Protein–RNA interactions for Protein: Q14683

SMC1A, Structural maintenance of chromosomes protein 1A, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 1,233 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SMC1AQ14683 AC011467.2-201ENST00000598425 242 ntBASIC19.24■□□□□ 0.67
SMC1AQ14683 ZNF772-206ENST00000600175 737 ntTSL 2 BASIC19.24■□□□□ 0.67
SMC1AQ14683 AC114488.2-214ENST00000609033 813 ntTSL 5 BASIC19.24■□□□□ 0.67
SMC1AQ14683 CLEC11A-203ENST00000617718 1128 ntTSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
SMC1AQ14683 HNF1B-206ENST00000620125 1103 ntTSL 5 BASIC19.24■□□□□ 0.67
SMC1AQ14683 AC116407.3-201ENST00000623905 1129 ntBASIC19.24■□□□□ 0.67
SMC1AQ14683 JKAMP-201ENST00000261247 1726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
SMC1AQ14683 TMEM177-204ENST00000424086 1738 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.24■□□□□ 0.67
SMC1AQ14683 VAC14-201ENST00000261776 3099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
SMC1AQ14683 SYVN1-203ENST00000377190 3052 ntTSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
SMC1AQ14683 MATN3-201ENST00000407540 2524 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
SMC1AQ14683 CROCCP1-201ENST00000426910 5675 ntBASIC19.24■□□□□ 0.67
SMC1AQ14683 ZNF804A-201ENST00000302277 4690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
SMC1AQ14683 PEX10-201ENST00000288774 2871 ntTSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
SMC1AQ14683 MRTO4-201ENST00000330263 2315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
SMC1AQ14683 NEK3-206ENST00000611833 2345 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.24■□□□□ 0.67
SMC1AQ14683 APBB1-215ENST00000608394 2128 ntTSL 5 BASIC19.24■□□□□ 0.67
SMC1AQ14683 APBB1-222ENST00000610474 2147 ntTSL 5 BASIC19.24■□□□□ 0.67
SMC1AQ14683 CLDN14-203ENST00000399136 1330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
SMC1AQ14683 GNAI2-204ENST00000440628 1663 ntTSL 5 BASIC19.24■□□□□ 0.67
SMC1AQ14683 FAM50B-202ENST00000380274 1932 ntAPPRIS P1 BASIC19.23■□□□□ 0.67
SMC1AQ14683 ZBTB16-202ENST00000392996 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
SMC1AQ14683 SLC7A2-205ENST00000522656 2274 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
SMC1AQ14683 TCP10L2-202ENST00000366832 2185 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
SMC1AQ14683 ACOT7-202ENST00000377842 1813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
SMC1AQ14683 PEX6-202ENST00000304611 3478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
SMC1AQ14683 TMED3-201ENST00000299705 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
SMC1AQ14683 CCDC188-201ENST00000439765 1475 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.23■□□□□ 0.67
SMC1AQ14683 CCNA2-201ENST00000274026 2797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
SMC1AQ14683 LINC01979-201ENST00000576738 5271 ntTSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
SMC1AQ14683 AMZ2-203ENST00000392720 1378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
SMC1AQ14683 GDF5-202ENST00000374372 2572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
SMC1AQ14683 HNRNPUL2-BSCL2-201ENST00000403734 4001 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.23■□□□□ 0.67
SMC1AQ14683 SMARCA4-215ENST00000590574 5282 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.23■□□□□ 0.67
SMC1AQ14683 LAMTOR5-201ENST00000256644 868 ntTSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
SMC1AQ14683 BX842568.4-201ENST00000421222 227 ntBASIC19.23■□□□□ 0.67
SMC1AQ14683 AL365226.1-201ENST00000448363 349 ntTSL 2 BASIC19.23■□□□□ 0.67
SMC1AQ14683 LAMTOR5-204ENST00000483260 694 ntTSL 2 BASIC19.23■□□□□ 0.67
SMC1AQ14683 AC136604.3-201ENST00000508188 429 ntTSL 3 BASIC19.23■□□□□ 0.67
SMC1AQ14683 UBXN1-210ENST00000529640 1110 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.23■□□□□ 0.67
SMC1AQ14683 LAMTOR5-206ENST00000602318 634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
SMC1AQ14683 CAND2-206ENST00000626378 333 ntTSL 5 BASIC19.23■□□□□ 0.67
SMC1AQ14683 EIPR1-201ENST00000382125 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
SMC1AQ14683 SURF4-208ENST00000613129 3148 ntTSL 2 BASIC19.23■□□□□ 0.67
SMC1AQ14683 CFC1B-203ENST00000620207 1444 ntTSL 5 BASIC19.23■□□□□ 0.67
SMC1AQ14683 CRTAC1-201ENST00000309155 1946 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
SMC1AQ14683 CNPPD1-201ENST00000360507 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
SMC1AQ14683 PSMD8-207ENST00000592035 1581 ntTSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
SMC1AQ14683 AFG3L2-201ENST00000269143 3247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
SMC1AQ14683 TTLL11-201ENST00000321582 3250 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.22■□□□□ 0.67
SMC1AQ14683 LRFN3-201ENST00000246529 2513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
SMC1AQ14683 CROCCP3-201ENST00000263511 5368 ntTSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
SMC1AQ14683 GRIN2C-202ENST00000347612 2929 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
SMC1AQ14683 DVL1-202ENST00000378891 2926 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
SMC1AQ14683 DNM1-216ENST00000634267 2909 ntTSL 5 BASIC19.22■□□□□ 0.67
SMC1AQ14683 MON1B-202ENST00000439557 1759 ntTSL 2 BASIC19.22■□□□□ 0.67
SMC1AQ14683 RNF19A-201ENST00000341084 4285 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.22■□□□□ 0.67
SMC1AQ14683 PPP3CA-203ENST00000394854 4685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
SMC1AQ14683 PDLIM7-202ENST00000355841 1689 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
SMC1AQ14683 POMC-203ENST00000395826 959 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.22■□□□□ 0.67
SMC1AQ14683 AL807752.7-201ENST00000471521 989 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.22■□□□□ 0.67
SMC1AQ14683 NUBP2-214ENST00000568706 913 ntTSL 2 BASIC19.22■□□□□ 0.67
SMC1AQ14683 AC055811.1-201ENST00000584203 1231 ntTSL 5 BASIC19.22■□□□□ 0.67
SMC1AQ14683 LINC01956-202ENST00000584273 612 ntTSL 3 BASIC19.22■□□□□ 0.67
SMC1AQ14683 GPAT3-208ENST00000611707 2633 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.22■□□□□ 0.67
SMC1AQ14683 APEH-202ENST00000438011 2249 ntTSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
SMC1AQ14683 PLPPR4-202ENST00000370185 5369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
SMC1AQ14683 FAM83A-202ENST00000518448 5393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
SMC1AQ14683 CACNA1A-240ENST00000637432 7809 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.22■□□□□ 0.67
SMC1AQ14683 DPP9-AS1-201ENST00000381796 3071 ntTSL 2 BASIC19.22■□□□□ 0.67
SMC1AQ14683 GMCL1P1-201ENST00000463439 1581 ntBASIC19.22■□□□□ 0.67
SMC1AQ14683 ECE2-205ENST00000404464 3229 ntTSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
SMC1AQ14683 LBX2-AS1-201ENST00000548978 1852 ntTSL 3 BASIC19.22■□□□□ 0.67
SMC1AQ14683 PVR-204ENST00000406449 1344 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
SMC1AQ14683 FXYD6-204ENST00000526014 2171 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
SMC1AQ14683 PTGES2-201ENST00000277462 1614 ntTSL 2 BASIC19.22■□□□□ 0.67
SMC1AQ14683 GPER1-202ENST00000397088 2639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
SMC1AQ14683 PIEZO1-201ENST00000301015 8072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
SMC1AQ14683 AC004951.4-201ENST00000454572 2076 ntTSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
SMC1AQ14683 TNK2-AS1-201ENST00000458180 2096 ntTSL 2 BASIC19.21■□□□□ 0.67
SMC1AQ14683 CPXM1-201ENST00000380605 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
SMC1AQ14683 MAP4K1-201ENST00000396857 2653 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.21■□□□□ 0.67
SMC1AQ14683 DAPK1-202ENST00000408954 5892 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.21■□□□□ 0.67
SMC1AQ14683 POLR3H-202ENST00000355209 4416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
SMC1AQ14683 AP3D1-201ENST00000345016 4870 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
SMC1AQ14683 PSRC1-205ENST00000409138 1826 ntTSL 2 BASIC19.21■□□□□ 0.67
SMC1AQ14683 CD19-202ENST00000538922 1957 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.21■□□□□ 0.67
SMC1AQ14683 TMED3-203ENST00000536821 2265 ntTSL 2 BASIC19.21■□□□□ 0.67
SMC1AQ14683 CCT6A-201ENST00000275603 2719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
SMC1AQ14683 TMEM119-201ENST00000392806 2707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
SMC1AQ14683 PRSS36-207ENST00000569305 2723 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
SMC1AQ14683 EXOSC5-201ENST00000221233 1118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
SMC1AQ14683 ADIPOR1-202ENST00000367254 1116 ntTSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
SMC1AQ14683 FUOM-202ENST00000368551 628 ntTSL 3 BASIC19.21■□□□□ 0.67
SMC1AQ14683 IL12RB2-202ENST00000371000 2454 ntTSL 2 BASIC19.21■□□□□ 0.67
SMC1AQ14683 OTOS-202ENST00000391989 645 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.21■□□□□ 0.67
SMC1AQ14683 CACNA1G-206ENST00000416767 4899 ntTSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
SMC1AQ14683 COX10-202ENST00000429152 875 ntTSL 2 BASIC19.21■□□□□ 0.67
SMC1AQ14683 AC125634.1-201ENST00000438758 1403 ntBASIC19.21■□□□□ 0.67
SMC1AQ14683 SPCS2-207ENST00000530257 612 ntTSL 3 BASIC19.21■□□□□ 0.67
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 45 ms