Protein–RNA interactions for Protein: Q6ZSB3

LINC00299, Putative uncharacterized protein encoded by LINC00299, humanhuman

Predictions only

Length 139 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LINC00299Q6ZSB3 BNIP2-212ENST00000607373 1851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
LINC00299Q6ZSB3 ITGA8-201ENST00000378076 6755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
LINC00299Q6ZSB3 GYG1-214ENST00000627418 1831 ntTSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
LINC00299Q6ZSB3 PALLD-215ENST00000512127 2958 ntTSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
LINC00299Q6ZSB3 TMC7-201ENST00000304381 3640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
LINC00299Q6ZSB3 CDH16-207ENST00000568632 2526 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
LINC00299Q6ZSB3 STN1-201ENST00000224950 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
LINC00299Q6ZSB3 ARSI-203ENST00000515301 1429 ntTSL 4 BASIC15.03■□□□□ -0
LINC00299Q6ZSB3 SPATA22-214ENST00000575375 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
LINC00299Q6ZSB3 AC104581.4-201ENST00000623126 3052 ntBASIC15.03■□□□□ -0
LINC00299Q6ZSB3 PSMD11-202ENST00000457654 2159 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
LINC00299Q6ZSB3 NDUFAF2-201ENST00000296597 719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
LINC00299Q6ZSB3 HIST2H2AC-201ENST00000331380 390 ntAPPRIS P1 BASIC15.03■□□□□ -0
LINC00299Q6ZSB3 AC091874.3-201ENST00000512672 1195 ntBASIC15.03■□□□□ -0
LINC00299Q6ZSB3 SPAG7-207ENST00000575142 1094 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
LINC00299Q6ZSB3 SUMO2-203ENST00000578238 490 ntTSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
LINC00299Q6ZSB3 AC130371.2-201ENST00000619443 611 ntBASIC15.03■□□□□ -0
LINC00299Q6ZSB3 MAN1C1-203ENST00000374332 4641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
LINC00299Q6ZSB3 MAN1C1-208ENST00000611903 4647 ntTSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
LINC00299Q6ZSB3 KREMEN1-201ENST00000327813 2719 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
LINC00299Q6ZSB3 SELENBP1-204ENST00000426705 1928 ntTSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
LINC00299Q6ZSB3 PMS1-221ENST00000624204 3417 ntTSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
LINC00299Q6ZSB3 LATS1-202ENST00000392273 2567 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
LINC00299Q6ZSB3 AC112504.1-201ENST00000623415 1841 ntBASIC15.03■□□□□ -0
LINC00299Q6ZSB3 MUTYH-201ENST00000354383 1744 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
LINC00299Q6ZSB3 ARPC1B-211ENST00000451682 1715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
LINC00299Q6ZSB3 TOM1L2-207ENST00000535933 1748 ntTSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
LINC00299Q6ZSB3 GABARAPL1-205ENST00000539170 1700 ntTSL 3 BASIC15.03■□□□□ -0
LINC00299Q6ZSB3 AC099508.1-201ENST00000499110 1666 ntTSL 4 BASIC15.03■□□□□ -0
LINC00299Q6ZSB3 BRD3-201ENST00000303407 5652 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
LINC00299Q6ZSB3 TAF6-209ENST00000452041 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
LINC00299Q6ZSB3 SLC25A32-201ENST00000297578 2891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
LINC00299Q6ZSB3 RHOC-201ENST00000285735 2199 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.02■□□□□ -0
LINC00299Q6ZSB3 DCAKD-201ENST00000310604 2122 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.02■□□□□ -0
LINC00299Q6ZSB3 FAM160A2-203ENST00000524416 3327 ntTSL 2 BASIC15.02■□□□□ -0
LINC00299Q6ZSB3 ALG1-204ENST00000588623 2671 ntTSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
LINC00299Q6ZSB3 KCTD20-202ENST00000373731 5619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
LINC00299Q6ZSB3 IFNLR1-202ENST00000327575 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
LINC00299Q6ZSB3 CRHR2-208ENST00000506074 3109 ntTSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
LINC00299Q6ZSB3 C6orf223-201ENST00000336600 3581 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
LINC00299Q6ZSB3 ELMO3-201ENST00000360833 2480 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.02■□□□□ -0
LINC00299Q6ZSB3 RER1-209ENST00000605895 3044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
LINC00299Q6ZSB3 WASHC2C-204ENST00000374362 4623 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
LINC00299Q6ZSB3 TSC2-202ENST00000350773 5532 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
LINC00299Q6ZSB3 FAM160B1-203ENST00000369250 2870 ntTSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
LINC00299Q6ZSB3 FASTKD5-201ENST00000380266 2874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
LINC00299Q6ZSB3 TFB2M-201ENST00000366514 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
LINC00299Q6ZSB3 GRAMD4-203ENST00000408031 2834 ntTSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
LINC00299Q6ZSB3 RPS14-201ENST00000312037 711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
LINC00299Q6ZSB3 VKORC1-202ENST00000319788 1077 ntTSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
LINC00299Q6ZSB3 AKR1A1-201ENST00000351829 1166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
LINC00299Q6ZSB3 HCFC1R1-202ENST00000354679 765 ntTSL 2 BASIC15.02■□□□□ -0
LINC00299Q6ZSB3 EIF6-202ENST00000374443 1017 ntTSL 5 BASIC15.02■□□□□ -0
LINC00299Q6ZSB3 VSX1-201ENST00000376707 943 ntTSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
LINC00299Q6ZSB3 METTL26-203ENST00000397664 604 ntTSL 2 BASIC15.02■□□□□ -0
LINC00299Q6ZSB3 C19orf73-201ENST00000408991 744 ntAPPRIS P1 BASIC15.02■□□□□ -0
LINC00299Q6ZSB3 AC016769.1-201ENST00000409132 1010 ntBASIC15.02■□□□□ -0
LINC00299Q6ZSB3 NIFKP9-201ENST00000419265 221 ntBASIC15.02■□□□□ -0
LINC00299Q6ZSB3 ZNF706-206ENST00000519744 785 ntTSL 3 BASIC15.02■□□□□ -0
LINC00299Q6ZSB3 FAM86C2P-201ENST00000525180 435 ntTSL 4 BASIC15.02■□□□□ -0
LINC00299Q6ZSB3 REEP1-207ENST00000535845 1196 ntTSL 2 BASIC15.02■□□□□ -0
LINC00299Q6ZSB3 REEP1-209ENST00000541910 969 ntTSL 2 BASIC15.02■□□□□ -0
LINC00299Q6ZSB3 PLEKHJ1-213ENST00000591099 1092 ntTSL 2 BASIC15.02■□□□□ -0
LINC00299Q6ZSB3 AC011446.1-201ENST00000591825 458 ntTSL 2 BASIC15.02■□□□□ -0
LINC00299Q6ZSB3 BCL2L12-208ENST00000600947 633 ntTSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
LINC00299Q6ZSB3 C18orf21-207ENST00000610527 1059 ntTSL 2 BASIC15.02■□□□□ -0
LINC00299Q6ZSB3 C18orf21-208ENST00000618334 856 ntTSL 3 BASIC15.02■□□□□ -0
LINC00299Q6ZSB3 ALDH3A2-224ENST00000626500 995 ntTSL 5 BASIC15.02■□□□□ -0
LINC00299Q6ZSB3 FES-207ENST00000444422 2266 ntTSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
LINC00299Q6ZSB3 AC006449.6-201ENST00000612330 2296 ntBASIC15.02□□□□□ -0.01
LINC00299Q6ZSB3 OSBPL6-203ENST00000357080 2217 ntTSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
LINC00299Q6ZSB3 RGS3-202ENST00000342620 1714 ntTSL 5 BASIC15.02□□□□□ -0.01
LINC00299Q6ZSB3 TMBIM7P-203ENST00000641617 1718 ntBASIC15.02□□□□□ -0.01
LINC00299Q6ZSB3 GPR161-204ENST00000367838 2676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
LINC00299Q6ZSB3 PRELID3A-203ENST00000587735 1694 ntTSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
LINC00299Q6ZSB3 GLMP-201ENST00000362007 1604 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
LINC00299Q6ZSB3 FADS3-207ENST00000527697 1640 ntTSL 5 BASIC15.02□□□□□ -0.01
LINC00299Q6ZSB3 LSP1-202ENST00000381775 2016 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.02□□□□□ -0.01
LINC00299Q6ZSB3 BX276092.9-201ENST00000636797 1563 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.02□□□□□ -0.01
LINC00299Q6ZSB3 CIRBP-215ENST00000588030 1509 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.02□□□□□ -0.01
LINC00299Q6ZSB3 TVP23C-203ENST00000428082 1911 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
LINC00299Q6ZSB3 REEP2-211ENST00000613650 1944 ntTSL 5 BASIC15.02□□□□□ -0.01
LINC00299Q6ZSB3 MEN1-207ENST00000377326 3150 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.01□□□□□ -0.01
LINC00299Q6ZSB3 AGFG1-201ENST00000310078 8668 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
LINC00299Q6ZSB3 PSMD9-201ENST00000261817 2307 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.01□□□□□ -0.01
LINC00299Q6ZSB3 WDR18-204ENST00000587001 1465 ntTSL 5 BASIC15.01□□□□□ -0.01
LINC00299Q6ZSB3 CDK13-201ENST00000181839 7298 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
LINC00299Q6ZSB3 KRT73-201ENST00000305748 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
LINC00299Q6ZSB3 TMTC4-203ENST00000376234 3483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
LINC00299Q6ZSB3 TMEM161A-201ENST00000162044 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
LINC00299Q6ZSB3 UBXN11-204ENST00000374217 1846 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.01□□□□□ -0.01
LINC00299Q6ZSB3 MCF2L2-201ENST00000328913 4980 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.01□□□□□ -0.01
LINC00299Q6ZSB3 SPPL2B-207ENST00000610743 2583 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
LINC00299Q6ZSB3 NLRX1-202ENST00000409109 4092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
LINC00299Q6ZSB3 LILRP2-201ENST00000413439 2127 ntTSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
LINC00299Q6ZSB3 LINC02212-201ENST00000515243 2130 ntTSL 2 BASIC15.01□□□□□ -0.01
LINC00299Q6ZSB3 MIEF2-203ENST00000395704 2879 ntTSL 2 BASIC15.01□□□□□ -0.01
LINC00299Q6ZSB3 ZNF302-215ENST00000627982 1723 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.01□□□□□ -0.01
LINC00299Q6ZSB3 ZNF367-201ENST00000375256 3646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
LINC00299Q6ZSB3 TRPC4AP-201ENST00000252015 3226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30.3 ms