Protein–RNA interactions for Protein: Q96CX2

KCTD12, BTB/POZ domain-containing protein KCTD12, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 325 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KCTD12Q96CX2 INHBB-201ENST00000295228 3204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
KCTD12Q96CX2 TMEM106C-203ENST00000449758 1414 ntTSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
KCTD12Q96CX2 GLG1-201ENST00000205061 8261 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
KCTD12Q96CX2 PPP1R21-206ENST00000449090 3049 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
KCTD12Q96CX2 LINC00671-201ENST00000301683 1958 ntTSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
KCTD12Q96CX2 CR392000.2-201ENST00000640235 1994 ntTSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
KCTD12Q96CX2 EVA1A-205ENST00000410113 1747 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC15.09■□□□□ 0.01
KCTD12Q96CX2 GIGYF1-201ENST00000275732 6530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
KCTD12Q96CX2 NUS1-201ENST00000368494 4676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
KCTD12Q96CX2 SPAG4-201ENST00000374273 1453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
KCTD12Q96CX2 PPP1R26-205ENST00000605286 4744 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.09■□□□□ 0.01
KCTD12Q96CX2 ALDH3B1-208ENST00000617288 2078 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
KCTD12Q96CX2 CLDN4-201ENST00000340958 1831 ntAPPRIS P1 BASIC15.09■□□□□ 0.01
KCTD12Q96CX2 NR2C1-203ENST00000393101 1822 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
KCTD12Q96CX2 UNC13A-205ENST00000551649 6052 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
KCTD12Q96CX2 PEX11G-201ENST00000221480 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
KCTD12Q96CX2 NME1-202ENST00000336097 986 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
KCTD12Q96CX2 NME1-203ENST00000393196 940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
KCTD12Q96CX2 ANKRD54-204ENST00000411961 946 ntTSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
KCTD12Q96CX2 SEPHS1P7-201ENST00000452995 1177 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
KCTD12Q96CX2 TNFRSF18-204ENST00000486728 727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
KCTD12Q96CX2 AC090833.1-202ENST00000511073 781 ntTSL 3 BASIC15.09■□□□□ 0.01
KCTD12Q96CX2 NUDT16P1-203ENST00000513809 620 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
KCTD12Q96CX2 CNOT8-224ENST00000523698 862 ntTSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
KCTD12Q96CX2 JPT2-204ENST00000561516 1065 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
KCTD12Q96CX2 AP005242.2-201ENST00000580065 1175 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
KCTD12Q96CX2 AC008649.1-201ENST00000589557 516 ntTSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
KCTD12Q96CX2 AC091551.1-201ENST00000590722 1228 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
KCTD12Q96CX2 AC097478.2-201ENST00000610572 514 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
KCTD12Q96CX2 POC1A-201ENST00000296484 1898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
KCTD12Q96CX2 SEC14L4-201ENST00000255858 2499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
KCTD12Q96CX2 FAM76B-201ENST00000358780 3952 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
KCTD12Q96CX2 ARFRP1-212ENST00000618838 1623 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
KCTD12Q96CX2 ZNF644-201ENST00000337393 5763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
KCTD12Q96CX2 SLC17A7-204ENST00000600601 2237 ntTSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
KCTD12Q96CX2 GPR176-205ENST00000561100 2816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
KCTD12Q96CX2 CBX8-201ENST00000269385 3791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
KCTD12Q96CX2 LTBR-201ENST00000228918 2260 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
KCTD12Q96CX2 UNC119B-201ENST00000344651 4404 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
KCTD12Q96CX2 SMUG1-209ENST00000505128 2607 ntTSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
KCTD12Q96CX2 INTS11-247ENST00000540437 2629 ntTSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
KCTD12Q96CX2 ADM5-201ENST00000420022 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
KCTD12Q96CX2 TCF25-202ENST00000263347 2377 ntTSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
KCTD12Q96CX2 TAF1D-203ENST00000448108 2082 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0.01
KCTD12Q96CX2 FGF11-201ENST00000293829 3063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
KCTD12Q96CX2 NFATC4-210ENST00000554050 3057 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
KCTD12Q96CX2 JPH4-202ENST00000397118 4386 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
KCTD12Q96CX2 C2CD4A-201ENST00000355522 3445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
KCTD12Q96CX2 KRT89P-201ENST00000620027 1478 ntBASIC15.08■□□□□ 0.01
KCTD12Q96CX2 RDX-201ENST00000343115 4491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
KCTD12Q96CX2 PCCB-207ENST00000466072 1844 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.08■□□□□ 0.01
KCTD12Q96CX2 GPS1-226ENST00000623691 1839 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0.01
KCTD12Q96CX2 LAPTM4B-201ENST00000445593 3173 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
KCTD12Q96CX2 ANKRD23-203ENST00000418232 2156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
KCTD12Q96CX2 NEO1-206ENST00000558964 4441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
KCTD12Q96CX2 SLCO5A1-203ENST00000524945 3725 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
KCTD12Q96CX2 MPG-201ENST00000219431 1193 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC15.08■□□□□ 0
KCTD12Q96CX2 EMC6-201ENST00000248378 653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
KCTD12Q96CX2 FITM1-201ENST00000267426 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
KCTD12Q96CX2 MYCLP1-201ENST00000372451 1075 ntBASIC15.08■□□□□ 0
KCTD12Q96CX2 AL669831.5-220ENST00000412115 581 ntTSL 3 BASIC15.08■□□□□ 0
KCTD12Q96CX2 GNB2-205ENST00000419828 1285 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
KCTD12Q96CX2 SAPCD2P4-201ENST00000424595 1171 ntBASIC15.08■□□□□ 0
KCTD12Q96CX2 AL451069.1-201ENST00000455414 634 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
KCTD12Q96CX2 C1QBPP2-201ENST00000528754 825 ntBASIC15.08■□□□□ 0
KCTD12Q96CX2 AC027458.1-201ENST00000563639 613 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
KCTD12Q96CX2 AC011498.3-201ENST00000590159 569 ntTSL 4 BASIC15.08■□□□□ 0
KCTD12Q96CX2 CD177P1-201ENST00000606252 935 ntBASIC15.08■□□□□ 0
KCTD12Q96CX2 BX649632.1-201ENST00000610187 819 ntTSL 3 BASIC15.08■□□□□ 0
KCTD12Q96CX2 KCTD11-201ENST00000333751 2783 ntAPPRIS P1 BASIC15.08■□□□□ 0
KCTD12Q96CX2 DMRTC2-204ENST00000596827 1675 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
KCTD12Q96CX2 EGLN2-207ENST00000593726 2821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
KCTD12Q96CX2 SLC30A1-201ENST00000367001 5474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
KCTD12Q96CX2 PROSER1-211ENST00000625998 5102 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
KCTD12Q96CX2 VWA1-203ENST00000476993 4511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
KCTD12Q96CX2 GFAP-233ENST00000639277 1783 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
KCTD12Q96CX2 STARD7-201ENST00000337288 3368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
KCTD12Q96CX2 CXXC1-212ENST00000589940 2242 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
KCTD12Q96CX2 LINC01270-201ENST00000371639 2281 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
KCTD12Q96CX2 FOXP3-202ENST00000376199 2274 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
KCTD12Q96CX2 TMC5-202ENST00000381414 4755 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
KCTD12Q96CX2 PIKFYVE-204ENST00000407449 1898 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
KCTD12Q96CX2 RDH13-202ENST00000396247 1987 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
KCTD12Q96CX2 RBM47-212ENST00000514014 2419 ntTSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
KCTD12Q96CX2 STT3B-201ENST00000295770 4248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
KCTD12Q96CX2 ABO-203ENST00000611156 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
KCTD12Q96CX2 AC006460.2-201ENST00000638173 4744 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
KCTD12Q96CX2 TVP23B-202ENST00000476139 2989 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
KCTD12Q96CX2 ONECUT1-201ENST00000305901 2092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
KCTD12Q96CX2 TMEM97-201ENST00000226230 2568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
KCTD12Q96CX2 BSX-201ENST00000343035 830 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
KCTD12Q96CX2 HP1BP3-202ENST00000375000 928 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
KCTD12Q96CX2 FAM9B-203ENST00000428477 1064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
KCTD12Q96CX2 AC007405.3-201ENST00000429172 561 ntTSL 3 BASIC15.07■□□□□ 0
KCTD12Q96CX2 GYG2-AS1-201ENST00000445107 515 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
KCTD12Q96CX2 FO393415.3-201ENST00000456424 375 ntTSL 3 BASIC15.07■□□□□ 0
KCTD12Q96CX2 DBNL-214ENST00000456905 1241 ntTSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
KCTD12Q96CX2 REEP5-207ENST00000513339 1139 ntTSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
KCTD12Q96CX2 ACTR6P1-201ENST00000514311 1104 ntBASIC15.07■□□□□ 0
KCTD12Q96CX2 AC087273.1-201ENST00000519368 529 ntTSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 32.7 ms