Protein–RNA interactions for Protein: Q8IVL6

P3H3, Prolyl 3-hydroxylase 3, humanhuman

Predictions only

Length 736 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
P3H3Q8IVL6 PPP6R2P1-201ENST00000450880 1275 ntBASIC27.03■■□□□ 1.92
P3H3Q8IVL6 CLDN7-203ENST00000538261 1923 ntTSL 5 BASIC27.03■■□□□ 1.92
P3H3Q8IVL6 POLD4-211ENST00000539074 714 ntTSL 3 BASIC27.03■■□□□ 1.92
P3H3Q8IVL6 RBM7-207ENST00000544582 692 ntTSL 3 BASIC27.03■■□□□ 1.92
P3H3Q8IVL6 BAD-207ENST00000544785 525 ntTSL 3 BASIC27.03■■□□□ 1.92
P3H3Q8IVL6 AC099482.1-201ENST00000563471 481 ntTSL 2 BASIC27.03■■□□□ 1.92
P3H3Q8IVL6 NEIL1-221ENST00000569035 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.03■■□□□ 1.92
P3H3Q8IVL6 SSH2-211ENST00000590153 570 ntTSL 4 BASIC27.03■■□□□ 1.92
P3H3Q8IVL6 TEAD2-204ENST00000593945 2141 ntTSL 1 (best) BASIC27.03■■□□□ 1.92
P3H3Q8IVL6 LCN8-205ENST00000612714 638 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.03■■□□□ 1.92
P3H3Q8IVL6 STRBP-201ENST00000348403 3337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.03■■□□□ 1.92
P3H3Q8IVL6 KLF16-201ENST00000250916 2890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.03■■□□□ 1.92
P3H3Q8IVL6 DDIT4L-201ENST00000273990 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.03■■□□□ 1.92
P3H3Q8IVL6 KCNH2-203ENST00000430723 2648 ntTSL 5 BASIC27.03■■□□□ 1.92
P3H3Q8IVL6 SUDS3-204ENST00000543473 4897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
P3H3Q8IVL6 ACOXL-205ENST00000439055 2373 ntTSL 2 BASIC27.02■■□□□ 1.92
P3H3Q8IVL6 OGG1-203ENST00000302036 2220 ntTSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
P3H3Q8IVL6 LRRC27-203ENST00000368613 2113 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
P3H3Q8IVL6 SLC44A3-207ENST00000529450 2045 ntTSL 2 BASIC27.02■■□□□ 1.92
P3H3Q8IVL6 MECP2-205ENST00000453960 1729 ntTSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
P3H3Q8IVL6 WWTR1-204ENST00000467467 1603 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.02■■□□□ 1.92
P3H3Q8IVL6 CLDN7-201ENST00000360325 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
P3H3Q8IVL6 HMBS-203ENST00000442944 1548 ntTSL 5 BASIC27.02■■□□□ 1.92
P3H3Q8IVL6 OTUD5-204ENST00000428668 1493 ntTSL 2 BASIC27.02■■□□□ 1.92
P3H3Q8IVL6 CASD1-201ENST00000297273 3942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
P3H3Q8IVL6 PIP5KL1-201ENST00000300432 1104 ntTSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
P3H3Q8IVL6 CD8B-201ENST00000331469 832 ntTSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
P3H3Q8IVL6 EIF5A-201ENST00000336452 1256 ntTSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
P3H3Q8IVL6 CD81-202ENST00000381036 880 ntTSL 3 BASIC27.02■■□□□ 1.92
P3H3Q8IVL6 IGHV3-42-201ENST00000520410 361 ntBASIC27.02■■□□□ 1.92
P3H3Q8IVL6 AC190387.1-201ENST00000551683 408 ntBASIC27.02■■□□□ 1.92
P3H3Q8IVL6 TAF6-211ENST00000453269 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
P3H3Q8IVL6 EGFL6-202ENST00000380602 2385 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
P3H3Q8IVL6 IQCE-210ENST00000438376 2170 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.02■■□□□ 1.92
P3H3Q8IVL6 UGP2-202ENST00000394417 2136 ntTSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
P3H3Q8IVL6 TMEM175-201ENST00000264771 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
P3H3Q8IVL6 FLOT2-202ENST00000394908 2618 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
P3H3Q8IVL6 FA2H-201ENST00000219368 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.92
P3H3Q8IVL6 COMP-202ENST00000425807 2292 ntTSL 2 BASIC27.01■■□□□ 1.91
P3H3Q8IVL6 LINC02167-203ENST00000566900 1489 ntTSL 2 BASIC27.01■■□□□ 1.91
P3H3Q8IVL6 ADGRA2-201ENST00000315215 6270 ntTSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.91
P3H3Q8IVL6 FOXD4L6-201ENST00000622588 2034 ntAPPRIS P1 BASIC27.01■■□□□ 1.91
P3H3Q8IVL6 MARCH8-201ENST00000319836 5272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.91
P3H3Q8IVL6 POLR3D-201ENST00000306433 1931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.91
P3H3Q8IVL6 TMEM270-201ENST00000320531 854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.91
P3H3Q8IVL6 RESP18-201ENST00000333527 795 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.91
P3H3Q8IVL6 MUC1-201ENST00000337604 859 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.91
P3H3Q8IVL6 HNRNPA1P40-201ENST00000426371 1278 ntBASIC27.01■■□□□ 1.91
P3H3Q8IVL6 SPDYE2-202ENST00000432940 1209 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.91
P3H3Q8IVL6 SPDYE2B-201ENST00000436228 1209 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.91
P3H3Q8IVL6 SPDYE5-201ENST00000455862 1209 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.91
P3H3Q8IVL6 AC140878.1-201ENST00000565277 250 ntBASIC27.01■■□□□ 1.91
P3H3Q8IVL6 AL035252.4-201ENST00000624174 288 ntBASIC27.01■■□□□ 1.91
P3H3Q8IVL6 AL354751.1-201ENST00000412768 1863 ntBASIC27.01■■□□□ 1.91
P3H3Q8IVL6 DENND2A-201ENST00000275884 3735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.91
P3H3Q8IVL6 ARHGAP11A-208ENST00000567348 2422 ntTSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.91
P3H3Q8IVL6 TMEM155-202ENST00000394394 1753 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC27.01■■□□□ 1.91
P3H3Q8IVL6 HARS-204ENST00000438307 1789 ntTSL 2 BASIC27.01■■□□□ 1.91
P3H3Q8IVL6 GPX3-210ENST00000622181 1757 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC27.01■■□□□ 1.91
P3H3Q8IVL6 BEGAIN-211ENST00000637646 2911 ntTSL 5 BASIC27.01■■□□□ 1.91
P3H3Q8IVL6 MADCAM1-204ENST00000587541 1723 ntTSL 2 BASIC27.01■■□□□ 1.91
P3H3Q8IVL6 CTSH-201ENST00000220166 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.91
P3H3Q8IVL6 ADAM33-202ENST00000356518 3677 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.91
P3H3Q8IVL6 ADAM33-203ENST00000379861 3674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.91
P3H3Q8IVL6 AGAP1-205ENST00000409538 6138 ntTSL 5 BASIC27.01■■□□□ 1.91
P3H3Q8IVL6 FGFBP3-201ENST00000311575 2545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
P3H3Q8IVL6 RBM24-202ENST00000379052 2703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
P3H3Q8IVL6 FBXL17-201ENST00000359660 4510 ntTSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
P3H3Q8IVL6 HMGA1-205ENST00000447654 2159 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
P3H3Q8IVL6 LRCH4-201ENST00000310300 2552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
P3H3Q8IVL6 SORCS3-201ENST00000369699 5530 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27■■□□□ 1.91
P3H3Q8IVL6 ITGB2-204ENST00000397846 422 ntTSL 2 BASIC27■■□□□ 1.91
P3H3Q8IVL6 AC005034.1-201ENST00000426657 489 ntBASIC27■■□□□ 1.91
P3H3Q8IVL6 FXYD1-202ENST00000455515 594 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27■■□□□ 1.91
P3H3Q8IVL6 PTPRVP-202ENST00000490575 953 ntTSL 5 BASIC27■■□□□ 1.91
P3H3Q8IVL6 AGGF1-204ENST00000506806 1142 ntTSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
P3H3Q8IVL6 MTFR1L-218ENST00000526894 733 ntTSL 4 BASIC27■■□□□ 1.91
P3H3Q8IVL6 ZNF606-202ENST00000546715 636 ntTSL 4 BASIC27■■□□□ 1.91
P3H3Q8IVL6 RPL13-214ENST00000567815 712 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27■■□□□ 1.91
P3H3Q8IVL6 AC090241.2-202ENST00000602333 633 ntTSL 3 BASIC27■■□□□ 1.91
P3H3Q8IVL6 LINC01097-201ENST00000627163 2122 ntTSL 2 BASIC27■■□□□ 1.91
P3H3Q8IVL6 AC084121.4-201ENST00000641598 221 ntBASIC27■■□□□ 1.91
P3H3Q8IVL6 AF228730.8-201ENST00000642140 221 ntBASIC27■■□□□ 1.91
P3H3Q8IVL6 GBA2-201ENST00000378088 1672 ntTSL 2 BASIC27■■□□□ 1.91
P3H3Q8IVL6 HYAL1-204ENST00000395144 2081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
P3H3Q8IVL6 AL162586.1-201ENST00000439298 2055 ntTSL 2 BASIC27■■□□□ 1.91
P3H3Q8IVL6 ZNF395-211ENST00000523202 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
P3H3Q8IVL6 TMEM235-202ENST00000421688 2490 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27■■□□□ 1.91
P3H3Q8IVL6 SERPINB6-201ENST00000335686 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
P3H3Q8IVL6 LINC00671-201ENST00000301683 1958 ntTSL 2 BASIC27■■□□□ 1.91
P3H3Q8IVL6 ELF2-207ENST00000510408 1965 ntTSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
P3H3Q8IVL6 FAM60A-203ENST00000454658 1555 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27■■□□□ 1.91
P3H3Q8IVL6 CAMKV-217ENST00000620470 1485 ntTSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
P3H3Q8IVL6 NR4A2-203ENST00000409108 1735 ntTSL 5 BASIC26.99■■□□□ 1.91
P3H3Q8IVL6 GOLPH3-201ENST00000265070 2721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
P3H3Q8IVL6 DNAJA3-203ENST00000431375 2294 ntTSL 2 BASIC26.99■■□□□ 1.91
P3H3Q8IVL6 LCE1E-201ENST00000368770 1180 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
P3H3Q8IVL6 NDUFAF3-203ENST00000395458 808 ntTSL 2 BASIC26.99■■□□□ 1.91
P3H3Q8IVL6 AC016735.2-201ENST00000438736 569 ntTSL 4 BASIC26.99■■□□□ 1.91
P3H3Q8IVL6 AC244107.1-201ENST00000442033 332 ntBASIC26.99■■□□□ 1.91
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