Protein–RNA interactions for Protein: Q15573

TAF1A, TATA box-binding protein-associated factor RNA polymerase I subunit A, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 450 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TAF1AQ15573 DHRS4L2-207ENST00000558753 556 ntTSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
TAF1AQ15573 CYGB-205ENST00000590175 830 ntTSL 3 BASIC17.17■□□□□ 0.34
TAF1AQ15573 SMIM22-210ENST00000615471 928 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.17■□□□□ 0.34
TAF1AQ15573 AL031008.1-201ENST00000619963 541 ntBASIC17.17■□□□□ 0.34
TAF1AQ15573 GRTP1-205ENST00000620217 1073 ntTSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
TAF1AQ15573 GLRB-201ENST00000264428 3126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
TAF1AQ15573 SPECC1-203ENST00000395525 2536 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
TAF1AQ15573 MYC-202ENST00000377970 2351 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
TAF1AQ15573 WBP2-201ENST00000254806 1944 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
TAF1AQ15573 UBE3D-203ENST00000369747 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
TAF1AQ15573 SQOR-208ENST00000568606 1792 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
TAF1AQ15573 INHA-201ENST00000243786 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
TAF1AQ15573 FAM57B-201ENST00000279389 1481 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
TAF1AQ15573 PTHLH-203ENST00000395872 1318 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
TAF1AQ15573 CLN6-202ENST00000538696 1343 ntTSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
TAF1AQ15573 HNRNPDL-210ENST00000630827 1318 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
TAF1AQ15573 EN2-201ENST00000297375 3395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
TAF1AQ15573 ANTXRL-206ENST00000622632 1964 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
TAF1AQ15573 ARHGAP27-214ENST00000532891 2604 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
TAF1AQ15573 CSF1-204ENST00000369802 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
TAF1AQ15573 PRORSD1P-202ENST00000563365 2154 ntBASIC17.16■□□□□ 0.34
TAF1AQ15573 GTPBP8-208ENST00000619116 1378 ntTSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
TAF1AQ15573 DHCR7-201ENST00000355527 2666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
TAF1AQ15573 AC022211.2-201ENST00000585075 2527 ntBASIC17.16■□□□□ 0.34
TAF1AQ15573 LYPLAL1-202ENST00000366928 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
TAF1AQ15573 HLA-A-204ENST00000396634 1868 ntAPPRIS P1 BASIC17.16■□□□□ 0.34
TAF1AQ15573 FAM178B-204ENST00000490605 2710 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
TAF1AQ15573 HMCN2-204ENST00000611173 1920 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
TAF1AQ15573 CCNYL1-201ENST00000295414 3767 ntTSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
TAF1AQ15573 ESYT2-206ENST00000613624 2766 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
TAF1AQ15573 DPM3-201ENST00000341298 486 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
TAF1AQ15573 TMEM234-202ENST00000344461 721 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
TAF1AQ15573 DNAH14-205ENST00000366850 1103 ntTSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
TAF1AQ15573 IGF2-206ENST00000418738 934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
TAF1AQ15573 KRT18P67-201ENST00000432816 1264 ntBASIC17.16■□□□□ 0.34
TAF1AQ15573 C1orf109-203ENST00000464085 919 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
TAF1AQ15573 ACP6-203ENST00000487562 1258 ntTSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
TAF1AQ15573 TSPAN4-214ENST00000525201 834 ntTSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
TAF1AQ15573 AC002091.2-201ENST00000585297 402 ntTSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
TAF1AQ15573 TUBB4A-209ENST00000598006 565 ntTSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
TAF1AQ15573 CALM3-211ENST00000598871 561 ntTSL 4 BASIC17.16■□□□□ 0.34
TAF1AQ15573 AL022328.2-201ENST00000608016 640 ntTSL 3 BASIC17.16■□□□□ 0.34
TAF1AQ15573 HS6ST2-203ENST00000406696 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
TAF1AQ15573 LINC01657-201ENST00000457217 1809 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
TAF1AQ15573 VPS51-201ENST00000279281 2714 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
TAF1AQ15573 MAGI3-201ENST00000307546 6430 ntTSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
TAF1AQ15573 PDE3B-201ENST00000282096 6076 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
TAF1AQ15573 LCORL-203ENST00000382226 5009 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
TAF1AQ15573 DNM2-201ENST00000355667 3541 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
TAF1AQ15573 PIGT-257ENST00000640210 1715 ntTSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
TAF1AQ15573 KRT85-202ENST00000544265 1387 ntTSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
TAF1AQ15573 WASF1-205ENST00000392587 2675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
TAF1AQ15573 PGAP3-203ENST00000378011 2533 ntTSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
TAF1AQ15573 KLHDC8B-201ENST00000332780 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
TAF1AQ15573 C14orf28-201ENST00000325192 2915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
TAF1AQ15573 TRAM1-205ENST00000521425 3394 ntTSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
TAF1AQ15573 AC092068.3-201ENST00000587894 2016 ntBASIC17.15■□□□□ 0.34
TAF1AQ15573 ADCY6-202ENST00000357869 5748 ntTSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
TAF1AQ15573 PHKA1-201ENST00000339490 6121 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
TAF1AQ15573 AP4S1-202ENST00000313566 839 ntTSL 3 BASIC17.15■□□□□ 0.34
TAF1AQ15573 OLFM1-207ENST00000371801 568 ntTSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
TAF1AQ15573 MED22-202ENST00000371999 987 ntTSL 3 BASIC17.15■□□□□ 0.34
TAF1AQ15573 SNHG7-203ENST00000436596 509 ntTSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
TAF1AQ15573 IER2-202ENST00000587885 1291 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.15■□□□□ 0.34
TAF1AQ15573 AC005625.1-201ENST00000590304 472 ntTSL 3 BASIC17.15■□□□□ 0.34
TAF1AQ15573 AC020909.1-201ENST00000599632 1265 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
TAF1AQ15573 AC104692.2-201ENST00000603054 253 ntBASIC17.15■□□□□ 0.34
TAF1AQ15573 AC018529.2-201ENST00000612024 828 ntTSL 4 BASIC17.15■□□□□ 0.34
TAF1AQ15573 ANO2-212ENST00000612575 1087 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
TAF1AQ15573 CSNK2A1-203ENST00000400217 1451 ntTSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
TAF1AQ15573 CHTOP-201ENST00000368686 2250 ntTSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
TAF1AQ15573 PARVG-205ENST00000422871 3462 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
TAF1AQ15573 SP3-203ENST00000418194 3937 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
TAF1AQ15573 GATA2-202ENST00000430265 2525 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
TAF1AQ15573 GMPPA-204ENST00000373908 1501 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
TAF1AQ15573 AGBL5-202ENST00000360131 3177 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
TAF1AQ15573 NADSYN1-201ENST00000319023 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
TAF1AQ15573 NRXN1-209ENST00000405581 5078 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
TAF1AQ15573 ARL6IP6-201ENST00000326446 2805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
TAF1AQ15573 LINC00894-202ENST00000425602 1597 ntTSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
TAF1AQ15573 MAPK11-201ENST00000330651 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
TAF1AQ15573 C6orf132-201ENST00000341865 6210 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
TAF1AQ15573 AC243591.1-201ENST00000452967 1364 ntBASIC17.15■□□□□ 0.34
TAF1AQ15573 ADGRB2-201ENST00000373655 5400 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.34
TAF1AQ15573 GPR137-212ENST00000539851 1843 ntTSL 2 BASIC17.14■□□□□ 0.34
TAF1AQ15573 AD000864.1-201ENST00000624076 2295 ntBASIC17.14■□□□□ 0.33
TAF1AQ15573 KRT84-201ENST00000257951 2092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
TAF1AQ15573 AC005920.1-201ENST00000501718 2054 ntTSL 2 BASIC17.14■□□□□ 0.33
TAF1AQ15573 NECAB2-203ENST00000565691 2064 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
TAF1AQ15573 MBL1P-201ENST00000480805 1424 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
TAF1AQ15573 HOOK2-202ENST00000397668 2513 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
TAF1AQ15573 LSP1-217ENST00000612798 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.14■□□□□ 0.33
TAF1AQ15573 ASIC2-201ENST00000225823 3443 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
TAF1AQ15573 ARHGAP9-204ENST00000430041 2323 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
TAF1AQ15573 DAPK1-207ENST00000469640 5899 ntTSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
TAF1AQ15573 PCGF3-201ENST00000362003 5685 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
TAF1AQ15573 LGALS12-201ENST00000255684 1667 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
TAF1AQ15573 TRA2A-211ENST00000538367 2142 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.14■□□□□ 0.33
TAF1AQ15573 OSBP2-211ENST00000446658 2836 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
TAF1AQ15573 TRIL-201ENST00000539664 4935 ntAPPRIS P1 BASIC17.14■□□□□ 0.33
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 34.1 ms