Protein–RNA interactions for Protein: Q15306

IRF4, Interferon regulatory factor 4, humanhuman

Predictions only

Length 451 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
IRF4Q15306 DUSP6-204ENST00000547291 1074 ntTSL 2 BASIC16.9■□□□□ 0.3
IRF4Q15306 MIR4469-201ENST00000583919 79 ntBASIC16.9■□□□□ 0.3
IRF4Q15306 AC244517.11-201ENST00000624192 573 ntTSL 5 BASIC16.9■□□□□ 0.3
IRF4Q15306 TDRKH-202ENST00000368823 2751 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.9■□□□□ 0.3
IRF4Q15306 OSGIN1-202ENST00000361711 2230 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.9■□□□□ 0.3
IRF4Q15306 TRIM8-201ENST00000302424 2831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
IRF4Q15306 IVNS1ABP-202ENST00000367498 4199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
IRF4Q15306 GSDMD-206ENST00000526406 2496 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.9■□□□□ 0.3
IRF4Q15306 DPM2-201ENST00000314392 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
IRF4Q15306 HLA-F-218ENST00000376861 1544 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.9■□□□□ 0.3
IRF4Q15306 PDHX-203ENST00000448838 2653 ntTSL 5 BASIC16.9■□□□□ 0.3
IRF4Q15306 AC003002.1-202ENST00000596755 1743 ntAPPRIS P1 BASIC16.9■□□□□ 0.3
IRF4Q15306 SELENBP1-204ENST00000426705 1928 ntTSL 2 BASIC16.9■□□□□ 0.3
IRF4Q15306 AGAP6-201ENST00000374056 2703 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
IRF4Q15306 LRRC71-201ENST00000337428 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.3
IRF4Q15306 CHRD-202ENST00000348986 3155 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.89■□□□□ 0.3
IRF4Q15306 EVX2-201ENST00000308618 4203 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.89■□□□□ 0.29
IRF4Q15306 PACS2-205ENST00000547217 2809 ntTSL 5 BASIC16.89■□□□□ 0.29
IRF4Q15306 FOXD4L4-201ENST00000377413 2230 ntAPPRIS P1 BASIC16.89■□□□□ 0.29
IRF4Q15306 CYHR1-204ENST00000438911 2020 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.89■□□□□ 0.29
IRF4Q15306 PIF1-201ENST00000268043 2687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
IRF4Q15306 PACSIN2-203ENST00000402229 1883 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.89■□□□□ 0.29
IRF4Q15306 PRRT2-205ENST00000567659 1470 ntTSL 2 BASIC16.89■□□□□ 0.29
IRF4Q15306 ZNF593-201ENST00000270812 698 ntTSL 2 BASIC16.89■□□□□ 0.29
IRF4Q15306 SPACA4-201ENST00000321762 972 ntAPPRIS P1 BASIC16.89■□□□□ 0.29
IRF4Q15306 CD82-202ENST00000342935 967 ntTSL 5 BASIC16.89■□□□□ 0.29
IRF4Q15306 PDLIM7-201ENST00000355572 977 ntTSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
IRF4Q15306 MRPL55-208ENST00000366734 990 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.89■□□□□ 0.29
IRF4Q15306 MRPL55-217ENST00000366746 565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
IRF4Q15306 SELENOH-201ENST00000388857 833 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
IRF4Q15306 AC006042.2-201ENST00000428660 568 ntTSL 4 BASIC16.89■□□□□ 0.29
IRF4Q15306 FAM58CP-201ENST00000435741 640 ntBASIC16.89■□□□□ 0.29
IRF4Q15306 TMEM205-202ENST00000447337 916 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.89■□□□□ 0.29
IRF4Q15306 USP30-AS1-201ENST00000478808 656 ntTSL 2 BASIC16.89■□□□□ 0.29
IRF4Q15306 GMDS-AS1-205ENST00000529893 900 ntTSL 5 BASIC16.89■□□□□ 0.29
IRF4Q15306 MVB12A-211ENST00000529939 1091 ntTSL 3 BASIC16.89■□□□□ 0.29
IRF4Q15306 HIST4H4-204ENST00000539745 577 ntAPPRIS P1 BASIC16.89■□□□□ 0.29
IRF4Q15306 TMEM220-AS1-206ENST00000583343 876 ntTSL 3 BASIC16.89■□□□□ 0.29
IRF4Q15306 MED16-214ENST00000617672 554 ntTSL 5 BASIC16.89■□□□□ 0.29
IRF4Q15306 OPN5-206ENST00000638973 1090 ntTSL 5 BASIC16.89■□□□□ 0.29
IRF4Q15306 SSB-201ENST00000260956 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
IRF4Q15306 AL109955.1-201ENST00000417346 1540 ntTSL 2 BASIC16.89■□□□□ 0.29
IRF4Q15306 HIPK1-207ENST00000369561 3777 ntTSL 5 BASIC16.89■□□□□ 0.29
IRF4Q15306 SLC39A1-210ENST00000617697 2214 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.89■□□□□ 0.29
IRF4Q15306 ANKRD13B-209ENST00000614878 2670 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.89■□□□□ 0.29
IRF4Q15306 TATDN3-214ENST00000532324 1381 ntTSL 2 BASIC16.89■□□□□ 0.29
IRF4Q15306 GMDS-AS1-201ENST00000456943 2308 ntTSL 2 BASIC16.88■□□□□ 0.29
IRF4Q15306 LGI3-201ENST00000306317 3272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
IRF4Q15306 LGI4-201ENST00000310123 2814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
IRF4Q15306 CHEK1-202ENST00000427383 1670 ntTSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
IRF4Q15306 RUSC1-209ENST00000471876 1749 ntTSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
IRF4Q15306 CROCCP2-202ENST00000412962 2773 ntBASIC16.88■□□□□ 0.29
IRF4Q15306 DTX2-211ENST00000446600 2281 ntTSL 2 BASIC16.88■□□□□ 0.29
IRF4Q15306 LINC00905-202ENST00000588117 1768 ntTSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
IRF4Q15306 FIGLA-201ENST00000332372 722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
IRF4Q15306 DDT-204ENST00000404092 805 ntTSL 3 BASIC16.88■□□□□ 0.29
IRF4Q15306 AC005281.1-201ENST00000433040 911 ntTSL 5 BASIC16.88■□□□□ 0.29
IRF4Q15306 MKNK2P1-201ENST00000437526 628 ntBASIC16.88■□□□□ 0.29
IRF4Q15306 AC092183.1-201ENST00000469884 875 ntBASIC16.88■□□□□ 0.29
IRF4Q15306 MRFAP1-203ENST00000507420 563 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC16.88■□□□□ 0.29
IRF4Q15306 EEF1E1-205ENST00000507463 654 ntTSL 2 BASIC16.88■□□□□ 0.29
IRF4Q15306 AP001160.2-201ENST00000596071 487 ntBASIC16.88■□□□□ 0.29
IRF4Q15306 MRPL34-205ENST00000600434 793 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC16.88■□□□□ 0.29
IRF4Q15306 AC068137.2-201ENST00000605408 478 ntBASIC16.88■□□□□ 0.29
IRF4Q15306 REXO1L3P-201ENST00000622202 1288 ntBASIC16.88■□□□□ 0.29
IRF4Q15306 NOX4-207ENST00000525196 1555 ntTSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
IRF4Q15306 REM2-202ENST00000536884 1331 ntTSL 2 BASIC16.88■□□□□ 0.29
IRF4Q15306 C2orf27A-205ENST00000624391 1335 ntTSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
IRF4Q15306 UGP2-202ENST00000394417 2136 ntTSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
IRF4Q15306 SLC37A2-203ENST00000403796 2910 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.88■□□□□ 0.29
IRF4Q15306 LSP1-217ENST00000612798 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.88■□□□□ 0.29
IRF4Q15306 FGFR4-202ENST00000393637 2418 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
IRF4Q15306 JPT1-209ENST00000482348 1614 ntTSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
IRF4Q15306 XXYLT1-201ENST00000310380 2727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
IRF4Q15306 CRTAC1-201ENST00000309155 1946 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
IRF4Q15306 CD244-202ENST00000368033 1360 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
IRF4Q15306 VGLL4-211ENST00000430365 1377 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.88■□□□□ 0.29
IRF4Q15306 RBCK1-203ENST00000382181 2208 ntTSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
IRF4Q15306 INPP5J-205ENST00000404390 2215 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.88■□□□□ 0.29
IRF4Q15306 BAG5-202ENST00000337322 1960 ntTSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
IRF4Q15306 CCDC94-201ENST00000262962 1434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
IRF4Q15306 HYAL3-205ENST00000450982 1402 ntTSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
IRF4Q15306 VRK1-201ENST00000216639 1745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
IRF4Q15306 FAM53B-AS1-202ENST00000448422 1491 ntTSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
IRF4Q15306 HS6ST2-203ENST00000406696 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
IRF4Q15306 CCDC189-204ENST00000541260 1531 ntTSL 5 BASIC16.87■□□□□ 0.29
IRF4Q15306 ADCY3-201ENST00000260600 5050 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
IRF4Q15306 PFN4-201ENST00000313213 974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
IRF4Q15306 AMACR-204ENST00000382085 1195 ntTSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
IRF4Q15306 AFG3L1P-209ENST00000429663 458 ntTSL 3 BASIC16.87■□□□□ 0.29
IRF4Q15306 DNAJB3-202ENST00000449667 1266 ntBASIC16.87■□□□□ 0.29
IRF4Q15306 AKR1A1-204ENST00000471651 1018 ntTSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
IRF4Q15306 AC005606.1-201ENST00000567515 504 ntTSL 5 BASIC16.87■□□□□ 0.29
IRF4Q15306 AC091812.2-201ENST00000619081 385 ntBASIC16.87■□□□□ 0.29
IRF4Q15306 PGLYRP1-201ENST00000008938 720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
IRF4Q15306 NIPAL2-202ENST00000430223 4496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
IRF4Q15306 AC092919.2-201ENST00000623631 1645 ntBASIC16.87■□□□□ 0.29
IRF4Q15306 PNRC1-202ENST00000354922 1345 ntTSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
IRF4Q15306 RALGPS1-208ENST00000424082 2362 ntTSL 2 BASIC16.87■□□□□ 0.29
IRF4Q15306 CLDN6-201ENST00000328796 1369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 37.5 ms