Protein–RNA interactions for Protein: Q92729

PTPRU, Receptor-type tyrosine-protein phosphatase U, humanhuman

Predictions only

Length 1,446 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRUQ92729 SNHG17-203ENST00000417578 880 ntTSL 2 BASIC23.6■■□□□ 1.37
PTPRUQ92729 AL158198.1-201ENST00000449143 380 ntTSL 3 BASIC23.6■■□□□ 1.37
PTPRUQ92729 GPR53P-205ENST00000457298 1084 ntBASIC23.6■■□□□ 1.37
PTPRUQ92729 PRR29-204ENST00000577953 565 ntTSL 4 BASIC23.6■■□□□ 1.37
PTPRUQ92729 MPDU1-223ENST00000582151 728 ntBASIC23.6■■□□□ 1.37
PTPRUQ92729 RNA5-8SN1-201ENST00000610460 153 ntBASIC23.6■■□□□ 1.37
PTPRUQ92729 RNA5-8SN5-202ENST00000612463 153 ntBASIC23.6■■□□□ 1.37
PTPRUQ92729 RNA5-8SN4-201ENST00000613359 153 ntBASIC23.6■■□□□ 1.37
PTPRUQ92729 RNA5-8SN5-201ENST00000619471 153 ntBASIC23.6■■□□□ 1.37
PTPRUQ92729 EI24-214ENST00000620753 1718 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.6■■□□□ 1.37
PTPRUQ92729 RNF34-201ENST00000361234 2066 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
PTPRUQ92729 AP005329.2-201ENST00000580139 1771 ntTSL 2 BASIC23.6■■□□□ 1.37
PTPRUQ92729 ORAI2-204ENST00000473939 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
PTPRUQ92729 AC087499.5-201ENST00000452760 1342 ntBASIC23.6■■□□□ 1.37
PTPRUQ92729 CCNA1-203ENST00000625767 1699 ntTSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
PTPRUQ92729 SCARF2-202ENST00000622235 3232 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
PTPRUQ92729 MIB2-203ENST00000378712 2890 ntTSL 2 BASIC23.6■■□□□ 1.37
PTPRUQ92729 LLGL2-209ENST00000578363 1393 ntTSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
PTPRUQ92729 MTMR12-201ENST00000264934 2215 ntTSL 2 BASIC23.6■■□□□ 1.37
PTPRUQ92729 ZNF133-211ENST00000538547 2245 ntTSL 2 BASIC23.6■■□□□ 1.37
PTPRUQ92729 AL080243.2-201ENST00000418783 582 ntBASIC23.59■■□□□ 1.37
PTPRUQ92729 RCAN3-204ENST00000425530 997 ntTSL 5 BASIC23.59■■□□□ 1.37
PTPRUQ92729 ARL6IP4-207ENST00000426960 910 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.59■■□□□ 1.37
PTPRUQ92729 NECAP2-203ENST00000457722 935 ntTSL 2 BASIC23.59■■□□□ 1.37
PTPRUQ92729 BCL2L11-201ENST00000308659 1522 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.59■■□□□ 1.37
PTPRUQ92729 ACVR1B-203ENST00000426655 1782 ntTSL 2 BASIC23.59■■□□□ 1.37
PTPRUQ92729 CHRM2-201ENST00000320658 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
PTPRUQ92729 SEMA7A-203ENST00000543145 2304 ntTSL 2 BASIC23.59■■□□□ 1.37
PTPRUQ92729 LGMN-201ENST00000334869 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
PTPRUQ92729 ETV2-205ENST00000479824 1342 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
PTPRUQ92729 GATA2-202ENST00000430265 2525 ntTSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
PTPRUQ92729 CDIP1-207ENST00000564828 1636 ntTSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
PTPRUQ92729 RNF146-213ENST00000610153 2070 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC23.59■■□□□ 1.37
PTPRUQ92729 RGS20-201ENST00000276500 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
PTPRUQ92729 CIDEA-201ENST00000320477 828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
PTPRUQ92729 CTHRC1-201ENST00000330295 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
PTPRUQ92729 AL353597.1-201ENST00000414875 998 ntTSL 5 BASIC23.59■■□□□ 1.37
PTPRUQ92729 TMEM14B-212ENST00000475942 992 ntTSL 2 BASIC23.59■■□□□ 1.37
PTPRUQ92729 GIMAP3P-201ENST00000495150 836 ntBASIC23.59■■□□□ 1.37
PTPRUQ92729 MIR4492-201ENST00000581627 80 ntBASIC23.59■■□□□ 1.37
PTPRUQ92729 AC012615.6-204ENST00000587741 477 ntTSL 3 BASIC23.59■■□□□ 1.37
PTPRUQ92729 GPS1-201ENST00000306823 1842 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
PTPRUQ92729 HFE2-205ENST00000497365 1419 ntTSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
PTPRUQ92729 ABTB1-201ENST00000232744 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
PTPRUQ92729 HDAC10-202ENST00000349505 1950 ntTSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
PTPRUQ92729 SLC44A3-207ENST00000529450 2045 ntTSL 2 BASIC23.58■■□□□ 1.37
PTPRUQ92729 FAM91A1-207ENST00000521166 2706 ntTSL 2 BASIC23.58■■□□□ 1.37
PTPRUQ92729 CLDN14-204ENST00000399137 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
PTPRUQ92729 LMNA-208ENST00000448611 1943 ntTSL 2 BASIC23.58■■□□□ 1.37
PTPRUQ92729 EDC3-202ENST00000426797 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
PTPRUQ92729 BAIAP2-204ENST00000428708 2095 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
PTPRUQ92729 REPS1-203ENST00000409812 2511 ntTSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
PTPRUQ92729 PDE4D-204ENST00000358923 2969 ntTSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
PTPRUQ92729 RETN-202ENST00000381324 249 ntTSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.36
PTPRUQ92729 AP1S3-202ENST00000396653 589 ntTSL 4 BASIC23.58■■□□□ 1.36
PTPRUQ92729 DGCR5-201ENST00000399539 862 ntBASIC23.58■■□□□ 1.36
PTPRUQ92729 AC093151.3-201ENST00000425554 623 ntTSL 2 BASIC23.58■■□□□ 1.36
PTPRUQ92729 MACROD2-AS1-201ENST00000439451 1230 ntTSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.36
PTPRUQ92729 PSMD7-204ENST00000567958 692 ntTSL 3 BASIC23.58■■□□□ 1.36
PTPRUQ92729 CYP2A7P1-201ENST00000595391 815 ntBASIC23.58■■□□□ 1.36
PTPRUQ92729 AC073389.2-202ENST00000607450 441 ntTSL 5 BASIC23.58■■□□□ 1.36
PTPRUQ92729 BHLHE22-201ENST00000321870 3262 ntAPPRIS P1 BASIC23.58■■□□□ 1.36
PTPRUQ92729 STARD3NL-204ENST00000434197 1341 ntTSL 5 BASIC23.57■■□□□ 1.36
PTPRUQ92729 DDX59-201ENST00000331314 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
PTPRUQ92729 HS6ST2-203ENST00000406696 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
PTPRUQ92729 ULK3-220ENST00000569437 2611 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
PTPRUQ92729 LINC00574-201ENST00000420557 2318 ntTSL 2 BASIC23.57■■□□□ 1.36
PTPRUQ92729 CREB3L3-204ENST00000602147 1382 ntTSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
PTPRUQ92729 HS3ST3A1-201ENST00000284110 2527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
PTPRUQ92729 C14orf93-205ENST00000397379 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
PTPRUQ92729 BORCS8-MEF2B-203ENST00000514819 1406 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.57■■□□□ 1.36
PTPRUQ92729 GNA11-201ENST00000078429 4147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
PTPRUQ92729 PALM3-201ENST00000340790 2262 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.57■■□□□ 1.36
PTPRUQ92729 FCGRT-201ENST00000221466 1798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
PTPRUQ92729 PLA2G16-203ENST00000415826 1099 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.57■■□□□ 1.36
PTPRUQ92729 INE1-201ENST00000456273 945 ntBASIC23.57■■□□□ 1.36
PTPRUQ92729 SPSB2-204ENST00000523102 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
PTPRUQ92729 SPSB2-205ENST00000524270 1236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
PTPRUQ92729 DRAM1-202ENST00000544152 1048 ntTSL 2 BASIC23.57■■□□□ 1.36
PTPRUQ92729 HEXIM2-206ENST00000591576 1176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
PTPRUQ92729 RAB34-223ENST00000636154 730 ntTSL 2 BASIC23.57■■□□□ 1.36
PTPRUQ92729 PLA2G16-206ENST00000639271 957 ntTSL 5 BASIC23.57■■□□□ 1.36
PTPRUQ92729 ITPKC-201ENST00000263370 3385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
PTPRUQ92729 DHRS4L2-205ENST00000543805 1334 ntTSL 5 BASIC23.56■■□□□ 1.36
PTPRUQ92729 MXRA8-202ENST00000342753 2231 ntTSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
PTPRUQ92729 WBP2-219ENST00000626827 1867 ntTSL 5 BASIC23.56■■□□□ 1.36
PTPRUQ92729 NQO2-201ENST00000338130 1515 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.56■■□□□ 1.36
PTPRUQ92729 CDIPT-209ENST00000569956 1532 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.56■■□□□ 1.36
PTPRUQ92729 BAALC-203ENST00000309982 2831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
PTPRUQ92729 MRFAP1-205ENST00000617365 2112 ntTSL 5 BASIC23.56■■□□□ 1.36
PTPRUQ92729 RAI2-201ENST00000331511 2317 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.56■■□□□ 1.36
PTPRUQ92729 SS18L2-201ENST00000011691 781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
PTPRUQ92729 AL157832.1-201ENST00000428273 495 ntTSL 2 BASIC23.56■■□□□ 1.36
PTPRUQ92729 AL121753.1-201ENST00000444717 529 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.56■■□□□ 1.36
PTPRUQ92729 AL133215.2-201ENST00000609242 977 ntBASIC23.56■■□□□ 1.36
PTPRUQ92729 TMEM265-201ENST00000615541 995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
PTPRUQ92729 SRGAP2C-201ENST00000304465 1477 ntTSL 5 BASIC23.56■■□□□ 1.36
PTPRUQ92729 SRGAP2-201ENST00000419187 1477 ntTSL 5 BASIC23.56■■□□□ 1.36
PTPRUQ92729 SRGAP2B-205ENST00000619678 1477 ntTSL 5 BASIC23.56■■□□□ 1.36
PTPRUQ92729 RDM1-227ENST00000619876 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.56■■□□□ 1.36
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 53.1 ms