Protein–RNA interactions for Protein: Q16695

HIST3H3, Histone H3.1t, humanhuman

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Length 136 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HIST3H3Q16695 PHKA1-201ENST00000339490 6121 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
HIST3H3Q16695 COLEC11-202ENST00000349077 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
HIST3H3Q16695 DUSP12-201ENST00000367943 1270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
HIST3H3Q16695 KCNAB2-205ENST00000378092 1202 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
HIST3H3Q16695 TTLL10-201ENST00000379288 2114 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
HIST3H3Q16695 BAG1-202ENST00000379704 1128 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
HIST3H3Q16695 HIST2H3DP1-201ENST00000401004 416 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
HIST3H3Q16695 LINC00421-201ENST00000413833 1054 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
HIST3H3Q16695 LINC01972-201ENST00000422271 553 ntTSL 3 BASIC15.15■□□□□ 0.02
HIST3H3Q16695 ARTN-206ENST00000472435 402 ntTSL 3 BASIC15.15■□□□□ 0.02
HIST3H3Q16695 NOP16-205ENST00000509257 1000 ntTSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
HIST3H3Q16695 TOLLIP-AS1-201ENST00000530897 939 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
HIST3H3Q16695 AHSA1-208ENST00000555517 832 ntTSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
HIST3H3Q16695 MAP2K3-215ENST00000627447 351 ntTSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
HIST3H3Q16695 AC005915.1-201ENST00000624912 2018 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
HIST3H3Q16695 ZBTB44-201ENST00000357899 2781 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
HIST3H3Q16695 RASA4-202ENST00000449970 2787 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
HIST3H3Q16695 TCP1-203ENST00000420894 1671 ntTSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
HIST3H3Q16695 CHTOP-203ENST00000368690 2165 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
HIST3H3Q16695 TRPV4-205ENST00000537083 2436 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
HIST3H3Q16695 QPCTL-201ENST00000012049 2310 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
HIST3H3Q16695 LINC01657-201ENST00000457217 1809 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
HIST3H3Q16695 GPR137-212ENST00000539851 1843 ntTSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
HIST3H3Q16695 KCNT1-202ENST00000371757 4717 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
HIST3H3Q16695 PDCL3-201ENST00000264254 1337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
HIST3H3Q16695 CLN6-202ENST00000538696 1343 ntTSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
HIST3H3Q16695 SERPINH1-201ENST00000358171 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
HIST3H3Q16695 LRRC71-201ENST00000337428 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
HIST3H3Q16695 COL4A3BP-203ENST00000380494 5651 ntTSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
HIST3H3Q16695 USP7-201ENST00000344836 5412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.02
HIST3H3Q16695 INHA-201ENST00000243786 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
HIST3H3Q16695 GXYLT2-201ENST00000389617 3260 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
HIST3H3Q16695 TDRKH-202ENST00000368823 2751 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
HIST3H3Q16695 ADAMTSL1-202ENST00000327883 1864 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
HIST3H3Q16695 LINC00847-201ENST00000501855 1871 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
HIST3H3Q16695 AC106886.4-201ENST00000623557 2502 ntBASIC15.14■□□□□ 0.01
HIST3H3Q16695 IL34-202ENST00000429149 1779 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
HIST3H3Q16695 NKILA-202ENST00000614771 2598 ntBASIC15.14■□□□□ 0.01
HIST3H3Q16695 CXADR-201ENST00000284878 6254 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
HIST3H3Q16695 KLHDC7B-201ENST00000395676 2991 ntAPPRIS P1 BASIC15.14■□□□□ 0.01
HIST3H3Q16695 MAT2A-202ENST00000409017 1927 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
HIST3H3Q16695 RHNO1-209ENST00000618250 2070 ntAPPRIS P3 TSL 4 BASIC15.14■□□□□ 0.01
HIST3H3Q16695 KDSR-202ENST00000406396 5447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
HIST3H3Q16695 NDUFS7-201ENST00000233627 1039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
HIST3H3Q16695 NFKBIB-202ENST00000392079 991 ntTSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
HIST3H3Q16695 FAM3A-205ENST00000393572 1041 ntTSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
HIST3H3Q16695 YDJC-202ENST00000398873 1066 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
HIST3H3Q16695 MEF2B-202ENST00000409447 1297 ntTSL 3 BASIC15.14■□□□□ 0.01
HIST3H3Q16695 EMBP1-201ENST00000458200 901 ntBASIC15.14■□□□□ 0.01
HIST3H3Q16695 AP000721.2-201ENST00000537170 650 ntTSL 4 BASIC15.14■□□□□ 0.01
HIST3H3Q16695 TMEM106C-214ENST00000550161 976 ntTSL 3 BASIC15.14■□□□□ 0.01
HIST3H3Q16695 AC021739.2-201ENST00000558375 964 ntTSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
HIST3H3Q16695 SAXO2-206ENST00000566205 340 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
HIST3H3Q16695 TERC-201ENST00000602385 541 ntBASIC15.14■□□□□ 0.01
HIST3H3Q16695 MAP3K8-207ENST00000542547 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
HIST3H3Q16695 FICD-204ENST00000552695 3347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
HIST3H3Q16695 ZNF48-205ENST00000613509 3339 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
HIST3H3Q16695 MOAP1-202ENST00000556883 2529 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
HIST3H3Q16695 LGMN-202ENST00000393218 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
HIST3H3Q16695 VPS37A-201ENST00000324849 4906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
HIST3H3Q16695 SETD3-201ENST00000329331 1330 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
HIST3H3Q16695 FLT3LG-204ENST00000595510 1301 ntTSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
HIST3H3Q16695 PAX4-202ENST00000341640 2010 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
HIST3H3Q16695 ELF3-201ENST00000359651 4994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
HIST3H3Q16695 MARK2-209ENST00000509502 2862 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
HIST3H3Q16695 FAM57B-201ENST00000279389 1481 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
HIST3H3Q16695 PSMD6-210ENST00000492933 1495 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
HIST3H3Q16695 TEX264-215ENST00000611400 1488 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
HIST3H3Q16695 JKAMP-215ENST00000616435 2338 ntTSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
HIST3H3Q16695 SLC9A6-208ENST00000636206 4711 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
HIST3H3Q16695 EN2-201ENST00000297375 3395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
HIST3H3Q16695 TPD52L1-213ENST00000534000 2356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
HIST3H3Q16695 FCHO1-201ENST00000252771 3118 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
HIST3H3Q16695 AUNIP-201ENST00000374298 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
HIST3H3Q16695 IFT74-203ENST00000433700 2119 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
HIST3H3Q16695 AKIRIN1-202ENST00000432648 2741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
HIST3H3Q16695 HRASLS5-206ENST00000540857 3032 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
HIST3H3Q16695 PPOX-202ENST00000367999 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
HIST3H3Q16695 ACTRT2-201ENST00000378404 1421 ntAPPRIS P1 BASIC15.13■□□□□ 0.01
HIST3H3Q16695 ITM2B-201ENST00000378549 805 ntTSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
HIST3H3Q16695 GYG2P1-204ENST00000382966 639 ntTSL 3 BASIC15.13■□□□□ 0.01
HIST3H3Q16695 KRTCAP3-202ENST00000407293 942 ntTSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
HIST3H3Q16695 CCNL2-203ENST00000408952 1857 ntTSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
HIST3H3Q16695 RAB17-203ENST00000409576 466 ntTSL 3 BASIC15.13■□□□□ 0.01
HIST3H3Q16695 EVA1A-205ENST00000410113 1747 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC15.13■□□□□ 0.01
HIST3H3Q16695 SNHG11-204ENST00000420006 720 ntTSL 3 BASIC15.13■□□□□ 0.01
HIST3H3Q16695 SNHG11-206ENST00000432153 1181 ntTSL 3 BASIC15.13■□□□□ 0.01
HIST3H3Q16695 MPIG6B-210ENST00000480039 790 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
HIST3H3Q16695 MBL1P-201ENST00000480805 1424 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
HIST3H3Q16695 AC067930.3-201ENST00000524808 701 ntTSL 3 BASIC15.13■□□□□ 0.01
HIST3H3Q16695 PNMT-203ENST00000581428 677 ntTSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
HIST3H3Q16695 CYGB-205ENST00000590175 830 ntTSL 3 BASIC15.13■□□□□ 0.01
HIST3H3Q16695 TUBB4A-209ENST00000598006 565 ntTSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
HIST3H3Q16695 ZSCAN1-203ENST00000601162 813 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
HIST3H3Q16695 TST-204ENST00000622841 1105 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
HIST3H3Q16695 AC107918.4-202ENST00000641623 219 ntBASIC15.13■□□□□ 0.01
HIST3H3Q16695 ENPP1-201ENST00000360971 7442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
HIST3H3Q16695 BLCAP-201ENST00000373537 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
HIST3H3Q16695 EVPLL-201ENST00000399134 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
HIST3H3Q16695 CNTRL-208ENST00000373865 1917 ntTSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
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