Protein–RNA interactions for Protein: Q8WVX3

C4orf3, Uncharacterized protein C4orf3, humanhuman

Predictions only

Length 66 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
C4orf3Q8WVX3 LINC01128-210ENST00000609139 455 ntTSL 3 BASIC13.15□□□□□ -0.3
C4orf3Q8WVX3 AL513190.1-201ENST00000621254 727 ntBASIC13.15□□□□□ -0.3
C4orf3Q8WVX3 AC092865.6-201ENST00000642101 219 ntBASIC13.15□□□□□ -0.3
C4orf3Q8WVX3 CLDN9-201ENST00000445369 2050 ntAPPRIS P1 BASIC13.15□□□□□ -0.3
C4orf3Q8WVX3 SPIRE2-201ENST00000378247 3235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
C4orf3Q8WVX3 AC003002.1-202ENST00000596755 1743 ntAPPRIS P1 BASIC13.15□□□□□ -0.3
C4orf3Q8WVX3 URAHP-203ENST00000517889 1381 ntTSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
C4orf3Q8WVX3 PSMC3IP-204ENST00000587209 1381 ntTSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
C4orf3Q8WVX3 SCARF1-202ENST00000348987 2619 ntTSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
C4orf3Q8WVX3 HMOX2-217ENST00000619528 1829 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.15□□□□□ -0.3
C4orf3Q8WVX3 MINDY2-202ENST00000450403 4820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
C4orf3Q8WVX3 BAG3-201ENST00000369085 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
C4orf3Q8WVX3 PLPPR2-208ENST00000591608 2552 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.15□□□□□ -0.3
C4orf3Q8WVX3 ADCY1-202ENST00000432715 1693 ntTSL 2 BASIC13.15□□□□□ -0.31
C4orf3Q8WVX3 AC018470.1-201ENST00000624790 3129 ntBASIC13.15□□□□□ -0.31
C4orf3Q8WVX3 ZSWIM8-223ENST00000605216 6004 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.31
C4orf3Q8WVX3 AC025580.3-201ENST00000617932 1424 ntBASIC13.14□□□□□ -0.31
C4orf3Q8WVX3 SALL3-202ENST00000537592 6555 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.14□□□□□ -0.31
C4orf3Q8WVX3 REPS1-202ENST00000367663 2607 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.14□□□□□ -0.31
C4orf3Q8WVX3 CLDN7-201ENST00000360325 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
C4orf3Q8WVX3 BOC-212ENST00000485230 2173 ntTSL 2 BASIC13.14□□□□□ -0.31
C4orf3Q8WVX3 FOXL2-201ENST00000330315 2917 ntAPPRIS P1 BASIC13.14□□□□□ -0.31
C4orf3Q8WVX3 ADAM33-202ENST00000356518 3677 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
C4orf3Q8WVX3 ADAM33-203ENST00000379861 3674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
C4orf3Q8WVX3 PIGQ-203ENST00000321878 3006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
C4orf3Q8WVX3 HS6ST2-203ENST00000406696 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
C4orf3Q8WVX3 PON1-201ENST00000222381 2568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
C4orf3Q8WVX3 RPH3A-203ENST00000543106 2581 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.14□□□□□ -0.31
C4orf3Q8WVX3 CDK1-204ENST00000448257 1948 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
C4orf3Q8WVX3 FO681492.1-201ENST00000623662 5321 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC13.14□□□□□ -0.31
C4orf3Q8WVX3 KDSR-202ENST00000406396 5447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
C4orf3Q8WVX3 KCNIP2-208ENST00000370046 923 ntTSL 5 BASIC13.14□□□□□ -0.31
C4orf3Q8WVX3 PNRC2-202ENST00000374468 814 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.14□□□□□ -0.31
C4orf3Q8WVX3 SGO2-202ENST00000409203 1041 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
C4orf3Q8WVX3 Z97056.1-201ENST00000433230 556 ntTSL 2 BASIC13.14□□□□□ -0.31
C4orf3Q8WVX3 FIS1-203ENST00000442303 631 ntTSL 3 BASIC13.14□□□□□ -0.31
C4orf3Q8WVX3 SDHA-213ENST00000510361 2148 ntTSL 2 BASIC13.14□□□□□ -0.31
C4orf3Q8WVX3 AC107918.2-201ENST00000530817 355 ntBASIC13.14□□□□□ -0.31
C4orf3Q8WVX3 HIST4H4-204ENST00000539745 577 ntAPPRIS P1 BASIC13.14□□□□□ -0.31
C4orf3Q8WVX3 AC005412.3-201ENST00000580309 715 ntBASIC13.14□□□□□ -0.31
C4orf3Q8WVX3 TWSG1-202ENST00000581641 1119 ntTSL 2 BASIC13.14□□□□□ -0.31
C4orf3Q8WVX3 STX10-207ENST00000589083 1241 ntTSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
C4orf3Q8WVX3 ACTL9-202ENST00000612068 1252 ntBASIC13.14□□□□□ -0.31
C4orf3Q8WVX3 C20orf181-201ENST00000623918 480 ntBASIC13.14□□□□□ -0.31
C4orf3Q8WVX3 CYP51A1P2-201ENST00000419457 1499 ntBASIC13.14□□□□□ -0.31
C4orf3Q8WVX3 EVA1C-202ENST00000382699 1668 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
C4orf3Q8WVX3 CXADR-201ENST00000284878 6254 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
C4orf3Q8WVX3 LINC00905-202ENST00000588117 1768 ntTSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
C4orf3Q8WVX3 AKAP17A-201ENST00000313871 3204 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
C4orf3Q8WVX3 HAPLN4-201ENST00000291481 3449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
C4orf3Q8WVX3 GCGR-201ENST00000400723 2051 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
C4orf3Q8WVX3 DDX42-202ENST00000389924 3939 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.14□□□□□ -0.31
C4orf3Q8WVX3 PANX1-202ENST00000436171 2750 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
C4orf3Q8WVX3 FAM135A-209ENST00000505769 4806 ntTSL 5 BASIC13.14□□□□□ -0.31
C4orf3Q8WVX3 CCDC94-201ENST00000262962 1434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
C4orf3Q8WVX3 ISLR2-203ENST00000435464 4259 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.13□□□□□ -0.31
C4orf3Q8WVX3 KIF25-202ENST00000354419 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
C4orf3Q8WVX3 TPT1-AS1-215ENST00000522673 1519 ntTSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
C4orf3Q8WVX3 AP004609.1-201ENST00000498872 1646 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
C4orf3Q8WVX3 NR4A2-203ENST00000409108 1735 ntTSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
C4orf3Q8WVX3 B4GALNT2-201ENST00000300404 1906 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
C4orf3Q8WVX3 CMTM3-214ENST00000567572 1934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
C4orf3Q8WVX3 B3GALT5-206ENST00000615480 2617 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.13□□□□□ -0.31
C4orf3Q8WVX3 ZNF131-206ENST00000505606 3209 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
C4orf3Q8WVX3 UNC13A-206ENST00000552293 5314 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
C4orf3Q8WVX3 DUSP4-201ENST00000240100 5537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
C4orf3Q8WVX3 ZNRF2-201ENST00000323037 3460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
C4orf3Q8WVX3 PPAN-P2RY11-201ENST00000393796 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
C4orf3Q8WVX3 SNX16-201ENST00000345957 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
C4orf3Q8WVX3 TATDN3-214ENST00000532324 1381 ntTSL 2 BASIC13.13□□□□□ -0.31
C4orf3Q8WVX3 PRLH-201ENST00000165524 264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
C4orf3Q8WVX3 C19orf70-201ENST00000309324 896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
C4orf3Q8WVX3 C22orf39-201ENST00000333059 1221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
C4orf3Q8WVX3 ASTL-201ENST00000342380 1296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
C4orf3Q8WVX3 SH3TC1-202ENST00000382521 829 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
C4orf3Q8WVX3 EXOSC8-202ENST00000389704 1198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
C4orf3Q8WVX3 SLC25A1P3-201ENST00000395415 828 ntBASIC13.13□□□□□ -0.31
C4orf3Q8WVX3 JMJD7-203ENST00000408047 1192 ntTSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
C4orf3Q8WVX3 WNT7B-203ENST00000410058 714 ntTSL 3 BASIC13.13□□□□□ -0.31
C4orf3Q8WVX3 TMEM205-202ENST00000447337 916 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.13□□□□□ -0.31
C4orf3Q8WVX3 AC074386.1-202ENST00000463561 864 ntBASIC13.13□□□□□ -0.31
C4orf3Q8WVX3 EEF1E1-205ENST00000507463 654 ntTSL 2 BASIC13.13□□□□□ -0.31
C4orf3Q8WVX3 DHDH-204ENST00000523250 634 ntTSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
C4orf3Q8WVX3 AC092718.3-202ENST00000564536 1032 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
C4orf3Q8WVX3 AC005829.1-201ENST00000570002 483 ntBASIC13.13□□□□□ -0.31
C4orf3Q8WVX3 TMEM220-AS1-206ENST00000583343 876 ntTSL 3 BASIC13.13□□□□□ -0.31
C4orf3Q8WVX3 TNFRSF13B-206ENST00000583789 859 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
C4orf3Q8WVX3 AC010624.2-201ENST00000600998 575 ntTSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
C4orf3Q8WVX3 AL121832.1-201ENST00000615180 677 ntTSL 3 BASIC13.13□□□□□ -0.31
C4orf3Q8WVX3 ZNF445-205ENST00000617032 1291 ntTSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
C4orf3Q8WVX3 MED16-214ENST00000617672 554 ntTSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
C4orf3Q8WVX3 AC079781.4-201ENST00000641908 219 ntBASIC13.13□□□□□ -0.31
C4orf3Q8WVX3 AL645728.2-201ENST00000641974 660 ntBASIC13.13□□□□□ -0.31
C4orf3Q8WVX3 PGLYRP1-201ENST00000008938 720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
C4orf3Q8WVX3 SLC8A3-202ENST00000356921 5250 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
C4orf3Q8WVX3 ARHGAP9-202ENST00000393797 2912 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
C4orf3Q8WVX3 CEP78-204ENST00000415759 2623 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
C4orf3Q8WVX3 CYHR1-204ENST00000438911 2020 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.13□□□□□ -0.31
C4orf3Q8WVX3 GOLGA2P9-203ENST00000600260 2033 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
C4orf3Q8WVX3 UBE3D-203ENST00000369747 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 58.4 ms