Protein–RNA interactions for Protein: Q96JN2

CCDC136, Coiled-coil domain-containing protein 136, humanhuman

Predictions only

Length 1,154 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC136Q96JN2 MTCL1P1-201ENST00000446207 792 ntBASIC22.1■■□□□ 1.13
CCDC136Q96JN2 RAB29-205ENST00000446390 1441 ntTSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
CCDC136Q96JN2 PBX3-207ENST00000447726 2789 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
CCDC136Q96JN2 AC026471.3-201ENST00000565137 578 ntTSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
CCDC136Q96JN2 AC005943.1-201ENST00000585937 1002 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.1■■□□□ 1.13
CCDC136Q96JN2 C16orf74-202ENST00000602583 1237 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
CCDC136Q96JN2 AC007950.2-201ENST00000615045 2347 ntBASIC22.1■■□□□ 1.13
CCDC136Q96JN2 IL18BP-214ENST00000620017 1566 ntTSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
CCDC136Q96JN2 CROCCP2-205ENST00000639481 1296 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
CCDC136Q96JN2 ARHGAP35-201ENST00000404338 8889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
CCDC136Q96JN2 NF2-202ENST00000338641 6025 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
CCDC136Q96JN2 SCAF8-201ENST00000367178 5057 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
CCDC136Q96JN2 MINDY1-201ENST00000312210 2400 ntTSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
CCDC136Q96JN2 PPM1D-201ENST00000305921 4778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
CCDC136Q96JN2 UBQLN1-201ENST00000257468 2299 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
CCDC136Q96JN2 CES4A-206ENST00000540579 1825 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
CCDC136Q96JN2 MAPKAP1-206ENST00000373511 3252 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
CCDC136Q96JN2 CRY1-201ENST00000008527 3267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
CCDC136Q96JN2 FO681492.1-203ENST00000622861 1362 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
CCDC136Q96JN2 FAM83G-202ENST00000388995 5266 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
CCDC136Q96JN2 MEGF6-201ENST00000294599 4501 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
CCDC136Q96JN2 RAB31-207ENST00000578921 4055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
CCDC136Q96JN2 RGS3-210ENST00000462143 2759 ntTSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
CCDC136Q96JN2 CARD14-202ENST00000570421 2607 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
CCDC136Q96JN2 DDX19B-204ENST00000451014 1608 ntTSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
CCDC136Q96JN2 TICAM2-201ENST00000427199 3049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
CCDC136Q96JN2 PPP1R21-206ENST00000449090 3049 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
CCDC136Q96JN2 SPAG4-201ENST00000374273 1453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
CCDC136Q96JN2 FAM104A-202ENST00000405159 2865 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
CCDC136Q96JN2 POC1A-201ENST00000296484 1898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
CCDC136Q96JN2 EPHA8-201ENST00000166244 4943 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
CCDC136Q96JN2 NKPD1-201ENST00000317951 4233 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
CCDC136Q96JN2 TYSND1-201ENST00000287078 3644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
CCDC136Q96JN2 ARSE-206ENST00000545496 2506 ntTSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
CCDC136Q96JN2 ARHGEF28-211ENST00000512883 2936 ntTSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
CCDC136Q96JN2 PIGH-201ENST00000216452 1420 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
CCDC136Q96JN2 DGKE-204ENST00000572810 1843 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
CCDC136Q96JN2 PAX3-208ENST00000409828 1254 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
CCDC136Q96JN2 AC037459.1-202ENST00000430850 531 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC22.09■■□□□ 1.13
CCDC136Q96JN2 CR769775.1-204ENST00000439760 747 ntTSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
CCDC136Q96JN2 AL136307.1-201ENST00000454882 411 ntTSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
CCDC136Q96JN2 FIS1-207ENST00000474120 915 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
CCDC136Q96JN2 RBM14-RBM4-203ENST00000500635 829 ntTSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
CCDC136Q96JN2 ADA-207ENST00000537820 1128 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
CCDC136Q96JN2 NAPSB-206ENST00000562112 1266 ntBASIC22.09■■□□□ 1.13
CCDC136Q96JN2 AC092118.1-202ENST00000568697 718 ntTSL 3 BASIC22.09■■□□□ 1.13
CCDC136Q96JN2 ECSIT-207ENST00000588998 818 ntTSL 3 BASIC22.09■■□□□ 1.13
CCDC136Q96JN2 IFNL4-202ENST00000616270 1132 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
CCDC136Q96JN2 ARHGEF4-205ENST00000409359 5489 ntTSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
CCDC136Q96JN2 ANKRD23-203ENST00000418232 2156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
CCDC136Q96JN2 CCNC-209ENST00000520371 2186 ntTSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
CCDC136Q96JN2 BCAT2-202ENST00000402551 2041 ntTSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
CCDC136Q96JN2 CDCP2-202ENST00000530059 1623 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
CCDC136Q96JN2 EPS8-201ENST00000281172 4061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
CCDC136Q96JN2 EVA1A-205ENST00000410113 1747 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC22.09■■□□□ 1.13
CCDC136Q96JN2 RUSC1-214ENST00000490373 1700 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
CCDC136Q96JN2 WT1-203ENST00000379079 2466 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
CCDC136Q96JN2 LTBP2-205ENST00000556690 5614 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.13
CCDC136Q96JN2 ADRA2A-201ENST00000280155 3745 ntAPPRIS P1 BASIC22.08■■□□□ 1.13
CCDC136Q96JN2 PROK1-201ENST00000271331 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
CCDC136Q96JN2 AC010460.3-201ENST00000511359 1579 ntBASIC22.08■■□□□ 1.13
CCDC136Q96JN2 YY1-201ENST00000262238 6697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
CCDC136Q96JN2 DNAAF5-201ENST00000297440 3410 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
CCDC136Q96JN2 POMC-204ENST00000405623 1426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
CCDC136Q96JN2 ATG5-210ENST00000636437 2261 ntTSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.13
CCDC136Q96JN2 AL513523.2-202ENST00000427283 2040 ntBASIC22.08■■□□□ 1.13
CCDC136Q96JN2 ADGRA1-AS1-202ENST00000444433 2646 ntTSL 3 BASIC22.08■■□□□ 1.13
CCDC136Q96JN2 CADPS2-204ENST00000412584 4308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
CCDC136Q96JN2 FAM184B-201ENST00000265018 6622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
CCDC136Q96JN2 TCEAL3-201ENST00000243286 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
CCDC136Q96JN2 HCRT-201ENST00000293330 577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
CCDC136Q96JN2 DNPH1-202ENST00000393987 796 ntTSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.13
CCDC136Q96JN2 CYB561D2-204ENST00000424512 1212 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.13
CCDC136Q96JN2 ABHD11-207ENST00000458339 890 ntTSL 3 BASIC22.08■■□□□ 1.13
CCDC136Q96JN2 PPOX-214ENST00000535223 664 ntTSL 3 BASIC22.08■■□□□ 1.13
CCDC136Q96JN2 RTBDN-213ENST00000592204 1024 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
CCDC136Q96JN2 AC004076.1-201ENST00000596831 664 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.13
CCDC136Q96JN2 SNX21-213ENST00000614929 587 ntTSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.13
CCDC136Q96JN2 MAN1C1-203ENST00000374332 4641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
CCDC136Q96JN2 MAN1C1-208ENST00000611903 4647 ntTSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.13
CCDC136Q96JN2 FAM153A-203ENST00000440605 1966 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
CCDC136Q96JN2 ANAPC11-211ENST00000575195 1361 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.12
CCDC136Q96JN2 PEX16-201ENST00000241041 1479 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
CCDC136Q96JN2 OTUD5-204ENST00000428668 1493 ntTSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.12
CCDC136Q96JN2 TRIM13-206ENST00000457662 1489 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
CCDC136Q96JN2 YAP1-208ENST00000531439 1490 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
CCDC136Q96JN2 EPB41L3-203ENST00000400111 4259 ntTSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.12
CCDC136Q96JN2 IRF7-207ENST00000525445 1588 ntTSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.12
CCDC136Q96JN2 COQ8B-201ENST00000243583 2041 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
CCDC136Q96JN2 PXK-204ENST00000383716 3035 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
CCDC136Q96JN2 AL109955.1-201ENST00000417346 1540 ntTSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
CCDC136Q96JN2 ASIC3-201ENST00000297512 1718 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
CCDC136Q96JN2 BTN1A1-202ENST00000613186 2266 ntTSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
CCDC136Q96JN2 HSCB-201ENST00000216027 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
CCDC136Q96JN2 AZU1-201ENST00000233997 908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
CCDC136Q96JN2 METTL27-201ENST00000297873 941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
CCDC136Q96JN2 RHOG-202ENST00000396978 1066 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.07■■□□□ 1.12
CCDC136Q96JN2 DDT-202ENST00000398344 713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
CCDC136Q96JN2 DDT-203ENST00000403754 569 ntTSL 3 BASIC22.07■■□□□ 1.12
CCDC136Q96JN2 AL596275.1-201ENST00000423464 877 ntBASIC22.07■■□□□ 1.12
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 33.5 ms