Protein–RNA interactions for Protein: Q6UWL2

SUSD1, Sushi domain-containing protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 747 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SUSD1Q6UWL2 SMPD4-202ENST00000409031 4896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
SUSD1Q6UWL2 RNASEH2A-201ENST00000221486 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
SUSD1Q6UWL2 MRPS18A-201ENST00000372116 785 ntTSL 2 BASIC16.78■□□□□ 0.28
SUSD1Q6UWL2 DMKN-206ENST00000418261 1257 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
SUSD1Q6UWL2 EMC9-202ENST00000419198 953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
SUSD1Q6UWL2 TTLL12-204ENST00000494035 888 ntTSL 2 BASIC16.78■□□□□ 0.28
SUSD1Q6UWL2 TUBA1A-203ENST00000546918 984 ntTSL 3 BASIC16.78■□□□□ 0.28
SUSD1Q6UWL2 AC021087.4-201ENST00000563761 564 ntBASIC16.78■□□□□ 0.28
SUSD1Q6UWL2 BLOC1S6-214ENST00000567461 1052 ntTSL 2 BASIC16.78■□□□□ 0.28
SUSD1Q6UWL2 AL022326.1-202ENST00000641533 845 ntBASIC16.78■□□□□ 0.28
SUSD1Q6UWL2 ZNF286A-204ENST00000464847 5616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
SUSD1Q6UWL2 KCNQ2-213ENST00000626839 9213 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
SUSD1Q6UWL2 MEST-202ENST00000341441 2443 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
SUSD1Q6UWL2 GDPD5-214ENST00000533784 2441 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
SUSD1Q6UWL2 SYT15-202ENST00000374323 6428 ntTSL 2 BASIC16.78■□□□□ 0.28
SUSD1Q6UWL2 IL2RG-202ENST00000374188 1432 ntTSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
SUSD1Q6UWL2 RNF121-203ENST00000393713 2132 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
SUSD1Q6UWL2 FAM208A-209ENST00000493960 5600 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
SUSD1Q6UWL2 TBXAS1-206ENST00000425687 2080 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
SUSD1Q6UWL2 INPP5J-207ENST00000405300 2515 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
SUSD1Q6UWL2 DCLK2-204ENST00000506325 2298 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.28
SUSD1Q6UWL2 GNA13-201ENST00000439174 4922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
SUSD1Q6UWL2 MBOAT1-201ENST00000324607 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
SUSD1Q6UWL2 ANHX-201ENST00000419717 1765 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.77■□□□□ 0.28
SUSD1Q6UWL2 DAG1-201ENST00000308775 5522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
SUSD1Q6UWL2 SMARCA4-203ENST00000429416 5691 ntTSL 2 BASIC16.77■□□□□ 0.28
SUSD1Q6UWL2 RHBDF1P1-201ENST00000427504 1941 ntBASIC16.77■□□□□ 0.28
SUSD1Q6UWL2 BATF2-202ENST00000435842 1949 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
SUSD1Q6UWL2 CLDN7-203ENST00000538261 1923 ntTSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.28
SUSD1Q6UWL2 VKORC1-201ENST00000300851 876 ntTSL 2 BASIC16.77■□□□□ 0.28
SUSD1Q6UWL2 SMARCC2-202ENST00000347471 3839 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
SUSD1Q6UWL2 RWDD3-202ENST00000370202 1235 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.77■□□□□ 0.28
SUSD1Q6UWL2 SDR39U1-201ENST00000399395 1233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
SUSD1Q6UWL2 SLC9A3R1-202ENST00000413388 1285 ntTSL 2 BASIC16.77■□□□□ 0.28
SUSD1Q6UWL2 AC078883.2-201ENST00000441212 558 ntTSL 3 BASIC16.77■□□□□ 0.28
SUSD1Q6UWL2 FAM197Y8-203ENST00000450145 560 ntBASIC16.77■□□□□ 0.28
SUSD1Q6UWL2 TXNRD2-212ENST00000485358 850 ntTSL 2 BASIC16.77■□□□□ 0.28
SUSD1Q6UWL2 ARSK-202ENST00000504763 1088 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
SUSD1Q6UWL2 AC021739.2-201ENST00000558375 964 ntTSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.28
SUSD1Q6UWL2 PSME1-205ENST00000559123 1033 ntTSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.28
SUSD1Q6UWL2 AC012615.3-201ENST00000592884 500 ntTSL 3 BASIC16.77■□□□□ 0.28
SUSD1Q6UWL2 AC020909.1-201ENST00000599632 1265 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.28
SUSD1Q6UWL2 AC064862.7-201ENST00000604520 867 ntBASIC16.77■□□□□ 0.28
SUSD1Q6UWL2 AC011247.3-202ENST00000605062 570 ntTSL 4 BASIC16.77■□□□□ 0.28
SUSD1Q6UWL2 LINC01607-201ENST00000607172 621 ntTSL 2 BASIC16.77■□□□□ 0.28
SUSD1Q6UWL2 NOTCH3-201ENST00000263388 8666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
SUSD1Q6UWL2 CDCP1-201ENST00000296129 6006 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
SUSD1Q6UWL2 BCL2-202ENST00000398117 7461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
SUSD1Q6UWL2 TRAF2-201ENST00000247668 2264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
SUSD1Q6UWL2 HSPA8-224ENST00000534624 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
SUSD1Q6UWL2 HEBP2-204ENST00000607197 10014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
SUSD1Q6UWL2 AZIN2-203ENST00000373441 1443 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
SUSD1Q6UWL2 L1CAM-203ENST00000370055 4655 ntTSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.27
SUSD1Q6UWL2 DOK4-201ENST00000340099 2772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
SUSD1Q6UWL2 CSNK1D-204ENST00000398519 1580 ntTSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.27
SUSD1Q6UWL2 SYT15-201ENST00000374321 1369 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC16.77■□□□□ 0.27
SUSD1Q6UWL2 MFGE8-201ENST00000268150 1937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
SUSD1Q6UWL2 ISPD-201ENST00000399310 1709 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
SUSD1Q6UWL2 MIF4GD-204ENST00000577542 1531 ntTSL 3 BASIC16.76■□□□□ 0.27
SUSD1Q6UWL2 COL4A2-201ENST00000360467 6281 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
SUSD1Q6UWL2 SDR39U1-206ENST00000553930 1325 ntTSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
SUSD1Q6UWL2 RABGAP1L-204ENST00000357444 2605 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
SUSD1Q6UWL2 CFL1-203ENST00000525451 1878 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.76■□□□□ 0.27
SUSD1Q6UWL2 TMEM37-201ENST00000306406 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
SUSD1Q6UWL2 RHBDF1-201ENST00000262316 2992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
SUSD1Q6UWL2 KLHDC7B-201ENST00000395676 2991 ntAPPRIS P1 BASIC16.76■□□□□ 0.27
SUSD1Q6UWL2 ASIC3-203ENST00000357922 2232 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
SUSD1Q6UWL2 SLC44A3-207ENST00000529450 2045 ntTSL 2 BASIC16.76■□□□□ 0.27
SUSD1Q6UWL2 TIMM50-202ENST00000544017 2572 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
SUSD1Q6UWL2 GOSR2-201ENST00000225567 1245 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
SUSD1Q6UWL2 TOR3A-201ENST00000352445 1182 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
SUSD1Q6UWL2 SLC25A1P3-201ENST00000395415 828 ntBASIC16.76■□□□□ 0.27
SUSD1Q6UWL2 HDAC11-202ENST00000402259 1000 ntTSL 3 BASIC16.76■□□□□ 0.27
SUSD1Q6UWL2 MYCNOS-201ENST00000419083 770 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
SUSD1Q6UWL2 TPM4P1-201ENST00000436100 807 ntBASIC16.76■□□□□ 0.27
SUSD1Q6UWL2 PTPRF-209ENST00000438120 6377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
SUSD1Q6UWL2 FAAHP1-202ENST00000446499 1238 ntBASIC16.76■□□□□ 0.27
SUSD1Q6UWL2 PRYP5-201ENST00000451909 266 ntBASIC16.76■□□□□ 0.27
SUSD1Q6UWL2 AL133343.2-201ENST00000457213 370 ntTSL 3 BASIC16.76■□□□□ 0.27
SUSD1Q6UWL2 HOXB-AS4-202ENST00000480386 566 ntTSL 4 BASIC16.76■□□□□ 0.27
SUSD1Q6UWL2 SMN1-203ENST00000503079 1219 ntTSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
SUSD1Q6UWL2 RNF151-202ENST00000569210 853 ntTSL 2 BASIC16.76■□□□□ 0.27
SUSD1Q6UWL2 RUNX1-203ENST00000358356 2720 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
SUSD1Q6UWL2 TEAD4-201ENST00000358409 1637 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
SUSD1Q6UWL2 PDX1-201ENST00000381033 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
SUSD1Q6UWL2 AC106886.4-201ENST00000623557 2502 ntBASIC16.76■□□□□ 0.27
SUSD1Q6UWL2 LINC00671-201ENST00000301683 1958 ntTSL 2 BASIC16.76■□□□□ 0.27
SUSD1Q6UWL2 RNF169-201ENST00000299563 7823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
SUSD1Q6UWL2 TBXAS1-202ENST00000411653 1792 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
SUSD1Q6UWL2 PBK-201ENST00000301905 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
SUSD1Q6UWL2 ADGRG2-209ENST00000379876 4779 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
SUSD1Q6UWL2 ZDHHC9-202ENST00000371064 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
SUSD1Q6UWL2 MIB2-232ENST00000520777 3321 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
SUSD1Q6UWL2 KLK6-202ENST00000376851 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
SUSD1Q6UWL2 AC093525.9-201ENST00000624961 1746 ntBASIC16.76■□□□□ 0.27
SUSD1Q6UWL2 ZNF302-201ENST00000423823 2590 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
SUSD1Q6UWL2 CAMK2D-201ENST00000296402 5820 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
SUSD1Q6UWL2 UBFD1-201ENST00000395878 5110 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.76■□□□□ 0.27
SUSD1Q6UWL2 PHF12-205ENST00000577226 7679 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
SUSD1Q6UWL2 AC124067.4-201ENST00000519691 2379 ntBASIC16.75■□□□□ 0.27
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 45.9 ms