Protein–RNA interactions for Protein: Q15834

CCDC85B, Coiled-coil domain-containing protein 85B, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 202 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC85BQ15834 ITGA9-201ENST00000264741 7889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
CCDC85BQ15834 DDX59-201ENST00000331314 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
CCDC85BQ15834 PCDHA5-202ENST00000529859 5218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
CCDC85BQ15834 MED9-201ENST00000268711 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
CCDC85BQ15834 PRPS1-203ENST00000372428 1748 ntTSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.48
CCDC85BQ15834 KCNC3-203ENST00000477616 3176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
CCDC85BQ15834 PPM1B-201ENST00000282412 2606 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
CCDC85BQ15834 REPS2-201ENST00000303843 7771 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
CCDC85BQ15834 TCTEX1D1-201ENST00000282670 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
CCDC85BQ15834 FCMR-201ENST00000367091 1950 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
CCDC85BQ15834 NBL1-209ENST00000548815 1953 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC18.08■□□□□ 0.48
CCDC85BQ15834 OSR2-209ENST00000522510 1528 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.48
CCDC85BQ15834 GATAD2A-202ENST00000360315 5671 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
CCDC85BQ15834 CXXC1-202ENST00000412036 2280 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
CCDC85BQ15834 ANKMY1-209ENST00000405523 1827 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
CCDC85BQ15834 IL17RC-215ENST00000455057 2244 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
CCDC85BQ15834 IMP4-201ENST00000259239 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
CCDC85BQ15834 TRMT2A-203ENST00000404751 2498 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
CCDC85BQ15834 DTX3-204ENST00000548804 2067 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
CCDC85BQ15834 SMPD3-203ENST00000563226 2093 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
CCDC85BQ15834 LRFN4-201ENST00000309602 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
CCDC85BQ15834 SS18L2-201ENST00000011691 781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
CCDC85BQ15834 C11orf71-201ENST00000325636 652 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
CCDC85BQ15834 POLDIP3-202ENST00000339677 783 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
CCDC85BQ15834 CD81-202ENST00000381036 880 ntTSL 3 BASIC18.07■□□□□ 0.48
CCDC85BQ15834 VCX-202ENST00000381059 967 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
CCDC85BQ15834 CXCL1-201ENST00000395761 1097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
CCDC85BQ15834 ITGB2-204ENST00000397846 422 ntTSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
CCDC85BQ15834 ACTG1P4-201ENST00000425123 1122 ntBASIC18.07■□□□□ 0.48
CCDC85BQ15834 TMEM247-204ENST00000434431 680 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
CCDC85BQ15834 REEP2-206ENST00000506158 1021 ntTSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
CCDC85BQ15834 AP001995.1-201ENST00000531784 1157 ntTSL 4 BASIC18.07■□□□□ 0.48
CCDC85BQ15834 THTPA-204ENST00000554970 569 ntTSL 4 BASIC18.07■□□□□ 0.48
CCDC85BQ15834 THTPA-206ENST00000556015 535 ntTSL 3 BASIC18.07■□□□□ 0.48
CCDC85BQ15834 C19orf33-202ENST00000588605 520 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
CCDC85BQ15834 EIF6-209ENST00000621148 1054 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.07■□□□□ 0.48
CCDC85BQ15834 AC084121.4-201ENST00000641598 221 ntBASIC18.07■□□□□ 0.48
CCDC85BQ15834 AF228730.8-201ENST00000642140 221 ntBASIC18.07■□□□□ 0.48
CCDC85BQ15834 ISCA1-203ENST00000375991 1958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
CCDC85BQ15834 RPP25-201ENST00000322177 3049 ntAPPRIS P1 BASIC18.07■□□□□ 0.48
CCDC85BQ15834 C11orf80-214ENST00000532565 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
CCDC85BQ15834 SULT1A1-204ENST00000395609 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
CCDC85BQ15834 BCL11B-202ENST00000357195 7559 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
CCDC85BQ15834 TMEM259-209ENST00000592590 2509 ntTSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
CCDC85BQ15834 BORCS8-203ENST00000477565 1489 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
CCDC85BQ15834 AC105411.1-202ENST00000565050 1476 ntTSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
CCDC85BQ15834 NARFL-201ENST00000251588 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
CCDC85BQ15834 PLK5-201ENST00000334770 2106 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
CCDC85BQ15834 MARK4-210ENST00000620044 2105 ntTSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
CCDC85BQ15834 NAPA-AS1-201ENST00000593284 1753 ntTSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
CCDC85BQ15834 NFIB-208ENST00000397581 3318 ntTSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
CCDC85BQ15834 ACSS3-201ENST00000261206 2666 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
CCDC85BQ15834 LGMN-211ENST00000555699 1728 ntTSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
CCDC85BQ15834 NMRAL1-201ENST00000283429 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
CCDC85BQ15834 ZNF84-201ENST00000327668 7162 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
CCDC85BQ15834 FPGS-203ENST00000373247 2279 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
CCDC85BQ15834 LIN54-209ENST00000510557 2257 ntTSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
CCDC85BQ15834 AC093010.1-201ENST00000473625 1624 ntBASIC18.06■□□□□ 0.48
CCDC85BQ15834 ZNF296-202ENST00000622376 1631 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
CCDC85BQ15834 MICU3-201ENST00000318063 3992 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
CCDC85BQ15834 DIABLO-203ENST00000353548 1345 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
CCDC85BQ15834 SARDH-202ENST00000371867 1326 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
CCDC85BQ15834 PLCG1-201ENST00000244007 5285 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
CCDC85BQ15834 KCNH2-202ENST00000330883 3267 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
CCDC85BQ15834 NDUFAF3-203ENST00000395458 808 ntTSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
CCDC85BQ15834 BX276092.7-202ENST00000422194 696 ntTSL 3 BASIC18.06■□□□□ 0.48
CCDC85BQ15834 ZNF815P-202ENST00000422825 805 ntTSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
CCDC85BQ15834 ROPN1-207ENST00000484329 566 ntTSL 3 BASIC18.06■□□□□ 0.48
CCDC85BQ15834 AC106872.10-201ENST00000503778 747 ntTSL 3 BASIC18.06■□□□□ 0.48
CCDC85BQ15834 AC021054.1-202ENST00000543884 599 ntTSL 3 BASIC18.06■□□□□ 0.48
CCDC85BQ15834 AC020978.5-201ENST00000564147 533 ntTSL 4 BASIC18.06■□□□□ 0.48
CCDC85BQ15834 AC132938.2-201ENST00000579188 680 ntBASIC18.06■□□□□ 0.48
CCDC85BQ15834 IL11-202ENST00000585513 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
CCDC85BQ15834 AC243964.2-202ENST00000591312 752 ntTSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
CCDC85BQ15834 TXNL4A-212ENST00000592957 546 ntTSL 3 BASIC18.06■□□□□ 0.48
CCDC85BQ15834 ZNF655-225ENST00000626122 705 ntTSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
CCDC85BQ15834 AL031056.2-201ENST00000637957 1217 ntTSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
CCDC85BQ15834 AL591163.1-201ENST00000641757 987 ntBASIC18.06■□□□□ 0.48
CCDC85BQ15834 RCCD1-201ENST00000394258 2689 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
CCDC85BQ15834 PHGDH-209ENST00000641074 1780 ntBASIC18.06■□□□□ 0.48
CCDC85BQ15834 CDH22-201ENST00000372262 3661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
CCDC85BQ15834 TMEM151A-201ENST00000327259 2562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
CCDC85BQ15834 RIF1-204ENST00000430328 7992 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
CCDC85BQ15834 TUBA3FP-202ENST00000422086 1974 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
CCDC85BQ15834 ASXL1-212ENST00000620121 5374 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
CCDC85BQ15834 MDFIC-201ENST00000257724 4598 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
CCDC85BQ15834 OCIAD1-213ENST00000508293 1423 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
CCDC85BQ15834 UNC5D-204ENST00000420357 2966 ntTSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
CCDC85BQ15834 ADAM23-201ENST00000264377 6330 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
CCDC85BQ15834 BDKRB1-201ENST00000216629 1687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
CCDC85BQ15834 RAD51D-201ENST00000335858 1353 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
CCDC85BQ15834 AC093677.2-201ENST00000600169 1863 ntBASIC18.05■□□□□ 0.48
CCDC85BQ15834 SLC8A3-202ENST00000356921 5250 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
CCDC85BQ15834 MED25-201ENST00000312865 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
CCDC85BQ15834 ANKRD20A5P-207ENST00000581935 2089 ntTSL 2 BASIC18.05■□□□□ 0.48
CCDC85BQ15834 FOXC2-201ENST00000320354 2478 ntAPPRIS P1 BASIC18.05■□□□□ 0.48
CCDC85BQ15834 AC112492.5-201ENST00000421897 457 ntBASIC18.05■□□□□ 0.48
CCDC85BQ15834 REEP4-207ENST00000523293 913 ntTSL 3 BASIC18.05■□□□□ 0.48
CCDC85BQ15834 FAM192A-212ENST00000566077 1066 ntTSL 3 BASIC18.05■□□□□ 0.48
CCDC85BQ15834 COQ4-205ENST00000609948 956 ntTSL 2 BASIC18.05■□□□□ 0.48
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