Protein–RNA interactions for Protein: Q5VSD8

Putative uncharacterized protein LOC401522, humanhuman

Predictions only

Length 79 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Q5VSD8 EI24-214ENST00000620753 1718 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.44□□□□□ -0.74
Q5VSD8 SHOX2-203ENST00000441443 3038 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.44□□□□□ -0.74
Q5VSD8 MARCH9-201ENST00000266643 2982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Q5VSD8 MCU-202ENST00000373053 2949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Q5VSD8 LZTS1-203ENST00000522290 1614 ntTSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Q5VSD8 GAS2L1-208ENST00000616432 2925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Q5VSD8 PRSS12-201ENST00000296498 4809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Q5VSD8 KIAA0895-204ENST00000415803 2865 ntTSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Q5VSD8 OCIAD1-202ENST00000381473 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
Q5VSD8 IQCE-210ENST00000438376 2170 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.43□□□□□ -0.74
Q5VSD8 OXSR1-201ENST00000311806 4553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
Q5VSD8 F10-202ENST00000375559 1517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
Q5VSD8 TTBK2-208ENST00000622375 6891 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
Q5VSD8 AC004951.4-201ENST00000454572 2076 ntTSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
Q5VSD8 LINC02167-203ENST00000566900 1489 ntTSL 2 BASIC10.43□□□□□ -0.74
Q5VSD8 TSC2-201ENST00000219476 6156 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.43□□□□□ -0.74
Q5VSD8 RAVER2-201ENST00000294428 4398 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.43□□□□□ -0.74
Q5VSD8 A4GALT-201ENST00000249005 2020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
Q5VSD8 SQOR-201ENST00000260324 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
Q5VSD8 LRRC4B-202ENST00000599957 3019 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.43□□□□□ -0.74
Q5VSD8 IGF2-204ENST00000381406 5179 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC10.43□□□□□ -0.74
Q5VSD8 ZNF446-207ENST00000610298 1869 ntTSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
Q5VSD8 RAD51C-215ENST00000583539 1319 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.43□□□□□ -0.74
Q5VSD8 DGKZ-203ENST00000421244 2862 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
Q5VSD8 BIN1-208ENST00000376113 1832 ntTSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
Q5VSD8 DLC1-203ENST00000358919 4392 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
Q5VSD8 CCNL1-201ENST00000295925 549 ntTSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
Q5VSD8 SPAG11A-201ENST00000326558 612 ntTSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
Q5VSD8 FAM19A3-202ENST00000369630 1282 ntTSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
Q5VSD8 SNRPB-201ENST00000381342 1154 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
Q5VSD8 RTN4RL2-202ENST00000395120 582 ntTSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
Q5VSD8 IFITM3-201ENST00000399808 808 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
Q5VSD8 AC093702.1-201ENST00000423433 367 ntTSL 3 BASIC10.43□□□□□ -0.74
Q5VSD8 PRAP1-201ENST00000433452 971 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
Q5VSD8 HLA-V-204ENST00000476601 1289 ntBASIC10.43□□□□□ -0.74
Q5VSD8 SATB1-217ENST00000493952 626 ntTSL 3 BASIC10.43□□□□□ -0.74
Q5VSD8 AC092658.1-201ENST00000505836 891 ntBASIC10.43□□□□□ -0.74
Q5VSD8 MSC-AS1-206ENST00000519751 596 ntTSL 4 BASIC10.43□□□□□ -0.74
Q5VSD8 ZSCAN2-213ENST00000541040 965 ntTSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
Q5VSD8 RARRES2P9-201ENST00000565168 469 ntBASIC10.43□□□□□ -0.74
Q5VSD8 AC016727.1-204ENST00000578974 420 ntTSL 3 BASIC10.43□□□□□ -0.74
Q5VSD8 AC007967.4-201ENST00000614700 386 ntBASIC10.43□□□□□ -0.74
Q5VSD8 RAB34-223ENST00000636154 730 ntTSL 2 BASIC10.43□□□□□ -0.74
Q5VSD8 F11R-202ENST00000368026 4835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
Q5VSD8 LGMN-216ENST00000557434 1797 ntTSL 5 BASIC10.43□□□□□ -0.74
Q5VSD8 PRMT5-201ENST00000216350 2271 ntTSL 2 BASIC10.43□□□□□ -0.74
Q5VSD8 EDA-204ENST00000374553 5272 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
Q5VSD8 ANGPTL4-202ENST00000393962 1705 ntTSL 5 BASIC10.43□□□□□ -0.74
Q5VSD8 DMRT3-201ENST00000190165 2183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
Q5VSD8 TRABD-203ENST00000395827 2172 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.43□□□□□ -0.74
Q5VSD8 CACNA1B-205ENST00000371363 9758 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.43□□□□□ -0.74
Q5VSD8 ZNF487-202ENST00000437590 2111 ntTSL 2 BASIC10.43□□□□□ -0.74
Q5VSD8 ADGRB2-201ENST00000373655 5400 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
Q5VSD8 CACNA1A-201ENST00000360228 8627 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
Q5VSD8 SCLT1-205ENST00000503401 1604 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC10.43□□□□□ -0.74
Q5VSD8 HDAC2-201ENST00000368632 2084 ntTSL 2 BASIC10.43□□□□□ -0.74
Q5VSD8 C2CD2L-201ENST00000336702 4771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
Q5VSD8 SPRED3-201ENST00000338502 4778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
Q5VSD8 SPAG9-202ENST00000357122 4761 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
Q5VSD8 TMEM44-204ENST00000392432 2490 ntTSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
Q5VSD8 CARMIL2-201ENST00000334583 4687 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
Q5VSD8 AP005233.1-201ENST00000562341 2424 ntTSL 2 BASIC10.43□□□□□ -0.74
Q5VSD8 GAREM2-201ENST00000401533 4161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
Q5VSD8 SHCBP1L-201ENST00000367547 2317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
Q5VSD8 RBM6-204ENST00000422955 2324 ntTSL 2 BASIC10.42□□□□□ -0.74
Q5VSD8 APOA5-201ENST00000227665 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
Q5VSD8 TMEM106C-203ENST00000449758 1414 ntTSL 2 BASIC10.42□□□□□ -0.74
Q5VSD8 AC073592.3-201ENST00000625118 1834 ntBASIC10.42□□□□□ -0.74
Q5VSD8 ADGRB2-202ENST00000373658 5414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.42□□□□□ -0.74
Q5VSD8 NKX2-1-203ENST00000518149 2583 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.42□□□□□ -0.74
Q5VSD8 MSLN-202ENST00000545450 2162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
Q5VSD8 TSPAN4-208ENST00000409531 1339 ntTSL 5 BASIC10.42□□□□□ -0.74
Q5VSD8 AC016027.1-202ENST00000607927 1699 ntBASIC10.42□□□□□ -0.74
Q5VSD8 TBL3-205ENST00000568546 6803 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
Q5VSD8 KLHL11-201ENST00000319121 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
Q5VSD8 UBB-201ENST00000302182 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
Q5VSD8 POLR1C-201ENST00000304004 1280 ntTSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
Q5VSD8 KIAA0907-201ENST00000368319 1155 ntTSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
Q5VSD8 MRPL9-202ENST00000368830 1296 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
Q5VSD8 NPM2-202ENST00000381530 925 ntTSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
Q5VSD8 AC008278.1-201ENST00000431117 568 ntTSL 4 BASIC10.42□□□□□ -0.74
Q5VSD8 AL158198.1-201ENST00000449143 380 ntTSL 3 BASIC10.42□□□□□ -0.74
Q5VSD8 FKBP11-203ENST00000453172 959 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.42□□□□□ -0.74
Q5VSD8 AP001471.1-201ENST00000454245 672 ntTSL 3 BASIC10.42□□□□□ -0.74
Q5VSD8 AHSA2-208ENST00000489653 1197 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.42□□□□□ -0.74
Q5VSD8 MTRF1LP2-201ENST00000506027 1122 ntBASIC10.42□□□□□ -0.74
Q5VSD8 CLNS1A-210ENST00000528364 953 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.42□□□□□ -0.74
Q5VSD8 API5-211ENST00000534695 560 ntTSL 5 BASIC10.42□□□□□ -0.74
Q5VSD8 KRT17P8-201ENST00000540749 863 ntBASIC10.42□□□□□ -0.74
Q5VSD8 TSPAN11-204ENST00000546076 1058 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.42□□□□□ -0.74
Q5VSD8 FAM192A-212ENST00000566077 1066 ntTSL 3 BASIC10.42□□□□□ -0.74
Q5VSD8 ARMC7-205ENST00000584947 445 ntTSL 3 BASIC10.42□□□□□ -0.74
Q5VSD8 PGPEP1-209ENST00000604499 769 ntTSL 5 BASIC10.42□□□□□ -0.74
Q5VSD8 AK3-202ENST00000381809 2736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
Q5VSD8 KCTD20-202ENST00000373731 5619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
Q5VSD8 EHMT1-203ENST00000460843 5137 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.42□□□□□ -0.74
Q5VSD8 C18orf63-201ENST00000579455 5127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
Q5VSD8 OGFOD2-212ENST00000538755 1949 ntTSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
Q5VSD8 MAN2A1-201ENST00000261483 4667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
Q5VSD8 NAT16-201ENST00000300303 2935 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC10.42□□□□□ -0.74
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 46.6 ms