Protein–RNA interactions for Protein: Q15906

VPS72, Vacuolar protein sorting-associated protein 72 homolog, humanhuman

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Length 364 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VPS72Q15906 SLC6A9-201ENST00000357730 2168 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
VPS72Q15906 FBXO15-201ENST00000419743 1708 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
VPS72Q15906 MADCAM1-204ENST00000587541 1723 ntTSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
VPS72Q15906 RBM45-201ENST00000286070 1785 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
VPS72Q15906 C6orf47-AS1-203ENST00000422049 673 ntTSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
VPS72Q15906 AC140481.1-201ENST00000448777 706 ntTSL 3 BASIC22.21■■□□□ 1.15
VPS72Q15906 KRT18P34-201ENST00000488218 1270 ntBASIC22.21■■□□□ 1.15
VPS72Q15906 NEU3-203ENST00000529024 581 ntTSL 3 BASIC22.21■■□□□ 1.15
VPS72Q15906 AC004477.1-202ENST00000584428 539 ntTSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
VPS72Q15906 AC021097.1-201ENST00000607902 574 ntBASIC22.21■■□□□ 1.15
VPS72Q15906 CPQ-201ENST00000220763 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
VPS72Q15906 LRRC71-201ENST00000337428 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
VPS72Q15906 RGN-204ENST00000457380 2041 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
VPS72Q15906 ATAD3A-202ENST00000378755 2612 ntTSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
VPS72Q15906 AC118344.1-201ENST00000378432 1462 ntTSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
VPS72Q15906 AL162586.1-201ENST00000439298 2055 ntTSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
VPS72Q15906 DACT2-204ENST00000610183 2088 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
VPS72Q15906 CAMKK2-207ENST00000404169 2116 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
VPS72Q15906 DGKZ-203ENST00000421244 2862 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
VPS72Q15906 IRF5-215ENST00000619830 1652 ntTSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.15
VPS72Q15906 MAGI2-212ENST00000626691 4599 ntTSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
VPS72Q15906 AC133561.2-201ENST00000380145 1802 ntTSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
VPS72Q15906 PNLDC1-207ENST00000610273 1940 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
VPS72Q15906 TDRKH-202ENST00000368823 2751 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
VPS72Q15906 PARD3-207ENST00000374788 5996 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
VPS72Q15906 NCAPH2-203ENST00000395701 2077 ntTSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
VPS72Q15906 IFNL3-201ENST00000413851 656 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
VPS72Q15906 GSTZ1-219ENST00000557639 873 ntTSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
VPS72Q15906 USP21-201ENST00000289865 2195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
VPS72Q15906 TEAD3-204ENST00000639578 1308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
VPS72Q15906 STAC3-206ENST00000554578 1580 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
VPS72Q15906 ADORA2A-215ENST00000618076 2630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
VPS72Q15906 ATP6V1C2-204ENST00000635370 1578 ntTSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
VPS72Q15906 RIN1-201ENST00000311320 2693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
VPS72Q15906 ACOT7-204ENST00000377855 1614 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
VPS72Q15906 POLR1D-207ENST00000621089 1606 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
VPS72Q15906 TM7SF3-201ENST00000343028 2709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
VPS72Q15906 MCOLN2-201ENST00000284027 1729 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
VPS72Q15906 RNPS1-205ENST00000561718 1806 ntTSL 3 BASIC22.2■■□□□ 1.14
VPS72Q15906 RGS3-206ENST00000374136 2092 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
VPS72Q15906 MARVELD3-202ENST00000299952 2214 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
VPS72Q15906 KAT5-203ENST00000377046 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
VPS72Q15906 MORF4L1-201ENST00000331268 2359 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
VPS72Q15906 PLIN5-201ENST00000381848 2470 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
VPS72Q15906 ATRIP-202ENST00000346691 2509 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
VPS72Q15906 RPS5-201ENST00000196551 740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
VPS72Q15906 EEF1B2-201ENST00000236957 844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
VPS72Q15906 EIF1AX-201ENST00000379593 765 ntTSL 3 BASIC22.19■■□□□ 1.14
VPS72Q15906 CSHL1-204ENST00000392824 823 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
VPS72Q15906 AKIP1-204ENST00000396648 1084 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
VPS72Q15906 NUDT1-206ENST00000397049 714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
VPS72Q15906 BCYRN1-201ENST00000418539 200 ntBASIC22.19■■□□□ 1.14
VPS72Q15906 AC114501.2-201ENST00000439631 535 ntBASIC22.19■■□□□ 1.14
VPS72Q15906 RN7SL618P-201ENST00000477850 296 ntBASIC22.19■■□□□ 1.14
VPS72Q15906 ELK1P1-201ENST00000485699 580 ntBASIC22.19■■□□□ 1.14
VPS72Q15906 AL512361.1-201ENST00000554200 418 ntBASIC22.19■■□□□ 1.14
VPS72Q15906 AL163974.1-201ENST00000554540 466 ntTSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
VPS72Q15906 XRCC3-210ENST00000554974 575 ntTSL 4 BASIC22.19■■□□□ 1.14
VPS72Q15906 CTBP2P3-201ENST00000585629 1255 ntBASIC22.19■■□□□ 1.14
VPS72Q15906 TMEM261P1-201ENST00000604899 340 ntBASIC22.19■■□□□ 1.14
VPS72Q15906 KLK8-211ENST00000600767 1324 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
VPS72Q15906 KREMEN1-203ENST00000407188 1422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
VPS72Q15906 PLSCR4-204ENST00000446574 1442 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
VPS72Q15906 LINC00221-202ENST00000619530 1499 ntTSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
VPS72Q15906 NFYC-210ENST00000425457 1536 ntTSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
VPS72Q15906 ACP2-206ENST00000529444 1719 ntTSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
VPS72Q15906 NAB2-202ENST00000342556 2318 ntTSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
VPS72Q15906 C9orf64-203ENST00000376344 2443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
VPS72Q15906 H2AFY-217ENST00000511689 2789 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
VPS72Q15906 DBN1-201ENST00000292385 3072 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
VPS72Q15906 ELOA-201ENST00000418390 5154 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
VPS72Q15906 PTOV1-AS1-201ENST00000596521 2155 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
VPS72Q15906 REXO1L9P-201ENST00000604264 2108 ntBASIC22.18■■□□□ 1.14
VPS72Q15906 KDELC1-201ENST00000376004 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
VPS72Q15906 STK4-201ENST00000372801 2038 ntTSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
VPS72Q15906 TXNDC2-204ENST00000536353 1703 ntTSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
VPS72Q15906 SHISA5-219ENST00000612611 1677 ntTSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
VPS72Q15906 PNCK-202ENST00000370142 1525 ntTSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
VPS72Q15906 FBLIM1-206ENST00000441801 1543 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
VPS72Q15906 RAD51D-218ENST00000590016 1528 ntTSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
VPS72Q15906 ANKRD19P-201ENST00000338192 862 ntBASIC22.18■■□□□ 1.14
VPS72Q15906 LYPLA2-201ENST00000374501 1117 ntTSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
VPS72Q15906 TPSD1-202ENST00000397534 896 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
VPS72Q15906 AL161785.3-201ENST00000435157 395 ntTSL 3 BASIC22.18■■□□□ 1.14
VPS72Q15906 MYCLP2-201ENST00000449268 967 ntBASIC22.18■■□□□ 1.14
VPS72Q15906 SERF1A-205ENST00000507348 663 ntTSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
VPS72Q15906 PRYP6-201ENST00000514804 343 ntBASIC22.18■■□□□ 1.14
VPS72Q15906 AC025442.1-201ENST00000521596 481 ntTSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
VPS72Q15906 LINC01605-204ENST00000522718 1093 ntTSL 3 BASIC22.18■■□□□ 1.14
VPS72Q15906 AL928654.4-206ENST00000551180 980 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
VPS72Q15906 MIR6869-201ENST00000619434 62 ntBASIC22.18■■□□□ 1.14
VPS72Q15906 AL160035.1-201ENST00000637583 576 ntTSL 4 BASIC22.18■■□□□ 1.14
VPS72Q15906 CADPS-219ENST00000612439 5455 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
VPS72Q15906 MOGS-202ENST00000409065 2668 ntTSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
VPS72Q15906 UMOD-205ENST00000570689 2315 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
VPS72Q15906 MXD3-202ENST00000427908 2269 ntTSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
VPS72Q15906 GPR35-201ENST00000319838 2249 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
VPS72Q15906 NEIL2-203ENST00000436750 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
VPS72Q15906 AL606970.3-201ENST00000446811 2246 ntTSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
VPS72Q15906 ARPIN-202ENST00000460685 2145 ntTSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
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