Protein–RNA interactions for Protein: Q14839

CHD4, Chromodomain-helicase-DNA-binding protein 4, humanhuman

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Length 1,912 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CHD4Q14839 LLGL2-203ENST00000392550 3509 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
CHD4Q14839 AC008443.3-201ENST00000412295 549 ntTSL 4 BASIC21.19■□□□□ 0.98
CHD4Q14839 AC099669.1-201ENST00000457331 456 ntTSL 3 BASIC21.19■□□□□ 0.98
CHD4Q14839 AC099548.2-209ENST00000480264 625 ntBASIC21.19■□□□□ 0.98
CHD4Q14839 SATB1-217ENST00000493952 626 ntTSL 3 BASIC21.19■□□□□ 0.98
CHD4Q14839 LINC02437-201ENST00000505053 911 ntTSL 3 BASIC21.19■□□□□ 0.98
CHD4Q14839 TUBA1A-203ENST00000546918 984 ntTSL 3 BASIC21.19■□□□□ 0.98
CHD4Q14839 STK25P1-201ENST00000585406 838 ntBASIC21.19■□□□□ 0.98
CHD4Q14839 TNNT1-209ENST00000587758 1016 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
CHD4Q14839 HIST1H3I-201ENST00000616365 411 ntAPPRIS P1 BASIC21.19■□□□□ 0.98
CHD4Q14839 FAM92A-219ENST00000620645 1014 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.19■□□□□ 0.98
CHD4Q14839 FPGS-201ENST00000373225 2278 ntTSL 2 BASIC21.19■□□□□ 0.98
CHD4Q14839 LINC00887-203ENST00000429578 1717 ntTSL 2 BASIC21.19■□□□□ 0.98
CHD4Q14839 LARGE2-208ENST00000531526 2528 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.19■□□□□ 0.98
CHD4Q14839 MFSD2B-202ENST00000406420 1528 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.19■□□□□ 0.98
CHD4Q14839 NOC2LP1-202ENST00000452600 2235 ntBASIC21.19■□□□□ 0.98
CHD4Q14839 ST8SIA4-202ENST00000451528 1794 ntTSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
CHD4Q14839 USP18-201ENST00000215794 2129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
CHD4Q14839 IDUA-210ENST00000514224 2130 ntTSL 2 BASIC21.19■□□□□ 0.98
CHD4Q14839 TAF15-211ENST00000604841 2140 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
CHD4Q14839 SCYL1-202ENST00000279270 1659 ntTSL 5 BASIC21.19■□□□□ 0.98
CHD4Q14839 RBM24-202ENST00000379052 2703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
CHD4Q14839 RPN2-201ENST00000237530 2515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
CHD4Q14839 DNLZ-202ENST00000371739 2934 ntTSL 5 BASIC21.18■□□□□ 0.98
CHD4Q14839 C11orf71-201ENST00000325636 652 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
CHD4Q14839 MRPS6-201ENST00000399312 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
CHD4Q14839 HNRNPA3P1-201ENST00000401429 1139 ntBASIC21.18■□□□□ 0.98
CHD4Q14839 AC007731.4-201ENST00000420225 652 ntTSL 2 BASIC21.18■□□□□ 0.98
CHD4Q14839 HNRNPA3P5-201ENST00000455201 833 ntBASIC21.18■□□□□ 0.98
CHD4Q14839 CD74-212ENST00000524315 584 ntTSL 5 BASIC21.18■□□□□ 0.98
CHD4Q14839 AL109936.8-201ENST00000641772 604 ntBASIC21.18■□□□□ 0.98
CHD4Q14839 CPT2-207ENST00000636867 2643 ntTSL 5 BASIC21.18■□□□□ 0.98
CHD4Q14839 SERPINF2-202ENST00000382061 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
CHD4Q14839 SNTG2-202ENST00000407292 1436 ntTSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
CHD4Q14839 SLCO4A1-AS1-202ENST00000433126 1420 ntTSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
CHD4Q14839 EVA1C-202ENST00000382699 1668 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
CHD4Q14839 PTPA-201ENST00000337738 2845 ntTSL 2 BASIC21.18■□□□□ 0.98
CHD4Q14839 PCCB-209ENST00000469217 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.18■□□□□ 0.98
CHD4Q14839 RPS6KA1-203ENST00000374166 3131 ntTSL 5 BASIC21.18■□□□□ 0.98
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CHD4Q14839 WNT5B-201ENST00000310594 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
CHD4Q14839 CDH22-201ENST00000372262 3661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
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CHD4Q14839 TMEM178A-206ENST00000618232 1286 ntTSL 5 BASIC21.17■□□□□ 0.98
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CHD4Q14839 HFE2-205ENST00000497365 1419 ntTSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
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CHD4Q14839 URAHP-203ENST00000517889 1381 ntTSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
CHD4Q14839 KIRREL2-205ENST00000592409 2563 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
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CHD4Q14839 VCX-202ENST00000381059 967 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
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CHD4Q14839 ZNF668-208ENST00000538906 2865 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.16■□□□□ 0.98
CHD4Q14839 SLC22A4-201ENST00000200652 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
CHD4Q14839 ZNF282-204ENST00000610704 3722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
CHD4Q14839 C19orf57-208ENST00000591586 1559 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.16■□□□□ 0.98
CHD4Q14839 SPTBN4-201ENST00000338932 8686 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.16■□□□□ 0.98
CHD4Q14839 ACTA1-201ENST00000366683 1122 ntTSL 5 BASIC21.16■□□□□ 0.98
CHD4Q14839 LHFPL6-201ENST00000379589 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
CHD4Q14839 YDJC-202ENST00000398873 1066 ntTSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
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CHD4Q14839 LINC01160-201ENST00000441004 768 ntTSL 3 BASIC21.16■□□□□ 0.98
CHD4Q14839 STARD4-205ENST00000505803 803 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.16■□□□□ 0.98
CHD4Q14839 STARD4-207ENST00000509887 1186 ntTSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
CHD4Q14839 AC020659.2-202ENST00000512295 513 ntTSL 2 BASIC21.16■□□□□ 0.98
CHD4Q14839 AP002008.1-201ENST00000530283 1155 ntTSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
CHD4Q14839 XRCC3-210ENST00000554974 575 ntTSL 4 BASIC21.16■□□□□ 0.98
CHD4Q14839 COMMD4-207ENST00000562789 746 ntTSL 2 BASIC21.16■□□□□ 0.98
CHD4Q14839 WDR90-202ENST00000315764 1454 ntTSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
CHD4Q14839 HYAL3-207ENST00000621157 1696 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.16■□□□□ 0.98
CHD4Q14839 ADAP2-201ENST00000330889 2934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
CHD4Q14839 CCDC17-202ENST00000421127 2216 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.16■□□□□ 0.98
CHD4Q14839 COQ6-220ENST00000629426 1538 ntTSL 5 BASIC21.16■□□□□ 0.98
CHD4Q14839 ADORA2A-214ENST00000611543 2412 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.16■□□□□ 0.98
CHD4Q14839 DCAF4-201ENST00000353777 1940 ntTSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
CHD4Q14839 KANSL1L-203ENST00000418791 3562 ntTSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
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