Protein–RNA interactions for Protein: Q16518

RPE65, Retinoid isomerohydrolase, humanhuman

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Length 533 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RPE65Q16518 FAM210A-201ENST00000322247 4340 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.64■□□□□ 0.25
RPE65Q16518 MUM1-216ENST00000627377 2235 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.64■□□□□ 0.25
RPE65Q16518 EIF3B-201ENST00000360876 3055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
RPE65Q16518 AL139099.2-201ENST00000555043 2469 ntTSL 2 BASIC16.63■□□□□ 0.25
RPE65Q16518 PAX7-201ENST00000375375 2260 ntTSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
RPE65Q16518 LAT-203ENST00000395456 1616 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
RPE65Q16518 HYAL3-205ENST00000450982 1402 ntTSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
RPE65Q16518 ZDHHC8P1-204ENST00000433168 2309 ntTSL 2 BASIC16.63■□□□□ 0.25
RPE65Q16518 UBE3D-203ENST00000369747 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
RPE65Q16518 C21orf58-203ENST00000397680 2624 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.63■□□□□ 0.25
RPE65Q16518 PHYH-202ENST00000396913 1732 ntTSL 5 BASIC16.63■□□□□ 0.25
RPE65Q16518 MRPS16-201ENST00000372940 866 ntTSL 2 BASIC16.63■□□□□ 0.25
RPE65Q16518 THAP7-202ENST00000399133 1144 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.63■□□□□ 0.25
RPE65Q16518 C1orf226-202ENST00000426197 1049 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.63■□□□□ 0.25
RPE65Q16518 MOBP-208ENST00000441980 830 ntAPPRIS P4 TSL 4 BASIC16.63■□□□□ 0.25
RPE65Q16518 MRVI1-AS1-203ENST00000529979 784 ntTSL 3 BASIC16.63■□□□□ 0.25
RPE65Q16518 CD63-210ENST00000550776 870 ntTSL 5 BASIC16.63■□□□□ 0.25
RPE65Q16518 PAX9-204ENST00000554201 1289 ntTSL 2 BASIC16.63■□□□□ 0.25
RPE65Q16518 AC040169.1-201ENST00000565382 521 ntBASIC16.63■□□□□ 0.25
RPE65Q16518 AC018845.2-201ENST00000568326 409 ntBASIC16.63■□□□□ 0.25
RPE65Q16518 SNHG15-206ENST00000580528 1073 ntTSL 2 BASIC16.63■□□□□ 0.25
RPE65Q16518 AC074135.2-201ENST00000600896 510 ntTSL 3 BASIC16.63■□□□□ 0.25
RPE65Q16518 SLC9A3-AS1-204ENST00000606288 791 ntTSL 2 BASIC16.63■□□□□ 0.25
RPE65Q16518 PRMT2-203ENST00000355680 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
RPE65Q16518 ATOH1-201ENST00000306011 2212 ntAPPRIS P1 BASIC16.63■□□□□ 0.25
RPE65Q16518 KIF25-201ENST00000351261 1326 ntTSL 5 BASIC16.63■□□□□ 0.25
RPE65Q16518 B3GNT3-202ENST00000595387 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
RPE65Q16518 NFKBIA-201ENST00000216797 1558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
RPE65Q16518 EPHA10-201ENST00000319637 2050 ntTSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
RPE65Q16518 EIF3J-201ENST00000261868 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
RPE65Q16518 PAK4-201ENST00000321944 2555 ntTSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
RPE65Q16518 HDAC10-205ENST00000448072 2133 ntTSL 5 BASIC16.63■□□□□ 0.25
RPE65Q16518 AC002310.6-201ENST00000624451 1377 ntBASIC16.63■□□□□ 0.25
RPE65Q16518 FAM111A-204ENST00000528737 6189 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.63■□□□□ 0.25
RPE65Q16518 AL355987.4-201ENST00000415992 4244 ntTSL 2 BASIC16.62■□□□□ 0.25
RPE65Q16518 TRAF3IP1-201ENST00000373327 4279 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
RPE65Q16518 CCDC91-220ENST00000545336 2738 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
RPE65Q16518 ATXN2-227ENST00000616825 4575 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
RPE65Q16518 LINC00887-203ENST00000429578 1717 ntTSL 2 BASIC16.62■□□□□ 0.25
RPE65Q16518 RMDN3-202ENST00000338376 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
RPE65Q16518 PCDHGC3-205ENST00000617641 2346 ntTSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
RPE65Q16518 HOXA2-201ENST00000222718 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
RPE65Q16518 ELOF1-201ENST00000252445 1019 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.62■□□□□ 0.25
RPE65Q16518 HIST1H2BL-201ENST00000377401 488 ntAPPRIS P1 BASIC16.62■□□□□ 0.25
RPE65Q16518 C22orf39-203ENST00000399568 1005 ntTSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
RPE65Q16518 CAPG-203ENST00000409670 1183 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
RPE65Q16518 C2orf49-202ENST00000410049 854 ntTSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
RPE65Q16518 AC023274.1-201ENST00000418278 595 ntBASIC16.62■□□□□ 0.25
RPE65Q16518 LINC00237-202ENST00000455890 1220 ntTSL 2 BASIC16.62■□□□□ 0.25
RPE65Q16518 CD99L2-206ENST00000466436 988 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
RPE65Q16518 KIRREL3-AS1-201ENST00000548204 586 ntTSL 3 BASIC16.62■□□□□ 0.25
RPE65Q16518 AC092115.3-201ENST00000575838 592 ntTSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
RPE65Q16518 CDC42EP4-206ENST00000581014 737 ntTSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
RPE65Q16518 GIPC1-213ENST00000591349 1068 ntTSL 2 BASIC16.62■□□□□ 0.25
RPE65Q16518 AC023511.2-201ENST00000618803 211 ntBASIC16.62■□□□□ 0.25
RPE65Q16518 AC010507.1-201ENST00000633895 436 ntBASIC16.62■□□□□ 0.25
RPE65Q16518 CDK11A-203ENST00000357760 2446 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
RPE65Q16518 CDK11A-204ENST00000358779 2419 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
RPE65Q16518 CDK11A-206ENST00000378638 2429 ntTSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
RPE65Q16518 CDK11A-208ENST00000404249 2449 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
RPE65Q16518 TOR3A-203ENST00000367627 2724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
RPE65Q16518 UBE2D2-202ENST00000398733 2702 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
RPE65Q16518 CD99P1-204ENST00000435581 2788 ntTSL 2 BASIC16.62■□□□□ 0.25
RPE65Q16518 CHEK1-202ENST00000427383 1670 ntTSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
RPE65Q16518 B3GNT9-201ENST00000449549 2917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
RPE65Q16518 PRRT4-205ENST00000489835 2313 ntTSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
RPE65Q16518 SREBF2-201ENST00000361204 5240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
RPE65Q16518 THNSL2-202ENST00000343544 2052 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
RPE65Q16518 ABHD14B-206ENST00000483233 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
RPE65Q16518 SKOR1-202ENST00000380035 3675 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
RPE65Q16518 PLEKHM2-201ENST00000375793 4004 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
RPE65Q16518 ZDHHC20-209ENST00000542645 5315 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.61■□□□□ 0.25
RPE65Q16518 ZNF74-201ENST00000357502 2788 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
RPE65Q16518 TDRKH-202ENST00000368823 2751 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.61■□□□□ 0.25
RPE65Q16518 HS6ST2-203ENST00000406696 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
RPE65Q16518 KCNV2-201ENST00000382082 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
RPE65Q16518 CDIPT-209ENST00000569956 1532 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
RPE65Q16518 CDC73-201ENST00000367435 4969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
RPE65Q16518 TNFSF13-205ENST00000396545 1593 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
RPE65Q16518 MEG3-205ENST00000412736 1615 ntTSL 2 BASIC16.61■□□□□ 0.25
RPE65Q16518 JPT1-209ENST00000482348 1614 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
RPE65Q16518 ABHD11-203ENST00000395147 812 ntTSL 3 BASIC16.61■□□□□ 0.25
RPE65Q16518 COX10-202ENST00000429152 875 ntTSL 2 BASIC16.61■□□□□ 0.25
RPE65Q16518 CXCL1P1-201ENST00000502804 216 ntBASIC16.61■□□□□ 0.25
RPE65Q16518 FCHSD1-204ENST00000519800 802 ntTSL 2 BASIC16.61■□□□□ 0.25
RPE65Q16518 MAL2-202ENST00000531508 892 ntTSL 3 BASIC16.61■□□□□ 0.25
RPE65Q16518 AC096734.2-201ENST00000562054 433 ntBASIC16.61■□□□□ 0.25
RPE65Q16518 AC008403.2-204ENST00000600650 1006 ntTSL 3 BASIC16.61■□□□□ 0.25
RPE65Q16518 PLCB2-202ENST00000456256 4242 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
RPE65Q16518 FAM9B-202ENST00000362066 2047 ntTSL 2 BASIC16.61■□□□□ 0.25
RPE65Q16518 PHGDH-208ENST00000641023 2096 ntAPPRIS P1 BASIC16.61■□□□□ 0.25
RPE65Q16518 RBM15B-201ENST00000563281 6641 ntAPPRIS P1 BASIC16.61■□□□□ 0.25
RPE65Q16518 HECTD2-204ENST00000446394 4939 ntTSL 2 BASIC16.61■□□□□ 0.25
RPE65Q16518 AC011474.1-201ENST00000582581 2582 ntTSL 2 BASIC16.61■□□□□ 0.25
RPE65Q16518 INPP5A-203ENST00000368594 2967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
RPE65Q16518 MAFK-201ENST00000343242 3368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
RPE65Q16518 RUNX2-202ENST00000371432 5487 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
RPE65Q16518 IFFO1-201ENST00000336604 2686 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
RPE65Q16518 PNPO-201ENST00000225573 2256 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
RPE65Q16518 LSP1-217ENST00000612798 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.61■□□□□ 0.25
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