3-224ENST00000639583 2245 ntTSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
SORT1Q99523 TMED7-TICAM2-201ENST00000282382 3491 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.74■□□□□ 0.27
SORT1Q99523 NPNT-201ENST00000305572 3003 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
SORT1Q99523 LGR6-205ENST00000439764 2487 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
SORT1Q99523 SHQ1-201ENST00000325599 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
SORT1Q99523 H1F0-201ENST00000340857 2344 ntAPPRIS P1 BASIC16.74■□□□□ 0.27
SORT1Q99523 GFAP-233ENST00000639277 1783 ntTSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
SORT1Q99523 ATXN2-219ENST00000550104 4648 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
SORT1Q99523 KCNT1-202ENST00000371757 4717 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
SORT1Q99523 MIER1-205ENST00000371014 1728 ntTSL 2 BASIC16.73■□□□□ 0.27
SORT1Q99523 ULBP2-201ENST00000367351 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
SORT1Q99523 RPLP0-219ENST00000551150 1344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
SORT1Q99523 ADORA1-204ENST00000367236 3407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
SORT1Q99523 CCDC40-201ENST00000269318 1970 ntTSL 2 BASIC16.73■□□□□ 0.27
SORT1Q99523 ELMO1-209ENST00000448602 2621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
SORT1Q99523 CHAC1-204ENST00000617768 1560 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
SORT1Q99523 PCCB-209ENST00000469217 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.73■□□□□ 0.27
SORT1Q99523 AL365203.3-201ENST00000609742 2057 ntBASIC16.73■□□□□ 0.27
SORT1Q99523 RPL13P5-202ENST00000412023 1438 ntTSL 2 BASIC16.73■□□□□ 0.27
SORT1Q99523 VPS16-203ENST00000380469 2318 ntTSL 2 BASIC16.73■□□□□ 0.27
SORT1Q99523 LRRC61-201ENST00000323078 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
SORT1Q99523 GCAT-202ENST00000323205 1656 ntTSL 2 BASIC16.73■□□□□ 0.27
SORT1Q99523 ARID1B-203ENST00000350026 7962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
SORT1Q99523 SMTNL2-201ENST00000338859 1919 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
SORT1Q99523 KCNJ12-201ENST00000331718 2198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
SORT1Q99523 NSUN2-201ENST00000264670 3303 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
SORT1Q99523 ISG15-201ENST00000379389 711 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
SORT1Q99523 AC004080.5-201ENST00000498652 368 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
SORT1Q99523 PACRGL-218ENST00000507634 1142 ntTSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
SORT1Q99523 LY6E-213ENST00000522528 606 ntTSL 3 BASIC16.73■□□□□ 0.27
SORT1Q99523 AC140504.1-202ENST00000568222 652 ntTSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27.3 ms