Protein–RNA interactions for Protein: Q96LD8

SENP8, Sentrin-specific protease 8, humanhuman

Predictions only

Length 212 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SENP8Q96LD8 PHYH-202ENST00000396913 1732 ntTSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
SENP8Q96LD8 PRRT4-205ENST00000489835 2313 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
SENP8Q96LD8 PRR29-AS1-202ENST00000580942 2926 ntTSL 2 BASIC18.21■□□□□ 0.51
SENP8Q96LD8 URAHP-203ENST00000517889 1381 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
SENP8Q96LD8 LINC00957-202ENST00000441052 2590 ntTSL 2 BASIC18.21■□□□□ 0.51
SENP8Q96LD8 CNTNAP3-204ENST00000377656 4986 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
SENP8Q96LD8 TVP23C-204ENST00000438826 1852 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
SENP8Q96LD8 GFY-201ENST00000576655 1876 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
SENP8Q96LD8 PNRC2-202ENST00000374468 814 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.21■□□□□ 0.51
SENP8Q96LD8 JAKMIP1-202ENST00000409021 2975 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
SENP8Q96LD8 SGO2-202ENST00000409203 1041 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
SENP8Q96LD8 COA5-202ENST00000409997 557 ntTSL 4 BASIC18.21■□□□□ 0.51
SENP8Q96LD8 PIGBOS1-201ENST00000436697 866 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.21■□□□□ 0.51
SENP8Q96LD8 AC074386.1-202ENST00000463561 864 ntBASIC18.21■□□□□ 0.51
SENP8Q96LD8 ZNF454-202ENST00000519564 2142 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.21■□□□□ 0.51
SENP8Q96LD8 DDIAS-202ENST00000524921 607 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC18.21■□□□□ 0.51
SENP8Q96LD8 TMEM220-AS1-206ENST00000583343 876 ntTSL 3 BASIC18.21■□□□□ 0.51
SENP8Q96LD8 AC002985.2-201ENST00000601106 957 ntTSL 4 BASIC18.21■□□□□ 0.51
SENP8Q96LD8 ZEB1-AS1-206ENST00000606250 573 ntTSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
SENP8Q96LD8 ZCWPW1-202ENST00000398027 2356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
SENP8Q96LD8 CDIPT-209ENST00000569956 1532 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
SENP8Q96LD8 EIF4G3-214ENST00000634879 5325 ntTSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
SENP8Q96LD8 EPS8L2-205ENST00000526198 2289 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
SENP8Q96LD8 PHC1-212ENST00000543824 4292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
SENP8Q96LD8 A4GALT-202ENST00000381278 1935 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
SENP8Q96LD8 RGS3-211ENST00000462403 2155 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
SENP8Q96LD8 ASCC2-202ENST00000397771 2823 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
SENP8Q96LD8 POFUT2-201ENST00000331343 4825 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
SENP8Q96LD8 LMNA-205ENST00000368299 2253 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
SENP8Q96LD8 PDHX-203ENST00000448838 2653 ntTSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
SENP8Q96LD8 ICAM3-205ENST00000589261 2024 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
SENP8Q96LD8 BBS7-204ENST00000506636 2570 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
SENP8Q96LD8 HLA-F-218ENST00000376861 1544 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.2■□□□□ 0.5
SENP8Q96LD8 TPT1-AS1-215ENST00000522673 1519 ntTSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
SENP8Q96LD8 CCDC189-204ENST00000541260 1531 ntTSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
SENP8Q96LD8 STX10-201ENST00000242770 1099 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
SENP8Q96LD8 C19orf70-201ENST00000309324 896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
SENP8Q96LD8 HIST1H2BD-202ENST00000377777 496 ntAPPRIS P1 BASIC18.2■□□□□ 0.5
SENP8Q96LD8 SELENOH-201ENST00000388857 833 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
SENP8Q96LD8 ALG1L5P-201ENST00000482043 771 ntBASIC18.2■□□□□ 0.5
SENP8Q96LD8 FAM181A-205ENST00000557719 1072 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.2■□□□□ 0.5
SENP8Q96LD8 BORCS8-206ENST00000585679 801 ntTSL 3 BASIC18.2■□□□□ 0.5
SENP8Q96LD8 STX10-204ENST00000587230 1136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
SENP8Q96LD8 ZNF445-205ENST00000617032 1291 ntTSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
SENP8Q96LD8 AL691403.2-201ENST00000618460 490 ntBASIC18.2■□□□□ 0.5
SENP8Q96LD8 C20orf181-201ENST00000623918 480 ntBASIC18.2■□□□□ 0.5
SENP8Q96LD8 TMEM263-204ENST00000548125 3349 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.2■□□□□ 0.5
SENP8Q96LD8 GULP1-209ENST00000410051 1595 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
SENP8Q96LD8 HDAC10-205ENST00000448072 2133 ntTSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
SENP8Q96LD8 RUSC1-209ENST00000471876 1749 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
SENP8Q96LD8 TSNARE1-205ENST00000520166 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
SENP8Q96LD8 EIF2AK3-201ENST00000303236 4646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
SENP8Q96LD8 KAZN-203ENST00000376030 6030 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
SENP8Q96LD8 ANKS1A-201ENST00000360359 6347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
SENP8Q96LD8 SEMA6D-205ENST00000389425 2318 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
SENP8Q96LD8 MEGF9-201ENST00000373930 6298 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.2■□□□□ 0.5
SENP8Q96LD8 RSPH6A-201ENST00000221538 2456 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
SENP8Q96LD8 B4GALNT2-201ENST00000300404 1906 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
SENP8Q96LD8 NGLY1-207ENST00000428257 2534 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
SENP8Q96LD8 XKR8-201ENST00000373884 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
SENP8Q96LD8 RBFOX1-207ENST00000547338 1513 ntTSL 2 BASIC18.19■□□□□ 0.5
SENP8Q96LD8 C6orf223-203ENST00000442114 3109 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
SENP8Q96LD8 CNNM3-201ENST00000305510 3447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
SENP8Q96LD8 FAM210A-201ENST00000322247 4340 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.19■□□□□ 0.5
SENP8Q96LD8 TRAF2-201ENST00000247668 2264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
SENP8Q96LD8 PLEKHB1-203ENST00000398492 2275 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
SENP8Q96LD8 ZNF500-202ENST00000545009 2440 ntTSL 2 BASIC18.19■□□□□ 0.5
SENP8Q96LD8 CCDC94-201ENST00000262962 1434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
SENP8Q96LD8 ADCY8-201ENST00000286355 5938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
SENP8Q96LD8 LMNA-202ENST00000361308 1713 ntTSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
SENP8Q96LD8 ANP32E-201ENST00000369114 1048 ntTSL 3 BASIC18.19■□□□□ 0.5
SENP8Q96LD8 HMGN4-201ENST00000377575 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
SENP8Q96LD8 NR4A2-203ENST00000409108 1735 ntTSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
SENP8Q96LD8 AP001058.1-201ENST00000423967 463 ntTSL 2 BASIC18.19■□□□□ 0.5
SENP8Q96LD8 ZNF295-AS1-202ENST00000429739 783 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
SENP8Q96LD8 AL669831.5-202ENST00000457084 566 ntTSL 4 BASIC18.19■□□□□ 0.5
SENP8Q96LD8 EHMT1-216ENST00000493484 1182 ntTSL 3 BASIC18.19■□□□□ 0.5
SENP8Q96LD8 EEF1E1-205ENST00000507463 654 ntTSL 2 BASIC18.19■□□□□ 0.5
SENP8Q96LD8 SFTPC-204ENST00000520605 519 ntTSL 3 BASIC18.19■□□□□ 0.5
SENP8Q96LD8 SFTPC-210ENST00000524255 681 ntTSL 2 BASIC18.19■□□□□ 0.5
SENP8Q96LD8 DUSP6-204ENST00000547291 1074 ntTSL 2 BASIC18.19■□□□□ 0.5
SENP8Q96LD8 LHX5-AS1-201ENST00000551357 522 ntTSL 2 BASIC18.19■□□□□ 0.5
SENP8Q96LD8 AC005829.1-201ENST00000570002 483 ntBASIC18.19■□□□□ 0.5
SENP8Q96LD8 TJP3-205ENST00000587686 2946 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
SENP8Q96LD8 PGPEP1-209ENST00000604499 769 ntTSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
SENP8Q96LD8 LINC00623-201ENST00000613486 486 ntTSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
SENP8Q96LD8 SLC9A6-208ENST00000636206 4711 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
SENP8Q96LD8 NOV-201ENST00000259526 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
SENP8Q96LD8 HSF2-201ENST00000368455 2549 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
SENP8Q96LD8 ATOH1-201ENST00000306011 2212 ntAPPRIS P1 BASIC18.19■□□□□ 0.5
SENP8Q96LD8 MARK2-207ENST00000502399 2885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
SENP8Q96LD8 KIAA1522-202ENST00000373480 5294 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
SENP8Q96LD8 KIAA1522-203ENST00000373481 5293 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.19■□□□□ 0.5
SENP8Q96LD8 EPHX2-204ENST00000518379 1959 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
SENP8Q96LD8 CTSB-202ENST00000353047 3875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
SENP8Q96LD8 FAM213B-205ENST00000444521 2827 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.18■□□□□ 0.5
SENP8Q96LD8 SKOR1-202ENST00000380035 3675 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
SENP8Q96LD8 ZNF200-202ENST00000396870 2373 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
SENP8Q96LD8 TMCO1-207ENST00000580248 1735 ntTSL 2 BASIC18.18■□□□□ 0.5
SENP8Q96LD8 ZNF12-204ENST00000405858 5051 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 34.7 ms