Protein–RNA interactions for Protein: Q13608

PEX6, Peroxisome assembly factor 2, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PEX6Q13608 PRICKLE4-204ENST00000458694 1646 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.44■□□□□ 0.38
PEX6Q13608 PCDH8P1-201ENST00000428983 2773 ntBASIC17.44■□□□□ 0.38
PEX6Q13608 DMRTA1-201ENST00000325870 5569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
PEX6Q13608 TRIB3-202ENST00000422053 1533 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.44■□□□□ 0.38
PEX6Q13608 AC023830.1-201ENST00000569678 1543 ntTSL 2 BASIC17.44■□□□□ 0.38
PEX6Q13608 HINT1-201ENST00000304043 1081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
PEX6Q13608 SMIM29-201ENST00000335352 1160 ntTSL 2 BASIC17.44■□□□□ 0.38
PEX6Q13608 RBCK1-206ENST00000400247 790 ntTSL 2 BASIC17.44■□□□□ 0.38
PEX6Q13608 ABCD1P5-201ENST00000445663 754 ntBASIC17.44■□□□□ 0.38
PEX6Q13608 AC080013.1-203ENST00000468242 720 ntTSL 5 BASIC17.44■□□□□ 0.38
PEX6Q13608 PPIE-208ENST00000470213 927 ntTSL 3 BASIC17.44■□□□□ 0.38
PEX6Q13608 AC080013.1-201ENST00000495318 566 ntTSL 4 BASIC17.44■□□□□ 0.38
PEX6Q13608 AC073648.2-201ENST00000510116 352 ntBASIC17.44■□□□□ 0.38
PEX6Q13608 AF238378.1-201ENST00000526806 358 ntBASIC17.44■□□□□ 0.38
PEX6Q13608 TMEM220-AS1-202ENST00000580899 561 ntTSL 4 BASIC17.44■□□□□ 0.38
PEX6Q13608 AC087645.2-201ENST00000586321 799 ntTSL 3 BASIC17.44■□□□□ 0.38
PEX6Q13608 CHMP4A-211ENST00000609024 735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
PEX6Q13608 MED16-213ENST00000616387 1078 ntTSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
PEX6Q13608 ZNF619-205ENST00000456778 2192 ntTSL 2 BASIC17.44■□□□□ 0.38
PEX6Q13608 ADAD1-203ENST00000388725 1918 ntTSL 2 BASIC17.44■□□□□ 0.38
PEX6Q13608 TRNT1-205ENST00000402675 1935 ntTSL 2 BASIC17.44■□□□□ 0.38
PEX6Q13608 TBC1D30-203ENST00000539867 2594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
PEX6Q13608 NODAL-201ENST00000287139 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
PEX6Q13608 KXD1-201ENST00000222307 1426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
PEX6Q13608 AC009779.2-201ENST00000552576 1443 ntTSL 4 BASIC17.44■□□□□ 0.38
PEX6Q13608 PCBP4-203ENST00000428823 1835 ntTSL 5 BASIC17.44■□□□□ 0.38
PEX6Q13608 TMEM237-213ENST00000621467 1824 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
PEX6Q13608 OSGIN1-202ENST00000361711 2230 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.44■□□□□ 0.38
PEX6Q13608 CCZ1-207ENST00000628813 2218 ntTSL 2 BASIC17.44■□□□□ 0.38
PEX6Q13608 LINC00271-201ENST00000421378 1580 ntTSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
PEX6Q13608 TRMT44-201ENST00000389737 2799 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.44■□□□□ 0.38
PEX6Q13608 C6orf132-201ENST00000341865 6210 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.44■□□□□ 0.38
PEX6Q13608 RTCA-203ENST00000370128 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
PEX6Q13608 CACNA2D2-201ENST00000266039 5476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
PEX6Q13608 PABPC1L-201ENST00000217073 1851 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.44■□□□□ 0.38
PEX6Q13608 CHGA-202ENST00000334654 1474 ntTSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
PEX6Q13608 ZFYVE28-208ENST00000511071 3273 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.43■□□□□ 0.38
PEX6Q13608 ARHGAP9-204ENST00000430041 2323 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
PEX6Q13608 TLE2-217ENST00000590536 2344 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
PEX6Q13608 RGS12-203ENST00000344733 5469 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
PEX6Q13608 BUB3-201ENST00000368858 1361 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
PEX6Q13608 MAN1C1-201ENST00000263979 2627 ntTSL 5 BASIC17.43■□□□□ 0.38
PEX6Q13608 INSIG1-203ENST00000344756 2623 ntTSL 5 BASIC17.43■□□□□ 0.38
PEX6Q13608 RAPGEFL1-212ENST00000620260 3855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
PEX6Q13608 SERPINH1-201ENST00000358171 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
PEX6Q13608 NIPA2-201ENST00000337451 3233 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.43■□□□□ 0.38
PEX6Q13608 FAM208A-209ENST00000493960 5600 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.43■□□□□ 0.38
PEX6Q13608 MED16-201ENST00000269814 1199 ntTSL 5 BASIC17.43■□□□□ 0.38
PEX6Q13608 VAMP5-201ENST00000306384 689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
PEX6Q13608 QRFP-201ENST00000343079 411 ntAPPRIS P1 BASIC17.43■□□□□ 0.38
PEX6Q13608 ROMO1-203ENST00000374077 422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
PEX6Q13608 B4GALT1-AS1-202ENST00000442432 843 ntTSL 2 BASIC17.43■□□□□ 0.38
PEX6Q13608 TSPAN4-214ENST00000525201 834 ntTSL 5 BASIC17.43■□□□□ 0.38
PEX6Q13608 AL157871.1-202ENST00000556458 478 ntTSL 5 BASIC17.43■□□□□ 0.38
PEX6Q13608 AL773604.1-201ENST00000617417 272 ntBASIC17.43■□□□□ 0.38
PEX6Q13608 AC073592.5-201ENST00000624854 528 ntBASIC17.43■□□□□ 0.38
PEX6Q13608 PSMD12-202ENST00000357146 2437 ntTSL 2 BASIC17.43■□□□□ 0.38
PEX6Q13608 SPDEF-201ENST00000374037 1895 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
PEX6Q13608 TBX6-203ENST00000553607 2162 ntTSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
PEX6Q13608 DAG1-201ENST00000308775 5522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
PEX6Q13608 MAPRE1-201ENST00000375571 2623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
PEX6Q13608 DPF2-205ENST00000528416 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
PEX6Q13608 MYBPH-202ENST00000621380 1772 ntTSL 5 BASIC17.43■□□□□ 0.38
PEX6Q13608 NAA50-209ENST00000497525 1385 ntTSL 2 BASIC17.42■□□□□ 0.38
PEX6Q13608 DENND6B-201ENST00000413817 4939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
PEX6Q13608 ZNF302-202ENST00000446502 2635 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.42■□□□□ 0.38
PEX6Q13608 VSTM2A-204ENST00000407838 3112 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.42■□□□□ 0.38
PEX6Q13608 HGS-201ENST00000329138 2970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
PEX6Q13608 CEP120-201ENST00000306467 4900 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.42■□□□□ 0.38
PEX6Q13608 GML-201ENST00000220940 723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
PEX6Q13608 TYMS-202ENST00000323250 693 ntTSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
PEX6Q13608 RAB24-204ENST00000393611 1236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
PEX6Q13608 IGF2-206ENST00000418738 934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
PEX6Q13608 AL096828.1-201ENST00000423020 542 ntTSL 4 BASIC17.42■□□□□ 0.38
PEX6Q13608 RBSN-204ENST00000449050 903 ntTSL 2 BASIC17.42■□□□□ 0.38
PEX6Q13608 FAM197Y8-203ENST00000450145 560 ntBASIC17.42■□□□□ 0.38
PEX6Q13608 PQLC2L-205ENST00000461040 563 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.42■□□□□ 0.38
PEX6Q13608 AC092725.1-201ENST00000565783 499 ntTSL 4 BASIC17.42■□□□□ 0.38
PEX6Q13608 AC068594.1-202ENST00000581657 749 ntTSL 3 BASIC17.42■□□□□ 0.38
PEX6Q13608 ABHD17A-204ENST00000590661 1079 ntTSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
PEX6Q13608 TST-204ENST00000622841 1105 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.42■□□□□ 0.38
PEX6Q13608 ANKMY2-206ENST00000628652 1270 ntTSL 5 BASIC17.42■□□□□ 0.38
PEX6Q13608 SLC12A9-202ENST00000415287 1912 ntTSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
PEX6Q13608 TCAF2-203ENST00000425618 2448 ntTSL 2 BASIC17.42■□□□□ 0.38
PEX6Q13608 BAP1-202ENST00000460680 3937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
PEX6Q13608 VIPR2-202ENST00000377633 1491 ntTSL 2 BASIC17.42■□□□□ 0.38
PEX6Q13608 SUSD4-202ENST00000343846 3480 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.42■□□□□ 0.38
PEX6Q13608 TRIM60-203ENST00000508504 1674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
PEX6Q13608 CBS-202ENST00000359624 2353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
PEX6Q13608 CBSL-203ENST00000618024 2353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
PEX6Q13608 NEIL2-203ENST00000436750 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
PEX6Q13608 CXXC1-212ENST00000589940 2242 ntTSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
PEX6Q13608 PAN3-AS1-201ENST00000563843 1351 ntBASIC17.41■□□□□ 0.38
PEX6Q13608 ANGPTL4-202ENST00000393962 1705 ntTSL 5 BASIC17.41■□□□□ 0.38
PEX6Q13608 TMCO1-207ENST00000580248 1735 ntTSL 2 BASIC17.41■□□□□ 0.38
PEX6Q13608 AC003002.1-202ENST00000596755 1743 ntAPPRIS P1 BASIC17.41■□□□□ 0.38
PEX6Q13608 GBA2-203ENST00000378103 3611 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
PEX6Q13608 CDK4-201ENST00000257904 2076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
PEX6Q13608 GCGR-201ENST00000400723 2051 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
PEX6Q13608 FAM227A-201ENST00000355830 2417 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC17.41■□□□□ 0.38
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