Protein–RNA interactions for Protein: Q96MG2

JSRP1, Junctional sarcoplasmic reticulum protein 1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 331 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
JSRP1Q96MG2 ST8SIA5-201ENST00000315087 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
JSRP1Q96MG2 NCAPD2-201ENST00000315579 5548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
JSRP1Q96MG2 AC133963.1-201ENST00000504166 1679 ntBASIC15.83■□□□□ 0.13
JSRP1Q96MG2 ISPD-201ENST00000399310 1709 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
JSRP1Q96MG2 KANSL1L-201ENST00000281772 4754 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
JSRP1Q96MG2 DENND3-201ENST00000262585 5438 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
JSRP1Q96MG2 LRP10-201ENST00000359591 6886 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
JSRP1Q96MG2 FST-202ENST00000396947 2538 ntTSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
JSRP1Q96MG2 CTSG-201ENST00000216336 886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
JSRP1Q96MG2 AQP12A-201ENST00000337801 1084 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
JSRP1Q96MG2 GSTZ1-202ENST00000349555 867 ntTSL 2 BASIC15.83■□□□□ 0.12
JSRP1Q96MG2 TOR3A-201ENST00000352445 1182 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
JSRP1Q96MG2 CMTM2-202ENST00000379486 904 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
JSRP1Q96MG2 LINC00982-205ENST00000420957 435 ntBASIC15.83■□□□□ 0.12
JSRP1Q96MG2 AL359915.2-201ENST00000425884 745 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
JSRP1Q96MG2 HCG15-203ENST00000438190 1032 ntTSL 3 BASIC15.83■□□□□ 0.12
JSRP1Q96MG2 TSPY3-202ENST00000440483 414 ntTSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
JSRP1Q96MG2 AC009567.1-201ENST00000515071 525 ntTSL 4 BASIC15.83■□□□□ 0.12
JSRP1Q96MG2 AC068389.2-201ENST00000529518 430 ntTSL 2 BASIC15.83■□□□□ 0.12
JSRP1Q96MG2 BAX-213ENST00000539787 458 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
JSRP1Q96MG2 NUBP2-214ENST00000568706 913 ntTSL 2 BASIC15.83■□□□□ 0.12
JSRP1Q96MG2 FBF1-204ENST00000586631 621 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.83■□□□□ 0.12
JSRP1Q96MG2 TK1-204ENST00000590430 683 ntTSL 3 BASIC15.83■□□□□ 0.12
JSRP1Q96MG2 AC011530.1-201ENST00000593999 558 ntTSL 2 BASIC15.83■□□□□ 0.12
JSRP1Q96MG2 SMIM22-210ENST00000615471 928 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.83■□□□□ 0.12
JSRP1Q96MG2 AC117500.6-201ENST00000624871 588 ntBASIC15.83■□□□□ 0.12
JSRP1Q96MG2 RNH1-205ENST00000397615 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
JSRP1Q96MG2 KIAA1217-206ENST00000376462 6123 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
JSRP1Q96MG2 HFE2-204ENST00000475797 1381 ntTSL 2 BASIC15.83■□□□□ 0.12
JSRP1Q96MG2 ADGRB2-206ENST00000398556 4879 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
JSRP1Q96MG2 LINC01097-201ENST00000627163 2122 ntTSL 2 BASIC15.83■□□□□ 0.12
JSRP1Q96MG2 CYBA-210ENST00000569359 1415 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
JSRP1Q96MG2 REEP4-202ENST00000334530 1476 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
JSRP1Q96MG2 BAGE2-202ENST00000474011 1482 ntTSL 2 BASIC15.83■□□□□ 0.12
JSRP1Q96MG2 PHKG1-205ENST00000452681 2226 ntTSL 2 BASIC15.83■□□□□ 0.12
JSRP1Q96MG2 ST6GALNAC6-201ENST00000291839 2280 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
JSRP1Q96MG2 PPM1G-201ENST00000344034 2311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
JSRP1Q96MG2 AHRR-201ENST00000316418 5661 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
JSRP1Q96MG2 SARS2-212ENST00000600042 1630 ntTSL 2 BASIC15.83■□□□□ 0.12
JSRP1Q96MG2 RIC8A-208ENST00000527696 2565 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
JSRP1Q96MG2 CYP2D6-204ENST00000389970 1714 ntTSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
JSRP1Q96MG2 TXNL4A-201ENST00000269601 3504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
JSRP1Q96MG2 KIAA1324L-207ENST00000444627 3527 ntTSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
JSRP1Q96MG2 PRMT2-203ENST00000355680 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
JSRP1Q96MG2 TRIM72-201ENST00000322122 8500 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.82■□□□□ 0.12
JSRP1Q96MG2 POLR3D-201ENST00000306433 1931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
JSRP1Q96MG2 ZNF618-203ENST00000374126 3018 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
JSRP1Q96MG2 ZNF385A-202ENST00000352268 2076 ntTSL 2 BASIC15.82■□□□□ 0.12
JSRP1Q96MG2 TRIM33-202ENST00000369543 3457 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
JSRP1Q96MG2 SLCO6A1-202ENST00000389019 2340 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
JSRP1Q96MG2 PARD3-201ENST00000340077 3518 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
JSRP1Q96MG2 ARFIP2-201ENST00000254584 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
JSRP1Q96MG2 GOLGA2P7-201ENST00000316967 2525 ntTSL 2 BASIC15.82■□□□□ 0.12
JSRP1Q96MG2 ELK2BP-201ENST00000415014 1224 ntBASIC15.82■□□□□ 0.12
JSRP1Q96MG2 MMP24-AS1-201ENST00000424358 867 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.82■□□□□ 0.12
JSRP1Q96MG2 MMP24-AS1-209ENST00000456790 712 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.82■□□□□ 0.12
JSRP1Q96MG2 AC136632.2-201ENST00000512891 861 ntBASIC15.82■□□□□ 0.12
JSRP1Q96MG2 RNA5SP415-201ENST00000517246 115 ntBASIC15.82■□□□□ 0.12
JSRP1Q96MG2 TUBA1A-203ENST00000546918 984 ntTSL 3 BASIC15.82■□□□□ 0.12
JSRP1Q96MG2 CHMP1A-208ENST00000550102 803 ntTSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
JSRP1Q96MG2 CYGB-205ENST00000590175 830 ntTSL 3 BASIC15.82■□□□□ 0.12
JSRP1Q96MG2 AC004706.3-202ENST00000621574 984 ntBASIC15.82■□□□□ 0.12
JSRP1Q96MG2 IFT140-203ENST00000426508 5270 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
JSRP1Q96MG2 ESM1-201ENST00000381403 1326 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
JSRP1Q96MG2 ANKRD13B-209ENST00000614878 2670 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
JSRP1Q96MG2 AC062028.1-203ENST00000447433 1472 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
JSRP1Q96MG2 AC006504.4-201ENST00000592118 1568 ntBASIC15.82■□□□□ 0.12
JSRP1Q96MG2 MIB2-219ENST00000505820 3305 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
JSRP1Q96MG2 AC068888.1-203ENST00000546566 1650 ntTSL 2 BASIC15.82■□□□□ 0.12
JSRP1Q96MG2 AL135999.2-201ENST00000622438 1686 ntBASIC15.82■□□□□ 0.12
JSRP1Q96MG2 SLC30A1-201ENST00000367001 5474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
JSRP1Q96MG2 ZCCHC23-201ENST00000500526 1951 ntTSL 2 BASIC15.82■□□□□ 0.12
JSRP1Q96MG2 DTX2-211ENST00000446600 2281 ntTSL 2 BASIC15.82■□□□□ 0.12
JSRP1Q96MG2 RBBP7-203ENST00000380087 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
JSRP1Q96MG2 AC067852.2-201ENST00000590513 2313 ntBASIC15.82■□□□□ 0.12
JSRP1Q96MG2 FBXL22-202ENST00000534939 2443 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.82■□□□□ 0.12
JSRP1Q96MG2 MAFF-201ENST00000338483 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
JSRP1Q96MG2 TRMT6-201ENST00000203001 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
JSRP1Q96MG2 TM2D1-201ENST00000294613 1250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
JSRP1Q96MG2 ISCA2-201ENST00000298818 851 ntTSL 5 BASIC15.81■□□□□ 0.12
JSRP1Q96MG2 NUDT9-201ENST00000302174 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
JSRP1Q96MG2 TUFM-201ENST00000313511 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
JSRP1Q96MG2 ELOA3-201ENST00000330682 1877 ntAPPRIS P1 BASIC15.81■□□□□ 0.12
JSRP1Q96MG2 THEG-201ENST00000342640 1877 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
JSRP1Q96MG2 ZAR1L-201ENST00000345108 1103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
JSRP1Q96MG2 ADIPOR1-202ENST00000367254 1116 ntTSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
JSRP1Q96MG2 TM2D1-204ENST00000371180 1248 ntTSL 5 BASIC15.81■□□□□ 0.12
JSRP1Q96MG2 TMEM59-202ENST00000371337 600 ntTSL 2 BASIC15.81■□□□□ 0.12
JSRP1Q96MG2 ITM2B-201ENST00000378549 805 ntTSL 5 BASIC15.81■□□□□ 0.12
JSRP1Q96MG2 GYG2P1-204ENST00000382966 639 ntTSL 3 BASIC15.81■□□□□ 0.12
JSRP1Q96MG2 IGHV3-15-201ENST00000390603 437 ntAPPRIS P1 BASIC15.81■□□□□ 0.12
JSRP1Q96MG2 ANGPTL4-202ENST00000393962 1705 ntTSL 5 BASIC15.81■□□□□ 0.12
JSRP1Q96MG2 CLDN5-202ENST00000406028 2548 ntTSL 2 BASIC15.81■□□□□ 0.12
JSRP1Q96MG2 IDH3B-206ENST00000474315 1279 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
JSRP1Q96MG2 GNE-204ENST00000539208 2190 ntTSL 2 BASIC15.81■□□□□ 0.12
JSRP1Q96MG2 PWP1-202ENST00000541166 1722 ntTSL 2 BASIC15.81■□□□□ 0.12
JSRP1Q96MG2 RPL18-208ENST00000549920 1004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
JSRP1Q96MG2 RPL18-209ENST00000550645 463 ntTSL 5 BASIC15.81■□□□□ 0.12
JSRP1Q96MG2 RPL18-214ENST00000552588 559 ntTSL 3 BASIC15.81■□□□□ 0.12
JSRP1Q96MG2 SNX1-208ENST00000559844 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 36.7 ms