Protein–RNA interactions for Protein: Q5K4L6

SLC27A3, Long-chain fatty acid transport protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 730 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SLC27A3Q5K4L6 RPS5-202ENST00000596046 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
SLC27A3Q5K4L6 FGFR3-210ENST00000613647 4438 ntTSL 5 BASIC21.49■■□□□ 1.03
SLC27A3Q5K4L6 PSRC1-201ENST00000369903 1710 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.49■■□□□ 1.03
SLC27A3Q5K4L6 ADM5-201ENST00000420022 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
SLC27A3Q5K4L6 TMEM155-202ENST00000394394 1753 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC21.49■■□□□ 1.03
SLC27A3Q5K4L6 NCK1-207ENST00000481752 1971 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.49■■□□□ 1.03
SLC27A3Q5K4L6 TPCN2-208ENST00000637342 2856 ntTSL 5 BASIC21.49■■□□□ 1.03
SLC27A3Q5K4L6 ZNF554-201ENST00000317243 2736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
SLC27A3Q5K4L6 PPP1R27-201ENST00000330261 782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
SLC27A3Q5K4L6 GNAQP1-201ENST00000444815 1067 ntBASIC21.49■■□□□ 1.03
SLC27A3Q5K4L6 AC022210.1-201ENST00000449856 793 ntBASIC21.49■■□□□ 1.03
SLC27A3Q5K4L6 KRT18P34-201ENST00000488218 1270 ntBASIC21.49■■□□□ 1.03
SLC27A3Q5K4L6 NOP2-211ENST00000540228 668 ntTSL 2 BASIC21.49■■□□□ 1.03
SLC27A3Q5K4L6 TSPAN11-204ENST00000546076 1058 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.49■■□□□ 1.03
SLC27A3Q5K4L6 AC105339.1-202ENST00000559535 1283 ntTSL 5 BASIC21.49■■□□□ 1.03
SLC27A3Q5K4L6 TMEM114-205ENST00000624696 560 ntTSL 2 BASIC21.49■■□□□ 1.03
SLC27A3Q5K4L6 SPRED2-206ENST00000443619 1800 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.49■■□□□ 1.03
SLC27A3Q5K4L6 TCP11-201ENST00000244645 2018 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
SLC27A3Q5K4L6 FBLIM1-201ENST00000332305 1530 ntTSL 2 BASIC21.49■■□□□ 1.03
SLC27A3Q5K4L6 UHRF1-203ENST00000615884 2651 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.49■■□□□ 1.03
SLC27A3Q5K4L6 TACR2-202ENST00000373307 1740 ntTSL 2 BASIC21.49■■□□□ 1.03
SLC27A3Q5K4L6 MEN1-205ENST00000377316 2868 ntTSL 5 BASIC21.49■■□□□ 1.03
SLC27A3Q5K4L6 PCSK6-217ENST00000618548 4269 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
SLC27A3Q5K4L6 RELL2-202ENST00000444782 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
SLC27A3Q5K4L6 PRR5-ARHGAP8-201ENST00000352766 2043 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.48■■□□□ 1.03
SLC27A3Q5K4L6 CCDC28B-202ENST00000421922 1415 ntTSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
SLC27A3Q5K4L6 HIC1-201ENST00000322941 3053 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
SLC27A3Q5K4L6 MOGS-201ENST00000233616 2895 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
SLC27A3Q5K4L6 MCOLN1-201ENST00000264079 2082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
SLC27A3Q5K4L6 H2BFWT-201ENST00000217926 894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
SLC27A3Q5K4L6 CCDC182-201ENST00000299415 832 ntAPPRIS P1 BASIC21.48■■□□□ 1.03
SLC27A3Q5K4L6 SPAG11A-201ENST00000326558 612 ntTSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
SLC27A3Q5K4L6 WDR38-201ENST00000373574 1252 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
SLC27A3Q5K4L6 CIB3-202ENST00000379859 467 ntTSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
SLC27A3Q5K4L6 AP1S3-202ENST00000396653 589 ntTSL 4 BASIC21.48■■□□□ 1.03
SLC27A3Q5K4L6 PRAP1-201ENST00000433452 971 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
SLC27A3Q5K4L6 Z94721.1-201ENST00000444102 385 ntTSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
SLC27A3Q5K4L6 AL606760.2-202ENST00000452466 524 ntTSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
SLC27A3Q5K4L6 ARPIN-202ENST00000460685 2145 ntTSL 2 BASIC21.48■■□□□ 1.03
SLC27A3Q5K4L6 CALML4-206ENST00000467889 987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
SLC27A3Q5K4L6 DRAM1-202ENST00000544152 1048 ntTSL 2 BASIC21.48■■□□□ 1.03
SLC27A3Q5K4L6 AC026803.2-201ENST00000599784 819 ntTSL 3 BASIC21.48■■□□□ 1.03
SLC27A3Q5K4L6 DUSP13-214ENST00000607131 1019 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
SLC27A3Q5K4L6 RN7SL828P-201ENST00000607615 303 ntBASIC21.48■■□□□ 1.03
SLC27A3Q5K4L6 CLDN7-201ENST00000360325 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
SLC27A3Q5K4L6 MAPT-215ENST00000574436 1326 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
SLC27A3Q5K4L6 TRAPPC3-210ENST00000617904 1305 ntTSL 2 BASIC21.48■■□□□ 1.03
SLC27A3Q5K4L6 GRK6-201ENST00000355472 2939 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
SLC27A3Q5K4L6 ATP6V1C2-204ENST00000635370 1578 ntTSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
SLC27A3Q5K4L6 GPANK1-202ENST00000375895 1800 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
SLC27A3Q5K4L6 RGS3-206ENST00000374136 2092 ntTSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
SLC27A3Q5K4L6 NCAPH2-203ENST00000395701 2077 ntTSL 2 BASIC21.48■■□□□ 1.03
SLC27A3Q5K4L6 EYA2-210ENST00000611592 2612 ntTSL 5 BASIC21.47■■□□□ 1.03
SLC27A3Q5K4L6 SH3BP1-201ENST00000357436 2852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
SLC27A3Q5K4L6 RABL2B-205ENST00000395595 2428 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
SLC27A3Q5K4L6 AC131009.4-201ENST00000624048 1740 ntBASIC21.47■■□□□ 1.03
SLC27A3Q5K4L6 WIZP1-201ENST00000531444 2299 ntBASIC21.47■■□□□ 1.03
SLC27A3Q5K4L6 LIPE-AS1-201ENST00000457234 1501 ntTSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
SLC27A3Q5K4L6 BHMT2-205ENST00000521567 1537 ntTSL 2 BASIC21.47■■□□□ 1.03
SLC27A3Q5K4L6 RBM3-202ENST00000376755 1130 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.47■■□□□ 1.03
SLC27A3Q5K4L6 FAM166B-201ENST00000399742 958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
SLC27A3Q5K4L6 CENPM-206ENST00000407253 818 ntTSL 2 BASIC21.47■■□□□ 1.03
SLC27A3Q5K4L6 FBLN7-204ENST00000409667 1124 ntTSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
SLC27A3Q5K4L6 C6orf47-AS1-203ENST00000422049 673 ntTSL 2 BASIC21.47■■□□□ 1.03
SLC27A3Q5K4L6 AC092658.1-201ENST00000505836 891 ntBASIC21.47■■□□□ 1.03
SLC27A3Q5K4L6 AC093004.1-201ENST00000508850 424 ntBASIC21.47■■□□□ 1.03
SLC27A3Q5K4L6 ATXN2-AS-201ENST00000547021 485 ntTSL 2 BASIC21.47■■□□□ 1.03
SLC27A3Q5K4L6 AC091544.3-201ENST00000556424 531 ntTSL 2 BASIC21.47■■□□□ 1.03
SLC27A3Q5K4L6 APOC4-201ENST00000591600 348 ntTSL 3 BASIC21.47■■□□□ 1.03
SLC27A3Q5K4L6 PIH1D1-209ENST00000596049 992 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.47■■□□□ 1.03
SLC27A3Q5K4L6 TEKT4P2-201ENST00000416067 1599 ntTSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
SLC27A3Q5K4L6 USP36-203ENST00000542802 6063 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
SLC27A3Q5K4L6 TOM1-201ENST00000382034 1300 ntTSL 5 BASIC21.47■■□□□ 1.03
SLC27A3Q5K4L6 ATP6AP2-225ENST00000637482 1648 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.47■■□□□ 1.03
SLC27A3Q5K4L6 BCL2L12-203ENST00000441864 1371 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
SLC27A3Q5K4L6 FBXO24-206ENST00000468962 1901 ntTSL 2 BASIC21.47■■□□□ 1.03
SLC27A3Q5K4L6 LYSMD4-203ENST00000378904 2122 ntBASIC21.46■■□□□ 1.03
SLC27A3Q5K4L6 VAV1-204ENST00000596764 2775 ntTSL 2 BASIC21.46■■□□□ 1.03
SLC27A3Q5K4L6 ELOA3-201ENST00000330682 1877 ntAPPRIS P1 BASIC21.46■■□□□ 1.03
SLC27A3Q5K4L6 KCNK7-203ENST00000394216 1563 ntTSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
SLC27A3Q5K4L6 STX3-203ENST00000529177 1571 ntTSL 2 BASIC21.46■■□□□ 1.03
SLC27A3Q5K4L6 POLDIP3-202ENST00000339677 783 ntTSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
SLC27A3Q5K4L6 KIAA0907-201ENST00000368319 1155 ntTSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
SLC27A3Q5K4L6 FAM220BP-201ENST00000377689 816 ntBASIC21.46■■□□□ 1.03
SLC27A3Q5K4L6 HOPX-203ENST00000381255 1164 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.46■■□□□ 1.03
SLC27A3Q5K4L6 MTND6P24-201ENST00000440466 518 ntBASIC21.46■■□□□ 1.03
SLC27A3Q5K4L6 MPZL1-209ENST00000474859 630 ntTSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
SLC27A3Q5K4L6 RAB30-AS1-202ENST00000526795 567 ntTSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
SLC27A3Q5K4L6 HOPX-210ENST00000553379 1001 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.46■■□□□ 1.03
SLC27A3Q5K4L6 AL161757.4-201ENST00000554149 621 ntTSL 3 BASIC21.46■■□□□ 1.03
SLC27A3Q5K4L6 HOPX-212ENST00000555760 1139 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.46■■□□□ 1.03
SLC27A3Q5K4L6 HOPX-213ENST00000556376 1064 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.46■■□□□ 1.03
SLC27A3Q5K4L6 MPDU1-223ENST00000582151 728 ntBASIC21.46■■□□□ 1.03
SLC27A3Q5K4L6 ELOF1-206ENST00000590700 585 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.46■■□□□ 1.03
SLC27A3Q5K4L6 AL136531.2-202ENST00000617804 573 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC21.46■■□□□ 1.03
SLC27A3Q5K4L6 LINC00895-201ENST00000629028 1637 ntBASIC21.46■■□□□ 1.03
SLC27A3Q5K4L6 IRF5-215ENST00000619830 1652 ntTSL 2 BASIC21.46■■□□□ 1.03
SLC27A3Q5K4L6 GABRD-218ENST00000640949 1684 ntTSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
SLC27A3Q5K4L6 HOXA-AS3-205ENST00000524304 2063 ntTSL 2 BASIC21.46■■□□□ 1.03
SLC27A3Q5K4L6 DEF8-225ENST00000569453 1852 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC21.45■■□□□ 1.02
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 47.7 ms