Protein–RNA interactions for Protein: Q13740

ALCAM, CD166 antigen, humanhuman

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Length 583 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ALCAMQ13740 SFTPB-202ENST00000409383 1867 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
ALCAMQ13740 AC004890.2-201ENST00000426347 2419 ntTSL 5 BASIC18.8■□□□□ 0.6
ALCAMQ13740 PHPT1-202ENST00000371661 985 ntTSL 5 BASIC18.8■□□□□ 0.6
ALCAMQ13740 TRIM36-203ENST00000379618 693 ntTSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
ALCAMQ13740 RAB24-204ENST00000393611 1236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
ALCAMQ13740 EXOSC3-202ENST00000396521 768 ntTSL 2 BASIC18.8■□□□□ 0.6
ALCAMQ13740 TSTD1-204ENST00000423014 593 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.8■□□□□ 0.6
ALCAMQ13740 HFE-210ENST00000470149 1123 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
ALCAMQ13740 TMEM41B-203ENST00000527813 803 ntTSL 5 BASIC18.8■□□□□ 0.6
ALCAMQ13740 ABO-202ENST00000538324 1147 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC18.8■□□□□ 0.6
ALCAMQ13740 CHMP1A-208ENST00000550102 803 ntTSL 5 BASIC18.8■□□□□ 0.6
ALCAMQ13740 AP001005.1-201ENST00000571755 1248 ntBASIC18.8■□□□□ 0.6
ALCAMQ13740 ADORA1-209ENST00000640524 653 ntTSL 5 BASIC18.8■□□□□ 0.6
ALCAMQ13740 STX3-201ENST00000337979 3299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
ALCAMQ13740 FBXO7-201ENST00000266087 2195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
ALCAMQ13740 ARHGEF19-201ENST00000270747 3029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
ALCAMQ13740 MAPRE1-201ENST00000375571 2623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
ALCAMQ13740 RPRD1A-209ENST00000590898 1945 ntTSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
ALCAMQ13740 TNIP1-221ENST00000610874 2629 ntTSL 5 BASIC18.8■□□□□ 0.6
ALCAMQ13740 KCNE3-201ENST00000310128 3143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
ALCAMQ13740 BFSP1-201ENST00000377868 2063 ntTSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
ALCAMQ13740 STPG3-AS1-201ENST00000612170 1701 ntTSL 2 BASIC18.8■□□□□ 0.6
ALCAMQ13740 LINC01168-201ENST00000461291 5254 ntTSL 2 BASIC18.8■□□□□ 0.6
ALCAMQ13740 STRN4-201ENST00000263280 3210 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
ALCAMQ13740 PRDM8-203ENST00000504452 3706 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.79■□□□□ 0.6
ALCAMQ13740 AC060834.1-201ENST00000443027 2032 ntBASIC18.79■□□□□ 0.6
ALCAMQ13740 CERCAM-201ENST00000372838 2685 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
ALCAMQ13740 LRRC71-201ENST00000337428 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
ALCAMQ13740 RTKN-203ENST00000305557 2646 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.79■□□□□ 0.6
ALCAMQ13740 PSMC5-202ENST00000375812 1494 ntTSL 2 BASIC18.79■□□□□ 0.6
ALCAMQ13740 PRRT2-205ENST00000567659 1470 ntTSL 2 BASIC18.79■□□□□ 0.6
ALCAMQ13740 RETREG1-201ENST00000306320 3268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
ALCAMQ13740 KAZN-208ENST00000636203 6874 ntTSL 5 BASIC18.79■□□□□ 0.6
ALCAMQ13740 TDRKH-202ENST00000368823 2751 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.79■□□□□ 0.6
ALCAMQ13740 SLC38A11-202ENST00000409058 1647 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.79■□□□□ 0.6
ALCAMQ13740 EVI5L-202ENST00000538904 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
ALCAMQ13740 IL4I1-204ENST00000595948 2407 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
ALCAMQ13740 GJB3-201ENST00000373362 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
ALCAMQ13740 BATF2-202ENST00000435842 1949 ntTSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
ALCAMQ13740 FGFR4-203ENST00000393648 2733 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.79■□□□□ 0.6
ALCAMQ13740 GHSR-201ENST00000241256 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
ALCAMQ13740 TMEM59-202ENST00000371337 600 ntTSL 2 BASIC18.79■□□□□ 0.6
ALCAMQ13740 MSANTD3-201ENST00000374885 786 ntTSL 2 BASIC18.79■□□□□ 0.6
ALCAMQ13740 MRPL3P1-201ENST00000400109 1033 ntBASIC18.79■□□□□ 0.6
ALCAMQ13740 CCDC74A-202ENST00000409856 1298 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
ALCAMQ13740 AC021066.1-201ENST00000549788 647 ntTSL 3 BASIC18.79■□□□□ 0.6
ALCAMQ13740 DUX4L17-201ENST00000557360 1267 ntBASIC18.79■□□□□ 0.6
ALCAMQ13740 CBFB-203ENST00000561924 584 ntTSL 5 BASIC18.79■□□□□ 0.6
ALCAMQ13740 AC008667.4-201ENST00000607370 168 ntBASIC18.79■□□□□ 0.6
ALCAMQ13740 AC005593.1-201ENST00000624894 515 ntBASIC18.79■□□□□ 0.6
ALCAMQ13740 ABBA01031661.1-201ENST00000634362 1253 ntBASIC18.79■□□□□ 0.6
ALCAMQ13740 ATP6AP2-220ENST00000636970 1187 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.79■□□□□ 0.6
ALCAMQ13740 OSBPL9-222ENST00000531828 2210 ntTSL 5 BASIC18.79■□□□□ 0.6
ALCAMQ13740 LY6E-207ENST00000520466 1419 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.79■□□□□ 0.6
ALCAMQ13740 NIPAL2-201ENST00000341166 4581 ntTSL 2 BASIC18.79■□□□□ 0.6
ALCAMQ13740 KRT8-201ENST00000293308 1882 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.79■□□□□ 0.6
ALCAMQ13740 ADCYAP1R1-203ENST00000409363 1889 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
ALCAMQ13740 AP5B1-201ENST00000532090 4811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
ALCAMQ13740 FGFBP1-201ENST00000382333 1359 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.79■□□□□ 0.6
ALCAMQ13740 DDX1-207ENST00000617198 2257 ntTSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
ALCAMQ13740 ZNF211-201ENST00000240731 2440 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC18.79■□□□□ 0.6
ALCAMQ13740 TUBGCP3-202ENST00000375669 2723 ntTSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
ALCAMQ13740 CREB3L1-206ENST00000621158 2687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
ALCAMQ13740 ZSCAN10-202ENST00000538082 2350 ntTSL 4 BASIC18.78■□□□□ 0.6
ALCAMQ13740 AC068944.1-201ENST00000514855 1604 ntTSL 2 BASIC18.78■□□□□ 0.6
ALCAMQ13740 STXBP3-201ENST00000370008 2478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
ALCAMQ13740 CORO6-210ENST00000580212 2345 ntTSL 5 BASIC18.78■□□□□ 0.6
ALCAMQ13740 PLCG1-202ENST00000373271 7395 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
ALCAMQ13740 TMEM183A-201ENST00000367242 3019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
ALCAMQ13740 PI4KAP1-204ENST00000612579 1703 ntBASIC18.78■□□□□ 0.6
ALCAMQ13740 ALDH3A2-225ENST00000630662 1558 ntTSL 5 BASIC18.78■□□□□ 0.6
ALCAMQ13740 RBM14-202ENST00000393979 1426 ntTSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
ALCAMQ13740 DCTN3-201ENST00000259632 808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
ALCAMQ13740 PPIB-201ENST00000300026 1081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
ALCAMQ13740 NDUFA11-201ENST00000308961 539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
ALCAMQ13740 LCE1F-201ENST00000334371 357 ntAPPRIS P1 BASIC18.78■□□□□ 0.6
ALCAMQ13740 AC109309.1-201ENST00000418995 435 ntTSL 3 BASIC18.78■□□□□ 0.6
ALCAMQ13740 NDUFB2-208ENST00000471136 499 ntTSL 3 BASIC18.78■□□□□ 0.6
ALCAMQ13740 REPIN1-217ENST00000518514 478 ntTSL 3 BASIC18.78■□□□□ 0.6
ALCAMQ13740 AC012640.2-201ENST00000561606 901 ntBASIC18.78■□□□□ 0.6
ALCAMQ13740 CIRBP-235ENST00000591935 746 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC18.78■□□□□ 0.6
ALCAMQ13740 AC008878.4-201ENST00000602083 293 ntTSL 5 BASIC18.78■□□□□ 0.6
ALCAMQ13740 SCN5A-214ENST00000612060 714 ntTSL 5 BASIC18.78■□□□□ 0.6
ALCAMQ13740 MIR7706-201ENST00000613747 67 ntBASIC18.78■□□□□ 0.6
ALCAMQ13740 AC243547.2-201ENST00000616257 234 ntTSL 3 BASIC18.78■□□□□ 0.6
ALCAMQ13740 GPR137-212ENST00000539851 1843 ntTSL 2 BASIC18.78■□□□□ 0.6
ALCAMQ13740 SEPHS1-202ENST00000378614 2387 ntTSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
ALCAMQ13740 BMPER-201ENST00000297161 5031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
ALCAMQ13740 ACTN3-203ENST00000513398 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
ALCAMQ13740 USP7-201ENST00000344836 5412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
ALCAMQ13740 KRT84-201ENST00000257951 2092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
ALCAMQ13740 THNSL2-202ENST00000343544 2052 ntTSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
ALCAMQ13740 NECAB2-203ENST00000565691 2064 ntTSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
ALCAMQ13740 CHRNG-201ENST00000389492 1398 ntTSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
ALCAMQ13740 IRF8-203ENST00000563180 1394 ntTSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
ALCAMQ13740 SLC29A1-202ENST00000371713 2168 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.78■□□□□ 0.6
ALCAMQ13740 NUDT19-201ENST00000397061 2967 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.78■□□□□ 0.6
ALCAMQ13740 RIC8B-203ENST00000392839 2440 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
ALCAMQ13740 FAM234A-203ENST00000399932 3213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
ALCAMQ13740 DIAPH1-201ENST00000253811 5789 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.78■□□□□ 0.6
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