Protein–RNA interactions for Protein: Q13609

DNASE1L3, Deoxyribonuclease gamma, humanhuman

Predictions only

Length 305 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DNASE1L3Q13609 C6orf48-207ENST00000375642 962 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.66■□□□□ 0.26
DNASE1L3Q13609 BAZ1A-203ENST00000382422 5775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
DNASE1L3Q13609 TMEM128-202ENST00000382753 1221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
DNASE1L3Q13609 GPER1-202ENST00000397088 2639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
DNASE1L3Q13609 LBH-204ENST00000406087 559 ntTSL 4 BASIC16.66■□□□□ 0.26
DNASE1L3Q13609 C2orf49-202ENST00000410049 854 ntTSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
DNASE1L3Q13609 LINC01105-206ENST00000456327 1434 ntTSL 5 BASIC16.66■□□□□ 0.26
DNASE1L3Q13609 PMPCAP1-201ENST00000508114 1576 ntBASIC16.66■□□□□ 0.26
DNASE1L3Q13609 PGAM5P1-201ENST00000518923 814 ntBASIC16.66■□□□□ 0.26
DNASE1L3Q13609 RPS29-206ENST00000557111 488 ntTSL 2 BASIC16.66■□□□□ 0.26
DNASE1L3Q13609 BEAN1-203ENST00000561796 1078 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
DNASE1L3Q13609 AC104758.1-202ENST00000568184 602 ntTSL 3 BASIC16.66■□□□□ 0.26
DNASE1L3Q13609 NAA60-217ENST00000572942 1089 ntTSL 2 BASIC16.66■□□□□ 0.26
DNASE1L3Q13609 FOSB-209ENST00000590335 2170 ntTSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
DNASE1L3Q13609 HEXIM2-207ENST00000592695 1246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
DNASE1L3Q13609 TEX264-216ENST00000614067 1174 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.66■□□□□ 0.26
DNASE1L3Q13609 HMGN3-203ENST00000620514 1010 ntTSL 3 BASIC16.66■□□□□ 0.26
DNASE1L3Q13609 TOR2A-205ENST00000463577 2211 ntTSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
DNASE1L3Q13609 C8orf34-206ENST00000518698 2223 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.66■□□□□ 0.26
DNASE1L3Q13609 UQCC3-201ENST00000377953 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
DNASE1L3Q13609 MYO1B-202ENST00000339514 5026 ntTSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
DNASE1L3Q13609 AP002414.3-201ENST00000589352 1468 ntBASIC16.66■□□□□ 0.26
DNASE1L3Q13609 PEX10-201ENST00000288774 2871 ntTSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
DNASE1L3Q13609 LIFR-202ENST00000453190 4253 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.66■□□□□ 0.26
DNASE1L3Q13609 SOX30-202ENST00000311371 2716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
DNASE1L3Q13609 UBFD1-201ENST00000395878 5110 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.66■□□□□ 0.26
DNASE1L3Q13609 CEACAM16-202ENST00000587331 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
DNASE1L3Q13609 KLC1-212ENST00000553286 3135 ntTSL 5 BASIC16.65■□□□□ 0.26
DNASE1L3Q13609 CHST10-201ENST00000264249 2842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
DNASE1L3Q13609 KRT8P47-201ENST00000604727 1398 ntBASIC16.65■□□□□ 0.26
DNASE1L3Q13609 PCDHA8-202ENST00000531613 5260 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
DNASE1L3Q13609 C16orf59-204ENST00000563531 1864 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.65■□□□□ 0.26
DNASE1L3Q13609 BAIAP2L2-201ENST00000332536 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.65■□□□□ 0.26
DNASE1L3Q13609 NPC1L1-203ENST00000423141 2554 ntTSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
DNASE1L3Q13609 USP2-202ENST00000455332 2903 ntTSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
DNASE1L3Q13609 OTUB1-202ENST00000422031 2297 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.65■□□□□ 0.26
DNASE1L3Q13609 MUTYH-202ENST00000355498 1776 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
DNASE1L3Q13609 HS6ST2-204ENST00000521489 2607 ntTSL 5 BASIC16.65■□□□□ 0.26
DNASE1L3Q13609 ZNF211-211ENST00000541801 2629 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.65■□□□□ 0.26
DNASE1L3Q13609 ICA1L-201ENST00000358299 3457 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.65■□□□□ 0.26
DNASE1L3Q13609 RPS12-201ENST00000230050 631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
DNASE1L3Q13609 PIH1D1-201ENST00000262265 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
DNASE1L3Q13609 PDCD1-201ENST00000334409 2114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
DNASE1L3Q13609 ROMO1-201ENST00000336695 496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
DNASE1L3Q13609 BECN1-201ENST00000361523 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
DNASE1L3Q13609 PIGU-202ENST00000374820 1248 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
DNASE1L3Q13609 GRM5-203ENST00000393294 1268 ntTSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
DNASE1L3Q13609 PTPRF-209ENST00000438120 6377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
DNASE1L3Q13609 AL442663.3-201ENST00000554737 1000 ntTSL 3 BASIC16.65■□□□□ 0.26
DNASE1L3Q13609 AC012645.3-201ENST00000568506 470 ntTSL 3 BASIC16.65■□□□□ 0.26
DNASE1L3Q13609 FBF1-204ENST00000586631 621 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.65■□□□□ 0.26
DNASE1L3Q13609 IER2-202ENST00000587885 1291 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.65■□□□□ 0.26
DNASE1L3Q13609 SPTBN4-212ENST00000598249 8070 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
DNASE1L3Q13609 CCL3-204ENST00000613922 778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
DNASE1L3Q13609 PAX4-204ENST00000463946 1613 ntTSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
DNASE1L3Q13609 MALT1-202ENST00000348428 9368 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
DNASE1L3Q13609 DAGLB-204ENST00000436575 2385 ntTSL 2 BASIC16.65■□□□□ 0.26
DNASE1L3Q13609 FAM72B-207ENST00000619376 1659 ntTSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
DNASE1L3Q13609 ZFYVE28-208ENST00000511071 3273 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.65■□□□□ 0.26
DNASE1L3Q13609 SPAG6-202ENST00000376603 2770 ntTSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
DNASE1L3Q13609 CACNA1A-238ENST00000637276 7135 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.65■□□□□ 0.26
DNASE1L3Q13609 TBXAS1-210ENST00000458722 2057 ntTSL 2 BASIC16.65■□□□□ 0.26
DNASE1L3Q13609 CDH23-205ENST00000398809 4533 ntTSL 5 BASIC16.64■□□□□ 0.25
DNASE1L3Q13609 AC005865.2-201ENST00000505276 2303 ntTSL 2 BASIC16.64■□□□□ 0.25
DNASE1L3Q13609 SLC1A4-201ENST00000234256 4561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
DNASE1L3Q13609 CHEK2-202ENST00000348295 1771 ntTSL 5 BASIC16.64■□□□□ 0.25
DNASE1L3Q13609 PHGDH-209ENST00000641074 1780 ntBASIC16.64■□□□□ 0.25
DNASE1L3Q13609 ORAI2-202ENST00000403646 2528 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.64■□□□□ 0.25
DNASE1L3Q13609 GABARAPL1-201ENST00000266458 1957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
DNASE1L3Q13609 HECTD2-203ENST00000371681 2175 ntTSL 2 BASIC16.64■□□□□ 0.25
DNASE1L3Q13609 ZNF619-205ENST00000456778 2192 ntTSL 2 BASIC16.64■□□□□ 0.25
DNASE1L3Q13609 C2CD4C-201ENST00000332235 3129 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.64■□□□□ 0.25
DNASE1L3Q13609 REL-202ENST00000394479 2398 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
DNASE1L3Q13609 MOV10L1-203ENST00000395852 1422 ntTSL 2 BASIC16.64■□□□□ 0.25
DNASE1L3Q13609 ANAPC13-206ENST00000514612 1420 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.64■□□□□ 0.25
DNASE1L3Q13609 AC142086.1-202ENST00000398669 1839 ntTSL 2 BASIC16.64■□□□□ 0.25
DNASE1L3Q13609 KIAA1147-202ENST00000536163 7296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
DNASE1L3Q13609 AL513477.1-201ENST00000602865 2407 ntBASIC16.64■□□□□ 0.25
DNASE1L3Q13609 DPY30-201ENST00000295066 631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
DNASE1L3Q13609 DPY30-202ENST00000342166 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
DNASE1L3Q13609 LCE1B-201ENST00000360090 1139 ntAPPRIS P1 BASIC16.64■□□□□ 0.25
DNASE1L3Q13609 DPM3-203ENST00000368400 409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
DNASE1L3Q13609 RPL13P5-203ENST00000421824 845 ntTSL 3 BASIC16.64■□□□□ 0.25
DNASE1L3Q13609 AC016999.1-201ENST00000447880 452 ntTSL 3 BASIC16.64■□□□□ 0.25
DNASE1L3Q13609 KRT18P3-201ENST00000451602 1288 ntBASIC16.64■□□□□ 0.25
DNASE1L3Q13609 SMIM27-204ENST00000453396 1003 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.64■□□□□ 0.25
DNASE1L3Q13609 NDUFB2-208ENST00000471136 499 ntTSL 3 BASIC16.64■□□□□ 0.25
DNASE1L3Q13609 SPCS2-202ENST00000526361 772 ntTSL 2 BASIC16.64■□□□□ 0.25
DNASE1L3Q13609 FLJ20021-201ENST00000527564 790 ntTSL 2 BASIC16.64■□□□□ 0.25
DNASE1L3Q13609 UNC93B6-202ENST00000528242 690 ntBASIC16.64■□□□□ 0.25
DNASE1L3Q13609 HAGH-208ENST00000566709 1291 ntTSL 5 BASIC16.64■□□□□ 0.25
DNASE1L3Q13609 AL022328.2-201ENST00000608016 640 ntTSL 3 BASIC16.64■□□□□ 0.25
DNASE1L3Q13609 SELENOM-210ENST00000611680 689 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.64■□□□□ 0.25
DNASE1L3Q13609 NXNL2-205ENST00000618633 739 ntTSL 5 BASIC16.64■□□□□ 0.25
DNASE1L3Q13609 NPAS4-204ENST00000639555 878 ntTSL 5 BASIC16.64■□□□□ 0.25
DNASE1L3Q13609 SWSAP1-201ENST00000312423 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
DNASE1L3Q13609 TSKU-205ENST00000612930 2666 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC16.64■□□□□ 0.25
DNASE1L3Q13609 PFKL-201ENST00000349048 2912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
DNASE1L3Q13609 C2orf27B-201ENST00000623129 1325 ntTSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
DNASE1L3Q13609 DPF2-205ENST00000528416 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 43.4 ms